Balanç de la temporada gripal 2017-2018 a Catalunya

Grip estacional; Virus respiratoris; EpidèmiesSeasonal flu; Respiratory viruses; EpidemicsGripe estacional; Virus respiratorios; EpidemiasIntroducció. El Pla d’informació Diària de les infeccions respiratòries agudes a Catalunya (PIDIRAC) engloba la vigilància dels virus respiratoris que circulen durant la temporada de grip estacional amb indicadors virològics i de morbimortalitat. L’objectiu de l’estudi és descriure les característiques clíniques, epidemiològiques i virològiques de la temporada de grip estacional 2017-2018. Mètode. La mostra consta dels casos reportats per la xarxa sentinella PIDIRAC de l’atenció primària i hospitalària durant la temporada 2017-2018. La tècnica de confirmació emprada ha estat la PCR i/o l’aïllament viral en cultiu cel·lular a partir de mostra respiratòria. Resultats. La taxa d’incidència acumulada d’aquesta temporada ha estat de 2295,27 casos per 100.000 habitants, i la taxa més elevada s’ha localitzat en el grup d’edat de 0-4 anys (6.921,96 x 105 h.). El pic d’incidència de 413,3 per 100.000 habitants es va donar la setmana 3. Es van registrar un total de 1.306 casos greus hospitalitzats confirmats de grip (CGHCG), dels quals un 17,9% van requerir ingrés a l’UCI i un 13,4% van ser exitus. La mitjana d’edat dels CGHCG va ser de 75,2 anys (DE: 26,7 anys) i el 65,5%, de majors de 64 anys. Un 70,8% no estaven vacunats; un 91,3% van rebre tractament antiviral. Pel que fa a l’inici del tractament, en el 84% dels casos es va iniciar abans de 48 hores de l’ingrés hospitalari i en el 40,8% dels casos, abans de 48 hores posteriors a l’inici de símptomes, respectivament. En el 60,3% dels casos es va identificar virus de la grip B –llinatge Yamagata– i en el 39,7%, de la grip A –el 54,6% d’A(H1N1)pdm09 i el 45,4% d’A(H3N2) dels subtipats. Conclusions. La temporada 2017-2018 ha estat una temporada d’intensitat moderada-alta, amb un increment del nombre de CGHCG malgrat que la letalitat s’ha mantingut a nivells similars a altres temporades. El virus circulant predominant ha estat el virus de la grip B –llinatge Yamagata– i, en la segona meitat de la temporada, s’ha observat un increment de circulació de virus A –tant d’H1N1pdm09 com d’H3N2–, que ha provocat un allargament de la durada de l’onada epidèmica.Introducción. El Plan de información Diaria de las infecciones respiratorias agudas en Cataluña (PIDIRAC) engloba la vigilancia de los virus respiratorios que circulan durante la temporada de gripe estacional con indicadores virológicos y de morbimortalidad. El objetivo del estudio es describir las características clínicas, epidemiológicas y virológicas de la temporada de gripe estacional 2017-2018. Método. Registro de los casos reportados por la red centinela PIDIRAC de la atención primaria y hospitalaria durante la temporada 2017-2018. La técnica de confirmación utilizada ha sido la PCR y/o el aislamiento viral en cultivo celular a partir de muestra respiratoria. Resultados. La tasa de incidencia acumulada de esta temporada ha sido de 2295,27 casos por 100.000 habitantes, siendo la tasa más elevada en el grupo de edad de 0-4 años (6.921,96 x 105 h.). El pico de incidencia (413,3 x 105 h.) fue la semana 3. Se registraron un total de 1.306 casos graves hospitalizados confirmados de gripe (CGHCG), de los cuales un 18% requirieron ingreso en UCI y un 13,4% fueron exitus. La media de edad de los CGHCG fue de 75,2 años (DE: 26,7 años) y el 65,5%, de mayores de 64 años. Un 70,8% no estaban vacunados; un 91,3% recibieron tratamiento antiviral, en el 84% y el 40,8% de los casos antes de 48 horas de ingreso y de inicio de síntomas, respectivamente. En el 60,3% de los casos se identificó el virus de la gripe B –linaje Yamagata– y en el 39,7%, de la gripe A –el 54,6% de A(H1N1)pdm09 y el 45,4% de A(H3N2) de los subtipados. Conclusiones. La temporada 2017-2018 ha sido una temporada de intensidad moderada-alta, con un incremento del número de CGHCG aunque la letalidad se ha mantenido a niveles similares a otras temporadas. El virus circulante predominante ha sido el virus de la gripe B –linaje Yamagata– y, en la segunda mitad de la temporada, se observó un incremento de circulación de virus A –tanto de H1N1pdm09 como de H3N2–, provocando un alargamiento de la duración de la ola epidémica.Background. The Daily Information Plan for Acute Respiratory Infections in Catalonia (PIDIRAC) encompasses the surveillance of respiratory viruses that circulate during the flu season with virological and morbidity and mortality indicators. The objective of the study is to portray the clinical, epidemiological and virological features of the 2017-2018 influenza season. Methods: The sample consists of cases reported by PIDIRAC’s sentinel network of primary and hospital care during the 2017-2018 influenza season. The confirmation technique used was PCR and/or viral isolation in cell culture from respiratory sample. Results: Cumulative incidence rate for this season was of 2,295.27 cases × 100,000 inhabitants, being the highest rate in 0-4 years (6,921.96 x 105 h.). Peak incidence (413.3 × 100,000 h) was achieved on week 3. A total of 1,298 severe confirmed influenza hospitalized cases (SCIHC) were reported, of which 18% required admission to ICU and 12.2% were exitus. The mean of age of SCIHC was 75.2 years (SD: 26.7 years), 65.5% were older than 64 years. 70.8% were not vaccinated; 91.3% received antiviral treatment, in 84% and 40.8% of cases before 48 hours of admission and of beginning of symptoms, respectively. 60.3% of the cases identified influenza virus B –Yamagata lineage– and 39.7% virus A –54.6% AH1N1pdm09 and 45.4% AH3N2 in those subtyped. Conclusions: The 2017-2018 influenza season was of moderatehigh intensity with an increase in the number of SCIHC even though mortality was at similar level as in previous seasons. The predominant virus was influenza B, lineage Yamagata and in the second half of the season an increase in the circulation of virus A –both H1N1pdm09 and H3N2– extending the duration of the epidemic wave

Vigilància epidemiològica dels casos greus hospitalitzats confirmats de grip. Xarxa sentinella PIDIRAC (Catalunya 2010-2015)

Grip; Viigilància; Epidemiologia; Antivírics; VacunaGripe; Vigilancia; Epidemiología; Antivíricos; VacunaFlu; Surveillance; Epidemiology; Antivirals; VaccineIntroducció: el Pla d’informació de les infeccions respiratòries agudes a Catalunya (PIDIRAC) va incorporar la vigilància de casos greus hospitalitzats confirmats de grip (CGHCG) l’any 2009. L’objectiu de l’estudi és descriure les característiques clíniques, epidemiològiques i virològiques dels CGHCG registrats en 12 hospitals de la xarxa sentinella durant cinc temporades gripals. Mètode: la mostra consta dels CGHCG registrats durant les temporades que van de 2010-2011 a 2014-2015. La tècnica de confirmació emprada ha estat la PCR i/o l’aïllament viral en cultiu cel·lular a partir de mostra respiratòria. Resultats: es van registrar 1.400 CGHCG, dels quals un 33% van requerir ingrés a l’UCI i un 12% van ser èxitus. La mitjana d’edat dels casos va ser de 55,2 anys (DE: 26,7 anys), amb un rang de 0-101 anys. Un 70,8% no estaven vacunats; un 87% van rebre tractament antiviral en el 80,4% i el 24% dels casos abans de 48 hores d’ingrés i d’inici de símptomes, respectivament. En el 87,7% dels casos es va identificar el virus de la grip A (37,9% A(H1N1)pdm09 i 29,3% A(H3N2)). Conclusions: la vigilància de CGHCG proporciona una estimació de la gravetat de les epidèmies estacionals de grip i permet identificar i caracteritzar grups de risc per adoptar mesures preventives (vacunació) i tractament antiviral precoç.Introducción: el Plan de información de las infecciones respiratorias agudas en Cataluña (PIDIRAC) incorporó la vigilancia de casos graves hospitalizados confirmados de gripe (CGHCG) el año 2009. El objetivo del estudio es describir las características clínicas, epidemiológicas y virológicas de los CGHCG registrados en 12 hospitales de la red centinela durante cinco temporadas gripales. Método: la muestra consta de los CGHCG registrados durante las temporadas que van de 2010-2011 a 2014-2015. La técnica de confirmación utilizada ha sido la PCR y/o el aislamiento viral en cultivo celular a partir de muestra respiratoria. Resultados: se registraron 1.400 CGHCG, de los cuales un 33% requirieron ingreso a la UCI y un 12% fueron exitus. La media de edad de los casos fue de 55,2 años (DE: 26,7 años), con un rango de 0-101 años. Un 70,8% no estaban vacunados; un 87% recibieron tratamiento antiviral, en el 80,4% y el 24% de los casos antes de 48 horas de ingreso y de inicio de síntomas, respectivamente. En el 87,7% de los casos se identificó virus de la gripe A (37,9% A(H1N1)pdm09 y 29,3% A(H3N2)). Conclusiones: la vigilancia de CGHCG proporciona una estimación de la gravedad de las epidemias estacionales de gripe y permite identificar y caracterizar grupos de riesgo para adoptar medidas preventivas (vacunación) y tratamiento antiviral precoz.Introduction: the Information Plan for Acute Respiratory Infections in Catalonia (PIDIRAC) incorporated the surveillance of severe confirmed influenza hospitalized cases (CGHCG) in 2009. The objective of the study is to portray the clinical, epidemiological and virological features of the CGHCG registered in 12 sentinel hospitals during 5 influenza seasons. Method: the sample consists of the CGHCG registered during 2010-2011 to 2014-2015 influenza seasons. The confirmation technique used was PCR and/or viral isolation in cell culture from respiratory sample. Results: 1400 CGHCG were registered, of which 33% required admission to ICU and 12% were exitus. The mean age of cases was 55.2 years (SD: 26.7 years), range of 0-101 years. 70.8% were not vaccinated; 87% received antiviral treatment, in 80.4% and 24% of the cases before 48 hours of admission and of beginning of symptoms, respectively. 87,7% of the cases identified influenza virus A (37,9% AH1N1pdm09, 29,3% AH3N2). Conclusions: surveillance of CGHCG provides an estimation of the severity of seasonal influenza epidemics allows to identify and characterize at-risk groups to adopt preventive measures (vaccination) and early antiviral treatment

The imperative for quality control programs in Monkeypox virus DNA testing by PCR: CIBERINFEC quality control

© 2023 The Authors. Journal of Medical Virology published by Wiley Periodicals LLC. This is an open access article under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs License, which permits use and distribution in any medium, provided the original work is properly cited, the use is non-commercial and no modifications or adaptations are made.To evaluate molecular assays for Mpox diagnosis available in various clinical microbiology services in Spain through a quality control (QC) approach. A total of 14 centers from across Spain participated in the study. The Reference Laboratory dispatched eight serum samples and eight nucleic acid extracts to each participating center. Some samples were spiked with Mpox or Vaccinia virus to mimic positive samples for Mpox or other orthopox viruses. Participating centers provided information on the results obtained, as well as the laboratory methods used. Among the 14 participating centers seven different commercial assays were employed, with the most commonly used kit being LightMix Modular Orthopox/Monkeypox (Mpox) Virus (Roche®). Of the 12 centers conducting Mpox determinations, concordance ranged from 62.5% (n = 1) to 100% (n = 11) for eluates and from 75.0% (n = 1) to 100% (n = 10) for serum. Among the 10 centers performing Orthopoxvirus determinations, a 100% concordance was observed for eluates, while for serum, concordance ranged from 87.5% (n = 6) to 100% (n = 4). Repeatedly, 6 different centers reported a false negative in serum samples for Orthopoxvirus diagnosis, particularly in a sample with borderline Ct = 39. Conversely, one center, using the TaqMan™ Mpox Virus Microbe Detection Assay (Thermo Fisher), reported false positives in Mpox diagnosis for samples spiked with vaccinia virus due to cross-reactions. We observed a positive correlation of various diagnostic assays for Mpox used by the participating centers with the reference values. Our results highlight the significance of standardization, validation, and ongoing QC in the microbiological diagnosis of infectious diseases, which might be particularly relevant for emerging viruses.This research was supported by CIBER (Strategic Action for Monkeypox)—Consorcio Centro de Investigación Biomédica en Red—(CB 2021), Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación and Unión Europea—NextGenerationEU. A. d. S. is supported by ‘Instituto de Salud Carlos III’ (grant number JR22/00055).Peer reviewe

Balanç de la temporada gripal 2017-2018 a Catalunya

Grip estacional; Virus respiratoris; EpidèmiesSeasonal flu; Respiratory viruses; EpidemicsGripe estacional; Virus respiratorios; EpidemiasIntroducció. El Pla d’informació Diària de les infeccions respiratòries agudes a Catalunya (PIDIRAC) engloba la vigilància dels virus respiratoris que circulen durant la temporada de grip estacional amb indicadors virològics i de morbimortalitat. L’objectiu de l’estudi és descriure les característiques clíniques, epidemiològiques i virològiques de la temporada de grip estacional 2017-2018. Mètode. La mostra consta dels casos reportats per la xarxa sentinella PIDIRAC de l’atenció primària i hospitalària durant la temporada 2017-2018. La tècnica de confirmació emprada ha estat la PCR i/o l’aïllament viral en cultiu cel·lular a partir de mostra respiratòria. Resultats. La taxa d’incidència acumulada d’aquesta temporada ha estat de 2295,27 casos per 100.000 habitants, i la taxa més elevada s’ha localitzat en el grup d’edat de 0-4 anys (6.921,96 x 105 h.). El pic d’incidència de 413,3 per 100.000 habitants es va donar la setmana 3. Es van registrar un total de 1.306 casos greus hospitalitzats confirmats de grip (CGHCG), dels quals un 17,9% van requerir ingrés a l’UCI i un 13,4% van ser exitus. La mitjana d’edat dels CGHCG va ser de 75,2 anys (DE: 26,7 anys) i el 65,5%, de majors de 64 anys. Un 70,8% no estaven vacunats; un 91,3% van rebre tractament antiviral. Pel que fa a l’inici del tractament, en el 84% dels casos es va iniciar abans de 48 hores de l’ingrés hospitalari i en el 40,8% dels casos, abans de 48 hores posteriors a l’inici de símptomes, respectivament. En el 60,3% dels casos es va identificar virus de la grip B –llinatge Yamagata– i en el 39,7%, de la grip A –el 54,6% d’A(H1N1)pdm09 i el 45,4% d’A(H3N2) dels subtipats. Conclusions. La temporada 2017-2018 ha estat una temporada d’intensitat moderada-alta, amb un increment del nombre de CGHCG malgrat que la letalitat s’ha mantingut a nivells similars a altres temporades. El virus circulant predominant ha estat el virus de la grip B –llinatge Yamagata– i, en la segona meitat de la temporada, s’ha observat un increment de circulació de virus A –tant d’H1N1pdm09 com d’H3N2–, que ha provocat un allargament de la durada de l’onada epidèmica.Introducción. El Plan de información Diaria de las infecciones respiratorias agudas en Cataluña (PIDIRAC) engloba la vigilancia de los virus respiratorios que circulan durante la temporada de gripe estacional con indicadores virológicos y de morbimortalidad. El objetivo del estudio es describir las características clínicas, epidemiológicas y virológicas de la temporada de gripe estacional 2017-2018. Método. Registro de los casos reportados por la red centinela PIDIRAC de la atención primaria y hospitalaria durante la temporada 2017-2018. La técnica de confirmación utilizada ha sido la PCR y/o el aislamiento viral en cultivo celular a partir de muestra respiratoria. Resultados. La tasa de incidencia acumulada de esta temporada ha sido de 2295,27 casos por 100.000 habitantes, siendo la tasa más elevada en el grupo de edad de 0-4 años (6.921,96 x 105 h.). El pico de incidencia (413,3 x 105 h.) fue la semana 3. Se registraron un total de 1.306 casos graves hospitalizados confirmados de gripe (CGHCG), de los cuales un 18% requirieron ingreso en UCI y un 13,4% fueron exitus. La media de edad de los CGHCG fue de 75,2 años (DE: 26,7 años) y el 65,5%, de mayores de 64 años. Un 70,8% no estaban vacunados; un 91,3% recibieron tratamiento antiviral, en el 84% y el 40,8% de los casos antes de 48 horas de ingreso y de inicio de síntomas, respectivamente. En el 60,3% de los casos se identificó el virus de la gripe B –linaje Yamagata– y en el 39,7%, de la gripe A –el 54,6% de A(H1N1)pdm09 y el 45,4% de A(H3N2) de los subtipados. Conclusiones. La temporada 2017-2018 ha sido una temporada de intensidad moderada-alta, con un incremento del número de CGHCG aunque la letalidad se ha mantenido a niveles similares a otras temporadas. El virus circulante predominante ha sido el virus de la gripe B –linaje Yamagata– y, en la segunda mitad de la temporada, se observó un incremento de circulación de virus A –tanto de H1N1pdm09 como de H3N2–, provocando un alargamiento de la duración de la ola epidémica.Background. The Daily Information Plan for Acute Respiratory Infections in Catalonia (PIDIRAC) encompasses the surveillance of respiratory viruses that circulate during the flu season with virological and morbidity and mortality indicators. The objective of the study is to portray the clinical, epidemiological and virological features of the 2017-2018 influenza season. Methods: The sample consists of cases reported by PIDIRAC’s sentinel network of primary and hospital care during the 2017-2018 influenza season. The confirmation technique used was PCR and/or viral isolation in cell culture from respiratory sample. Results: Cumulative incidence rate for this season was of 2,295.27 cases × 100,000 inhabitants, being the highest rate in 0-4 years (6,921.96 x 105 h.). Peak incidence (413.3 × 100,000 h) was achieved on week 3. A total of 1,298 severe confirmed influenza hospitalized cases (SCIHC) were reported, of which 18% required admission to ICU and 12.2% were exitus. The mean of age of SCIHC was 75.2 years (SD: 26.7 years), 65.5% were older than 64 years. 70.8% were not vaccinated; 91.3% received antiviral treatment, in 84% and 40.8% of cases before 48 hours of admission and of beginning of symptoms, respectively. 60.3% of the cases identified influenza virus B –Yamagata lineage– and 39.7% virus A –54.6% AH1N1pdm09 and 45.4% AH3N2 in those subtyped. Conclusions: The 2017-2018 influenza season was of moderatehigh intensity with an increase in the number of SCIHC even though mortality was at similar level as in previous seasons. The predominant virus was influenza B, lineage Yamagata and in the second half of the season an increase in the circulation of virus A –both H1N1pdm09 and H3N2– extending the duration of the epidemic wave

Vigilància epidemiològica dels casos greus hospitalitzats confirmats de grip. Xarxa sentinella PIDIRAC (Catalunya 2010-2015)

Grip; Viigilància; Epidemiologia; Antivírics; VacunaGripe; Vigilancia; Epidemiología; Antivíricos; VacunaFlu; Surveillance; Epidemiology; Antivirals; VaccineIntroducció: el Pla d’informació de les infeccions respiratòries agudes a Catalunya (PIDIRAC) va incorporar la vigilància de casos greus hospitalitzats confirmats de grip (CGHCG) l’any 2009. L’objectiu de l’estudi és descriure les característiques clíniques, epidemiològiques i virològiques dels CGHCG registrats en 12 hospitals de la xarxa sentinella durant cinc temporades gripals. Mètode: la mostra consta dels CGHCG registrats durant les temporades que van de 2010-2011 a 2014-2015. La tècnica de confirmació emprada ha estat la PCR i/o l’aïllament viral en cultiu cel·lular a partir de mostra respiratòria. Resultats: es van registrar 1.400 CGHCG, dels quals un 33% van requerir ingrés a l’UCI i un 12% van ser èxitus. La mitjana d’edat dels casos va ser de 55,2 anys (DE: 26,7 anys), amb un rang de 0-101 anys. Un 70,8% no estaven vacunats; un 87% van rebre tractament antiviral en el 80,4% i el 24% dels casos abans de 48 hores d’ingrés i d’inici de símptomes, respectivament. En el 87,7% dels casos es va identificar el virus de la grip A (37,9% A(H1N1)pdm09 i 29,3% A(H3N2)). Conclusions: la vigilància de CGHCG proporciona una estimació de la gravetat de les epidèmies estacionals de grip i permet identificar i caracteritzar grups de risc per adoptar mesures preventives (vacunació) i tractament antiviral precoç.Introducción: el Plan de información de las infecciones respiratorias agudas en Cataluña (PIDIRAC) incorporó la vigilancia de casos graves hospitalizados confirmados de gripe (CGHCG) el año 2009. El objetivo del estudio es describir las características clínicas, epidemiológicas y virológicas de los CGHCG registrados en 12 hospitales de la red centinela durante cinco temporadas gripales. Método: la muestra consta de los CGHCG registrados durante las temporadas que van de 2010-2011 a 2014-2015. La técnica de confirmación utilizada ha sido la PCR y/o el aislamiento viral en cultivo celular a partir de muestra respiratoria. Resultados: se registraron 1.400 CGHCG, de los cuales un 33% requirieron ingreso a la UCI y un 12% fueron exitus. La media de edad de los casos fue de 55,2 años (DE: 26,7 años), con un rango de 0-101 años. Un 70,8% no estaban vacunados; un 87% recibieron tratamiento antiviral, en el 80,4% y el 24% de los casos antes de 48 horas de ingreso y de inicio de síntomas, respectivamente. En el 87,7% de los casos se identificó virus de la gripe A (37,9% A(H1N1)pdm09 y 29,3% A(H3N2)). Conclusiones: la vigilancia de CGHCG proporciona una estimación de la gravedad de las epidemias estacionales de gripe y permite identificar y caracterizar grupos de riesgo para adoptar medidas preventivas (vacunación) y tratamiento antiviral precoz.Introduction: the Information Plan for Acute Respiratory Infections in Catalonia (PIDIRAC) incorporated the surveillance of severe confirmed influenza hospitalized cases (CGHCG) in 2009. The objective of the study is to portray the clinical, epidemiological and virological features of the CGHCG registered in 12 sentinel hospitals during 5 influenza seasons. Method: the sample consists of the CGHCG registered during 2010-2011 to 2014-2015 influenza seasons. The confirmation technique used was PCR and/or viral isolation in cell culture from respiratory sample. Results: 1400 CGHCG were registered, of which 33% required admission to ICU and 12% were exitus. The mean age of cases was 55.2 years (SD: 26.7 years), range of 0-101 years. 70.8% were not vaccinated; 87% received antiviral treatment, in 80.4% and 24% of the cases before 48 hours of admission and of beginning of symptoms, respectively. 87,7% of the cases identified influenza virus A (37,9% AH1N1pdm09, 29,3% AH3N2). Conclusions: surveillance of CGHCG provides an estimation of the severity of seasonal influenza epidemics allows to identify and characterize at-risk groups to adopt preventive measures (vaccination) and early antiviral treatment

A European multicentre evaluation of detection and typing methods for human enteroviruses and parechoviruses using RNA transcripts

Altres ajuts: The work in Oxford was funded in part by a Wellcome ISSF grant (ISSF204826/Z/16/Z). [...] financial support was provided by CIBEResp, Instituto de Salud Carlos III, Spain.Polymerase chain reaction (PCR) detection has become the gold standard for diagnosis and typing of enterovirus (EV) and human parechovirus (HPeV) infections. Its effectiveness depends critically on using the appropriate sample types and high assay sensitivity as viral loads in cerebrospinal fluid samples from meningitis and sepsis clinical presentation can be extremely low. This study evaluated the sensitivity and specificity of currently used commercial and in-house diagnostic and typing assays. Accurately quantified RNA transcript controls were distributed to 27 diagnostic and 12 reference laboratories in 17 European countries for blinded testing. Transcripts represented the four human EV species (EV-A71, echovirus 30, coxsackie A virus 21, and EV-D68), HPeV3, and specificity controls. Reported results from 48 in-house and 15 commercial assays showed 98% detection frequencies of high copy (1000 RNA copies/5 µL) transcripts. In-house assays showed significantly greater detection frequencies of the low copy (10 copies/5 µL) EV and HPeV transcripts (81% and 86%, respectively) compared with commercial assays (56%, 50%; P = 7 × 10 −5). EV-specific PCRs showed low cross-reactivity with human rhinovirus C (3 of 42 tests) and infrequent positivity in the negative control (2 of 63 tests). Most or all high copy EV and HPeV controls were successfully typed (88%, 100%) by reference laboratories, but showed reduced effectiveness for low copy controls (41%, 67%). Stabilized RNA transcripts provide an effective, logistically simple and inexpensive reagent for evaluation of diagnostic assay performance. The study provides reassurance of the performance of the many in-house assay formats used across Europe. However, it identified often substantially reduced sensitivities of commercial assays often used as point-of-care tests

Behavior of hospitalized severe influenza cases according to the outcome variable in Catalonia, Spain, during the 2017-2018 season

Altres ajuts: Programme of Prevention, Surveillance and Control of Transmissible Diseases (PREVICET); CIBER de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP).Influenza is an important cause of severe illness and death among patients with underlying medical conditions and in the elderly. The aim of this study was to investigate factors associated with ICU admission and death in patients hospitalized with severe laboratory-confirmed influenza during the 2017-2018 season in Catalonia. An observational epidemiological case-to-case study was carried out. Reported cases of severe laboratory-confirmed influenza requiring hospitalization in 2017-2018 influenza season were included. Mixed-effects regression analysis was used to estimate the factors associated with ICU admission and death. A total of 1306 cases of hospitalized severe influenza cases were included, of whom 175 (13.4%) died and 217 (16.6%) were ICU admitted. Age 65-74 years and ≥ 75 years and having ≥ 2 comorbidities were positively associated with death (aOR 3.19; 95%CI 1.19-8.50, aOR 6.95, 95%CI 2.76-1.80 and aOR 1.99; 95%CI 1.12-3.52, respectively). Neuraminidase inhibitor treatment and pneumonia were negatively associated with death. The 65-74 years and ≥ 75 years age groups were negatively associated with ICU admission (aOR 0.41; 95%CI 0.23-0.74 and aOR 0.30; 95%CI 0.17-0.53, respectively). A factor positively associated with ICU admission was neuraminidase inhibitor treatment. Our results support the need to investigate the worst outcomes of hospitalized severe cases, distinguishing between death and ICU admission