Better wheat germplasm for good seasons and high inputs

Take home messages New wheat germplasm has been identified that lodges less than Australian cultivars EGA Gregory , Suntop and LRPB Spitfire. From the favourable genetic markers identified in the new germplasm, only a proportion was present in a database of 502 Australian varieties, suggesting that there is room for improving lodging tolerance in high yielding wheats

Comparing the first and the second waves of COVID-19 in Italy: differences in epidemiological features and CT findings using a semi-quantitative score

Purpose: CT findings of hospitalized COVID-19 patients were analyzed during both the first and the second waves of the pandemic, in order to detect any significant differences between the two groups. Methods: In this observational, retrospective, monocentric study, all hospitalized patients who underwent CT for suspected COVID-19 pneumonia from February 27 to March 27, 2020 (first wave) and from October 26 to November 24, 2020 (second wave) were enrolled. Epidemiological data, radiological pattern according to the RSNA consensus statement and visual score extension using a semi-quantitative score were compared. Results: Two hundred and eleven patients (mean age, 64.52 years ± 15.14, 144 males) were evaluated during the first wave while 455 patients (mean age, 68.26 years ± 16.34, 283 males) were studied during the second wave. The same prevalence of patterns was documented in both the first and the second waves (p = 0.916), with non-typical patterns always more frequently observed in elderly patients, especially the “indeterminate” pattern. Compared to those infected during the first wave, the patients of the second wave were older (64.52 vs.68.26, p = 0.005) and presented a slightly higher mean semi-quantitative score (9.0 ± 2.88 vs. 8.4 ± 3.06, p = 0.042). Age and semi-quantitative score showed a positive correlation (r = 0.15, p = 0.001). Conclusions: There was no difference regarding CT pattern prevalence between the first and the second waves, confirming both the validity of the RSNA consensus and the most frequent radiological COVID-19 features. Non-typical COVID-19 features were more frequently observed in older patients, thus should not be underestimated in the elderly population

Better wheat germplasm for good seasons and high inputs

Take home messages New wheat germplasm has been identified that lodges less than Australian cultivars EGA Gregory , Suntop and LRPB Spitfire. From the favourable genetic markers identified in the new germplasm, only a proportion was present in a database of 502 Australian varieties, suggesting that there is room for improving lodging tolerance in high yielding wheats

Multi-donor × elite-based populations reveal QTL for low-lodging wheat

Low-lodging high-yielding wheat germplasm and SNP-tagged novel alleles for lodging were identified in a process that involved selecting donors through functional phenotyping for underlying traits with a designed phenotypic screen, and a crossing strategy involving multiple-donor × elite populations

Computerized tomography texture analysis of pheochromocytoma: relationship with hormonal and histopathological data

Objectives Pheochromocytomas are rare tumors which can present with heterogeneous secretion profiles, clinical manifestations, and radiologic appearance. Under a histopathological point of view, they can be characterized as more or less aggressive with the Pheochromocytoma of the Adrenal gland Scaled Score (PASS) and the Grading system for Adrenal Pheochromocytoma and Paraganglioma (GAPP) score. The aim of this study is to analyze the texture analysis characteristics of pheochromocytoma and identify whether the texture analysis can yield information aiding in the diagnosis and the characterization of those tumors. Methods Radiological, biochemical, and histopathological data regarding 30 consecutive patients with histologically confirmed pheochromocytoma were analyzed. Images obtained in the unenhanced, late arterial, venous, and delayed phases were used for the texture analysis. Results Urinary epinephrine and metanephrine levels showed a significant correlation (R-2 = 0.946; R-2 = 699) in the multivariate linear model with texture features, as well as Ki-67 (R-2 = 0.397), PASS score (R-2 = 0.182), GAPP score (R-2 = 0.705), and cellularity showed a significant correlation (R-2 = 0.389). The cluster analysis based on radiomic features resulted in 2 clusters, with significative differences in terms of systolic and diastolic blood pressure values at the time of diagnosis (p = 0.025), GAPP score (4 vs 6, p = 0.05), histological pattern (1-2, p = 0.039), and comedonecrosis (0% vs 50%, p = 0.013). Conclusion In conclusion, our study provides the proof of concept for the use of texture analysis on contrast-enhanced CT images as a noninvasive, quantitative tool for helping in the characterization of the clinical, biochemical, and histopathological features of pheochromocytoma

Transverse prostate maximum sectional area can predict clinically significant prostate cancer in PI-RADS 3 lesions at multiparametric magnetic resonance imaging

BackgroundTo evaluate multiparametric magnetic resonance imaging (mpMRI) parameters, such as TransPA (transverse prostate maximum sectional area), TransCGA (transverse central gland sectional area), TransPZA (transverse peripheral zone sectional area), and TransPAI (TransPZA/TransCGA ratio) in predicting prostate cancer (PCa) in prostate imaging reporting and data system (PI-RADS) 3 lesions. MethodsSensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV), the area under the receiver operating characteristic curve (AUC), and the best cut-off, were calculated. Univariate and multivariate analyses were carried out to evaluate the capability to predict PCa. ResultsOut of 120 PI-RADS 3 lesions, 54 (45.0%) were PCa with 34 (28.3%) csPCas. Median TransPA, TransCGA, TransPZA and TransPAI were 15.4cm(2), 9.1cm(2), 5.5cm(2) and 0.57, respectively. At multivariate analysis, location in the transition zone (OR=7.92, 95% CI: 2.70-23.29, P<0.001) and TransPA (OR=0.83, 95% CI: 0.76-0.92, P<0.001) were independent predictors of PCa. The TransPA (OR=0.90, 95% CI: 0.082-0.99, P=0.022) was an independent predictor of csPCa. The best cut-off of TransPA for csPCa was 18 (Sensitivity 88.2%, Specificity 37.2%, PPV 35.7%, NPV 88.9%). The discrimination (AUC) of the multivariate model was 0.627 (95% CI: 0.519-0.734, P<0.031). ConclusionsIn PI-RADS 3 lesions, the TransPA could be useful in selecting patients requiring biopsy

Aptitud Combinatoria de líneas endocriadas (S3) de maíces forrajeros con introgresión de Zea diploperennis litis, Ooebley y Guzmán para la producción de biomasa aérea

The evaluation of inbred lines within a program of hybrid maize requires not only the determination of lines production per-se but also that of the average behaviour of their hybrid combinations (General Combining Aptitude) and their capacity to produce higher hybrid combinations among them (Specific Combining Aptitude). The aim of this work was the analysis of the General Combining Aptitude (GCA) of eleven forage maize inbred lines derived from the original crossing between Zea mays L. x Zea diploperennis Iitis, Doebley and Guzman, and the Specific Combining Aptitude (SCA) of the progeny of a pimple and direct diallelic among them. The total aerial plant forage mass and their morphological components are evaluated in comparison with a commercial hybrid. The GCA/SCA rate was high for all the production characters evaluated, showing low dominance effect or over-dominance, maybe due to a slight difference among lines. GCA was found to be significant for the production of leaves -line 4 (LE 785) presented the highest values and was also favoured with the GCA highest values for stem and whole plant. Line 2 (LE 769) GCA was found satisfactory for corncob production. The crossing (2 x 4) showed good behaviour in the production of forage and since this is due to the genetic contribution of their progeny lines, it would be interesting to begin a recurrent selection program, starting with the first segregating generation of this crossing, trying a favourable gene recombination of the forage mass.La evaluación de líneas endocriadas en un programa de maíces híbridos requiere no sólo determinar la producción perse de las mismas, sino también el comportamiento promedio de sus combinaciones híbridas (Aptitud Combinatoria General) y la capacidad de producir combinaciones híbridas superiores al cruzarse entre sí (Aptitud Combinatoria Específica). El objetivo de este trabajo fue analizar la Aptitud Combinatoria General (ACG) de once líneas endocriadas de maíces forrajeros derivados de la cruza original entre Zea mays L. x Zea dipioperennis litis, Doebley y Guzman y la Aptitud Combinatoria Específica (ACE) de la progenie de un dialélico simple directo entre ellas. Se evaluó la biomasa aérea total de la planta y sus componentes morfológicos en comparación con un híbrido comercial. La proporción de ACG/ACE fue alta en todos los caracteres de producción evaluados indicando poco efecto de dominancia o sobredominancia, quizás producto de una escasa divergencia entre las líneas. Sólo se encontró ACG significativa para la producción de hojas. Sobresale en tal sentido la línea 4 (LE 785) que también presentó los mayores valores en la producción de tallo y planta entera. La línea 2 (LE 769) se destacó por su ACG en la producción de mazorca. La cruza (2 x 4) tuvo buen comportamiento en la producción de forraje y teniendo en cuenta que se debe a la transmisión de los genes de sus líneas progenitoras sería interesante iniciar un programa de selección recurrente a partir de la primera generación segregante de esa cruza, intentando una recombinación génica favorable en la producción de biomasa

Cytological analysis of hybrids among triticales and trigopiros

We studied three different tricepiros: (Don Santiago x Don Noé), (Cumé x Horovitz) and (Cumé x Don Noé). The tricepiro (Don Santiago x Don Noé) was obtained by crossing the triticale Don Santiago INTA (AABBRR, 2n = 6x = 42) with the trigopiro Don Noé INTA (AABBDDJJ, 2n = 8x = 56). The number of chromosomes for the F1 was 2n = 49, the most frequent meiotic configuration being 14 bivalents and 21 univalents. The univalents were situated in the periphery of the equatorial plane, whereas the bivalents were located in the central zone. The chromatids in some of the univalents split when bivalents underwent reductional division in anaphase I. There were few laggard chromosomes or chromatids at this phase. The number of chromosomes (2n = 48-58) was high and variable, and the number of bivalents per cell (18-23) also high in F 3 individuals. In all F 8 tricepiros (Don Santiago x Don Noé), F 12 tricepiros (Cumé x Horovitz) and F 12 tricepiros (Cumé x Don Noé), the number of chromosomes (2n = 42) was the same, these retaining the rye genome, as demonstrated by GISH and FISH. These new synthesized allopolyploids constitute interesting models for investigating the evolutionary changes responsible for diploidization, and the chromosomal and genomic re-ordering that cannot be revealed in natural allopolyploids

XLVIII Coloquio Argentino de Estadística. VI Jornada de Educación Estadística Martha Aliaga Modalidad virtual

Esta publicación es una compilación de las actividades realizadas en el marco del XLVIII Coloquio Argentino de Estadística y la VI Jornada de Educación Estadística Martha Aliaga organizada por la Sociedad Argentina de Estadística y la Facultad de Ciencias Económicas. Se presenta un resumen para cada uno de los talleres, cursos realizados, ponencias y poster presentados. Para los dos últimos se dispone de un hipervínculo que direcciona a la presentación del trabajo. Ellos obedecen a distintas temáticas de la estadística con una sesión especial destinada a la aplicación de modelos y análisis de datos sobre COVID-19.Fil: Saino, Martín. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Stimolo, María Inés. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Ortiz, Pablo. Universidad Nacional de córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Guardiola, Mariana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Aguirre, Alberto Frank Lázaro. Universidade Federal de Alfenas. Departamento de Estatística. Instituto de Ciências Exatas; Brasil.Fil: Alves Nogueira, Denismar. Universidade Federal de Alfenas. Departamento de Estatística. Instituto de Ciências Exatas; Brasil.Fil: Beijo, Luiz Alberto. Universidade Federal de Alfenas. Departamento de Estatística. Instituto de Ciências Exatas; Brasil.Fil: Solis, Juan Manuel. Universidad Nacional de Jujuy. Centro de Estudios en Bioestadística, Bioinformática y Agromática; Argentina.Fil: Alabar, Fabio. Universidad Nacional de Jujuy. Centro de Estudios en Bioestadística, Bioinformática y Agromática; Argentina.Fil: Ruiz, Sebastián León. Universidad Nacional de Jujuy. Centro de Estudios en Bioestadística, Bioinformática y Agromática; Argentina.Fil: Hurtado, Rafael. Universidad Nacional de Jujuy; Argentina.Fil: Alegría Jiménez, Alfredo. Universidad Técnica Federico Santa María. Departamento de Matemática; Chile.Fil: Emery, Xavier. Universidad de Chile. Departamento de Ingeniería en Minas; Chile.Fil: Emery, Xavier. Universidad de Chile. Advanced Mining Technology Center; Chile.Fil: Álvarez-Vaz, Ramón. Universidad de la República. Instituto de Estadística. Departamento de Métodos Cuantitativos; Uruguay.Fil: Massa, Fernando. Universidad de la República. Instituto de Estadística. Departamento de Métodos Cuantitativos; Uruguay.Fil: Vernazza, Elena. Universidad de la República. Facultad de Ciencias Económicas y de Administración. Instituto de Estadística; Uruguay.Fil: Lezcano, Mikaela. Universidad de la República. Facultad de Ciencias Económicas y de Administración. Instituto de Estadística; Uruguay.Fil: Urruticoechea, Alar. Universidad Católica del Uruguay. Facultad de Ciencias de la Salud. Departamento de Neurocognición; Uruguay.Fil: del Callejo Canal, Diana. Universidad Veracruzana. Instituto de Investigación de Estudios Superiores, Económicos y Sociales; México.Fil: Canal Martínez, Margarita. Universidad Veracruzana. Instituto de Investigación de Estudios Superiores, Económicos y Sociales; México.Fil: Ruggia, Ornela. CONICET; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de desarrollo rural; Argentina.Fil: Tolosa, Leticia Eva. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. Universidad Católica de Córdoba; Argentina.Fil: Rojo, María Paula. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina.Fil: Nicolas, María Claudia. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. Universidad Católica de Córdoba; Argentina.Fil: Barbaroy, Tomás. Universidad Nacional de Córdoba; Argentina.Fil: Villarreal, Fernanda. CONICET, Universidad Nacional del Sur. Instituto de Matemática de Bahía Blanca (INMABB); Argentina.Fil: Pisani, María Virginia. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Quintana, Alicia. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Elorza, María Eugenia. CONICET. Universidad Nacional del Sur. Instituto de Investigaciones Económicas y Sociales del Sur; Argentina.Fil: Peretti, Gianluca. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Buzzi, Sergio Martín. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Estadística y Matemática; Argentina.Fil: Settecase, Eugenia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadísticas. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas en Estadística; Argentina.Fil: Settecase, Eugenia. Department of Agriculture and Fisheries. Leslie Research Facility; Australia.Fil: Paccapelo, María Valeria. Department of Agriculture and Fisheries. Leslie Research Facility; Australia.Fil: Cuesta, Cristina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadísticas. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas en Estadística; Argentina.Fil: Saenz, José Luis. Universidad Nacional de la Patagonia Austral; Argentina.Fil: Luna, Silvia. Universidad Nacional de la Patagonia Austral; Argentina.Fil: Paredes, Paula. Universidad Nacional de la Patagonia Austral; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Estación Experimental Agropecuaria Santa Cruz; Argentina.Fil: Maglione, Dora. Universidad Nacional de la Patagonia Austral; Argentina.Fil: Rosas, Juan E. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA); Uruguay.Fil: Pérez de Vida, Fernando. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA); Uruguay.Fil: Marella, Muzio. Sociedad Anónima Molinos Arroceros Nacionales (SAMAN); Uruguay.Fil: Berberian, Natalia. Universidad de la República. Facultad de Agronomía; Uruguay.Fil: Ponce, Daniela. Universidad Estadual Paulista. Facultad de Medicina; Brasil.Fil: Silveira, Liciana Vaz de A. Universidad Estadual Paulista; Brasil.Fil: Freitas Galletti, Agda Jessica de. Universidad Estadual Paulista; Brasil.Fil: Bellassai, Juan Carlos. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigación y Estudios de Matemáticas (CIEM-Conicet); Argentina.Fil: Pappaterra, María Lucía. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigación y Estudios de Matemáticas (CIEM-Conicet); Argentina.Fil: Ojeda, Silvia María. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía, Física y Computación; Argentina.Fil: Ascua, Melina Belén. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Roldán, Dana Agustina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Rodi, Ayrton Luis. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Ventre, Giuliana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: González, Agustina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Físico-Químicas y Naturales. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Palacio, Gabriela. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Físico-Químicas y Naturales. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Bigolin, Sabina. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Físico-Químicas y Naturales. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Ferrero, Susana. Universidad Nacional de Rio Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Físico-Químicas y Naturales. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Del Medico, Ana Paula. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario (IICAR); Argentina.Fil: Pratta, Guillermo. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario (IICAR); Argentina.Fil: Tenaglia, Gerardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Instituto de Investigación y Desarrollo Tecnológico para la Agricultura Familiar; Argentina.Fil: Lavalle, Andrea. Universidad Nacional del Comahue. Departamento de Estadística; Argentina.Fil: Demaio, Alejo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Hernández, Paz. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Di Palma, Fabricio. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Calizaya, Pablo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Avalis, Francisca. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Caro, Norma Patricia. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Caro, Norma Patricia. Universidad Nacional de Córdoba. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Fernícola, Marcela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina.Fil: Nuñez, Myriam. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina.Fil: Dundray, , Fabián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina.Fil: Calviño, Amalia. Universidad de Buenos Aires. Instituto de Química y Metabolismo del Fármaco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Farfán Machaca, Yheni. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco. Departamento Académico de Matemáticas y Estadística; Argentina.Fil: Paucar, Guillermo. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco. Departamento Académico de Matemáticas y Estadística; Argentina.Fil: Coaquira, Frida. Universidad Nacional de San Antonio Abad del Cusco. Escuela de posgrado UNSAAC; Argentina.Fil: Ferreri, Noemí M. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Pascaner, Melina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Martinez, Facundo. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Bossolasco, María Luisa. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo; Argentina.Fil: Bortolotto, Eugenia B. Universidad Nacional de Rosario. Centro de Estudios Fotosintéticos y Bioquímicos (CEFOBI); Argentina.Fil: Bortolotto, Eugenia B. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Faviere, Gabriela S. Universidad Nacional de Rosario. Centro de Estudios Fotosintéticos y Bioquímicos (CEFOBI); Argentina.Fil: Faviere, Gabriela S. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Angelini, Julia. Universidad Nacional de Rosario. Centro de Estudios Fotosintéticos y Bioquímicos (CEFOBI); Argentina.Fil: Angelini, Julia. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Cervigni, Gerardo. Universidad Nacional de Rosario. Centro de Estudios Fotosintéticos y Bioquímicos (CEFOBI); Argentina.Fil: Cervigni, Gerardo. Universidad Nacional de Rosario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Valentini, Gabriel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Estación Experimental Agropecuaria INTA San Pedro; Argentina.Fil: Chiapella, Luciana C.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina.Fil: Chiapella, Luciana C. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.Fil: Grendas, Leandro. Universidad Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Farmacología; Argentina.Fil: Daray, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); Argentina.Fil: Daray, Federico. Universidad Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Farmacología; Argentina.Fil: Leal, Danilo. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ingeniería; Chile.Fil: Nicolis, Orietta. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ingeniería; Chile.Fil: Bonadies, María Eugenia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina.Fil: Ponteville, Christiane. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina.Fil: Catalano, Mara. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Catalano, Mara. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Dillon, Justina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Carnevali, Graciela H. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura; Argentina.Fil: Justo, Claudio Eduardo. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Agrimensura. Grupo de Aplicaciones Matemáticas y Estadísticas (UIDET); Argentina.Fil: Iglesias, Maximiliano. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Estadística y Demografía; Argentina.Fil: Gómez, Pablo Sebastián. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Sociales. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.Fil: Real, Ariel Hernán. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: Vargas, Silvia Lorena. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: López Calcagno, Yanil. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: Batto, Mabel. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: Sampaolesi, Edgardo. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: Tealdi, Juan Manuel. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Buzzi, Sergio Martín. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Estadística y Matemática; Argentina.Fil: García Bazán, Gaspar. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Monroy Caicedo, Xiomara Alejandra. Universidad Nacional de Rosario; Argentina.Fil: Bermúdez Rubio, Dagoberto. Universidad Santo Tomás. Facultad de Estadística; Colombia.Fil: Ricci, Lila. Universidad Nacional de Mar del Plata. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Centro Marplatense de Investigaciones Matemáticas; Argentina.Fil: Kelmansky, Diana Mabel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina.Fil: Rapelli, Cecilia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Escuela de Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: García, María del Carmen. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Escuela de Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Bussi, Javier. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Méndez, Fernanda. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística (IITAE); Argentina.Fil: García Mata, Luis Ángel. Universidad Nacional Autónoma de México. Facultad de Estudios Superiores Acatlán; México.Fil: Ramírez González, Marco Antonio. Universidad Nacional Autónoma de México. Facultad de Estudios Superiores Acatlán; México.Fil: Rossi, Laura. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Vicente, Gonzalo. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina. Universidad Pública de Navarra. Departamento de Estadística, Informática y Matemáticas; España.Fil: Scavino, Marco. Universidad de la República. Facultad de Ciencias Económicas y de Administración. Instituto de Estadística; Uruguay.Fil: Estragó, Virginia. Presidencia de la República. Comisión Honoraria para la Salud Cardiovascular; Uruguay.Fil: Muñoz, Matías. Presidencia de la República. Comisión Honoraria para la Salud Cardiovascular; Uruguay.Fil: Castrillejo, Andrés. Universidad de la República. Facultad de Ciencias Económicas y de Administración. Instituto de Estadística; Uruguay.Fil: Da Rocha, Naila Camila. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho- UNESP. Departamento de Bioestadística; BrasilFil: Macola Pacheco Barbosa, Abner. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho- UNESP; Brasil.Fil: Corrente, José Eduardo. Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho – UNESP. Instituto de Biociencias. Departamento de Bioestadística; Brasil.Fil: Spataro, Javier. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Economía; Argentina.Fil: Salvatierra, Luca Mauricio. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Nahas, Estefanía. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Márquez, Viviana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Boggio, Gabriela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Arnesi, Nora. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Harvey, Guillermina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Settecase, Eugenia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Instituto de Investigaciones Teóricas y Aplicadas de la Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Wojdyla, Daniel. Duke University. Duke Clinical Research Institute; Estados Unidos.Fil: Blasco, Manuel. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Economía y Finanzas; Argentina.Fil: Stanecka, Nancy. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Estadística y Demografía; Argentina.Fil: Caro, Valentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Estadística y Demografía; Argentina.Fil: Sigal, Facundo. Universidad Austral. Facultad de Ciencias Empresariales. Departamento de Economía; Argentina.Fil: Blacona, María Teresa. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística. Escuela de Estadística; Argentina.Fil: Rodriguez, Norberto Vicente. Universidad Nacional de Tres de Febrero; Argentina.Fil: Loiacono, Karina Valeria. Universidad Nacional de Tres de Febrero; Argentina.Fil: García, Gregorio. Instituto Nacional de Estadística y Censos. Dirección Nacional de Metodología Estadística; Argentina.Fil: Ciardullo, Emanuel. Instituto Nacional de Estadística y Censos. Dirección Nacional de Metodología Estadística; Argentina.Fil: Ciardullo, Emanuel. Instituto Nacional de Estadística y Censos. Dirección Nacional de Metodología Estadística; Argentina.Fil: Funkner, Sofía. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Fil: Dieser, María Paula. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Fil: Martín, María Cristina. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Fil: Martín, María Cristina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Peitton, Lucas. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Económicas y Estadística; Argentina. Queensland Department of Agriculture and Fisheries; Australia.Fil: Borgognone, María Gabriela. Queensland Department of Agriculture and Fisheries; Australia.Fil: Terreno, Dante D. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Contabilidad; Argentina.Fil: Castro González, Enrique L. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Contabilidad; Argentina.Fil: Roldán, Janina Micaela. Universidad Nacional de La Pampa. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Fil: González, Gisela Paula. CONICET. Instituto de Investigaciones Económicas y Sociales del Sur; Argentina. Universidad Nacional del Sur; Argentina.Fil: De Santis, Mariana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas; Argentina.Fil: Geri, Milva. CONICET. Instituto de Investigaciones Económicas y Sociales del Sur; Argentina.Fil: Geri, Milva. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Economía; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Matemática; Argentina.Fil: Marfia, Martín. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ingeniería. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina.Fil: Kudraszow, Nadia L. Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Matemática de La Plata; Argentina.Fil: Closas, Humberto. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina.Fil: Amarilla, Mariela. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina.Fil: Jovanovich, Carina. Universidad Tecnológica Nacional; Argentina.Fil: de Castro, Idalia. Universidad Nacional del Nordeste; Argentina.Fil: Franchini, Noelia. Universidad Nacional del Nordeste; Argentina.Fil: Cruz, Rosa. Universidad Nacional del Nordeste; Argentina.Fil: Dusicka, Alicia. Universidad Nacional del Nordeste; Argentina.Fil: Quaglino, Marta. Universidad Nacional de Rosario; Argentina.Fil: Kalauz, Roberto José Andrés. Investigador Independiente; Argentina.Fil: González, Mariana Verónica. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Económicas. Departamento de Estadística y Matemáticas; Argentina.Fil: Lescano, Maira Celeste.

Detailed stratified GWAS analysis for severe COVID-19 in four European populations

Given the highly variable clinical phenotype of Coronavirus disease 2019 (COVID-19), a deeper analysis of the host genetic contribution to severe COVID-19 is important to improve our understanding of underlying disease mechanisms. Here, we describe an extended genome-wide association meta-analysis of a well-characterized cohort of 3255 COVID-19 patients with respiratory failure and 12 488 population controls from Italy, Spain, Norway and Germany/Austria, including stratified analyses based on age, sex and disease severity, as well as targeted analyses of chromosome Y haplotypes, the human leukocyte antigen region and the SARS-CoV-2 peptidome. By inversion imputation, we traced a reported association at 17q21.31 to a ~0.9-Mb inversion polymorphism that creates two highly differentiated haplotypes and characterized the potential effects of the inversion in detail. Our data, together with the 5th release of summary statistics from the COVID-19 Host Genetics Initiative including non-Caucasian individuals, also identified a new locus at 19q13.33, including NAPSA, a gene which is expressed primarily in alveolar cells responsible for gas exchange in the lung.S.E.H. and C.A.S. partially supported genotyping through a philanthropic donation. A.F. and D.E. were supported by a grant from the German Federal Ministry of Education and COVID-19 grant Research (BMBF; ID:01KI20197); A.F., D.E. and F.D. were supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft Cluster of Excellence ‘Precision Medicine in Chronic Inflammation’ (EXC2167). D.E. was supported by the German Federal Ministry of Education and Research (BMBF) within the framework of the Computational Life Sciences funding concept (CompLS grant 031L0165). D.E., K.B. and S.B. acknowledge the Novo Nordisk Foundation (NNF14CC0001 and NNF17OC0027594). T.L.L., A.T. and O.Ö. were funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation), project numbers 279645989; 433116033; 437857095. M.W. and H.E. are supported by the German Research Foundation (DFG) through the Research Training Group 1743, ‘Genes, Environment and Inflammation’. L.V. received funding from: Ricerca Finalizzata Ministero della Salute (RF-2016-02364358), Italian Ministry of Health ‘CV PREVITAL’—strategie di prevenzione primaria cardiovascolare primaria nella popolazione italiana; The European Union (EU) Programme Horizon 2020 (under grant agreement No. 777377) for the project LITMUS- and for the project ‘REVEAL’; Fondazione IRCCS Ca’ Granda ‘Ricerca corrente’, Fondazione Sviluppo Ca’ Granda ‘Liver-BIBLE’ (PR-0391), Fondazione IRCCS Ca’ Granda ‘5permille’ ‘COVID-19 Biobank’ (RC100017A). A.B. was supported by a grant from Fondazione Cariplo to Fondazione Tettamanti: ‘Bio-banking of Covid-19 patient samples to support national and international research (Covid-Bank). This research was partly funded by an MIUR grant to the Department of Medical Sciences, under the program ‘Dipartimenti di Eccellenza 2018–2022’. This study makes use of data generated by the GCAT-Genomes for Life. Cohort study of the Genomes of Catalonia, Fundació IGTP (The Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol) IGTP is part of the CERCA Program/Generalitat de Catalunya. GCAT is supported by Acción de Dinamización del ISCIII-MINECO and the Ministry of Health of the Generalitat of Catalunya (ADE 10/00026); the Agència de Gestió d’Ajuts Universitaris i de Recerca (AGAUR) (2017-SGR 529). M.M. received research funding from grant PI19/00335 Acción Estratégica en Salud, integrated in the Spanish National RDI Plan and financed by ISCIII-Subdirección General de Evaluación and the Fondo Europeo de Desarrollo Regional (European Regional Development Fund (FEDER)-Una manera de hacer Europa’). B.C. is supported by national grants PI18/01512. X.F. is supported by the VEIS project (001-P-001647) (co-funded by the European Regional Development Fund (ERDF), ‘A way to build Europe’). Additional data included in this study were obtained in part by the COVICAT Study Group (Cohort Covid de Catalunya) supported by IsGlobal and IGTP, European Institute of Innovation & Technology (EIT), a body of the European Union, COVID-19 Rapid Response activity 73A and SR20-01024 La Caixa Foundation. A.J. and S.M. were supported by the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness (grant numbers: PSE-010000-2006-6 and IPT-010000-2010-36). A.J. was also supported by national grant PI17/00019 from the Acción Estratégica en Salud (ISCIII) and the European Regional Development Fund (FEDER). The Basque Biobank, a hospital-related platform that also involves all Osakidetza health centres, the Basque government’s Department of Health and Onkologikoa, is operated by the Basque Foundation for Health Innovation and Research-BIOEF. M.C. received Grants BFU2016-77244-R and PID2019-107836RB-I00 funded by the Agencia Estatal de Investigación (AEI, Spain) and the European Regional Development Fund (FEDER, EU). M.R.G., J.A.H., R.G.D. and D.M.M. are supported by the ‘Spanish Ministry of Economy, Innovation and Competition, the Instituto de Salud Carlos III’ (PI19/01404, PI16/01842, PI19/00589, PI17/00535 and GLD19/00100) and by the Andalussian government (Proyectos Estratégicos-Fondos Feder PE-0451-2018, COVID-Premed, COVID GWAs). The position held by Itziar de Rojas Salarich is funded by grant FI20/00215, PFIS Contratos Predoctorales de Formación en Investigación en Salud. Enrique Calderón’s team is supported by CIBER of Epidemiology and Public Health (CIBERESP), ‘Instituto de Salud Carlos III’. J.C.H. reports grants from Research Council of Norway grant no 312780 during the conduct of the study. E.S. reports grants from Research Council of Norway grant no. 312769. The BioMaterialBank Nord is supported by the German Center for Lung Research (DZL), Airway Research Center North (ARCN). The BioMaterialBank Nord is member of popgen 2.0 network (P2N). P.K. Bergisch Gladbach, Germany and the Cologne Excellence Cluster on Cellular Stress Responses in Aging-Associated Diseases, University of Cologne, Cologne, Germany. He is supported by the German Federal Ministry of Education and Research (BMBF). O.A.C. is supported by the German Federal Ministry of Research and Education and is funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under Germany’s Excellence Strategy—CECAD, EXC 2030–390661388. The COMRI cohort is funded by Technical University of Munich, Munich, Germany. This work was supported by grants of the Rolf M. Schwiete Stiftung, the Saarland University, BMBF and The States of Saarland and Lower Saxony. K.U.L. is supported by the German Research Foundation (DFG, LU-1944/3-1). Genotyping for the BoSCO study is funded by the Institute of Human Genetics, University Hospital Bonn. F.H. was supported by the Bavarian State Ministry for Science and Arts. Part of the genotyping was supported by a grant to A.R. from the German Federal Ministry of Education and Research (BMBF, grant: 01ED1619A, European Alzheimer DNA BioBank, EADB) within the context of the EU Joint Programme—Neurodegenerative Disease Research (JPND). Additional funding was derived from the German Research Foundation (DFG) grant: RA 1971/6-1 to A.R. P.R. is supported by the DFG (CCGA Sequencing Centre and DFG ExC2167 PMI and by SH state funds for COVID19 research). F.T. is supported by the Clinician Scientist Program of the Deutsche Forschungsgemeinschaft Cluster of Excellence ‘Precision Medicine in Chronic Inflammation’ (EXC2167). C.L. and J.H. are supported by the German Center for Infection Research (DZIF). T.B., M.M.B., O.W. und A.H. are supported by the Stiftung Universitätsmedizin Essen. M.A.-H. was supported by Juan de la Cierva Incorporacion program, grant IJC2018-035131-I funded by MCIN/AEI/10.13039/501100011033. E.C.S. is supported by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG; SCHU 2419/2-1).Peer reviewe