The molecular aspects of personalized anticancer treatment

Only 25% of cancer patients, on average, benefit from therapy. Even in the cases of complete clinical response the tumor progression is an event of high level expectation. The main reasons for tumor progression are: intratumor heterogeneity resulted from clonal evolution, drug resistance, and tumor-promoting microenvironment. The reprogramming of microenvironmental stromal-inflammatory components is expected to allow tumor phenotype reversion. So, to find the new effective markers of tumor progression, drug response and targets for therapy, it could be promising to take into account the tumor-microenvironment heterogeneity and tumor clonal evolution

Alerta bibliográfica y formación continuada: el Boletín Bibliográfico CESCA

The objective of this work is to analyze the quantity and quality of the comments included in CESCA Bibliography Bulletin and to study the usefulness of the Bulletin to its subscribers. We review the 1991 Bulletin and develop a postal survey to its suscribers. Papers from journals are 92 % of the total; they come from 90 different journals; 13 % of the journals give 55 % of the corhments. The clinical topics are the more frequent (29 %), being the health services research the second topic (29 %). There were 5 % of errors. Subscribers used the Bulletin as a source of information about new publications and as a tool for continuous medical education. CESCA Bibliography Bulletin is a useful publication which helps in following new publications and continuous medical education.El objetivo de este trabajo es analizar el contenido y calidad de los comentarios incluidos en el Boletín Bibliográfico CESCA, así como su utilidad para los suscriptores del mismo. Se realiza un estudio descriptivo de lo publicado en 1991 y se analizan las respuestas a una encuesta remitida a los suscriptores. Los artículos de revistas constituyeron el 92 % de todos los comentarios; se utilizaron 90 revistas distintas; 13 revistas concentran el 55 % del total de los comentarios. La temática más frecuente de los documentos comentados fue la clínica (39 %), seguida de la investigación de servicios sanitarios (29 %). Se ha encontrado un 5 % de errores. Los suscriptores emplearon el Boletín como alerta bibliográfica y como soporte de formación continuada. Así pues, el Boletín Bibliográfico CESCA, que comenta y califica los documentos, es una ayuda para los lectores, tanto en alerta bibliográfica como en formación continuada

МОНИТОРИНГ МУТАЦИЙ В ГЕНЕ EGFR В ЦИРКУЛИРУЮЩЕЙ ДНК ПЛАЗМЫ КРОВИ БОЛЬНЫХ НЕМЕЛКОКЛЕТОЧНЫМ РАКОМ ЛЕГКОГО

Activating mutations of EGFR are associated with sensitivity of non-small cell lung cancer (NSCLC ) to tyrosine kinase inhibitors (TKI). Liquid biopsy using circulating cell-free tumor DNA (cfDNA) is proposed in cases when formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tumor tissue is not available and for monitoring of EGFR status. In the study we evaluated new qPC R assay for EGFR mutations in plasma cfDNA. Sensitivity of the assay was 1 % of the mutant allele for L858R, L861Q, S768I mutations and deletions in exon 19, and 5 % of the mutant allele for G719X or T790M mutations Before surgery, mutation was detected in plasma of 4 out of 7 patients (57 %) with mutant EGFR in FFPE tumor tissue. Mutations found in cfDNA completely matched those found in tumor tissue in 2 cases. In one case with G719X and S768I mutations in FFPE tissue, only S768I was found in cfDNA. In another case, T790M was detected in plasma in addition to L858R that was present in tumor tissue. No EGFR mutations were detected in plasma DNA from 12 healthy volunteers and 13 cases of NSCLC with wt EGFR suggesting 100 % specificity of the assay. Liquid biopsy detected EGFR mutations in cfDNA in 8 of 16 cases of NSCLC with mutant EGFR being under therapy with TKI. Among them, 7 cases had mutations in liquid biopsy that matched those in tumor tissue and another case had T790M in addition to L858R. In 3 cases increased mutant allele frequency was detected 212 months before clinical progression.Активирующие мутации гена EGFR связаны с чувствительностью немелкоклеточного рака легкого (НМКРЛ) к ингибиторам тирозинкиназ (ИТК). Жидкостная биопсия с использованием циркулирующей внеклеточной опухолевой ДНК (цоДНК) предлагается в случаях, когда опухолевая ткань недоступна, а также для мониторинга статуса гена EGFR. В данном исследовании мы опробовали новый метод на основе количественной ПЦР (кПЦР) для выявления мутаций гена EGFR в цоДНК плазмы. Чувствительность метода составила 1 % мутантного аллеля EGFR L858R, L861Q, S768I и делеций экзона 19 и 5 % мутантного аллеля EGFR G719X или T790M. В плазме крови, взятой до операции, мутации были выявлены в 4 из 7 (57 %) случаев с мутацией гена EGFR в ткани опухоли. При этом в двух случаях мутации в цоДНК полностью соответствовали мутациям, которые были обнаружены в ткани опухоли. В одном случае при наличии мутаций G719X и S768I в ткани опухоли только S768I была выявлена в цоДНК. Еще в одном случае мутация T790M была выявлена в плазме дополнительно к мутации L858R, которая была в ткани опухоли. Мутации гена EGFR не были обнаружены в ДНК плазмы крови 12 здоровых доноров и 13 больных НМКРЛ, имевших ген EGFR дикого типа, что означает 100 % специфичность теста. Жидкостная биопсия выявила мутации EGFR в 8 из 16 случаев НМКРЛ, которые несли мутации гена EGFR и проходили курс терапии с использованием ИТК. В этой группе в 7 случаях мутации в жидкой биопсии соответствовали тем, которые были в опухолевой ткани, а еще в одном случае мутация T790M была выявлена дополнительно к мутации L858R. В 3 случаях увеличение частоты мутантного аллеля было выявлено за 2–12 мес до клинической прогрессии

A Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems: Computational Creativity Evaluation Based on What it is to be Creative

Computational creativity is a flourishing research area, with a variety of creative systems being produced and developed. Creativity evaluation has not kept pace with system development with an evident lack of systematic evaluation of the creativity of these systems in the literature. This is partially due to difficulties in defining what it means for a computer to be creative; indeed, there is no consensus on this for human creativity, let alone its computational equivalent. This paper proposes a Standardised Procedure for Evaluating Creative Systems (SPECS). SPECS is a three-step process: stating what it means for a particular computational system to be creative, deriving and performing tests based on these statements. To assist this process, the paper offers a collection of key components of creativity, identified empirically from discussions of human and computational creativity. Using this approach, the SPECS methodology is demonstrated through a comparative case study evaluating computational creativity systems that improvise music

Can we import quality tools? a feasibility study of European practice assessment in a country with less organised general practice

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Quality is on the agenda of European general practice (GP). European researchers have, in collaboration, developed tools to assess quality of GPs. In this feasibility study, we tested the European Practice Assessment (EPA) in a one-off project in Belgium, where general practice has a low level of GP organisation.</p> <p>Methods</p> <p>A framework for feasibility analysis included describing the recruiting of participants, a brief telephone study survey among non-responders, organisational and logistic problems. Using field notes and focus groups, we studied the participants' opinions.</p> <p>Results</p> <p>In this study, only 36 of 1000 invited practices agreed to participate. Co-ordination, administrative work, practice visits and organisational problems required several days per practice. The researchers further encountered technical problems, for instance when entering the data and uploading to the web-based server. In subsequent qualitative analysis using two focus groups, most participant GPs expressed a positive feeling after the EPA procedure. In the short period of follow-up, only a few GPs reported improvements after the visit. The participant GPs suggested that follow-up and coaching would probably facilitate the implementation of changes.</p> <p>Conclusion</p> <p>This feasibility study shows that prior interest in EPA is low in the GP community. We encountered a number of logistic and organisational problems. It proved attractive to participants, but it can be augmented by coaching of participants in more than a one-off project to identify and achieve targets for quality improvement. In the absence of commitment of the government, a network of universities and one scientific organisation will offer EPA as a service to training practices.</p

Полиморфизм гена хемокинового рецептора CCR5 у больных рассеянным склерозом в Сибирском регионе

Multiple sclerosis is chronic inflammatory disease of the central nervous system in the development of which chemokines of the type Tx1 play the leading role. Chemokines and their receptors participate in the development of multiple sclerosis as a result of drawing immune cells into central nervous system. Mutation of CCR5 delta32 decreases functional activity of the appropriate receptor on cellular surface and thus can reduce migration of leucocytes into foci of injury. Aimed at studying the role of mutation in multiple sclerosis, we compared frequency of gene type CCR5 in peripheral mononuclears of 102 multiple sclerosis patients and in 136 healthy subjects. The results obtained allow to conclude that polymorphism of chemokine receptor gene CCR5del32 is not a leading factor in the susceptibility to multiple sclerosis in the studied population.Рассеянный склероз (РС) — хроническое воспалительное заболевание центральной нервный системы, в развитии которого ведущее значение имеют Тх1 типа. Хемокины и их рецепторы участвуют в развитии РС вследствие привлечения иммунных клеток в центральную нервную систему. Мутация CCR5 delta32 уменьшает функциональную активность соответствующего рецептора на клеточной поверхности и тем самым может редуцировать миграцию лейкоцитов в очаги поражения. С целью изучения роли мутации при РС сравнилась частота генотипа CCR5 в периферических мононуклеарах 102 больных РС и 136 здоровых лиц. Полученные результаты позволяют заключить, что полиморфизм гена хемокинового рецептора CCR5del32 не является ведущим фактором в восприимчивости к рассеянному склерозу в изученной популяции

Монотерапия ниволумабом у больных метастатическим колоректальным раком: современные подходы к оценке ответа опухоли

Aim of the study: a systematic analysis of the modern literature data on the nivolumab monotherapy efficacy in patients with metastatic colorectal cancer (mCRC). Material and methods. The review summarizes the results of clinical studies of the nivolumab efficacy in patients with mCRC between 2012 and 2022. The current approaches to assessing the tumor response in patients treated with immune checkpoint inhibitors are considered, including response patterns and criteria. Results. Data analysis showed that the use of nivolumab in mCRC patients had significant clinical benefits. Nivolumab monotherapy was shown to improve survival in patients with high microsatellite instability (MSI) or deficiencies in mismatch repair (dMMR) that progressed during standard chemotherapy. Numerous clinical studies indicate the atypical response to nivolumab. Traditional response criteria, such as RECIST do not always adequately assess the therapeutic efficacy of nivolumab in patients with mCRC. Conclusion. To improve the efficacy of mCRC treatment, standardized approaches based on the proposed specific criteria for response to immunotherapy, including immune related RECIST, immune RECIST, and immune-modified RECIST must be developed.Цель исследования ‒ систематический анализ данных современной литературы об эффективности применения ниволумаба в монорежиме у больных метастатическим колоректальным раком (мКРР). Материал и методы. В обзор включены данные клинических исследований за период с 2012 по 2022 г., оценивающих эффективность лечения ниволумабом у больных мКРР. Рассмотрены текущие подходы к оценке опухолевого ответа, включая характер иммунного ответа и критерии ответа. Результаты. Анализ литературы показал, что применение ниволумаба при мКРР имеет значимые клинические преимущества. Продемонстрировано, что монотерапия ниволумабом улучшает показатели выживаемости у пациентов с высокой микросателлитной нестабильностью (MSI) или нарушением механизма репарации неспаренных оснований ДНК (dMMR), которые прогрессировали на фоне стандартной химиотерапии. Многочисленные клинические исследования указывают на развитие атипичных реакций ответа на ниволумаб. Традиционные критерии ответа, такие как RECIST, не всегда адекватно оценивают терапевтическую эффективность ниволумаба у пациентов с мКРР. Заключение. Для повышения эффективности лечения мКРР необходима разработка стандартизированных подходов, основанных на предложенных специфических критериях ответа на иммунотерапию, включая иммунологический Recist, иммунный Recist и иммуномодифицированный RECIST

The handling of urinary incontinence in Danish general practices after distribution of guidelines and voiding diary reimbursement: an observational study

BACKGROUND: Though urinary incontinence (UI) is a bothersome condition for the individual patient, the patients tend not to inform their physician about UI and the physician tend not to ask the patient. Recently different initiatives have been established in Danish general practices to improve the management of UI. The aim of this study was to identify the handling of urinary incontinence (UI) in Danish general practices after distribution of clinical guidelines and reimbursement for using a UI diary. METHODS: In October 2001, a questionnaire was sent to 243 general practitioners (GPs) in Frederiksborg County following distribution of clinical guidelines in July 1999 (UI in general practice) and September 2001 (UI in female, geriatric, or neurological patients). A policy for a small reimbursement to GPs for use of a fluid intake/voiding diary in the assessment of UI in general practice was implemented in October 2001. Information concerning monthly reimbursement for using a voiding diary, prescribed drugs (presumably used for treating UI), UI consultations in outpatient clinics, and patient reimbursement for pads was obtained from the National Health Service County Registry. RESULTS: Of the 132 (54%) GPs who replied, 87% had read the guidelines distributed 2 years before, but only 47% used them daily. The majority (69%) of the responding GPs had read and appreciated 1–3 other UI guidelines distributed before the study took place. Eighty-three percent of the responding GPs sometimes or often actively asked their patients about UI, and 92% sometimes or often included a voiding diary in the UI assessment. The available registry data concerning voiding diary reimbursement, prescribed UI drugs, UI consultations in outpatient clinics, and patient reimbursement for pads were insufficient or too variable to determine significant trends. CONCLUSION: GPs management of UI in a Danish county may be reasonable, but low response rate to the questionnaire and insufficient registry data made it difficult to evaluate the impact of different UI initiatives

Этнические аспекты наследственного рака молочной железы

This study aimed to reveal the spectrum of BRca1 and BRca2 genes mutation in various ethnic groups of the Russian Federation. asystematic literature search includes data for the past 10 years and was conducted by using electronic databases of pubmed, eliBRaRY and ect.Material and methods. The review includes research data on the frequency of mutations of breast cancer-associated genes in various ethnic groups of the Russian Federation.Results. For «slavic» patients with a family history, the BRca1/2 mutation testing is the standard of care. in addition, the development of new antitumour drugs has resulted in improved survival rates. more than 1000 mutations of the BRca1 gene have been identified. Recent research is focused on the confirmation the beneficial effect of identified mutations. For the indigenous population (mongoloid ethnic groups), there are no standards for the treatment of inherited breast cancer. thus, the advances in molecular oncology for the treatment of hereditary breast cancer are not available for the indigenous population of the Russian Federation.Conclusion. In this context, the search for markers of early cancer detection and the development of criteria for therapy response are relevant for indigenous people. the development of new predictive and prognostic criteria of breast cancer among mongoloid ethnic groups with a family history will allow the innovative strategies for personalized molecular therapy to be developed.Цель исследования – провести систематический анализ данных, имеющихся в современной литературе, о спектре мутаций генов BRca1 и BRca2 в различных этнических группах Российской Федерации.Материал и методы. В обзор включены данные исследований о частоте встречаемости мутаций РМЖ-ассоциированных генов у различных этнических групп Российской Федерации, опубликованные за последние 10 лет. Поиск производился в системах pubmed, eliBRaRYи др.Результаты. В настоящее время тестирование BRca1/2 мутаций является стандартом в лечении наследственного РМЖ у «славянских» пациентов с семейной историей, достигнут прогресс в разработке новых противоопухолевых препаратов и значительный рост показателей выживаемости, идентифицировано более 1000 мутаций гена BRca1, продолжается поиск патогенных клинически значимых мутаций для данной группы больных. Однако на данный момент отсутствуют сведения о молекулярных факторах, которые обусловливают риск развития наследственных форм РМЖ для коренного населения Российской Федерации (буряты, эвенки, якуты, алтайцы, тувинцы, хакасы и др.). Таким образом, современные достижения молекулярной онкологии в лечении наследственных форм РМЖ не доступны для коренного населения Российской Федерации.Заключение. Представленные данные подтверждают актуальность поиска маркеров ранней диагностики, эффективности терапии, риска прогрессирования РМЖ у коренных этносов. Данные о молекулярных механизмах наследственного РМЖ у этнических групп с семейной историей, принадлежащих к монголоидной расе, позволят в перспективе разработать инновационные стратегии персонализированной молекулярной терапии