Diagnostic moléculaire du Cytomégalovirus (CMV), de l’herpès virus humain de type 6 (HHV6) et d’Epstein-Barr virus (EBV) par PCR en temps réel chez les femmes enceintes VIH séropositives et séronégatives à Ouagadougou, Burkina Faso

Introduction: les herpès virus EBV, CMV et HHV-6 sont des virus qui évoluent sous le modèle pandémique et sont responsables d’infections congénitales pouvant provoquer des séquelles graves chez les nouveau-nés. L’objectif de cette étude était de déterminer les prévalences de CMV, EBV et HHV-6 chez les femmes enceintes VIH(+) et VIH(-) à Ouagadougou. Méthodes: dans cette étude 200 échantillons de plasma sanguin de femmes enceintes dont 100 femmes VIH(+) et 100 femmes VIH(-) ont été diagnostiqués par PCR multiplex en temps réel pour les trois infections (EBV, CMV et HHV-6). Résultats: sur l’ensemble des 200 échantillons analysés, 18 (9,0%) étaient positifs à au moins un des trois virus, 12 (6,0%) étaient positifs au EBV, 13 (6,5%) au CMV et 12 (6,0%) positifs au HHV-6. Parmi les 18 cas d’infections, nous avons trouvé 10 cas (55,6%) de coïnfections dont 90,0% (9/10) d’infection multiple EBV/CMV/HHV6 et 10,0% de coinfection EBV/HHV6. Le taux d’infection HHVs était plus élevé chez les femmes VIH(-) que celles VIH(+) (12,0% versus 6,0%). Parmi les VIH(+), la PCR a révélé 7,1% (soit 6/85) d’infection HHVs chez celles qui n’étaient pas sous ARV contre 0% chez celles sous ARV. Conclusion: les herpès virus sont fréquents chez les femmes enceintes au Burkina Faso et pourraient constituer une menace chez ces dernières à cause des complications et des risques d’infection pour le nouveau-né.The Pan African Medical Journal 2016;2

Molecular diagnosis of Shigella, Salmonella and Campylobacter by multiplex Real-time PCR in stool culture samples in Ouagadougou (Burkina Faso)

ABSTRACT:Background: Bacteriological diagnosis of Campylobacter spp, Salmonella spp and Shigella spp could be necessary in the case of infectious gastroenteritis syndrome.The objective of this study was to diagnose concomitantly the three enteropathogenic bacteria by multiplex Real-Time PCR in stool culture samples in Ouagadougou (Burkina Faso).Materials and Methods: The study was conducted from February 5th to March 9th, 2013. Two hundred stool samples were received during the study period. The bacteria were identified by bacterial culture following by multiplex Real-Time PCR.Results: Shigella spp and Campylobacter spp were sought by culture in all 200 samples. Enteropathogenic E. coli was sought only in 37 samples from all children under 2 years old. The bacterial culture was positive in 12 stool samples. Shigella spp and Salmonella spp. were isolated respectively in 5 (2.5%) and 3 samples (1.5%). Enteropathogenic E. coli was isolated in 10.8% (4/37) of the samples tested.The multiplex real-time PCR identified bacteria in 20 patients, including 17 cases of Shigella spp., 1 case of Salmonella spp. and 2 cases of Campylobacter spp.Conclusions: This study has highlighted the low frequency of 3 sought bacterial genera in stool samples. It has also demonstrated a significant difference between the culture and the multiplex Real-Time PCR method in the diagnosis of Shigella

Confirmation de l’électrophorèse des sujets drépanocytaires SS et non drépanocytaires par PCR en temps réel au Burkina Faso

La drépanocytose, maladie génétique très répandue dans le monde, a une prévalence élevée au Burkina Faso. Cette étude avait pour objectif de confirmer par PCR en temps réel l’électrophorèse des sujets drépanocytaires SS et non drépanocytaires afin de la proposer comme méthode de diagnostic précoce des hémoglobinopathies. Au total 280 patients ont participé à cette étude dont 86 drépanocytaires âgés de 1 à 15 ans (sujets non enceintes) et 194 femmes enceintes dont le génotype de l’hémoglobine était inconnu mais après l’examen, aucune femme enceinte SS n’a été identifiée. Tous les patients ont effectué les tests de l’électrophorèse de l’hémoglobine (EHb) et la PCR pour la détermination de leurs génotypes. En sus, ceux qui portaient l’hémoglobine SS ont réalisé les analyses de fer sérique, de ferritine et d’hémogramme. Le groupe des drépanocytaires étaient constitués de 41,9% de femmes et 58,1% d’hommes. Le génotypage par PCR chez les femmes enceintes a donné les fréquences génotypiques : AA(82,4%); AC(9,3%); AS(5,2%); CC(3,1%). Tous les tests d’EHb ont été confirmés à 100% par la PCR. La PCR était sensible et spécifique à 100% par rapport aux tests de l’EHb. La PCR qui permet d’effectuer des analyses prénatales et périnatales, différentie également l’hémoglobine S de l’hémoglobine D, et l’hémoglobine C de l’hémoglobine A2. Par conséquent, le test PCR de l’hémoglobine peut être dorénavant recommandé pour les examens de routine des hémoglobinopathies.   Englsih title: Electrophoresis confirmation of SS and non-sickle cell subjects using realtime PCR in Burkina FasoSickle cell disease, a genetic disease that is widespread in the world, has a high prevalence in Burkina Faso. The aim of this study was to confirm the electrophoresis of SS and non-sickle cell subjects by real-time PCR in order to propose it as an early diagnosis method for hemoglobinopathies. A total of 280 patients participated in this study, including 86 sickle aged 1 to 15 years (non-pregnant) cell patients and 194 pregnant women with unknown hemoglobin genotypes and no HbSS pregnant women was detected after Hb genotype analysis. All patients underwent hemoglobin electrophoresis (EHb) and PCR tests to determine their genotypes. In addition, those with SS hemoglobin performed serum iron, ferritin, and hemogram tests. The sickle cell group consisted of 41.9% women and 58.1% men. PCR genotyping in pregnant women yielded the following genotype frequencies: AA (82.4%); AC (9.3%); AS (5.2%); CC (3.1%). All EHb tests were 100% confirmed by PCR. PCR was 100% sensitive and specific compared to EHb tests. PCR, which allows for prenatal and perinatal testing, also differentiates hemoglobin S from hemoglobin D, and hemoglobin C from hemoglobin A2. Therefore, the PCR test for hemoglobin can now be recommended for routine exams of hemoglobinopathies