Relación del gradiente interior-borde de fragmentos de bosque andino sobre la comunidad de murciélagos en encino (santander, colombia)

En este trabajo se describe la configuración espacial del paisaje del municipio de Encino y la presencia de efecto de borde sobre la comunidad de murciélagos en fragmentos de bosque subandino inmersos en una matriz agrícola. Se analizó información cartográfica existente del municipio en el software ArcView 3.2 para determinar propiedades del paisaje como área total, número y densidad de parches y se estimaron índices que describen el grado de fragmentación para bosques andinos y subandinos y algunos atributos de los fragmentos como área y forma. Hay 53 fragmentos de bosque subandino y 111 de andino (164 fragmentos totales) que cubren 152,5 km2 delárea total y tienen una densidad de 0,39 parches/ha. Los índices calculados revelan que los bosques andinos tienen un menor proceso de fragmentación que los subandinos representado en fragmentos más grandes y más cercanos. El paisaje ha sido muy transformado pues el 90,4% de los fragmentos so

Bat functional traits associated with environmental, landscape, and conservation variables in Neotropical dry forests

Tropical dry forests are among the most threatened ecosystems worldwide. Bats' role in those ecosystems is critical because of multiple bat-mediated processes. Such processes are strongly related to bats' functional traits. However, it is poorly known which bat's functional traits could relate to variations in environmental conditions in tropical dry forests. In this study, we tested the hypotheses that bat functional traits would be significantly associated with landscape variables, climatic variables, and land-use intensity. For testing these hypotheses, we used data from phyllostomid and mormoopid bats captured in mist nets and data from non-phyllostomid insectivorous bat species registered by passive acoustic monitoring. We considered six functional traits for phyllostomid and mormoopid bats, and for non-phyllostomid insectivorous bats, we added two echolocation parameters. We measured five environmental variables, two of local climate (daily maximum temperature and wind speed) and three of landscape features (total area of water and closeness, probability of finding caves, and conservation status). The relationships between bat functional traits and environmental variables were evaluated using the RLQ and the fourth-corner analysis. We captured 360 individuals belonging to 14 species with mist nets (Phyllostomidae and Mormoopidae), and we identified 18 species and six sonotypes with acoustic sampling (Emballonuridae, Mormoopidae, Molossidae, Natalidae, Noctilionidae, and Vespertilionidae). We found that bats' functional traits related to environmental conditions were pulse structure, diet, vertical foraging stratification, and trophic level, although these relationships varied among bats' ecological roles. The hematophagous were related to water bodies' closeness, and animalivorous bats, mostly mormoopids, showed a relationship with the probability of finding caves. Insectivorous bats that mostly forage on the canopy and emit qCF calls were significantly related to more conserved sites, and bats that emit qCF pulses were significantly associated with less area covered by water. Our findings provide insights into how bat functional traits vary in their relationships with environmental conditions in harsh environments such as dry forests

Estándares para registrar señales de ecolocalización y construir bibliotecas de referencia de murciélagos en Colombia

Bioacoustic tools allow monitoring bats usually not detected with traditional methods, such as mist nets, and also provide information about different biological aspects of the species. The interest in applying these methods has increased in the last years, and consequently, there has been a rapid development of ultrasonic recording equipment and analysis tools. However, in the Neotropics, bat bioacoustics is emerging in some countries and just appearing in others; therefore it is necessary to reinforce this field to study the high taxonomic and functional diversity of the region. Therefore, it is essential to have bat call libraries that serve as a reference to validate and compare recordings from different species and localities. Some countries in the Neotropics have advanced in this process and are already building these reference libraries. In Colombia, the future work is challenging, due to the more than 200 bat species present. This paper establishes the methodological basis to obtain bat-reference calls in Colombia and allow those who are just starting out in this research field.La bioacústica permite monitorear murciélagos difícilmente detectados con métodos tradicionales, como las redes de niebla, y permiten obtener información sobre diferentes aspectos de la biología de las especies de estudio. En los últimos años se ha incrementado el interés por la aplicación de estos métodos y, en consecuencia, ha sido rápido el desarrollo de los equipos de grabación ultrasónica y las herramientas de análisis. Sin embargo, en el Neotrópico la bioacústica de murciélagos está en etapa de crecimiento en algunos países y apenas ahora está apareciendo en otros, por lo cual es necesario fortalecer este campo para estudiar la alta diversidad taxonómica y funcional de la región. En este contexto, es indispensable contar con bibliotecas de señales acústicas, que sirvan como referencia para identificar, validar y comparar las grabaciones de diferentes especies y localidades. Algunos países del Neotrópico han avanzado en este proceso y están construyendo estas bibliotecas de referencia. En Colombia, el trabajo a futuro implica un reto, debido a las más de 200 especies de murciélagos presentes. Este trabajo presenta las bases metodológicas para tomar grabaciones de referencia de murciélagos en Colombia y generar una guía para aquellos que se están iniciando en este campo de investigación

Mamíferos, historia natural y colecciones

In this issue of Mammalogy Notes, we feature three notes on range extension, seven notes on natural history, and four inventories of mammals. Contributions come from Colombia, Peru, Mexico, Brazil, and Venezuela. Additionally, we include three new contributions from the special series on biological collections of Colombian mammals. In this way, Mammalogy Notes keeps growing, improving, and contributing to the knowledge of neotropical mammals.En este número de Mammalogy Notes presentamos tres notas sobre extensiones de distribución, siete notas de historia natural y cuatro inventarios de mamíferos. Las contribuciones provienen de Colombia, Perú, México, Brasil y Venezuela. Adicionalmente, incluimos tres nuevos trabajos de la serie especial sobre colecciones de mamíferos de Colombia. De esta forma Mammalogy notes continúa creciendo, mejorando y aportando al conocimiento de los mamíferos neotropicales

DarkCideS 1.0, a global database for bats in karsts and caves

Tanalgo, Krizler C., Tabora, John Aries G., de Oliveira, Hernani Fernandes Magalhães, Haelewaters, Danny, Beranek, Chad T., Otálora-Ardila, Aída, Bernard, Enrico, Gonçalves, Fernando, Eriksson, Alan, Donnelly, Melissa, González, Joel Monzón, Ramos, Humberto Fernández, Rivas, Alberto Clark, Webala, Paul W., Deleva, Stanimira, Dalhoumi, Ridha, Maula, Jaycelle, Lizarro, Dennis, Aguirre, Luis F., Bouillard, Nils, Quibod, Ma. Niña Regina M., Barros, Jennifer, Turcios-Casco, Manfredo Alejandro, Martínez, Marcio, Ordoñez-Mazier, Diego Iván, Orellana, José Alejandro Soler, Ordoñez-Trejo, Eduardo J., Ordoñez, Danny, Chornelia, Ada, Lu, Jian Mei, Xing, Chen, Baniya, Sanjeev, Muylaert, Renata L., Dias-Silva, Leonardo Henrique, Ruadreo, Nittaya, Hughes, Alice Catherine (2022): DarkCideS 1.0, a global database for bats in karsts and caves. Scientific Data 9 (1): 155, DOI: 10.1038/s41597-022-01234-4, URL: http://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01234-

Mammals of the Oak Forest

The high rate of deforestation over the Andean forests has generated a large proportion of fragmented landscapes in the country. The distribution of Oak groves in the country was determined based on ecosystem maps. Charalá and Encino Oak groves patches are the largest ones found at the east Andes and like others, due to the unfair use of this resources, has suffered a fragmentation process. Fifty five species of mammals included in 10 orders and 14 families were found in these forests. Chiroptera and Rodentia were the most representative groups. Anthropic processes had produced a 68.1% loss of the habitat, and constitutes the main threat for these forests. The size of the patches were evaluated for three mammal species categories. The patches’ area are not favorable for large-size species, intermediately to favorable to medium-size species and are favorable for small-size species. It is suggested that patches’ area effect over mammal species could relate to the decrease of species richness and of each fragment area. There are good connections between patches (only five isolated), allowing the presence of a greater species diversity. There is also a bleak plateau zone between connected patches increasing their connectivity and offering different habitats and resources for some mammal species

Mamíferos de los bosques de roble

El acelerado proceso de deforestación sobre los bosques andinos ha generado la formación de paisajes fragmentados. La distribución de los robledales en el país, se estableció con base en mapas de ecosistemas existentes. Los robledales de la zona de Encino y Charalá corresponden al fragmento de mayor extensión. Estos ecosistemas han sufrido procesos de fragmentación por la sobreexplotación de sus recursos. En estos robledales se registran 55 especies de mamíferos pertenecientes a 10 órdenes y 14 familias. Los órdenes Chiroptera y Rodentia son los más abundantes. En Encino y Charalá se estimó una pérdida de hábitat del 68.1% y las principales amenazas sobre estos robledales son las ejercidas por la presión antrópica. Se realizó una valoración del área de los parches de roble para las especies de mamíferos. Las especies grandes tuvieron una valoración mala, las medianas buena y regular y las especies pequeñas terrestres y arborícolas muy buena. Se sugiere un efecto del área de los fragmentos sobre las especies de mamíferos que podría reflejarse en la disminución de la riqueza de especies con la disminución del área de cada fragmento. Existe buena conectividad entre los fragmentos (cinco aislados). Esto significa que los fragmentos restantes funcionan como una unidad continua permitiendo el sostenimiento de una mayor diversidad de especies. Además, entre los fragmentos conectados existe una gran franja de páramo la cual contribuye a aumentarla conectividad entre los mismos y ofrece hábitats diferentes para algunas especies de mamíferos que pueden explotar los recursos del ecosistema paramuno.The high rate of deforestation over the Andean forests has generated a large proportion of fragmented landscapes in the country. The distribution of Oak groves in the country was determined based on ecosystem maps. Charalá and Encino Oak groves patches are the largest ones found at the east Andes and like others, due to the unfair use of this resources, has suffered a fragmentation process. Fifty five species of mammals included in 10 orders and 14 families were found in these forests. Chiroptera and Rodentia were the mostrepresentative groups. Anthropic processes had produced a 68.1% loss of the habitat, and constitutes the main threat for these forests. The size of the patches were evaluated for three mammal species categories. The patches’ area are not favorable for large-size species, intermediately to favorable to medium-size species and are favorable for small-size species. It is suggested that patches’ area effect over mammal species could relate to the decrease of species richness and of each fragment area. There are good connections between patches (only five isolated), allowing the presence of a greater species diversity. There is also a bleak plateau zone between connected patches increasing their connectivity and offering different habitats and resources for some mammal species

Caracterización preliminar de las comunidades de murciélagos asociados a seis cavernas en Charalá y Ocamonte (Santander, Colombia)

Las cavernas se constituyen como refugios empleados por algunas especies de murciélagos y como ecosistemas que albergan comunidades bióticas singulares. En este trabajo se describe la presencia y riqueza de especies de murciélagos asociados a cavernas. Con este fin, se realizó una salida de campo de siete días a seis cavernas ubicadas en los municipios de Charalá y Ocamonte (Santander, Colombia). Se estimó la riqueza de especies de murciélagos y otras variables como: ubicación respecto a la intensidad de luz, tipo de agrupación y tipo de refugio empleado. Igualmente, se determinaron variables físicas de las cuevas como longitud y ancho  promedio, número de entradas y complejidad interior. Se sugiere la existencia de relaciones entre las variables de la comunidad y las características físicas evaluadas en estas cavernas. Se registran seis especies de murciélagos pertenecientes a las familias Vespertilionidae y Phyllostomidae con un promedio de 2,2 especies por caverna. Algunas especies presentan preferencias por un tipo de refugio específico dentro de las cuevas. Las especies registradas fueron: Phyllostomus discolor, Anoura geoffroyi, Carollia brevicauda, Plathyrrhinus dorsalis, Desmodus rotundus y Myotis keaysi, dos de éstas se consideran nuevos registros de especies asociadas a los sistemas cársticos del país

Evaluating the diversity of Trypanosomatid parasites infecting bats from different ecorregions in Colombia

Los murciélagos son uno de los grupos de mamíferos más abundantes y diversos a nivel mundial, y Colombia alberga 217 especies. Adicionalmente, los murciélagos están han sido considerados reservorios en los ciclos de transmisión de ciertos parásitos, virus y bacterias, por lo que es relevante entender su rol en la transmisión zoonótica. En este estudio, nuestro objetivo fue identificar los tripanosomátidos presentes en murciélagos capturados en diferentes ecorregiones de Colombia, y evaluar la diversidad de murciélagos y sus tripanosomátidos asociados en cuatro hábitats diferentes (sabanas naturales, bosque ripario, bosque terrafirme y cultivos de arroz). Realizamos muestreos de murciélagos en seis localidades utilizando redes de niebla, en donde los individuos capturados fueron sedados y se tomaron muestras de sangre y tejido. Se obtuvieron muestras adicionales colectadas por otros colaboradores para un total de 235 muestras de murciélagos de diferentes ecorregiones. En el laboratorio realizamos extracción de ADN, amplificamos secuencias de las regiones de los genes cytb y hsp70 en PCR convencional y enviamos los productos amplificados a secuenciación por Sanger. También realizamos una PCR convencional para amplificar el gen miniexon para corroborar la identificación de la especie Leishmania. Las secuencias obtenidas se depuraron y luego se realizó un Blastn para establecer una identificación preliminar. Las secuencias se alinearon usando MUSCLE y secuencias de referencia de GenBank y construyeron árboles filogenéticos, uno para el género Trypanosoma y otro para el género Leishmania. Finalmente, hicimos una curva de rarefacción para evaluar la representatividad del muestreo, calculamos el inverso del índice de Simpson y la proporción de individuos para establecer la diversidad de murciélagos en cada hábitat. De los 235 murciélagos estudiados, dos estuvieron infectados con Trypanosoma cruzi TcI y un murciélago de la especie Molossus molossus, estuvo infectado con Leishmania amazonensis. Por primera vez en Colombia se reportan murciélagos infectados con la especie Leishmania amazonensis, la cual ha sido reportada en murciélagos de Brasil. En cuanto a los resultados de diversidad de murciélagos, los bosques fueron los más diversos en comparación con los cultivos de arroz y la sabana, estas diferencias fueron significativas. Con relación a la diversidad de tripanosomátidos recolectados en los cuatro hábitats, sólo dos murciélagos estuvieron infectados con T. cruzi, el primero recolectado en bosque de terrafirme y el otro recolectado en un refugio cercano a una casa. La prevalencia de infección con tripanosomátidos en murciélagos en Colombia es baja en comparación con la infección encontrada en otros países, y curiosamente solo se encontraron tripanosomátidos con importancia médica en una de las ecorregiones muestreadas (Orinoquia). Los murciélagos infectados eran insectívoros, lo que puede explicar la ruta de transmisión de Trypanosoma cruzi. Todos los especímenes positivos se colectaron en la proximidad de viviendas humanas, lo que podría presentar un mayor riesgo de infección con tripanosomátidos de importancia médica.Proyecto Semilla (Facultad de Ciencias Uniandes)Bat Conservation International (BCI)Min CienciasNeotropical Grassland ConservancyMagíster en Ciencias BiológicasMaestríaParasitología y Ecología de Enfermedade