11 research outputs found

    Análisis del Comportamiento Dinámico de los Diques de Baja Cota de Coronación

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    Los diques de Baja Cota de Coronación constituyen una prometedora alternativa como barrera parcial para ciertas aplicaciones en Ingeniería de Costas. Poseen algunas ventajas potenciales frente a estructuras más convencionales, pero su diseño funcional es complicado por la gran cantidad de variables que intervienen, y por la complejidad de los procesos hidro-morfodinámicos que toman parte, siendo su impacto y funcionalidad difícil de prever. En este texto se realiza primeramente una revisión del estado del arte, y a continuación se estudian, mediante simulación numérica y análisis de datos experimentales en un modelo físico, los diferentes procesos que tienen lugar en torno a estructuras de baja cota de coronación con diferente grado de francobordo y ancho de coronación, y bajo diferentes condiciones de clima de oleaje. Además se caracteriza dinámicamente la implicación de estos procesos en el impacto morfológico en la playa

    Actualizando el conocimiento: arquitectura, uso y cronología de los monumentos escalonados en Mallorca

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    The ongoing excavation of a stepped monument at the Mestre Ramon settlement in the island of Mallorca provided new chronological and architectural information motivating an analytical review of known Mallorcan stepped monuments. The combination of the already existing chronological information and the new radiocarbon dates for Mestre Ramon place the construction of stepped monuments within the Prototalaiotic period (ca. 1100/1000-850 cal BCE). This chronology constitutes the basis for an analysis of the architectural characteristics of the monuments and of their relationships with other structures. This study offers a preliminary, but detailed, characterisation of the material features of stepped monuments and their social dimension within the process of social transformation that occurred during the Late Bronze Age in Mallorca.La excavación en curso de un monumento escalonado en el yacimiento de Mestre Ramon en la isla de Mallorca ha aportado nueva información cronológica y arquitectónica que ha motivado una revisión analítica de las estructuras conocidas como monumentos escalonados en Mallorca. La combinación de la información cronológica existente con nuevas dataciones radiocarbónicas relacionadas con el yacimiento de Mestre Ramon ha permitido situar el momento de construcción de los monumentos escalonados en el período Prototalayótico (ca. 1100/1000-850 cal a.n.e.). Este encuadre cronológico ha sido la base del análisis de las características arquitectónicas de dichos monumentos y su relación con otras estructuras. El trabajo que se presenta ofrece una caracterización preliminar, pero detallada, de las peculiaridades materiales de los monumentos escalonados y de su dimensión social dentro de los procesos de transformación social que se desarrollaron durante el final de la Edad de Bronce en Mallorca

    Automatic quantification of cardiomyocyte dimensions and connexin 43 lateralization in fluorescence images

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    Cardiomyocytes’ geometry and connexin 43 (CX43) amount and distribution are structural features that play a pivotal role in electrical conduction. Their quantitative assessment is of high interest in the study of arrhythmias, but it is usually hampered by the lack of automatic tools. In this work, we propose a software algorithm (Myocyte Automatic Retrieval and Tissue Analyzer, MARTA) to automatically detect myocytes from fluorescent microscopy images of cardiac tissue, measure their morphological features and evaluate the expression of CX43 and its degree of lateralization. The proposed software is based on the generation of cell masks, contouring of individual cells, enclosing of cells in minimum area rectangles and splitting of these rectangles into end-to-end and middle compartments to estimate CX43 lateral-to-total ratio. Application to human ventricular tissue images shows that mean differences between automatic and manual methods in terms of cardiomyocyte length and width are below 4 µm. The percentage of lateral CX43 also agrees between automatic and manual evaluation, with the interquartile range approximately covering from 3% to 30% in both cases. MARTA is not limited by fiber orientation and has an optimized speed by using contour filtering, which makes it run hundreds of times faster than a trained expert. Developed for CX43 studies in the left ventricle, MARTA is a flexible tool applicable to morphometric and lateralization studies of other markers in any heart chamber or even skeletal muscle. This open-access software is available online.Fil: Oliver Gelabert, Antoni. Universidad de Zaragoza; EspañaFil: García Mendívil, Laura. Universidad de Zaragoza; EspañaFil: Vallejo Gil, José María. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Fresneda Roldán, Pedro Carlos. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Andelová, Katarína. Centre of Experimental Medicine; EslovaquiaFil: Fañanás Mastral, Javier. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Vázquez Sancho, Manuel. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Matamala Adell, Marta. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Sorribas Berjón, Fernando. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Ballester Cuenca, Carlos. University Hospital Miguel Servet; EspañaFil: Tribulova, Narcisa. Centre of Experimental Medicine; EslovaquiaFil: Ordovás, Laura. Universidad de Zaragoza; EspañaFil: Diez, Emiliano Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo; ArgentinaFil: Pueyo, Esther. Biomedical Research Networking Center in Bioengineering; España. Universidad de Zaragoza; Españ

    Disseny, programació i construcció de qüestionaris amb retroacció específica automatitzada

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    [cat] El present treball és una proposta basada en l’ús de les tecnologies de la informació i les comunicacions (TIC) i de les tecnologies de l’aprenentatge i el coneixement (TAC) amb finalitats educatives mitjançant la seva inserció en un entorn web on l’estudiant interacciona amb la intenció d’aprendre. Particularment, aquest estudi centra l’atenció en una aplicació específica basada en retroaccions personalitzades en qüestionaris d’opció múltiple, que es poden elaborar mitjançant mapes mentals i es poden programar amb la tecnologia de Google Forms. L’objectiu d’aquesta tècnica és millorar l’atenció a la diversitat a partir de l’especificitat de la retroacció i la facilitació de l’avaluació formativa. Així s’introdueix el procés de correcció d’errors d’una manera automàtica a l’ensenyament. El professor només ha d’elaborar el qüestionari un cop, amb l’opció de millorar-lo amb el temps mitjançant l’adquisició de dades noves. El fet d’estar contextualitzat en un entorn digital en línia fa que el formulari estigui disponible des de qualsevol ordinador amb accés a internet. Això, a més, permet crear-los en conjunt donades les facilitats que aporten les tecnologies al nigul quant al treball cooperatiu, tant entre professorat com entre professorat i alumnat. El procediment genèric és exemplificat en quatre casos pràctics particulars implementats a la xarxa i incrustats en un directori web creat per exposar els continguts d’aquest treball de fi de màster (Oliver, 2017). A més, es proposa un procediment sistemàtic experimental que pot dur a terme el professor per tal de captar les idees dels estudiants i elaborar els qüestionaris interactius. Els casos pràctics són elements concrets d’una unitat didàctica que tracta els continguts de la pressió estàtica a 4t d’ESO. Aquests continguts estan ubicats en el bloc 4 anomenat el moviment i les forces, que estan descrits en el currículum bàsic (Reial decret 1105/2014)

    Desarrollo y aceleración hardware de metodologías de descripción y comparación de compuestos orgánicos

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    Introducción El acelerado ritmo al que se genera y crece la información en la sociedad actual y la posible llegada de la tecnología de transistor a sus límites de tamaño exige la puesta en marcha de soluciones para el procesado eficiente de datos en campos específicos de aplicación. Contenido Esta tesis doctoral de carácter transdisciplinar a medio camino entre la ingeniería electrónica y la química computacional presenta soluciones optimizadas en hardware y en software para la construcción y el procesado eficiente de bases de datos moleculares. En primer lugar se propone y se estudia el funcionamiento de bloques digitales que implementan funciones en lógica pulsante estocástica orientadas a tareas de reconocimiento de objetos. Especialmente se proponen y analizan diseños digitales para la construcción de generadores de números aleatorios (RNG) como base de estos sistemas que han sido implementados en dispositivos Field Programable Gate Array (FPGA). En segundo lugar se propone y se evalúa un conjunto reducido de descriptores moleculares para la caracterización de compuestos orgánicos y la generación de bases de datos moleculares. Estos descriptores recogen información sobre la distribución de la carga molecular en el espacio y la energía electrostática. Las bases de datos generadas con estos descriptores se han procesado utilizando sistemas de computación convencionales en software y mediante sistemas de computación estocástica implementados en hardware mediante el uso de circuitería digital programable. Finalmente se proponen optimizaciones para la estimación del potencial electrostático molecular (MEP) y para el cálculo de los puntos de interacción molecular derivados (SSIP). Conclusiones Por una parte, los resultados obtenidos ponen de manifiesto la importancia de la uniformidad de los RNG en el período de evaluación para poder implementar sistemas de computación estocástica de alta fiabilidad. Además, los RNG propuestos tienen una naturaleza aperiódica que minimiza las posibles correlaciones entre señales, haciendo que sean adecuados para la implementación de sistemas de computación estocástica. Por otra parte, el conjunto de descriptores moleculares propuestos PED han demostrado obtener muy buenos resultados en comparación con otros métodos presentes en la literatura. Este hecho se ha discutido mediante los parámetros Area Under The Curve (AUC) y Enrichment Factor (EF) obtenidos de las curvas promedio Receiving Operating Characteristic (ROC). Además, se ha mostrado como la eficacia de los descriptores aumenta cuando se implementan en sistemas de clasificación con aprendizaje supervisado, haciéndolos adecuados para la construcción de un sistema de predicción de dianas terapéuticas eficiente. En esta tesis, además, se ha determinado que los MEP calculados utilizando la teoría DFT y el conjunto de bases B3LYP/6-31*G en la superficie con densidad electrónica 0,01 au correlacionan bien con datos experimentales debido presumiblemente a la mayor contribución de las propiedades electrostáticas locales reflejadas en el MEP. Las parametrizaciones propuestas en función del tipo de hibridación atómica pueden haber contribuido también a esta mejora. Los cálculos realizados en dichas superficies suponen mejoras en un factor cinco en la velocidad de procesamiento del MEP. Dado el aceptable ajuste a datos experimentales del método propuesto para el cálculo del MEP aproximado y de los SSIP, éste se puede utilizar con el fin de obtener los SSIP para bases de datos moleculares extensas o en macromoléculas como proteínas de manera muy rápida (ya que la velocidad de procesamiento obtenida puede alcanzar del orden de cinco mil átomos procesados por segundo utilizando un solo procesador). Estas técnicas resultan de especial interés dadas las numerosas aplicaciones de los SSIP como por ejemplo el cribado virtual de cocristales o la predicción de energías libres en disolución.Introducció El creixement accelerat de les dades en la societat actual i l'arribada de la tecnologia del transistor als límits físics exigeix la proposta de metodologies per al processament eficient de dades. Contingut Aquesta tesi doctoral, de caràcter transdisciplinària i a mig camí entre els camps de l'enginyeria electrònica i la química computacional presenta solucions optimitzades en maquinari i en programari per tal d’accelerar el processament de bases de dades moleculars. En primer lloc es proposa i s'estudia el funcionament de blocs digitals que implementen funcions de lògica polsant estocàstica aplicades a tasques de reconeixement d'objectes. En concret es proposen i analitzen dissenys específics per a la construcció de generadors de nombres aleatoris (RNG) com a sistemes bàsics per al funcionament dels sistemes de computació estocàstics implementats en dispositius programables com les Field Programable Gate Array (FPGA). En segon lloc es proposen i avaluen un conjunt reduït de descriptors moleculars especialment orientats a la caracterització de compostos orgànics. Aquests descriptors reuneixen la informació sobre la distribució de càrrega molecular i les energies electroestàtiques. Les bases de dades generades amb aquests descriptors s’han processat emprant sistemes de computació convencionals en programari i mitjançant sistemes basats en computació estocàstica implementats en maquinari programable. Finalment es proposen optimitzacions per al càlcul del potencial electroestàtic molecular (MEP) calculat mitjançant la teoria del funcional de la densitat (DFT) i dels punts d’interacció que se’n deriven (SSIP). Conclusions Per una banda, els resultats obtinguts posen de manifest la importància de la uniformitat del RNG en el període d’avaluació per a poder implementar sistemes de computació estocàstics d’alta fiabilitat. A més, els RNG proposats presenten una font d’aleatorietat aperiòdica que minimitza les correlacions entre senyals, fent-los adequats per a la implementació de sistemes de computació estocàstica. Per una altra banda, el conjunt de descriptors moleculars proposats PED, han demostrat obtenir molts bons resultats en comparació amb els mètodes presents a la literatura. Aquest fet ha estat discutit mitjançant l’anàlisi dels paràmetres Area Under The Curve (AUC) i Enrichment Factor (EF) de les curves Receiving Operating Characteristic (ROC) analitzades. A més, s’ha mostrat com l’eficàcia dels descriptors augmenta de manera significativa quan s’implementen en sistemes de classificació amb aprenentatge supervisat com les finestres de Parzen, fent-los adequats per a la construcció d’un sistema de predicció de dianes terapèutiques eficient. En aquesta tesi doctoral, a més, s’ha trobat que els MEP calculats mitjançant la teoria DFT i el conjunt de bases B3LYP/6-31*G en la superfície amb densitat electrònica 0,01 au correlacionen bé amb dades experimentals possiblement a causa de la contribució més gran de les propietats electroestàtiques locals reflectides en el MEP. Les parametritzacions proposades en funció del tipus d’hibridació atòmica han contribuït també a la millora dels resultats. Els càlculs realitzats en aquestes superfícies suposen un guany en un factor cinc en la velocitat de processament del MEP. Donat l’acceptable ajust a les dades experimentals del mètode proposat per al càlcul del MEP aproximat i dels SSIP que se’n deriven, aquest procediment es pot emprar per obtenir els SSIP en bases de dades moleculars extenses i en macromolècules (com ara proteïnes) d’una manera molt ràpida (ja que la velocitat de processament obtinguda arriba fins als cinc mil àtoms per segon amb un sol processador). Les tècniques proposades en aquesta tesi doctoral resulten d’interès donades les nombroses aplicacions que tenen els SSIP com per exemple, en el cribratge virtual de cocristalls o en la predicció d’energies lliures en dissolució.Introduction Because of the generalized data growth in the nowadays digital era and due to the fact that we are possibly living on the last days of the Moore’s law, there exists a good reason for being focused on the development of technical solutions for efficient data processing. Contents In this transdisciplinary thesis between electronic engineering and computational chemistry, it's shown optimal solutions in hardware and software for molecular database processing. On the first hand, there's proposed and studied a set of stochastic computing systems in order to implement ultrafast pattern recognition applications. Specially, it’s proposed and analyzed specific digital designs in order to create digital Random Number Generators (RNG) as a base for stochastic functions. The digital platform used to generate the results is a Field Programmable Gate Array (FPGA). On the second hand, there's proposed and evaluated a set of molecular descriptors in order to create a compact molecular database. The proposed descriptors gather charge and molecular geometry information and they have been used as a database both in software conventional computing and in hardware stochastic computing. Finally, there's a proposed a set of optimizations for Molecular Electrostatic Potential (MEP) and Surface Site Interaction Points (SSIP). Conclusions Firstly, the results show the relevance of the uniformity of the RNG within the evaluation period in order to implement high precision stochastic computing systems. In addition, the proposed RNG have an aperiodic behavior which avoid some potential correlations between stochastic signals. This property makes the proposed RNG suitable for implementation of stochastic computing systems. Secondly, the proposed molecular descriptors PED have demonstrated to provide good results in comparison with other methods that are present in the literature. This has been discussed by the use of Area Under the Curve (AUC) and Enrichment Factor (EF) of averaged Receiving Operating Characteristic (ROC) curves. Furthermore, the performance of the proposed descriptors gets increased when they are implemented in supervised machine learning algorithms making them appropriate for therapeutic target predictions. Thirdly, the efficient molecular database characterization and the usage of stochastic computing circuitry can be used together in order to implement ultrafast information processing systems. On the other hand, in this thesis, it has been found that the MEP calculated by using DFT and B3LYP/6-31*G basis at 0.01 au density surface level has good correlation with experimental data. This fact may be due to the important contribution of local electrostatics and the refinement performed by the parameterization of the MEP as a function of the orbital atom type. Additionally, the proposed calculation over 0.01 au is five times faster than the calculation over 0.002 au. Finally, due to acceptable agreement between experimental data and theoretical results obtained by using the proposed calculation for MEP and SSIP, the proposed method is suitable for being applied in order to quickly process big molecular databases and macromolecules (the processing speed can achieve five thousand molecules per second using a single processor). The proposed techniques have special interest with the purpose of finding the SSIP because the big number of applications they have as for instance in virtual cocrystal screening and calculation of free energies in solution

    Desarrollo y aceleración hardware de metodologías de descripción y comparación de compuestos orgánicos

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    Introducción El acelerado ritmo al que se genera y crece la información en la sociedad actual y la posible llegada de la tecnología de transistor a sus límites de tamaño exige la puesta en marcha de soluciones para el procesado eficiente de datos en campos específicos de aplicación. Contenido Esta tesis doctoral de carácter transdisciplinar a medio camino entre la ingeniería electrónica y la química computacional presenta soluciones optimizadas en hardware y en software para la construcción y el procesado eficiente de bases de datos moleculares. En primer lugar se propone y se estudia el funcionamiento de bloques digitales que implementan funciones en lógica pulsante estocástica orientadas a tareas de reconocimiento de objetos. Especialmente se proponen y analizan diseños digitales para la construcción de generadores de números aleatorios (RNG) como base de estos sistemas que han sido implementados en dispositivos Field Programable Gate Array (FPGA). En segundo lugar se propone y se evalúa un conjunto reducido de descriptores moleculares para la caracterización de compuestos orgánicos y la generación de bases de datos moleculares. Estos descriptores recogen información sobre la distribución de la carga molecular en el espacio y la energía electrostática. Las bases de datos generadas con estos descriptores se han procesado utilizando sistemas de computación convencionales en software y mediante sistemas de computación estocástica implementados en hardware mediante el uso de circuitería digital programable. Finalmente se proponen optimizaciones para la estimación del potencial electrostático molecular (MEP) y para el cálculo de los puntos de interacción molecular derivados (SSIP). Conclusiones Por una parte, los resultados obtenidos ponen de manifiesto la importancia de la uniformidad de los RNG en el período de evaluación para poder implementar sistemas de computación estocástica de alta fiabilidad. Además, los RNG propuestos tienen una naturaleza aperiódica que minimiza las posibles correlaciones entre señales, haciendo que sean adecuados para la implementación de sistemas de computación estocástica. Por otra parte, el conjunto de descriptores moleculares propuestos PED han demostrado obtener muy buenos resultados en comparación con otros métodos presentes en la literatura. Este hecho se ha discutido mediante los parámetros Area Under The Curve (AUC) y Enrichment Factor (EF) obtenidos de las curvas promedio Receiving Operating Characteristic (ROC). Además, se ha mostrado como la eficacia de los descriptores aumenta cuando se implementan en sistemas de clasificación con aprendizaje supervisado, haciéndolos adecuados para la construcción de un sistema de predicción de dianas terapéuticas eficiente. En esta tesis, además, se ha determinado que los MEP calculados utilizando la teoría DFT y el conjunto de bases B3LYP/6-31*G en la superficie con densidad electrónica 0,01 au correlacionan bien con datos experimentales debido presumiblemente a la mayor contribución de las propiedades electrostáticas locales reflejadas en el MEP. Las parametrizaciones propuestas en función del tipo de hibridación atómica pueden haber contribuido también a esta mejora. Los cálculos realizados en dichas superficies suponen mejoras en un factor cinco en la velocidad de procesamiento del MEP. Dado el aceptable ajuste a datos experimentales del método propuesto para el cálculo del MEP aproximado y de los SSIP, éste se puede utilizar con el fin de obtener los SSIP para bases de datos moleculares extensas o en macromoléculas como proteínas de manera muy rápida (ya que la velocidad de procesamiento obtenida puede alcanzar del orden de cinco mil átomos procesados por segundo utilizando un solo procesador). Estas técnicas resultan de especial interés dadas las numerosas aplicaciones de los SSIP como por ejemplo el cribado virtual de cocristales o la predicción de energías libres en disolución.Introducció El creixement accelerat de les dades en la societat actual i l'arribada de la tecnologia del transistor als límits físics exigeix la proposta de metodologies per al processament eficient de dades. Contingut Aquesta tesi doctoral, de caràcter transdisciplinària i a mig camí entre els camps de l'enginyeria electrònica i la química computacional presenta solucions optimitzades en maquinari i en programari per tal d’accelerar el processament de bases de dades moleculars. En primer lloc es proposa i s'estudia el funcionament de blocs digitals que implementen funcions de lògica polsant estocàstica aplicades a tasques de reconeixement d'objectes. En concret es proposen i analitzen dissenys específics per a la construcció de generadors de nombres aleatoris (RNG) com a sistemes bàsics per al funcionament dels sistemes de computació estocàstics implementats en dispositius programables com les Field Programable Gate Array (FPGA). En segon lloc es proposen i avaluen un conjunt reduït de descriptors moleculars especialment orientats a la caracterització de compostos orgànics. Aquests descriptors reuneixen la informació sobre la distribució de càrrega molecular i les energies electroestàtiques. Les bases de dades generades amb aquests descriptors s’han processat emprant sistemes de computació convencionals en programari i mitjançant sistemes basats en computació estocàstica implementats en maquinari programable. Finalment es proposen optimitzacions per al càlcul del potencial electroestàtic molecular (MEP) calculat mitjançant la teoria del funcional de la densitat (DFT) i dels punts d’interacció que se’n deriven (SSIP). Conclusions Per una banda, els resultats obtinguts posen de manifest la importància de la uniformitat del RNG en el període d’avaluació per a poder implementar sistemes de computació estocàstics d’alta fiabilitat. A més, els RNG proposats presenten una font d’aleatorietat aperiòdica que minimitza les correlacions entre senyals, fent-los adequats per a la implementació de sistemes de computació estocàstica. Per una altra banda, el conjunt de descriptors moleculars proposats PED, han demostrat obtenir molts bons resultats en comparació amb els mètodes presents a la literatura. Aquest fet ha estat discutit mitjançant l’anàlisi dels paràmetres Area Under The Curve (AUC) i Enrichment Factor (EF) de les curves Receiving Operating Characteristic (ROC) analitzades. A més, s’ha mostrat com l’eficàcia dels descriptors augmenta de manera significativa quan s’implementen en sistemes de classificació amb aprenentatge supervisat com les finestres de Parzen, fent-los adequats per a la construcció d’un sistema de predicció de dianes terapèutiques eficient. En aquesta tesi doctoral, a més, s’ha trobat que els MEP calculats mitjançant la teoria DFT i el conjunt de bases B3LYP/6-31*G en la superfície amb densitat electrònica 0,01 au correlacionen bé amb dades experimentals possiblement a causa de la contribució més gran de les propietats electroestàtiques locals reflectides en el MEP. Les parametritzacions proposades en funció del tipus d’hibridació atòmica han contribuït també a la millora dels resultats. Els càlculs realitzats en aquestes superfícies suposen un guany en un factor cinc en la velocitat de processament del MEP. Donat l’acceptable ajust a les dades experimentals del mètode proposat per al càlcul del MEP aproximat i dels SSIP que se’n deriven, aquest procediment es pot emprar per obtenir els SSIP en bases de dades moleculars extenses i en macromolècules (com ara proteïnes) d’una manera molt ràpida (ja que la velocitat de processament obtinguda arriba fins als cinc mil àtoms per segon amb un sol processador). Les tècniques proposades en aquesta tesi doctoral resulten d’interès donades les nombroses aplicacions que tenen els SSIP com per exemple, en el cribratge virtual de cocristalls o en la predicció d’energies lliures en dissolució.Introduction Because of the generalized data growth in the nowadays digital era and due to the fact that we are possibly living on the last days of the Moore’s law, there exists a good reason for being focused on the development of technical solutions for efficient data processing. Contents In this transdisciplinary thesis between electronic engineering and computational chemistry, it's shown optimal solutions in hardware and software for molecular database processing. On the first hand, there's proposed and studied a set of stochastic computing systems in order to implement ultrafast pattern recognition applications. Specially, it’s proposed and analyzed specific digital designs in order to create digital Random Number Generators (RNG) as a base for stochastic functions. The digital platform used to generate the results is a Field Programmable Gate Array (FPGA). On the second hand, there's proposed and evaluated a set of molecular descriptors in order to create a compact molecular database. The proposed descriptors gather charge and molecular geometry information and they have been used as a database both in software conventional computing and in hardware stochastic computing. Finally, there's a proposed a set of optimizations for Molecular Electrostatic Potential (MEP) and Surface Site Interaction Points (SSIP). Conclusions Firstly, the results show the relevance of the uniformity of the RNG within the evaluation period in order to implement high precision stochastic computing systems. In addition, the proposed RNG have an aperiodic behavior which avoid some potential correlations between stochastic signals. This property makes the proposed RNG suitable for implementation of stochastic computing systems. Secondly, the proposed molecular descriptors PED have demonstrated to provide good results in comparison with other methods that are present in the literature. This has been discussed by the use of Area Under the Curve (AUC) and Enrichment Factor (EF) of averaged Receiving Operating Characteristic (ROC) curves. Furthermore, the performance of the proposed descriptors gets increased when they are implemented in supervised machine learning algorithms making them appropriate for therapeutic target predictions. Thirdly, the efficient molecular database characterization and the usage of stochastic computing circuitry can be used together in order to implement ultrafast information processing systems. On the other hand, in this thesis, it has been found that the MEP calculated by using DFT and B3LYP/6-31*G basis at 0.01 au density surface level has good correlation with experimental data. This fact may be due to the important contribution of local electrostatics and the refinement performed by the parameterization of the MEP as a function of the orbital atom type. Additionally, the proposed calculation over 0.01 au is five times faster than the calculation over 0.002 au. Finally, due to acceptable agreement between experimental data and theoretical results obtained by using the proposed calculation for MEP and SSIP, the proposed method is suitable for being applied in order to quickly process big molecular databases and macromolecules (the processing speed can achieve five thousand molecules per second using a single processor). The proposed techniques have special interest with the purpose of finding the SSIP because the big number of applications they have as for instance in virtual cocrystal screening and calculation of free energies in solution

    Análisis del Comportamiento Dinámico de los Diques de Baja Cota de Coronación

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    Los diques de Baja Cota de Coronación constituyen una prometedora alternativa como barrera parcial para ciertas aplicaciones en Ingeniería de Costas. Poseen algunas ventajas potenciales frente a estructuras más convencionales, pero su diseño funcional es complicado por la gran cantidad de variables que intervienen, y por la complejidad de los procesos hidro-morfodinámicos que toman parte, siendo su impacto y funcionalidad difícil de prever. En este texto se realiza primeramente una revisión del estado del arte, y a continuación se estudian, mediante simulación numérica y análisis de datos experimentales en un modelo físico, los diferentes procesos que tienen lugar en torno a estructuras de baja cota de coronación con diferente grado de francobordo y ancho de coronación, y bajo diferentes condiciones de clima de oleaje. Además se caracteriza dinámicamente la implicación de estos procesos en el impacto morfológico en la playa

    Updating knowledge: architecture, use and chronology of the Late Bronze Age stepped monuments in Mallorca

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    The ongoing excavation of a stepped monument at the Mestre Ramon settlement in the island of Mallorca provided new chronological and architectural information motivating an analytical review of known Mallorcan stepped monuments. The combination of the already existing chronological information and the new radiocarbon dates for Mestre Ramon place the construction of stepped monuments within the Prototalaiotic period (ca. 1100/1000-850 cal BCE). This chronology constitutes the basis for an analysis of the architectural characteristics of the monuments and of their relationships with other structures. This study offers a preliminary, but detailed, characterisation of the material features of stepped monuments and their social dimension within the process of social transformation that occurred during the Late Bronze Age in Mallorca.La excavación en curso de un monumento escalonado en el yacimiento de Mestre Ramon en la isla de Mallorca ha aportado nueva información cronológica y arquitectónica que ha motivado una revisión analítica de las estructuras conocidas como monumentos escalonados en Mallorca. La combinación de la información cronológica existente con nuevas dataciones radiocarbónicas relacionadas con el yacimiento de Mestre Ramon ha permitido situar el momento de construcción de los monumentos escalonados en el período Prototalayótico (ca. 1100/1000-850 cal a.n.e.). Este encuadre cronológico ha sido la base del análisis de las características arquitectónicas de dichos monumentos y su relación con otras estructuras. El trabajo que se presenta ofrece una caracterización preliminar, pero detallada, de las peculiaridades materiales de los monumentos escalonados y de su dimensión social dentro de los procesos de transformación social que se desarrollaron durante el final de la Edad de Bronce en Mallorca

    A Bayesian target predictor method based on molecular pairing energies estimation

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    [eng] Virtual screening (VS) is applied in the early drug discovery phases for the quick inspection of huge molecular databases to identify those compounds that most likely bind to a given drug target. In this context, there is the necessity of the use of compact molecular models for database screening and precise target prediction in reasonable times. In this work we present a new compact energy-based model that is tested for its application to Virtual Screening and target prediction. The model can be used to quickly identify active compounds in huge databases based on the estimation of the molecule's pairing energies. The greatest molecular polar regions along with its geometrical distribution are considered by using a short set of smart energy vectors. The model is tested using similarity searches within the Directory of Useful Decoys (DUD) database. The results obtained are considerably better than previously published models. As a Target prediction methodology we propose the use of a Bayesian Classifier that uses a combination of different active compounds to build an energy-dependent probability distribution function for each target

    Interindividual Age-Independent Differences in Human CX43 Impact Ventricular Arrhythmic Risk

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    Connexin 43 (CX43) is one of the major components of gap junctions, the structures responsible for the intercellular communication and transmission of the electrical impulse in the left ventricle. There is limited information on the histological changes of CX43 with age and their effect on electrophysiology, especially in humans. Here, we analyzed left ventricular biopsies from living donors starting at midlife to characterize age-related CX43 remodeling. We assessed its quantity, degree of lateralization, and spatial heterogeneity together with fibrotic deposition. We observed no significant age-related remodeling of CX43. Only spatial heterogeneity increased slightly with age, and this increase was better explained by biological age than by chronological age. Importantly, we found that CX43 features varied considerably among individuals in our population with no relevant relationship to age or fibrosis content, in contrast to animal species. We used our experimental results to feed computational models of human ventricular electrophysiology and to assess the effects of interindividual differences in specific features of CX43 and fibrosis on conduction velocity, action potential duration, and arrhythmogenicity. We found that larger amounts of fibrosis were associated with the highest arrhythmic risk, with this risk being increased when fibrosis deposition was combined with a reduction in CX43 amount and/or with an increase in CX43 spatial heterogeneity. These mechanisms underlying high arrhythmic risk in some individuals were not associated with age in our study population. In conclusion, our data rule out CX43 remodeling as an age-related arrhythmic substrate in the population beyond midlife, but highlight its potential as a proarrhythmic factor at the individual level, especially when combined with increased fibrosis
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