O ATUAL CENÁRIO PENITENCIÁRIO BRASILEIRO: DESCASO E ABANDONO DA FUNÇÃO REABILITADORA

A política criminal brasileira apresenta à população a imagem de que o sistema penitenciário está de acordo com as diretrizes humanitárias e respeita princípios como o da dignidade da pessoa humana. A ideia de recuperação foi, assim, inserida ao ideal de punição e fez com que a finalidade da pena privativa de liberdade possuísse um duplo caráter (retributivo e reformador). Esse conceito criou raízes no imaginário da sociedade contemporânea, entretanto o aumento constante e significativo da população carcerária e a realidade dos estabelecimentos demonstra o oposto. Desse modo, por meio de uma pesquisa qualitativa bibliográfica e documental, usando-se de literatura e de dados estatísticos, pretende-se demonstrar algumas questões da realidade carcerária brasileira e como a reabilitação não ocorre no sistema penitenciário brasileiro, uma vez que o seu conceito não mais se aplica na formação social atual

CONTRIBUIÇÃO DA ENFERMAGEM NOS CUIDADOS RELACIONADOS A CATETERISMO VENOSO PERIFÉRICO EM NEONATOS INTERNADOS EM UNIDADES DE TRATAMENTO INTENSIVO

This research aims to identify nursing care related to peripheral venipuncture in neonatal patients admitted to intensive care units. This is an integrative literature review, carried out between September and October 25, 2021, through the databases Latin American and Caribbean Literature in Health Sciences (LILACS), Nursing Database (BDENF), Scientific Electronic Library Online (Scielo), Medical Literature Analysis and Retrievel System Online (MEDLINE) and PubMed. Descriptors in Health Sciences (DeCS) were used and crossed with the Boolean operator “AND”: Nursing care AND peripheral catheterization AND Neonates AND Intensive care unit (together and separately). Ten studies were used to build the research discussion. The nursing team is a crucial factor in the care of neonatal patients in Intensive Care Units, adopting practices and planning aimed at safety and quality of hospitalization in relation to the insertion, care and removal of the PICC. In addition, the referent study serves as an influence for the development of new research on this theme.Esta investigación tiene como objetivo identificar los cuidados de enfermería relacionados con la punción venosa periférica en pacientes neonatales ingresados ​​en unidades de cuidados intensivos. Se trata de una revisión integradora de la literatura, realizada entre septiembre y el 25 de octubre de 2021, a través de las bases de datos Literatura Latinoamericana y del Caribe en Ciencias de la Salud (LILACS), Base de Datos de Enfermería (BDENF), Biblioteca Electrónica Científica en Línea (Scielo), Análisis de Literatura Médica y Retrievel System Online (MEDLINE) y PubMed. Se utilizaron Descriptores en Ciencias de la Salud (DeCS) y se cruzaron con el operador booleano “Y”: Cuidados de enfermería Y cateterismo periférico Y Neonatos Y Unidad de cuidados intensivos (juntos y por separado). Se utilizaron diez estudios para construir la discusión de la investigación. El equipo de enfermería es un factor crucial en la atención de los pacientes neonatales en las Unidades de Cuidados Intensivos, adoptando prácticas y planificación orientadas a la seguridad y calidad de la hospitalización en relación a la inserción, cuidado y retiro del PICC. Además, el estudio referente sirve de influencia para el desarrollo de nuevas investigaciones sobre este temaA referida pesquisa objetiva-se pela identificação dos cuidados de enfermagem relacionados a punção venosa periférica em pacientes neonatais internados em unidades de tratamento intensivo. Trata-se de uma revisão da literatura do tipo integrativa, realizada entre os meses de setembro a 25 de outubro de 2021, através das bases de dados Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde (LILACS), Base de Dados de Enfermagem (BDENF), o portal Scientific Electronic Library Online (Scielo), Medical Literature Analysis and Retrievel System Online (MEDLINE) e PubMed. Utilizado os Descritores em Ciências da Saúde (DeCS) e cruzados com o operador booleano “AND”: Cuidados de enfermagem AND cateterismo periférico AND Neonatos AND Unidade de terapia intensiva (juntos e separados). Foram usados 10 estudos para construção da discussão da pesquisa. A equipe de enfermagem é fator crucial no cuidado a pacientes neonatais em Unidades de Terapia Intensiva, adotando práticas e planejamentos que visam segurança e qualidade de internação em relação a inserção, cuidado e remoção do PICC. Além disso, o referente estudo serve de influência para o desenvolvimento de novas pesquisas nessa temática

A community effort in SARS-CoV-2 drug discovery.

peer reviewedThe COVID-19 pandemic continues to pose a substantial threat to human lives and is likely to do so for years to come. Despite the availability of vaccines, searching for efficient small-molecule drugs that are widely available, including in low- and middle-income countries, is an ongoing challenge. In this work, we report the results of an open science community effort, the "Billion molecules against Covid-19 challenge", to identify small-molecule inhibitors against SARS-CoV-2 or relevant human receptors. Participating teams used a wide variety of computational methods to screen a minimum of 1 billion virtual molecules against 6 protein targets. Overall, 31 teams participated, and they suggested a total of 639,024 molecules, which were subsequently ranked to find 'consensus compounds'. The organizing team coordinated with various contract research organizations (CROs) and collaborating institutions to synthesize and test 878 compounds for biological activity against proteases (Nsp5, Nsp3, TMPRSS2), nucleocapsid N, RdRP (only the Nsp12 domain), and (alpha) spike protein S. Overall, 27 compounds with weak inhibition/binding were experimentally identified by binding-, cleavage-, and/or viral suppression assays and are presented here. Open science approaches such as the one presented here contribute to the knowledge base of future drug discovery efforts in finding better SARS-CoV-2 treatments.R-AGR-3826 - COVID19-14715687-CovScreen (01/06/2020 - 31/01/2021) - GLAAB Enric

Educomunicação e suas áreas de intervenção: Novos paradigmas para o diálogo intercultural

oai:omp.abpeducom.org.br:publicationFormat/1O material aqui divulgado representa, em essência, a contribuição do VII Encontro Brasileiro de Educomunicação ao V Global MIL Week, da UNESCO, ocorrido na ECA/USP, entre 3 e 5 de novembro de 2016. Estamos diante de um conjunto de 104 papers executivos, com uma média de entre 7 e 10 páginas, cada um. Com este rico e abundante material, chegamos ao sétimo e-book publicado pela ABPEducom, em seus seis primeiros anos de existência. A especificidade desta obra é a de trazer as “Áreas de Intervenção” do campo da Educomunicação, colocando-as a serviço de uma meta essencial ao agir educomunicativo: o diálogo intercultural, trabalhado na linha do tema geral do evento internacional: Media and Information Literacy: New Paradigms for Intercultural Dialogue

Computer simulations of protein unfolding and ligand binding with enhanced sampling

Simulações moleculares podem fornecer informações e detalhes mecanísticos que são difíceis de obter de experimentos. No entanto, fenômenos bioquímicos como formação de complexos proteína-ligante e desenovelamento de proteína são lentos e difíceis de amostrar na escala de tempo geralmente atingida por simulações de dinâmica molecular (MD) convencionais. Esses fenômenos moleculares foram estudados aqui pela combinação de simulações de MD com diversos métodos e aproximações para aumentar a amostragem configuracional: método de energia de interação linear (LIE), a aproximação de ensemble ponderado (WE) e dinâmica molecular dirigida (SMD). Uma equação foi parametrizada para prever afinidades entre pequenas moléculas e proteínas baseada na aproximação LIE, que foca a amostragem computacional nos estados complexado e não-complexado do ligante. A flexibilidade proteica foi introduzida usando ensembles de configurações obtidos de simulações de MD. Diferentes esquemas de média foram testados para obter afinidades totais de complexos proteína-ligante, revelando que muitas configurações de complexo contribuem para as afinidades de proteínas flexíveis, enquanto as afinidades de proteínas rígidas são dominadas por uma configuração de complexo. O mutante L99A da lisozima T4 (T4L) é provavelmente a proteína mais frequentemente usada para estudar complexação de ligantes. Estruturas cristalográficas mostram que a cavidade de ligação artificial criada pela mutação é pouco acessível, portanto movimentos proteicos ou uma respiração conformacional são necessários para permitir a entrada e saída de ligantes. Simulações de MD foram combinadas aqui com a aproximação de WE para aumentar a amostragem de eventos infrequentes de saída do benzeno de T4L. Quatro possíveis caminhos foram encontrados e movimentações de alfa-hélices e cadeias laterais envolvidas na saída do ligante foram caracterizadas. Os quatro caminhos correspondem a túneis da proteína previamente observados em simulações de MD longas de T4L apo, sugerindo que a heterogeneidade de caminhos ao longo de túneis intrínsecos é explorada por pequenas moléculas para sair de cavidades de ligação enterradas em proteínas. Experimentos de microscopia de força atômica revelaram informações detalhadas do desenovelamento forçado e da estabilidade mecânica da rubredoxina, uma proteína ferro-enxofre simples. O desenovelamento completo da rubredoxina envolve a ruptura de ligações covalentes. Portanto, o processo de desenovelamento foi simulado aqui por simulações de SMD acopladas a uma descrição clássica da dissociação de ligações. A amostragem de eventos de desenovelamento forçado foi aumentada pelo uso de velocidades rápidas de esticamento. Os resultados foram analisados usando um modelo teórico válido para regimes de desenovelamento forçado lentos e rápidos. As simulações revelaram que mudanças no ponto de aplicação de força ao longo da sequência da rubredoxina levam a diferentes mecanismos de desenovelamento, caracterizados por variáveis graus de rompimento de ligações de hidrogênio e estrutura secundária da proteína.Molecular simulations may provide information and mechanistic insights that are difficult to obtain from experiments. However, biochemical phenomena such as ligand-protein binding and protein unfolding are slow and hard to sample on the timescales usually reached by conventional molecular dynamics (MD) simulations. These molecular phenomena were studied here by combining MD simulations with several methods or approximations to enhance configurational sampling: linear interaction energy (LIE) method, weighted ensemble (WE) approach and steered molecular dynamics (SMD). An equation was parametrized to predict affinities between small molecules and proteins based on the LIE approximation, which focus computational sampling in ligand bound and unbound states. Protein flexibility was introduced by using ensembles of configurations obtained from MD simulations. Different averaging schemes were tested to obtain overall affinities for ligand-protein complexes, revealing that many bound configurations contribute to affinities for flexible proteins, while affinities for rigid proteins are dominated by one bound configuration. T4 lysozyme (T4L) L99A mutant is probably the protein most often used to study ligand binding. Crystal structures show the artificial binding cavity created by the mutation has low accessibility, so protein movements or conformational breathing are necessary to allow the entry and egress of ligands. MD simulations were combined here with the WE approach to enhance sampling of infrequent benzene unbinding events from T4L. Four possible pathways were found and motions on alpha-helices and side chains involved in ligand egress were characterized. The four pathways correspond to protein tunnels previously observed in long MD simulations of apo T4L, suggesting that pathway heterogeneity along intrinsic tunnels is explored by small molecules to egress from binding cavities buried in proteins. Previous atomic force microscopy experiments revealed detailed information on the forced unfolding and mechanical stability of rubredoxin, a simple iron-sulfur protein. Complete unfolding of rubredoxin involves rupture of covalent bonds. Thus, the unfolding process was simulated here by SMD simulations coupled to a classical description of bond dissociation. Sampling of forced unfolding events was increased by using fast pulling velocities. Results were analyzed using a theoretical model valid for both slow and fast forced unfolding regimes. Simulations revealed that changing the points of force application along the rubredoxin sequence leads to different unfolding mechanisms, characterized by variable degrees of disruption of hydrogen bonds and secondary protein structure

A computational method to estimate affinities between flexible proteins and small ligands

Métodos computacionais são usados para gerar estruturas de complexo proteína-ligante e estimar suas afinidades. Esse trabalho investigou como as diferentes representações da flexibilidade proteica afetam as poses obtidas por ancoragem molecular e as afinidades atribuídas a essas poses. Os mutantes L99A e L99A/M102Q da lisozima T4 foram escolhidos como sistemas modelo. Um descritor para predição de afinidades baseado na aproximação de energia de interação linear (LIE) foi parametrizado especificamente para ligantes da lisozima e foi usado para estimar as afinidades. A proteína foi representada como um grupo de estruturas cristalográficas ou de estruturas de trajetória de dinâmica molecular. O campo de força OPLS-AA para modelar a proteína e os ligantes e a aproximação de Born generalizada para modelar o solvente foram empregados. O descritor de afinidades parametrizado resultou em desvios médios entre afinidades experimentais e calculadas de 1,8 kcal/mol para um conjunto de testes. O descritor teve desempenho satisfatório na separação entre poses cristalográficas e poses falso-positivo e na identificação de poses falso-positivo. Experimentos de agrupamento de complexos realizados com o objetivo de reduzir o custo computacional para estimar afinidades apresentaram resultados insatisfatórios. As melhores aproximações da teoria do ligante implícito propostas aqui para estimar afinidades consideram conjuntos de estruturas de receptor com o mesmo peso. Configurações de ligante também apresentam o mesmo peso ou são dominadas por uma única configuração. A representação da flexibilidade requer um tratamento estatístico adequado para estimativa de afinidades. Aqui, a associação entre LIE e a teoria do ligante implícito mostrou-se frutífera.Computational methods are used to generate protein-ligand complex structures and estimate their binding affinities. This work investigated how different representations of protein flexibility affect poses obtained by molecular docking and the affinities attributed to these poses. T4 lysozyme mutants L99A and L99A/M102Q were chosen as model systems. A descriptor for prediction of affinities based on linear interaction energy (LIE) approximation was parametrized specifically to lysozyme ligands and was used to estimate affinities. The protein was represented as a group of crystal structures or as structures from a molecular dynamics trajectory. OPLS-AA force field was used to model protein and ligands and the Generalized Born approximation was used to model solvent. The parametrized affinity descriptor resulted in average deviations between experimental and calculated affinities of 1.8 kcal/mol for a test set. Descriptor performance was satisfactory in the separation between crystal poses and false-positive ones and in the identification of false-positive poses. Clustering of complexes was tried out to reduce computational cost to estimate affinities, but results were poor. The best approximations to the implicit ligand theory proposed here in order to estimate affinities consider groups of receptor structures with the same weight. Ligand configurations also have the same weight or are dominated by only one configuration. The representation of protein flexibility requires an adequate statistical treatment when used to estimate affinities. Here, the linking between LIE and the implicit ligand theory proved itself useful