EVALLER: a web server for in silico assessment of potential protein allergenicity

Bioinformatics testing approaches for protein allergenicity, involving amino acid sequence comparisons, have evolved appreciably over the last several years to increased sophistication and performance. EVALLER, the web server presented in this article is based on our recently published ‘Detection based on Filtered Length-adjusted Allergen Peptides’ (DFLAP) algorithm, which affords in silico determination of potential protein allergenicity of high sensitivity and excellent specificity. To strengthen bioinformatics risk assessment in allergology EVALLER provides a comprehensive outline of its judgment on a query protein's potential allergenicity. Each such textual output incorporates a scoring figure, a confidence numeral of the assignment and information on high- or low-scoring matches to identified allergen-related motifs, including their respective location in accordingly derived allergens. The interface, built on a modified Perl Open Source package, enables dynamic and color-coded graphic representation of key parts of the output. Moreover, pertinent details can be examined in great detail through zoomed views. The server can be accessed at http://bioinformatics.bmc.uu.se/evaller.html

Lärarlegitimation i offentlig debatt : En idéanalys

Syftet med studien var att undersöka vilken bild införandet av lärarlegitimation ges i dagspress under tiden mellan början av 2008 och den 30 november 2012. I undersökningen samlades data i form av debattartiklar och ledare från svenska dags- och kvällstidningar in för att analyseras med avseende på vem som författat artikeln samt med hjälp av idéanalys för att utröna artiklarnas argumentativa innehåll. År 2010 beslutades sveriges riksdag om införandet av en legitimation för lärare från förskola till gymnasium, något som förespråkats av såväl lärarfack som politiska intressen. Trots detta ledde beslutet till en livlig debatt om för- och nackdelar med legitimationen. I debatten kom en mängd olika grupper och intressen till tals, även om journalister, politiker och fackliga företrädare dominerar debatten. Det uttalas en mängd olika argument för och emot legitimationen, vilket ger en bred och mångfaldig bild av problem och möjligheter med legitimationen. Dock så målar debatten upp en genomgående negativ bild av skolan som arbetsplats och läraryrket. De röster som talar emot införandet är ofta enskilda lärare och forskare inom fält som ligger skolan nära. Däremot är fack och politiker genomgående positiva till legitimation. I debatten kan man skönja en konflikt i motivationen till varför olika grupper vill införa legitimation. Vissa ser det som ett sätt för lärarna som yrkesgrupp att skapa sig autonomi och en maktbas jämtemot samhället i övrigt. Andra ser det som ett sätt för arbetsgivare och politiska krafter att få kontroll över lärarna