Emphysematous Pyelonephritis

Os autores apresentam um caso de pielonefrite enfisematosa a E. coli, numa doente diabética de 63 anos. Os exames imagiológicos(Rx simples do abdómen, ultrassonografia e tomografia computorizada) permitiram estabelecer o diagnóstico. A nefrostomia percutânea, combinada com o tratamento médico, contribuiu para a favorável evolução clínica

Dimensões dos conteúdos mobilizados por estudantes de biologia na argumentação sobre antibióticos e saúde

Na literatura, têm sido apontadas muitas vantagens do ensino baseado em questões sociocientíficas (QSC). Contudo, reconhecer e avaliar conteúdos mobilizados pelos estudantes é um desafio no contexto da educação Ciência-Tecnologia-Sociedade-Ambiente (CTSA), pois ainda há poucos estudos acerca dos modos de avaliação de aprendizagem condizentes com os objetivos da perspectiva de educação CTSA. Neste trabalho empírico e qualitativo, temos como objetivo analisar a presença de dimensões conceituais, procedimentais e atitudinais dos conteúdos mobilizados por estudantes de um curso de Licenciatura em Biologia, a partir de uma atividade envolvendo a análise de um caso que expôs uma QSC acerca da resistência bacteriana a antibióticos. Os dados foram coletados a partir dos argumentos produzidos por equipes de estudantes, utilizando o modelo de argumentação de Toulmin. Os estudantes conseguiram mobilizar alguns dos conteúdos previstos no planejamento do ensino usando a QSC, sobretudo conhecimentos científicos. Aspectos sociais, éticos e políticos não foram suficientemente mobilizados, o que aponta para a necessidade de maior ênfase sobre eles na educação em ciências. Nesse sentido, sugerimos orientações para a pesquisa e a prática da educação em ciências a partir do conceito de letramento científico crítico, que considera a relevância da compreensão das relações entre ciência, tecnologia, sociedade e ambiente envolvidas na QSC, conduzindo ao alcance de ações sociopolíticas.In the literature, many advantages of a socioscientific issues (SSI)-based teaching have been highlighted. However, the recognition and evaluation of the contents mobilized by the students have been a challenge in the context of STSE education, with few studies focusing on the evaluation of learning consistent to principles of STSE education. In this empirical article whose approach is qualitative, we will discuss conceptual, procedural and attitudinal dimensions of the contents mobilized by students of a preservice biology teacher education course, based on an activity involving SSI on bacterial resistance to antibiotics. We collected data from the arguments produced by students’ groups, using Toulmin’s Argumentation Pattern. The students were able to mobilize some of the expected contents, based on the planning of the teaching sequence using SSI, mainly scientific knowledge. Social, ethical, and political aspects, however, were not sufficiently mobilized, which points to the need of a deeper emphasis on them in Science Education. Therefore, we suggest some perspectives to guide research and practice on Science Education based on the concept of critical scientific literacy, which considers the relevance of understanding the relationships between science, technology, society and environment encompassed by the SSI, leading to sociopolitical actions

Aprendizagem Baseada em Problemas (ABP) na Educação Científica como Estratégia para Formação do Cidadão Socioambientalmente Responsável

A partir do pressuposto de que o ensino tradicional, na educação científica, é insuficiente para uma aprendizagem integrada de conteúdos relevantes em direção a uma adequada ação social cidadã, defendemos que estratégias pedagógicas com base na Aprendizagem Baseada em Problemas (ABP) podem contribuir para a formação de cidadãos responsáveis no âmbito social e ambiental, ao fornecer um ambiente amplo de aprendizagem e ao promover o desenvolvimento de conteúdos conceituais, procedimentais e atitudinais. Neste artigo, discutimos características de duas estratégias da ABP (resolução de caso e sessões tutoriais) como meio de aproximar a aprendizagem de diferentes conteúdos dos desafios da realidade cotidiana da sociedade contemporânea e favorecer tomadas de decisão que sejam socialmente responsáveis. Apontamos, também, algumas limitações e desafios para o uso dessas estratégias na educação científica

Tamanho do genoma em coqueiro (Cocos nucifera L.) via citometria de Fluxo.

O objetivo do presente trabalho foi determinar o tamanho do genoma do coqueiro (Cocos nucífera L.) via determinação do conteúdo de DNA estimado via citometria de fluxo. Quatorze genótipos de coco, seis do tipo anão e oito do tipo gigante, foram utilizados nesse estudo. Para tal, amostras de folíolos medindo aproximadamente 0,5 cm2, por genótipo foram maceradas em solução tampão e filtradas para obtenção de uma suspensão dos núcleos. Posteriormente, os núcleos foram coloridos com iodeto de propídeo e em seguida foi adicionado RNase em cada amostra. Como padrão interno foi utilizado a cultivar CE-777 de milho (Zea mays L.). Após 30 minutos, as amostras foram analisadas em citômetro de fluxo (Partec PA II); para cada genótipo foi feito a leitura de cinco amostras. O conteúdo 2C de DNA de cada genótipo foi determinado, com médias variando de 2,74 pg a 2,86 pg, sendo a média geral 2,80 pg o que corresponde a 2.744 Mpb. O conteúdo de DNA do grupo Gigante foi o mais varável sendo o maior conteúdo estimado para o Gigante de Rennel, e o menor conteúdo para Gigante do Oeste Africano; o grupo Anão teve uma menor variação. A média do conteúdo 2C de DNA do grupo gigante foi de 2,80 pg e a do grupo Anão foi de 2,78pg. Os coeficientes de variação variaram de 2,5% a 3,1%, o que indica a precisão das medições. O teste Scott e Knott a 5% de probabilidade, agrupou os genótipos em 4 classes de acordo com as médias do conteúdo de DNA. Os resultados permitiram concluir que a espécie apresenta baixo conteúdo de DNA quando comparada com outros membros da família Arecaceae

Next-Generation Phage Display: Integrating and Comparing Available Molecular Tools to Enable Cost-Effective High-Throughput Analysis

Background: Combinatorial phage display has been used in the last 20 years in the identification of protein-ligands and protein-protein interactions, uncovering relevant molecular recognition events. Rate-limiting steps of combinatorial phage display library selection are (i) the counting of transducing units and (ii) the sequencing of the encoded displayed ligands. Here, we adapted emerging genomic technologies to minimize such challenges. Methodology/Principal Findings: We gained efficiency by applying in tandem real-time PCR for rapid quantification to enable bacteria-free phage display library screening, and added phage DNA next-generation sequencing for large-scale ligand analysis, reporting a fully integrated set of high-throughput quantitative and analytical tools. The approach is far less labor-intensive and allows rigorous quantification; for medical applications, including selections in patients, it also represents an advance for quantitative distribution analysis and ligand identification of hundreds of thousands of targeted particles from patient-derived biopsy or autopsy in a longer timeframe post library administration. Additional advantages over current methods include increased sensitivity, less variability, enhanced linearity, scalability, and accuracy at much lower cost. Sequences obtained by qPhage plus pyrosequencing were similar to a dataset produced from conventional Sanger-sequenced transducing-units (TU), with no biases due to GC content, codon usage, and amino acid or peptide frequency. These tools allow phage display selection and ligand analysis at.1,000-fold faster rate, and reduce costs,250fol

Estimativa da viabilidade polínica de diferentes genótipos de aceroleiras cultivadas no Vale do São Francisco.

O objetivo do presente trabalho foi estimar a viabilidade polínica de seis genótipos de aceroleiras, visando dimensionar seu potencial para utilização em cruzamentos dirigidos para geração de novas cultivares

A quantitative view of the transcriptome of Schistosoma mansoni adult-worms using SAGE

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Five species of the genus Schistosoma, a parasitic trematode flatworm, are causative agents of Schistosomiasis, a disease that is endemic in a large number of developing countries, affecting millions of patients around the world. By using SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) we describe here the first large-scale quantitative analysis of the Schistosoma mansoni transcriptome, one of the most epidemiologically relevant species of this genus.</p> <p>Results</p> <p>After extracting mRNA from pooled male and female adult-worms, a SAGE library was constructed and sequenced, generating 68,238 tags that covered more than 6,000 genes expressed in this developmental stage. An analysis of the ordered tag-list shows the genes of F10 eggshell protein, pol-polyprotein, HSP86, 14-3-3 and a transcript yet to be identified to be the five top most abundant genes in pooled adult worms. Whereas only 8% of the 100 most abundant tags found in adult worms of S. mansoni could not be assigned to transcripts of this parasite, 46.9% of the total ditags could not be mapped, demonstrating that the 3 sequence of most of the rarest transcripts are still to be identified. Mapping of our SAGE tags to S. mansoni genes suggested the occurrence of alternative-polyadenylation in at least 13 gene transcripts. Most of these events seem to shorten the 3 UTR of the mRNAs, which may have consequences over their stability and regulation.</p> <p>Conclusion</p> <p>SAGE revealed the frequency of expression of the majority of the S. mansoni genes. Transcriptome data suggests that alternative polyadenylation is likely to be used in the control of mRNA stability in this organism. When transcriptome was compared with the proteomic data available, we observed a correlation of about 50%, suggesting that both transcriptional and post-transcriptional regulation are important for determining protein abundance in S. mansoni. The generation of SAGE tags from other life-cycle stages should contribute to reveal the dynamics of gene expression in this important parasite.</p

A total transcriptome profiling method for plasma-derived extracellular vesicles: applications for liquid biopsies

Extracellular vesicles (EVs) are key mediators of intercellular communication. Part of their biological effects can be attributed to the transfer of cargos of diverse types of RNAs, which are promising diagnostic and prognostic biomarkers. EVs found in human biofluids are a valuable source for the development of minimally invasive assays. However, the total transcriptional landscape of EVs is still largely unknown. Here we develop a new method for total transcriptome profiling of plasma-derived EVs by next generation sequencing (NGS) from limited quantities of patient-derived clinical samples, which enables the unbiased characterization of the complete RNA cargo, including both small- and long-RNAs, in a single library preparation step. This approach was applied to RNA extracted from EVs isolated by ultracentrifugation from the plasma of five healthy volunteers. Among the most abundant RNAs identified we found small RNAs such as tRNAs, miRNAs and miscellaneous RNAs, which have largely unknown functions. We also identified protein-coding and long noncoding transcripts, as well as circular RNA species that were also experimentally validated. This method enables, for the first time, the full spectrum of transcriptome data to be obtained from minute patient-derived samples, and will therefore potentially allow the identification of cell-to-cell communication mechanisms and biomarkers.Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo (FAPESP)Gillson-Longenbaugh FoundationNational Institutes of Health (NIH/NCATS) through the NIH Common Fund, Office of Strategic Coordination (OSC)AC Camargo Canc Ctr, Lab Med Genom, Sao Paulo, SP, BrazilAC Camargo Canc Ctr, Lab Computat Biol, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Sao Paulo, Inst Biomed Sci, Dept Cell & Dev Biol, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Electron Microscopy Ctr, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Texas MD Anderson Canc Ctr, Dept Expt Therapeut, Houston, TX 77030 USAUniv Texas MD Anderson Canc Ctr, Ctr RNA Interference & Non Coding RNAs, Houston, TX 77030 USAUniv New Mexico, Comprehens Canc Ctr, Albuquerque, NM 87131 USAUniv New Mexico, Sch Med, Div Hematol Oncol, Dept Internal Med, Albuquerque, NM 87131 USAUniv New Mexico, Sch Med, Div Mol Med, Dept Internal Med, Albuquerque, NM 87131 USARockefeller Univ, Lab Mol Immunol, 1230 York Ave, New York, NY 10021 USAFMUSP, Lab Neurociencias Alzira Denise Hertzog Silva LIM, Inst Psiquiatria, Sao Paulo, SP, BrazilUniv Fed Sao Paulo, Electron Microscopy Ctr, Sao Paulo, SP, BrazilFAPESP: 2011/09172-3FAPESP: 2014/26897-0Web of Scienc