Linear-time Computation of Minimal Absent Words Using Suffix Array

An absent word of a word y of length n is a word that does not occur in y. It is a minimal absent word if all its proper factors occur in y. Minimal absent words have been computed in genomes of organisms from all domains of life; their computation provides a fast alternative for measuring approximation in sequence comparison. There exists an O(n)-time and O(n)-space algorithm for computing all minimal absent words on a fixed-sized alphabet based on the construction of suffix automata (Crochemore et al., 1998). No implementation of this algorithm is publicly available. There also exists an O(n^2)-time and O(n)-space algorithm for the same problem based on the construction of suffix arrays (Pinho et al., 2009). An implementation of this algorithm was also provided by the authors and is currently the fastest available. In this article, we bridge this unpleasant gap by presenting an O(n)-time and O(n)-space algorithm for computing all minimal absent words based on the construction of suffix arrays. Experimental results using real and synthetic data show that the respective implementation outperforms the one by Pinho et al

Aizier – Berges de la Seine

Identifiant de l'opération archéologique : 27006002 Date de l'opération : 1987 (FP) L’opération archéologique réalisée en 2005 sur le « site portuaire », dans l’actuelle propriété de Monsieur Yves Laurent, intervient après une première campagne de sondages (1987), un relevé topographique des vestiges apparents (2003) et une campagne de prospection électrique (2004). Commune estuarienne implantée sur la rive gauche de la Seine, Aizier se situe à la limite de la forêt de Brotonne, à l’ouest de ..

Aizier – Le Port

Code INSEE commune : 27006Lien Atlas (MCC) :http://atlas.patrimoines.culture.fr/atlas/trunk/index.php?ap_theme=DOM_2.01.02&ap_bbox=0.607;49.420;0.649;49.444 Cette dernière campagne de fouille d’un programme pluriannuel initié en 2009, s’est déroulée du 12 août au 06 septembre 2013, avec un effectif moyen d’une quinzaine de stagiaires bénévoles. Cette année complémentaire avait pour objectifs principaux de mettre un terme aux points de fouilles engagés depuis l’an passé. Il ressort de cet amon..

Aizier – Le Port

Cette troisième campagne de fouille d’un programme établi sur trois ans (2010-2012), s’est déroulée du 6 août au 7 septembre 2012, avec un effectif moyen d’une vingtaine de stagiaires bénévoles. La fenêtre de fouille est actuellement localisée au sein de la propriété de M. Yves Laurent (parcelle actuelle no 3). Les coordonnées centrales Lambert II en sont : x = 475,760 ; y = 193,725. Au terme d’une campagne ayant bénéficié d’un décapage supplémentaire de 424 m2 au sein de la zone 3, se révèle..

Aizier – Le Port

Cette dernière campagne de fouille d’un programme pluriannuel initié en 2009, s’est déroulée du 12 août au 6 septembre 2013, avec un effectif moyen d’une quinzaine de stagiaires bénévoles. Cette année complémentaire avait pour objectifs principaux de mettre un terme aux points de fouilles engagés depuis l’an passé. Il ressort de cet amoncellement d’ouvrages maçonnés en calcaire un ensemble de terrasses romaines s’étalant sur environ 335 m2. Ces multiples aménagements et restructurations d’une..

Тetjana L Vilkul., Літопис і Хронограф : Студії з текстології домонгольського київського літописання

Les chroniques russes sont des sources qu’on ne présente plus : sans elles, il serait presque impensable d’écrire l’histoire de la Rus′, particulièrement à la période prémongole. Cependant, ce sont des sources difficiles à manier, qui suscitent toujours de nombreuses études. Parmi celles-ci, voici un ouvrage qui fera certainement date, dû à la plume de Tetjana Vilkul, de l’Institut d’histoire de l’Ukraine de l’Académie des sciences d’Ukraine. Il se compose de quatre chapitres : un premier chap..

Jumièges – Place de la Mairie

Date de l'opération : 2006 (DF) En janvier 2006, les tranchées de réseau des trottoirs du bourg de Jumièges, sans mettre au jour de structures anciennes, ont révélé quelques éléments remarquables. Face à la place de la Mairie, le mur d’enceinte de l’abbaye, reconstruit au XIXe s., conserve dans ses fondations des pierres calcaires sculptées issues des ruines voisines. Plusieurs fragments de tuiles glaçurées sont sortis du trottoir longeant la même place. Cette découverte ponctuelle complète d..

Réconcilier, réprimer : les "années de plomb" en Italie et les transitions démocratiques dans le cône sud latino-américain

Réconcilier, réprimer : les « années de plomb » en Italie et les transitions démocratiques dans le cône sud latino-américain Sandrine LEFRANC et Daniel MOUCHARD Comment sortir d’une période de violence politique de grande ampleur et de la logique de « l’ennemi intérieur » qui, parfois, organise cette violence ? Si l’on considère les modes volontaristes de « sortie » du conflit que peuvent adopter les gouvernements (et non la perspective d’une « usure temporelle »), deux solutions peuvent a ..

David B. Miller, Saint Sergius of Radonezh

Comme dans d’autres sociétés médiévales, le sentiment d’appartenance en Moscovie s’est développé dans une étroite compénétration entre le facteur proprement politique, le social et le religieux, souvent autour de grandes figures tutélaires. Le saint, et donc le culte qui lui est rendu, apparaissent ainsi comme un foyer de cohésion et une voie d’accès privilégiée à l’identité d’une communauté. C’est pourquoi son étude est l’un des thèmes centraux de l’histoire de la Moscovie prémoderne. Parmi ..