Diversidad genética y distribución regional de cepas de Mycobacterium bovis del ganado en México

The molecular fingerprints of 878 isolates of Mycobacterium bovis from cattle, mostly dairy cattle, collected from cattle between 2009 and 2010 in different regions of Mexico were obtained by spoligotyping. Seventy-two percent (72 %) of the spoligotypes fell into nine clusters, and 27 % of the isolates fell into only two spoligotypes; 149 were orphan spoligotypes. The two predominant spoligotypes, arbitrarily designated as SP1 and SP2, were found in almost all States in Mexico, especially in central Mexico, where a concentration of dairy cattle is known. In spite of the wide distribution of spoligotypes observed, some show high regional preference, especially those in geographically distant regions. Only a few spoligotypes show patterns completely different from those shown by the most frequent spoligotypes, suggesting strange sources of infection or the formation of new genetic lines derived from non-lethal mutations. Most States with predominantly high dairy cattle populations showed similar spoligotypes, suggesting exchange of animals between regions. Some spoligotypes are common to dairy and beef cattle, suggesting transmission between populations, most probably due to the movement of dairy cattle to non-dairy regions.Se obtuvieron patrones moleculares (espoligotipos) de 878 aislados de Mycobacterium bovis de ganado de diferentes regiones de México entre los años 2009 y 2010. Setenta y dos por ciento (72 %) de los espoligotipos cayeron en nueve grupos y 27 % de los aislados dentro de sólo dos espoligotipos; 149 fueron espoligotipos individuales. Los dos espoligotipos predominantes, arbitrariamente identificados como SP1 y SP2, se distribuyen en la mayor parte del territorio nacional, en especial en la zona centro de México en ganado especializado en producción de leche. A pesar de la amplia distribución geográfica de los espoligotipos de mayor frecuencia, algunos muestran cierta localización, en especial los encontrados en zonas geográficas distantes, como es el caso de Chihuahua y Baja California. Aunque pocos, algunos espoligotipos muestran patrones moleculares distintos a los mostrados por los espoligotipos de mayor frecuencia, sugiriendo fuentes de infección desconocida. La mayoría de los Estados con ganadería predominantemente lechera muestran espoligotipos comunes, lo que sugiere intercambio regional frecuente de ganado. Algunos espoligotipos son comunes en ganado para leche y ganado para carne, lo que sugiere transmisión entre estas dos poblaciones; se desconoce, sin embargo, si los animales de carne infectados provienen de explotaciones extensivas o si son de engordas ubicadas dentro de la explotación lechera. Se propone la tipificación rutinaria de aislados de M. bovis obtenidos en todos los laboratorios de diagnóstico y mejorar la captura de información epidemiológica de los casos, para hacer mejores conclusiones epidemiológicas de la distribución espacial de las cepas de este agente en el territorio nacional

Understanding the relationship between Mycobacterium bovis spoligotypes from cattle in Latin American Countries

Spoligotyping is the most frequently used method for genotyping isolates of Mycobacterium bovis worldwide. In the current work, we compared spoligotypes from 1684 M. bovis isolates from Argentina (816), Brazil (412), Chile (66), Mexico (274) and Venezuela (116), obtained from cattle, humans, pigs, wild boars, farmed deer, goats, buffaloes, cats, and wild animals. A total of 269 different spoligotypes were found: 142 (8.4%) isolates presented orphan spoligotypes, whereas 1542 (91.6%) formed 113 different clusters. In cattle, SB0140 was the most representative spoligotype with 355 (24.6%) isolates, followed by SB0121 with 149 (10.3%) isolates. Clustering of spoligotypes ranged from 95.2% in Argentina to 85.3% in Mexico. Orphan spoligotypes were also variable, ranging from 23.7% in Mexico to 4.1% in Brazil. A large proportion of spoligotypes were common to the neighboring countries Argentina, Brazil and Chile. In conclusion, despite the diversity of spoligotypes found in the five countries studied, there are major patterns that predominate in these neighboring countries. These clusters may reflect a long-lasting active transmission of bovine tuberculosis or common historical origins of infection.Fil: Zumárraga, Martín José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Arriaga, C.. Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias. Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Microbiología Animal; MéxicoFil: Barandiaran, Soledad. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Cobos Marín, Laura. Universidad Nacional Autónoma de México; MéxicoFil: de Waard, Jacobus. Universidad Central de Venezuela; VenezuelaFil: Estrada García, Inés. Instituto Politécnico Nacional. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas; MéxicoFil: Figueiredo, T.. Instituto Oswaldo Cruz; BrasilFil: Figueroa, A.. Universidad Austral de Chile; ChileFil: Giménez, F.. Universidad Central de Venezuela; VenezuelaFil: Gomes, H. M.. Instituto Oswaldo Cruz; BrasilFil: Gonzalez y Merchand, J. A.. Instituto Politécnico Nacional. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas; MéxicoFil: Macías, Analía. Universidad Nacional de Río Cuarto; ArgentinaFil: Milián Suazo, Feliciano. Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias. Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Fisiología y Mejoramiento Animal; MéxicoFil: Rodríguez, C. A. R.. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: Santillán, M. A.. Instituto Nacional de Investigaciones Forestales Agrícolas y Pecuarias. Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Fisiología y Mejoramiento Animal; MéxicoFil: Suffys, P. N.. Instituto Oswaldo Cruz; BrasilFil: Trangoni, M. D.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Zárraga, A. M.. Universidad Austral de Chile; ChileFil: Cataldi, Ángel Adrián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentin