B-ryhmän streptokokkia osoittavien menetelmien vertailu : Bakteeriviljely ja nukleiinihappo-osoitus

B-ryhmän streptokokki (Group B Streptococcus, GBS, Streptococcus agalactiae) on ihmisen normaaliflooraan kuuluva bakteeri ja sen oireeton kantajuus on yleistä. Bakteeri voi tarttua synnytyksen aikana äidistä vauvaan ja aiheuttaa vastasyntyneelle vakavia infektioita (GBS-tauti), jotka pahimmassa tapauksessa johtavat lapsen vammautumiseen tai jopa kuolemaan. Suomalaisena suosituksena on tällä hetkellä yleinen B-streptokokkiseulonta kaikilta raskaana olevilta raskausviikoilla 35 - 37. Vastasyntyneen infektio pyritään estämään antamalla mikrobilääkeprofylaksi synnytyksen käynnistyttyä äideille, joiden B-streptokokkikantajuus on todettu. Opinnäytetyön toimeksiantajana oli Seinäjoen keskussairaalan kliinisen mikrobiologian toimintayksikkö, jonne haluttiin nopeampi testimenetelmä B-streptokokin osoittamiseen. Tarkoituksena oli vertailla tällä hetkellä käytössä olevaa bakteeriviljelyä Cepheidin GeneXpert GBS -nukleiinihappotestiin. Vertailun avulla pyrittiin selvittämään, ovatko näillä menetelmillä saadut tulokset yhteneviä ja voidaanko uutta polymeraasiketjureaktioon (PCR) pohjautuvaa menetelmää käyttää kiireellisissä tapauksissa B-ryhmän streptokokin osoittamiseen. Tutkimuksen kokeellinen osio koostui 40 potilasnäytteestä. Sekä bakteeriviljelyn että PCR-menetelmän tuloksista yhdeksän oli positiivisia ja 31 negatiivisia. Tulosten perusteella laskettiin sensitiivisyys, spesifisyys, positiivinen ennustearvo ja negatiivinen ennustearvo. Niiden perusteella todettiin, että GeneXpert GBS on herkkä ja tarkka menetelmä osoittamaan B-ryhmän streptokokin kantajuutta. Opinnäytetyön tulokset osoittivat, että GeneXpert GBS -testiä voidaan käyttää B-ryhmän streptokokin kliiniseen diagnostiikkaan. Sillä saadaan nopeasti osoitettua äidit, jotka ovat GBS-bakteerin kantajia. Synnytyksen aikaisesta testauksesta hyötyvät erityisesti naiset, jotka eivät ole olleet äitiyshuollon piirissä, jotka synnyttävät ennenaikaisesti tai joiden GBS-seulonnan tulokset eivät ole tiedossa synnytyksen alkaessa. Testaus mahdollistaa hoidon nopean aloittamisen ja vastasyntyneen GBS-taudin paremman ehkäisyn sekä vähentää tarpeettomien antibioottihoitojen määrää.Group B Streptococcus (GBS, Streptococcus agalactiae) is a bacterium which belongs to the human normal microbial flora and is a common asymptomatic colonizer of healthy adults. The baby can be infected by bacteria during labor. The infection can cause a severe neonatal disease and in the worst case lead to disabilities or even death. It is recommended that all pregnant women in Finland should be screened for Group B Streptococcus during 35 - 37 weeks of gestation. The aim is to prevent neonatal infections by giving an intrapartum antimicrobial prophylaxis to mothers who are colonized by Group B Streptococcus. The topic of this thesis was provided by the Department of Clinical Microbiology of Seinäjoki Central Hospital where a more rapid test procedure was needed to identify Group B Streptococcus. The purpose was to compare two different techniques, bacterial culture and Cepheid GeneXpert GBS nucleic acid test. The aim was to find out if the results of these two techniques are identical and if the new polymerase chain reaction (PCR) based test can be used to identify Group B Streptococcus in emergencies. The experimental part of the study consisted of 40 clinical specimens. Nine of the results were positive and 31 negative in both techniques. Sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value were calculated based on results. It was confirmed that GeneXpert GBS is a sensitive and specific test to identify women who are colonized by Group B Streptococcus. The results of the thesis showed that GeneXpert GBS test is useful in clinical diagnostics of Group B Streptococcus. It enables rapid identification of GBS-colonized women. Especially the women who have had no prenatal care, who might deliver preterm or whose GBS test results are unknown at the time of the delivery will benefit from intrapartum testing. Because of the intrapartum testing, it is possible to start treatment rapidly and prevent neonatal GBS disease. It also decreases the use of unnecessary antibiotic treatments

B-ryhmän streptokokkia osoittavien menetelmien vertailu : Bakteeriviljely ja nukleiinihappo-osoitus

B-ryhmän streptokokki (Group B Streptococcus, GBS, Streptococcus agalactiae) on ihmisen normaaliflooraan kuuluva bakteeri ja sen oireeton kantajuus on yleistä. Bakteeri voi tarttua synnytyksen aikana äidistä vauvaan ja aiheuttaa vastasyntyneelle vakavia infektioita (GBS-tauti), jotka pahimmassa tapauksessa johtavat lapsen vammautumiseen tai jopa kuolemaan. Suomalaisena suosituksena on tällä hetkellä yleinen B-streptokokkiseulonta kaikilta raskaana olevilta raskausviikoilla 35 - 37. Vastasyntyneen infektio pyritään estämään antamalla mikrobilääkeprofylaksi synnytyksen käynnistyttyä äideille, joiden B-streptokokkikantajuus on todettu. Opinnäytetyön toimeksiantajana oli Seinäjoen keskussairaalan kliinisen mikrobiologian toimintayksikkö, jonne haluttiin nopeampi testimenetelmä B-streptokokin osoittamiseen. Tarkoituksena oli vertailla tällä hetkellä käytössä olevaa bakteeriviljelyä Cepheidin GeneXpert GBS -nukleiinihappotestiin. Vertailun avulla pyrittiin selvittämään, ovatko näillä menetelmillä saadut tulokset yhteneviä ja voidaanko uutta polymeraasiketjureaktioon (PCR) pohjautuvaa menetelmää käyttää kiireellisissä tapauksissa B-ryhmän streptokokin osoittamiseen. Tutkimuksen kokeellinen osio koostui 40 potilasnäytteestä. Sekä bakteeriviljelyn että PCR-menetelmän tuloksista yhdeksän oli positiivisia ja 31 negatiivisia. Tulosten perusteella laskettiin sensitiivisyys, spesifisyys, positiivinen ennustearvo ja negatiivinen ennustearvo. Niiden perusteella todettiin, että GeneXpert GBS on herkkä ja tarkka menetelmä osoittamaan B-ryhmän streptokokin kantajuutta. Opinnäytetyön tulokset osoittivat, että GeneXpert GBS -testiä voidaan käyttää B-ryhmän streptokokin kliiniseen diagnostiikkaan. Sillä saadaan nopeasti osoitettua äidit, jotka ovat GBS-bakteerin kantajia. Synnytyksen aikaisesta testauksesta hyötyvät erityisesti naiset, jotka eivät ole olleet äitiyshuollon piirissä, jotka synnyttävät ennenaikaisesti tai joiden GBS-seulonnan tulokset eivät ole tiedossa synnytyksen alkaessa. Testaus mahdollistaa hoidon nopean aloittamisen ja vastasyntyneen GBS-taudin paremman ehkäisyn sekä vähentää tarpeettomien antibioottihoitojen määrää.Group B Streptococcus (GBS, Streptococcus agalactiae) is a bacterium which belongs to the human normal microbial flora and is a common asymptomatic colonizer of healthy adults. The baby can be infected by bacteria during labor. The infection can cause a severe neonatal disease and in the worst case lead to disabilities or even death. It is recommended that all pregnant women in Finland should be screened for Group B Streptococcus during 35 - 37 weeks of gestation. The aim is to prevent neonatal infections by giving an intrapartum antimicrobial prophylaxis to mothers who are colonized by Group B Streptococcus. The topic of this thesis was provided by the Department of Clinical Microbiology of Seinäjoki Central Hospital where a more rapid test procedure was needed to identify Group B Streptococcus. The purpose was to compare two different techniques, bacterial culture and Cepheid GeneXpert GBS nucleic acid test. The aim was to find out if the results of these two techniques are identical and if the new polymerase chain reaction (PCR) based test can be used to identify Group B Streptococcus in emergencies. The experimental part of the study consisted of 40 clinical specimens. Nine of the results were positive and 31 negative in both techniques. Sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value were calculated based on results. It was confirmed that GeneXpert GBS is a sensitive and specific test to identify women who are colonized by Group B Streptococcus. The results of the thesis showed that GeneXpert GBS test is useful in clinical diagnostics of Group B Streptococcus. It enables rapid identification of GBS-colonized women. Especially the women who have had no prenatal care, who might deliver preterm or whose GBS test results are unknown at the time of the delivery will benefit from intrapartum testing. Because of the intrapartum testing, it is possible to start treatment rapidly and prevent neonatal GBS disease. It also decreases the use of unnecessary antibiotic treatments