14 research outputs found
Reprogramming dysfunctional CD8+ T cells to promote properties associated with natural HIV control
International audienc
Genesis : identification et caractérisation de nouveaux gÚnes de prédisposition au cancer du sein à partir de l'étude de paires de soeurs atteintes et de témoins apparentées et non apparentées
AbstractNational audienceContexte et Objectifs Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes dont lâespĂ©rance de vie est de plus de 80 ans. Les Ă©tudes de sĂ©grĂ©gation ont montrĂ© que 5 % des cas sont liĂ©s Ă un facteur gĂ©nĂ©tique transmis selon un mode dominant. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et 20 % des cas familiaux testĂ©s (Miki et al., 1994, Wooster et al., 1995). Une partie des 80 % restant pourrait ĂȘtre expliquĂ©e par des prĂ©dispositions encore non identifiĂ©es mais dont le mode de transmission serait plus vraisemblablement rĂ©cessif ou oligogĂ©nique. LâĂ©tude GENESIS a pour objectif dâidentifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et dâĂ©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. DonnĂ©es et MĂ©thode GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS et non porteuses dâunemutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Les analyses de liaison gĂ©nĂ©tique exploreront lâensemble du gĂ©nome (GW). Les Ă©tudes dâassociation seront plus particuliĂšrement centrĂ©es sur les rĂ©gions dâintĂ©rĂȘt dĂ©signĂ©es par les Ă©tudes de liaison et par les rĂ©sultats publiĂ©s des Ă©tudes dâassociation GW. Les Ă©tudes dâassociation permettront, outre dâidentifier de nouveaux facteurs gĂ©nĂ©tiques, dâestimer les risques de CS associĂ©s et dâĂ©valuer les Ă©ventuelles interactions gĂšnes-environnement/style de vie. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales examinĂ©es en tissu-array...) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et ainsi de diminuer lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique attendue au sein de la population dâĂ©tude. Lâeffectif attendu est 6 000 personnes (1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins et apparentĂ©s). Protocole du recueil des donnĂ©es et des prĂ©lĂšvements biologiques Les diverses Ă©tapes du protocole se font par courrier et sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les femmes index sont invitĂ©es Ă participer par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer (GGC) de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Les soeurs atteintes et indemnes, les frĂšres et les parents ainsi quâune proche non apparentĂ©e sont invitĂ©s par les index. Les donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques concernent les antĂ©cĂ©dents gynĂ©cologiques et obstĂ©triques, les traitements hormonaux, les habitudes tabagiques actives et passives, la consommation dâalcool, lâactivitĂ© physique,les expositions aux radiations,... Les Ă©chantillons sanguins (sang total, lymphocytes, plasma, sĂ©rum) et tumoraux sont collectĂ©s. Les mammographies des index, soeurs atteintes et de leurs tĂ©moins sont numĂ©risĂ©es pour la mesure de la densitĂ© mammaire. Ătat dâavancement Une Ă©tude pilote aĂ©tĂ© rĂ©alisĂ©e sur 48 cas index invitĂ©s en novembre 2006. La participation a Ă©tĂ© de 81 %. LâĂ©tude nationale a commencĂ© en avril 2007. Le protocole et lâavancement de GENESIS seront prĂ©sentĂ©s en dĂ©tail et la population incluse en janvier 2008 sera dĂ©crite. RetombĂ©es : Lâidentification de nouveauxgĂšnes de prĂ©disposition au CS aura un impact sur la prise en charge des femmes Ă risque. La connaissance de ces gĂšnes permettra Ă©galement de mieux comprendre lâorigine dâun certain nombre de cas de CS a priori non familiaux et permettra dâoptimiser la prise en charge de leurs apparentĂ©es.Enfin, la connaissance des fonctions biologiques de ces gĂšnes, de leurs interactions avec des facteurs environnementaux permettra de proposer des actions de prĂ©vention. Remerciements : GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 200
Genesis : identification et caractérisation de nouveaux gÚnes de prédisposition au cancer du sein à partir de l'étude de paires de soeurs atteintes et de témoins apparentées et non apparentées
AbstractNational audienceContexte et Objectifs Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes dont lâespĂ©rance de vie est de plus de 80 ans. Les Ă©tudes de sĂ©grĂ©gation ont montrĂ© que 5 % des cas sont liĂ©s Ă un facteur gĂ©nĂ©tique transmis selon un mode dominant. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et 20 % des cas familiaux testĂ©s (Miki et al., 1994, Wooster et al., 1995). Une partie des 80 % restant pourrait ĂȘtre expliquĂ©e par des prĂ©dispositions encore non identifiĂ©es mais dont le mode de transmission serait plus vraisemblablement rĂ©cessif ou oligogĂ©nique. LâĂ©tude GENESIS a pour objectif dâidentifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et dâĂ©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. DonnĂ©es et MĂ©thode GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS et non porteuses dâunemutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Les analyses de liaison gĂ©nĂ©tique exploreront lâensemble du gĂ©nome (GW). Les Ă©tudes dâassociation seront plus particuliĂšrement centrĂ©es sur les rĂ©gions dâintĂ©rĂȘt dĂ©signĂ©es par les Ă©tudes de liaison et par les rĂ©sultats publiĂ©s des Ă©tudes dâassociation GW. Les Ă©tudes dâassociation permettront, outre dâidentifier de nouveaux facteurs gĂ©nĂ©tiques, dâestimer les risques de CS associĂ©s et dâĂ©valuer les Ă©ventuelles interactions gĂšnes-environnement/style de vie. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales examinĂ©es en tissu-array...) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et ainsi de diminuer lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique attendue au sein de la population dâĂ©tude. Lâeffectif attendu est 6 000 personnes (1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins et apparentĂ©s). Protocole du recueil des donnĂ©es et des prĂ©lĂšvements biologiques Les diverses Ă©tapes du protocole se font par courrier et sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les femmes index sont invitĂ©es Ă participer par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer (GGC) de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Les soeurs atteintes et indemnes, les frĂšres et les parents ainsi quâune proche non apparentĂ©e sont invitĂ©s par les index. Les donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques concernent les antĂ©cĂ©dents gynĂ©cologiques et obstĂ©triques, les traitements hormonaux, les habitudes tabagiques actives et passives, la consommation dâalcool, lâactivitĂ© physique,les expositions aux radiations,... Les Ă©chantillons sanguins (sang total, lymphocytes, plasma, sĂ©rum) et tumoraux sont collectĂ©s. Les mammographies des index, soeurs atteintes et de leurs tĂ©moins sont numĂ©risĂ©es pour la mesure de la densitĂ© mammaire. Ătat dâavancement Une Ă©tude pilote aĂ©tĂ© rĂ©alisĂ©e sur 48 cas index invitĂ©s en novembre 2006. La participation a Ă©tĂ© de 81 %. LâĂ©tude nationale a commencĂ© en avril 2007. Le protocole et lâavancement de GENESIS seront prĂ©sentĂ©s en dĂ©tail et la population incluse en janvier 2008 sera dĂ©crite. RetombĂ©es : Lâidentification de nouveauxgĂšnes de prĂ©disposition au CS aura un impact sur la prise en charge des femmes Ă risque. La connaissance de ces gĂšnes permettra Ă©galement de mieux comprendre lâorigine dâun certain nombre de cas de CS a priori non familiaux et permettra dâoptimiser la prise en charge de leurs apparentĂ©es.Enfin, la connaissance des fonctions biologiques de ces gĂšnes, de leurs interactions avec des facteurs environnementaux permettra de proposer des actions de prĂ©vention. Remerciements : GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 200
Genesis : identification et caractérisation de nouveaux gÚnes de prédisposition au cancer du sein à partir de l'étude de paires de soeurs atteintes et de témoins apparentées et non apparentées
AbstractNational audienceContexte et Objectifs Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes dont lâespĂ©rance de vie est de plus de 80 ans. Les Ă©tudes de sĂ©grĂ©gation ont montrĂ© que 5 % des cas sont liĂ©s Ă un facteur gĂ©nĂ©tique transmis selon un mode dominant. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et 20 % des cas familiaux testĂ©s (Miki et al., 1994, Wooster et al., 1995). Une partie des 80 % restant pourrait ĂȘtre expliquĂ©e par des prĂ©dispositions encore non identifiĂ©es mais dont le mode de transmission serait plus vraisemblablement rĂ©cessif ou oligogĂ©nique. LâĂ©tude GENESIS a pour objectif dâidentifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et dâĂ©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. DonnĂ©es et MĂ©thode GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS et non porteuses dâunemutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Les analyses de liaison gĂ©nĂ©tique exploreront lâensemble du gĂ©nome (GW). Les Ă©tudes dâassociation seront plus particuliĂšrement centrĂ©es sur les rĂ©gions dâintĂ©rĂȘt dĂ©signĂ©es par les Ă©tudes de liaison et par les rĂ©sultats publiĂ©s des Ă©tudes dâassociation GW. Les Ă©tudes dâassociation permettront, outre dâidentifier de nouveaux facteurs gĂ©nĂ©tiques, dâestimer les risques de CS associĂ©s et dâĂ©valuer les Ă©ventuelles interactions gĂšnes-environnement/style de vie. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales examinĂ©es en tissu-array...) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et ainsi de diminuer lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique attendue au sein de la population dâĂ©tude. Lâeffectif attendu est 6 000 personnes (1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins et apparentĂ©s). Protocole du recueil des donnĂ©es et des prĂ©lĂšvements biologiques Les diverses Ă©tapes du protocole se font par courrier et sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les femmes index sont invitĂ©es Ă participer par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer (GGC) de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Les soeurs atteintes et indemnes, les frĂšres et les parents ainsi quâune proche non apparentĂ©e sont invitĂ©s par les index. Les donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques concernent les antĂ©cĂ©dents gynĂ©cologiques et obstĂ©triques, les traitements hormonaux, les habitudes tabagiques actives et passives, la consommation dâalcool, lâactivitĂ© physique,les expositions aux radiations,... Les Ă©chantillons sanguins (sang total, lymphocytes, plasma, sĂ©rum) et tumoraux sont collectĂ©s. Les mammographies des index, soeurs atteintes et de leurs tĂ©moins sont numĂ©risĂ©es pour la mesure de la densitĂ© mammaire. Ătat dâavancement Une Ă©tude pilote aĂ©tĂ© rĂ©alisĂ©e sur 48 cas index invitĂ©s en novembre 2006. La participation a Ă©tĂ© de 81 %. LâĂ©tude nationale a commencĂ© en avril 2007. Le protocole et lâavancement de GENESIS seront prĂ©sentĂ©s en dĂ©tail et la population incluse en janvier 2008 sera dĂ©crite. RetombĂ©es : Lâidentification de nouveauxgĂšnes de prĂ©disposition au CS aura un impact sur la prise en charge des femmes Ă risque. La connaissance de ces gĂšnes permettra Ă©galement de mieux comprendre lâorigine dâun certain nombre de cas de CS a priori non familiaux et permettra dâoptimiser la prise en charge de leurs apparentĂ©es.Enfin, la connaissance des fonctions biologiques de ces gĂšnes, de leurs interactions avec des facteurs environnementaux permettra de proposer des actions de prĂ©vention. Remerciements : GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 200
Etude Genesis : trois ans d'inclusion en France
AbstractNational audienceIntroduction.â Le cancer du sein (CS) concerne environ 10% des femmes. Des mutations dans les gĂšnes BRCA1/2 sont impliquĂ©es dans environ 5% des CS et seulement 15 Ă 20%des cas familiaux testĂ©s. LâĂ©tude GENESIS a pour objectifs dâidentifier et de caractĂ©riser de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et dâĂ©valuer le rĂŽle de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier lâeffet de ces gĂšnes. Ceci permettra une meilleure prise en charge des femmes Ă risque.MĂ©thodes.â GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS, non porteuses dâune mutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es. Lâeffectif attendu est 1000 paires de soeurs et 4000 tĂ©moins. Les cas index sont invitĂ©s par les consultants en gĂ©nĂ©tiquedu Groupe gĂ©nĂ©tique et cancer de la FĂ©dĂ©ration nationale des Centres de lutte contre le cancer. Des caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (caractĂ©ristiques tumorales, densitĂ© mammaire. . .) permettront de dĂ©finir des endophĂ©notypes et de diminuer ainsi lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique de la population dâĂ©tude. Le centre coordonateur organise le recueil et la gestion des donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques et des mammographies, le centre de ressources biologiques ceux des Ă©chantillonssanguins.RĂ©sultats.â Fin 2010, 1493 cas index, 740 soeurs atteintes, 520 soeurs indemnes et 1289 amies ont acceptĂ© de participer et ont recžu un dossier dâinclusion ; 75% ont renvoyĂ© leur questionnaire, 76%ont fait leur prĂ©lĂšvement sanguin, 74% ont fourni des mammographies qui ont Ă©tĂ© numĂ©risĂ©es et anonymisĂ©es.Discussion/conclusion.â AprĂšs trois ans dâinclusions, 630 paires de soeurs atteintes participent Ă lâĂ©tude. Le protocole a Ă©tĂ© Ă©tendu aux index sans soeur atteinte disponible afin dâaugmenter la puissance des Ă©tudes dâassociation. Remerciements.âGENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2006 et par lâINCa depuis 2008
Mutation analysis of PALB2 gene in French breast cancer families
International audienceSeveral population-based and family-based studies have demonstrated that germline mutations of the PALB2 gene (Partner and Localizer of BRCA2) are associated with an increased risk of breast cancer. Distinct mutation frequencies and spectrums have been described depending on the population studied. Here we describe the first complete PALB2 coding sequence screening in the French population. We screened the complete coding sequence and intron-exon boundaries of PALB2, using the EMMA technique, to assess the contribution of pathogenic mutations in a set of 835 familial breast cancer cases and 662 unrelated controls from the French national study GENESIS and the Paul Strauss Cancer Centre, all previously tested negative for BRCA1 and BRCA2 pathogenic mutations. Our analysis revealed the presence of four novel deleterious mutations: c.1186insT, c.1857delT and c.2850delC in three cases, c.3418dupT in one control. In addition, we identified two in-frame insertion/deletion, 19 missense substitutions (two of them predicted as pathogenic), 9 synonymous variants, 28 variants located in introns and 2 in UTRs, as well as frequent variants. Truncating PALB2 mutations were found in 0.36% of familial breast cancer cases, a frequency lower than the one detected in comparable studies in other populations (0.73-3.40%). This suggests a small but significant contribution of PALB2 mutations to the breast cancer susceptibility in the French population
Etude Genesis : deux ans d'inclusion !
AbstractNational audienceContexte et Objectifs- Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s (Miki et al. 1994, Wooster et al. 1995) ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et seulement 15 Ă 20 % des cas familiaux testĂ©s. 80 % des cas familiaux restent inexpliquĂ©s. LâĂ©tude GENESIS a Ă©tĂ© mise en place pour identifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et Ă©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. Ceci permettrait une meilleure prise en charge des femmes Ă risque. Nous proposons de prĂ©senter lâĂ©tat dâavancement et un descriptif intermĂ©diaire de GENESIS. DonnĂ©es et MĂ©thodes- GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS, non porteuses dâune mutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Lâeffectif attendu est 1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins. Les diverses Ă©tapes du protocole sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les cas index sont invitĂ©s par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales etc.) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et de diminuer ainsi lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique au sein de la population dâĂ©tude. Des donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques (facteurs gynĂ©co-obstĂ©triques, traitements hormonaux, habitudes tabagiques actives et passives, expositions aux radiations etc.) et des Ă©chantillons sanguins sont collectĂ©s. La densitĂ© mammaire est calculĂ©e avec le logiciel « Cumulus » aprĂšs numĂ©risation des mammographies prĂ©cĂ©dant le diagnostic de CS ou des derniĂšres mammographies pour les tĂ©moinsindemnes. Ătat dâavancement â En septembre 2009, 1022 cas index, 541 soeurs atteintes, 385 soeurs indemnes et 922 amies ont acceptĂ© de participer et ont reçu un dossier dâinclusion. 75 % ont renvoyĂ© leur questionnaire, 78 % ont fait leur prĂ©lĂšvement sanguin, 70 % ont fourni des mammographies qui ont pu ĂȘtre numĂ©risĂ©es. Perspectives- Un peu plus de la moitiĂ© des cas index inclus ont une soeur atteinte qui participe Ă lâĂ©tude. 1 820 cas index doivent donc ĂȘtre inclus pour atteindre lâobjectif des 1 000 paires de soeurs atteintes. La dynamique dâinclusion des cas index doit sâaccĂ©lĂ©rer, en particulier par lâinvitation des cas « prospectifs », lors de la remise de leur rĂ©sultat BRCA1/2 nĂ©gatif. Le protocole de lâĂ©tude GENEGO portant sur les caractĂ©ristiques tumorales de GENESIS est en cours dâĂ©laboration. Des Ă©tudes intermĂ©diaires sur des gĂšnes ou pathways « candidats » seront bientĂŽt proposĂ©es. Remerciements â GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2006 et par lâInstitut National du Cancer depuis 2008
Etude Genesis : deux ans d'inclusion !
AbstractNational audienceContexte et Objectifs- Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s (Miki et al. 1994, Wooster et al. 1995) ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et seulement 15 Ă 20 % des cas familiaux testĂ©s. 80 % des cas familiaux restent inexpliquĂ©s. LâĂ©tude GENESIS a Ă©tĂ© mise en place pour identifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et Ă©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. Ceci permettrait une meilleure prise en charge des femmes Ă risque. Nous proposons de prĂ©senter lâĂ©tat dâavancement et un descriptif intermĂ©diaire de GENESIS. DonnĂ©es et MĂ©thodes- GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS, non porteuses dâune mutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Lâeffectif attendu est 1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins. Les diverses Ă©tapes du protocole sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les cas index sont invitĂ©s par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales etc.) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et de diminuer ainsi lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique au sein de la population dâĂ©tude. Des donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques (facteurs gynĂ©co-obstĂ©triques, traitements hormonaux, habitudes tabagiques actives et passives, expositions aux radiations etc.) et des Ă©chantillons sanguins sont collectĂ©s. La densitĂ© mammaire est calculĂ©e avec le logiciel « Cumulus » aprĂšs numĂ©risation des mammographies prĂ©cĂ©dant le diagnostic de CS ou des derniĂšres mammographies pour les tĂ©moinsindemnes. Ătat dâavancement â En septembre 2009, 1022 cas index, 541 soeurs atteintes, 385 soeurs indemnes et 922 amies ont acceptĂ© de participer et ont reçu un dossier dâinclusion. 75 % ont renvoyĂ© leur questionnaire, 78 % ont fait leur prĂ©lĂšvement sanguin, 70 % ont fourni des mammographies qui ont pu ĂȘtre numĂ©risĂ©es. Perspectives- Un peu plus de la moitiĂ© des cas index inclus ont une soeur atteinte qui participe Ă lâĂ©tude. 1 820 cas index doivent donc ĂȘtre inclus pour atteindre lâobjectif des 1 000 paires de soeurs atteintes. La dynamique dâinclusion des cas index doit sâaccĂ©lĂ©rer, en particulier par lâinvitation des cas « prospectifs », lors de la remise de leur rĂ©sultat BRCA1/2 nĂ©gatif. Le protocole de lâĂ©tude GENEGO portant sur les caractĂ©ristiques tumorales de GENESIS est en cours dâĂ©laboration. Des Ă©tudes intermĂ©diaires sur des gĂšnes ou pathways « candidats » seront bientĂŽt proposĂ©es. Remerciements â GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2006 et par lâInstitut National du Cancer depuis 2008
Etude Genesis : deux ans d'inclusion !
AbstractNational audienceContexte et Objectifs- Le cancer du sein (CS) est une pathologie qui concerne environ 10 % des femmes. Deux gĂšnes, BRCA1 et BRCA2, ont Ă©tĂ© identifiĂ©s (Miki et al. 1994, Wooster et al. 1995) ; leurs mutations sont impliquĂ©es dans environ 5 % des CS et seulement 15 Ă 20 % des cas familiaux testĂ©s. 80 % des cas familiaux restent inexpliquĂ©s. LâĂ©tude GENESIS a Ă©tĂ© mise en place pour identifier de nouveaux gĂšnes de prĂ©disposition et Ă©valuer leur rĂŽle dans lâapparition dâun CS ainsi que celui de facteurs non gĂ©nĂ©tiques qui pourraient modifier leur effet. Ceci permettrait une meilleure prise en charge des femmes Ă risque. Nous proposons de prĂ©senter lâĂ©tat dâavancement et un descriptif intermĂ©diaire de GENESIS. DonnĂ©es et MĂ©thodes- GENESIS combine une Ă©tude de liaison gĂ©nĂ©tique non paramĂ©trique chez des paires de soeurs atteintes de CS, non porteuses dâune mutation des gĂšnes BRCA et une Ă©tude dâassociation avec deux groupes tĂ©moins : soeurs indemnes et proches non apparentĂ©es (amies, collĂšgues). Lâeffectif attendu est 1 000 paires de soeurs et 4 000 tĂ©moins. Les diverses Ă©tapes du protocole sont coordonnĂ©es par le Centre Coordonnateur* et le Centre de Ressources Biologiques#. Les cas index sont invitĂ©s par les consultants en gĂ©nĂ©tique du Groupe GĂ©nĂ©tique et Cancer de la FĂ©dĂ©ration Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer. Le recueil de caractĂ©ristiques phĂ©notypiques des cas (densitĂ© mammaire, caractĂ©ristiques tumorales etc.) permettra de dĂ©finir des endophĂ©notypes et de diminuer ainsi lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© gĂ©nĂ©tique au sein de la population dâĂ©tude. Des donnĂ©es Ă©pidĂ©miologiques (facteurs gynĂ©co-obstĂ©triques, traitements hormonaux, habitudes tabagiques actives et passives, expositions aux radiations etc.) et des Ă©chantillons sanguins sont collectĂ©s. La densitĂ© mammaire est calculĂ©e avec le logiciel « Cumulus » aprĂšs numĂ©risation des mammographies prĂ©cĂ©dant le diagnostic de CS ou des derniĂšres mammographies pour les tĂ©moinsindemnes. Ătat dâavancement â En septembre 2009, 1022 cas index, 541 soeurs atteintes, 385 soeurs indemnes et 922 amies ont acceptĂ© de participer et ont reçu un dossier dâinclusion. 75 % ont renvoyĂ© leur questionnaire, 78 % ont fait leur prĂ©lĂšvement sanguin, 70 % ont fourni des mammographies qui ont pu ĂȘtre numĂ©risĂ©es. Perspectives- Un peu plus de la moitiĂ© des cas index inclus ont une soeur atteinte qui participe Ă lâĂ©tude. 1 820 cas index doivent donc ĂȘtre inclus pour atteindre lâobjectif des 1 000 paires de soeurs atteintes. La dynamique dâinclusion des cas index doit sâaccĂ©lĂ©rer, en particulier par lâinvitation des cas « prospectifs », lors de la remise de leur rĂ©sultat BRCA1/2 nĂ©gatif. Le protocole de lâĂ©tude GENEGO portant sur les caractĂ©ristiques tumorales de GENESIS est en cours dâĂ©laboration. Des Ă©tudes intermĂ©diaires sur des gĂšnes ou pathways « candidats » seront bientĂŽt proposĂ©es. Remerciements â GENESIS est soutenue par la Ligue Nationale Contre le Cancer depuis 2006 et par lâInstitut National du Cancer depuis 2008
Impact of Early Versus Late Antiretroviral Treatment Initiation on Naive T Lymphocytes in HIV-1-Infected Children and Adolescents â The-ANRS-EP59-CLEAC Study
International audienceBackground: The early initiation of antiretroviral therapy (ART) in HIV-1-infected infants reduces mortality and prevents early CD4 T-cell loss. However, the impact of early ART on the immune system has not been thoroughly investigated in children over five years of age or adolescents. Here, we describe the levels of naive CD4 and CD8 T lymphocytes (CD4/CD8TN), reflecting the quality of immune reconstitution, as a function of the timing of ART initiation (early (<6 months) versus late (â„24 months of age)).Methods: The ANRS-EP59-CLEAC study enrolled 27 children (5-12 years of age) and nine adolescents (13-17 years of age) in the early-treatment group, and 19 children (L-Ch) and 21 adolescents (L-Ado) in the late-treatment group. T lymphocytes were analyzed by flow cytometry and plasma markers were analyzed by ELISA. Linear regression analysis was performed with univariate and multivariate models.Results: At the time of evaluation, all patients were on ART and had a good immunovirological status: 83% had HIV RNA loads below 50 copies/mL and the median CD4 T-cell count was 856 cells/”L (interquartile range: 685-1236 cells/”L). In children, early ART was associated with higher CD8TN percentages (medians: 48.7% vs. 31.0%, P = 0.001), and a marginally higher CD4TN (61.2% vs. 53.1%, P = 0.33). In adolescents, early ART was associated with low CD4TN percentages and less differentiated memory CD8 T cells. CD4TN and CD8TN levels were inversely related to cellular activation and gut permeability.Conclusion: In children and adolescents, the benefits of early ART for CD8TN were clear after long-term ART. The impact of early ART on CD4TN appears to be modest, because pediatric patients treated late respond to HIV-driven CD4 T-lymphocyte loss by the de novo production of TN cells in the thymus. Our data also suggest that current immune activation and/or gut permeability has a negative impact on TN levels