ATLANTIC EPIPHYTES: a data set of vascular and non-vascular epiphyte plants and lichens from the Atlantic Forest

Epiphytes are hyper-diverse and one of the frequently undervalued life forms in plant surveys and biodiversity inventories. Epiphytes of the Atlantic Forest, one of the most endangered ecosystems in the world, have high endemism and radiated recently in the Pliocene. We aimed to (1) compile an extensive Atlantic Forest data set on vascular, non-vascular plants (including hemiepiphytes), and lichen epiphyte species occurrence and abundance; (2) describe the epiphyte distribution in the Atlantic Forest, in order to indicate future sampling efforts. Our work presents the first epiphyte data set with information on abundance and occurrence of epiphyte phorophyte species. All data compiled here come from three main sources provided by the authors: published sources (comprising peer-reviewed articles, books, and theses), unpublished data, and herbarium data. We compiled a data set composed of 2,095 species, from 89,270 holo/hemiepiphyte records, in the Atlantic Forest of Brazil, Argentina, Paraguay, and Uruguay, recorded from 1824 to early 2018. Most of the records were from qualitative data (occurrence only, 88%), well distributed throughout the Atlantic Forest. For quantitative records, the most common sampling method was individual trees (71%), followed by plot sampling (19%), and transect sampling (10%). Angiosperms (81%) were the most frequently registered group, and Bromeliaceae and Orchidaceae were the families with the greatest number of records (27,272 and 21,945, respectively). Ferns and Lycophytes presented fewer records than Angiosperms, and Polypodiaceae were the most recorded family, and more concentrated in the Southern and Southeastern regions. Data on non-vascular plants and lichens were scarce, with a few disjunct records concentrated in the Northeastern region of the Atlantic Forest. For all non-vascular plant records, Lejeuneaceae, a family of liverworts, was the most recorded family. We hope that our effort to organize scattered epiphyte data help advance the knowledge of epiphyte ecology, as well as our understanding of macroecological and biogeographical patterns in the Atlantic Forest. No copyright restrictions are associated with the data set. Please cite this Ecology Data Paper if the data are used in publication and teaching events. © 2019 The Authors. Ecology © 2019 The Ecological Society of Americ

Composição florística de comunidades epifíticas vasculares em unidades de conservação no Estado de São Paulo

O epifitismo é uma relação ecológica interespecífica harmônica do tipo inquilinismo que ocorre entre espécies vegetais, onde umas beneficiam-se do substrato e suporte proporcionados por outras espécies sem que haja prejuízo para esta última. Tal interação biológica é responsável por grande parte da riqueza específica das florestas tropicais úmidas. Além disso, as plantas epífitas desempenham importantes funções como proporcionar recursos alimentares e abrigo para uma grande variedade de organismos componentes da fauna de dossel. Em algumas espécies, o acúmulo de água parada entre suas folhas proporciona o ambiente ideal para que um grande número de invertebrados completem seus ciclos de vida. No entanto, a coleta predatória de espécies com potencial econômico e a redução do hábitat das epífitas devido a atividades extrativistas nas florestas tem causado uma redução na população dessas plantas. Este estudo abordou as formações vegetacionais do bioma Mata Atlântica (Florestas Ombrófilas Densa e Mista, Floresta Estacional Semidecidual, Restinga e Manguezal) e áreas de Cerrado paulistas, em virtude da grande diversidade desses ambientes e do grau de perturbação a que estão sujeitos. Através de estudos florísticos, tem-se uma base para o conhecimento da flora de uma determinada área e subsídios para o planejamento e a implementação de áreas para conservação. Dessa forma, este estudo realizou um levantamento florístico da comunidade epifítica vascular em sete Unidades de Conservação do estado de São Paulo, totalizando 250 espécies, 90 gêneros e 21 famílias de epífitas vasculares. Informações acerca das categorias ecológicas, síndromes de polinização e de dispersão foram analisadas para cada espécie...The epiphytism is an ecological harmonic interspecific relationship inquilinism type that occurs between plants species, where some benefit from the substrate and support provided by other species without prejudice to the latter. Such biological interaction is responsible for much of the richness of rainforests. Moreover, the epiphytic plants have important roles as providing food resources and shelter for a wide variety of fauna organisms components canopy. In some species, the accumulation of stagnant water between their leaves provides the ideal environment for a large number of invertebrates complete their life cycles. However, the predation of species with economic potential and reducing the habitat of epiphytes due to extractive activities in forests has caused a reduction in the population of these plants. This study approached the vegetation formations of the Atlantic Forest biomes (Ombrophilous Dense Forest, Mixed Ombrophilous Forest, Semideciduous Forest, Restinga and Mangrove) and Cerrado areas of São Paulo, because of the great diversity of these environments and the degree of disturbance to which they are subject. Through floristic studies, there is a basis for the knowledge of the flora of a particular area, and subsidies for planning and implementation of conservation areas. Thus, this study conducted a floristic survey of vascular epiphyte community in seven Conservation Units of São Paulo State, totaling 250 species, 90 genera and 21 families of vascular epiphytes. Information about the ecological categories, pollination and dispersion syndromes were analyzed for each species. In addition, listings of species produced by other studies for the same analyzed regions were complemented and... (Complete abstract click electronic access below

Florística e ecologia de epífitas vasculares em um fragmento de floresta de restinga, Ubatuba, SP, Brasil

Resumo O epifitismo é responsável por parte significativa da diversidade de florestas tropicais, proporcionando recursos alimentares e microambientes especializados para a fauna de dossel. A comunidade de epífitas vasculares ocorrente em floresta alta de restinga na planície litorânea da Praia da Fazenda, Núcleo Picinguaba, ao norte do município de Ubatuba/SP, foi avaliada através de coletas mensais durante o período de um ano. Foram identificadas 64 espécies, 37 gêneros e 12 famílias, sendo Orchidaceae, Bromeliaceae, Polypodiaceae e Araceae as mais representativas com 75% do total de espécies amostradas. A forma de vida mais rica encontrada foi a holoepífita obrigatória (73,4%), tendo as monocotiledôneas como maioria (55,3%). Em seguida, apareceram as holoepífitas facultativas (14,1%), restritas às famílias Bromeliaceae e Lomariopsidaceae, as hemiepífitas secundárias (6,3%) e primárias (3,1%), exclusivamente da família Araceae, e as holoepífitas acidentais e preferenciais (1,6% cada)

Processo de informatização do Herbário Rioclarense (HRCB) da Universidade Estadual Paulista (UNESP), campus de Rio Claro, SP, e sua inclusão num sistema de rede

A herbarium is an important center for plant identification. It is the start-point for researches on taxonomic reviews and flora elaboration, a substantial source for floristic composition studies, and a recipient of rare or threatened species. Moreover, it is possible to use vouched collections as profitable sources for genetic resources. Collection computerizing is undoubtedly needed not only to manage the collection itself, but also to ease access to information and available data. Thus, the present work aimed to establish procedures and routine tasks so that the computerization process at the Herbário Rioclarense (HRCB) could be initialized, as well as to draw a preliminary collection profile and make partial data available within a net system of online information. Material information was then digitalized and written in simplified electronic sheets such as those of Microsoft?Excel?2000. After checking data with the aid of reference sites such as W3 Tropics, Missouri Botanical Garden, Index Kewensis and so forth, these were imported into the software BRAHMS 5.0 (Botanical Research and Herbarium Management System), through which they were later integrated to the information system known as speciesLink (Information System Distributed to Biological Collections: Integration of Species Analyst and SinBiota). Type specimens were photographed with ulterior image digitalization and inclusion into the herbarium website. A total of 3,071 materials (exsiccates) and 259 type materials were digitalized. The Asteraceae family was a highlight amongst all computerized families. In our partial analysis, it was clear to notice that the Brazilian southeastern region prevailed over the other ones regarding the number of collected material (81.0% of the computerized total amount), and that the largest contribution comes from the Sao Paulo State (83.9%). Within the Sao Paulo State, an amount of 14.7% of collections come from Itirapina (inside the so-called Rio Claro region), being this city the most representative. We can realize it is important to computerize information of botanical collections to develop various analyses so that local biodiversity may be preserved, characterized or simply maintained.Un herbario significa un importante centro de identificación de plantas, es la base para investigaciones relativas a las revisiones y elaboraciones de floras, constituye una importante fuente para hacer estudios florísticos originales y puede además demostrar especies raras o amenazadas. Más alla de eso, existe la posibilidad de utilización de colecciones herborizadas como importante fuente de recurso genético. La informatización de esas colecciones es de extrema importancia para que el uso y la difusión de la información pueda ser más rápida y eficiente. La informatización es una necesidad no solo para el gerenciamiento de la propia colección, como también para el acceso y la disponibilidad de los datos. Mientras tanto aún es un desafío. De esta forma el objetivo principal de este trabajo fue establecer procedimientos de rutina que sirviesen de base para el procedimiento de informatización del HRCB, además de producir un perfil previo del Herbario Rioclarense y colocar a disposición los datos en red on-line. Para ese propósito las informaciones de los materiales fueron digitadas y compiladas en planillas simples tipo Microsoft@Excel@2000. Despues de conferir los datos, utilizando sites de referencia: W3 Trópicos do Missouri Botanical Garden e Index Kewensis, entre otros, esos datos fueron importados para el Sofware BRAHMS 5.0 (Botanical Research and Herbarium Management System), por el cual fueron integrados al sistema de información, speciesLinK (Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas: a Integração do Species Analyst e do SinBiota). En cuanto, al espécimen tipo fue fotografiada y su imagen digitalizada e incluidas en el Website del Herbario. Fueron informatizados 3.071 materiales (desecados) más 259 materiales tipo. De las familias informatizadas La Asteraceae fue la que tuvo una mayor expresión. En ese análisis parcial se verificó que la región sureste prevaleció sobre las otras encuanto al número de materiales del acervo (81% del total informatizado) y la mayor contribución proviene del estado de São Paulo (83,9%). Itapina en la Región de Río Claro, presentó un total de 14,7% de colecta de ese estado, siendo el municipio más representado. De esa forma se puede percibir la importancia de la informatización de las colecciones botánicas en el desarrollo de los diversos análisis con el fin de preservar, caracterizar, o simplemente contribuir para la mantención de la biodiversidad local.Um herbário representa um importante centro para identificação de plantas, é a base para pesquisas relativas às revisões e elaboração de floras, constitui uma importante fonte para estudos de composição florística original e pode apresentar espécies raras ou ameaçadas. Além disso, é possível utilizar coleções herborizadas como uma importante fonte de recursos genéticos. A informatização dessas coleções é de extrema importância para que o uso e a disseminação da informação possa ser mais rápido e eficiente. A informatização dos acervos é reconhecidamente uma necessidade, não só para o gerenciamento da própria coleção, como também para o acesso e disponibilização dos dados. Entretanto, ainda é um desafio. Assim, o objetivo principal deste trabalho foi estabelecer os procedimentos e rotinas que servissem de base para o início do processo de informatização do HRCB, além de proporcionar um perfil, ainda que preliminar, do Herbário Rioclarense e disponibilizar os dados num sistema de rede de distribuição de informações on-line. Para isso, as informações dos materiais foram “digitadas” e compiladas em planilhas simplificadas do tipo Microsoft?Excel?2000. Após conferência dos dados, usando-se sites de referência como o W3 Trópicos do Missouri Botanical Garden e Index Kewensis, entre outros, esses dados foram importados para o software BRAHMS 5.0 (Botanical Research and Herbarium Management System), através do qual foram integrados ao sistema de informação speciesLink (Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas: a Integração do Species Analyst e do SinBiota). Quanto aos espécimes tipos, estes foram fotografados e suas imagens digitalizadas foram incluídas no website do herbário. Foram informatizados 3.071 materiais (exsicatas) além de 259 materiais tipo. Das famílias informatizadas, Asteraceae foi de maior expressão. Nessa análise parcial, verificou-se que a região sudeste prevaleceu sobre as demais quanto ao número de materiais do acervo (81% do total informatizado), e a maior contribuição provem do estado de São Paulo (83,9%). Itirapina, na região de Rio Claro, apresentou 14,7% do total de coletas deste estado, sendo o município mais representado. Dessa forma, pode-se perceber a importância da informatização de coleções botânicas no desenvolvimento de diversas análises a fim de preservar, caracterizar ou simplesmente contribuir para a manutenção da biodiversidade local