Metallochaperones Are Needed for Mycobacterium tuberculosis and Escherichia coli Nicotinamidase-Pyrazinamidase Activity.

Mycobacterium tuberculosis nicotinamidase-pyrazinamidase (PZAse) is a metalloenzyme that catalyzes conversion of nicotinamide-pyrazinamide to nicotinic acid-pyrazinoic acid. This study investigated whether a metallochaperone is required for optimal PZAse activity. M. tuberculosis and Escherichia coli PZAses (PZAse-MT and PZAse-EC, respectively) were inactivated by metal depletion (giving PZAse-MT-Apo and PZAse-EC-Apo). Reactivation with the E. coli metallochaperone ZnuA or Rv2059 (the M. tuberculosis analog) was measured. This was repeated following proteolytic and thermal treatment of ZnuA and Rv2059. The CDC1551 M. tuberculosis reference strain had the Rv2059 coding gene knocked out, and PZA susceptibility and the pyrazinoic acid (POA) efflux rate were measured. ZnuA (200 μM) achieved 65% PZAse-EC-Apo reactivation. Rv2059 (1 μM) and ZnuA (1 μM) achieved 69% and 34.3% PZAse-MT-Apo reactivation, respectively. Proteolytic treatment of ZnuA and Rv2059 and application of three (but not one) thermal shocks to ZnuA significantly reduced the capacity to reactivate PZAse-MT-Apo. An M. tuberculosis Rv2059 knockout strain was Wayne positive and susceptible to PZA and did not have a significantly different POA efflux rate than the reference strain, although a trend toward a lower efflux rate was observed after knockout. The metallochaperone Rv2059 restored the activity of metal-depleted PZAse in vitro Although Rv2059 is important in vitro, it seems to have a smaller effect on PZA susceptibility in vivo. It may be important to mechanisms of action and resistance to pyrazinamide in M. tuberculosis Further studies are needed for confirmation.IMPORTANCE Tuberculosis is an infectious disease caused by the bacterium Mycobacterium tuberculosis and remains one of the major causes of disease and death worldwide. Pyrazinamide is a key drug used in the treatment of tuberculosis, yet its mechanism of action is not fully understood, and testing strains of M. tuberculosis for pyrazinamide resistance is not easy with the tools that are presently available. The significance of the present research is that a metallochaperone-like protein may be crucial to pyrazinamide's mechanisms of action and of resistance. This may support the development of improved tools to detect pyrazinamide resistance, which would have significant implications for the clinical management of patients with tuberculosis: drug regimens that are appropriately tailored to the resistance profile of a patient's individual strain lead to better clinical outcomes, reduced onward transmission of infection, and reduction of the development of resistant strains that are more challenging and expensive to treat

What do experimental data "say" about growth of hadronic total cross-section?

We reanalyse $\bar p p$ and $pp$ high energy data of the elastic scattering above $\sqrt{s}=5$ GeV on the total cross-section $\sigma_{tot}$ and on the forward $\rho$-ratio for various models of Pomeron, utilizing two methods. The first one is based on analytic amplitudes, the other one relies on assumptions for $\sigma_{tot}$ and on dispersion relation for $\rho$. We argue that it is not possible, from fitting only existing data for forward scattering, to select a definite asymptotic growth with the energy of $\sigma_{tot}$. We find equivalent fits to the data together with a logarithmic Pomeron giving a behavior $\sigma_{tot} \propto \ln ^\gamma s$, $\gamma\in [0.5,2.20]$ and with a supercritical Pomeron giving a behavior $\sigma_{tot} \propto s^\epsilon$, $\epsilon\in [0.01,0.10]$.Comment: LaTeX, 18 pages, 5 eps figures included, to be published in Il Nuovo Ciment

Caracterização, classificação, potencialidades e restrições agrícolas de solos em Chapadinha-MA.

O assentamento Malhada do Meio, localizado em Chapadinha-MA, possui uma área de 630,86 ha, a vegetação é de Floresta Estacional Decidual Submontana e Savana Estépica. O relevo é ondulado e plano, com altitude média de 67 m. A geologia é formada por arenitos finos argilosos da Formação Itapecuru e Depósitos Aluvionares e Coluvionares. Objetivou-se neste trabalho caracterizar, classificar e avaliar as potencialidades e as restrições agrícolas dos solos do assentamento de reforma agrária Malhada do Meio, localizado no município de Chapadinha-MA. Foram abertos quatro perfis em pontos distintos da paisagem. Amostras foram coletadas para a realização das análises de caracterização químicas e granulométrica. Os solos estudados foram classificados no Sistema Brasileiro de Classificação de Solos como Plintossolo Pétrico Concrecionário êndico latossólico, Plintossolo Argilúvico Distrófico abrúptico gleissólico, Neossolo Flúvico e Gleissolo Háplico Tb Distrófico cambissólico. As limitações agrícolas entre os solos estudados (baixa fertilidade, drenagem deficiente, impedimentos à mecanização e ao desenvolvimento das raízes) podem restringir a produtividade das culturas agrícolas

Interaction between Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in the management of Spodoptera spp.

ABSTRACT: Interaction betweeen Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in the management of Spodoptera spp. The use of egg parasitoids is a promising strategy for Integrated Pest Management (IPM), but different species of parasitoids have greater or lesser control efficiency, depending on the pest species. Recently, not only Anticarsia gemmatalis and Pseudoplusia includens but also Spodoptera cosmioides and S. eridania have been among the key Lepidoptera larvae attacking soybeans. This study evaluated the combination of Telenomus remus and Trichogramma pretiosum for parasitism of eggs of the Spodoptera complex, for better control efficiency and broader spectrum of action among the key pests of soybeans. The experiment was carried out under controlled environmental conditions (25 ± 2ºC; 70 ± 10% RH; and 14 h photophase) in a completely randomized experimental design with seven treatments and 10 replicates with S. frugiperda, S. cosmioides and S. eridania eggs. Each replicate consisted of one egg mass of each Spodoptera species, with approximately 100 eggs offered to the parasitoids. The treatments were: 1) 10 females of T. pretiosum; 2) nine females of T. pretiosum and one female of T. remus; 3) eight females of T. pretiosum and two females of T. remus; 4) seven females of T. pretiosum and three females of T. remus; 5) six females of T. pretiosum and four females of T. remus; 6) five females of T. pretiosum and five females of T. remus, and 7) 10 females of T. remus. The parameter evaluated was the percentage of parasitized eggs. Results showed that treatments combining both parasitoid species with only 1 T. remus for each 9 T. pretiosum (10%) and only 2 T. remus for each 8 T. pretiosum (20%) were enough to significantly increase the parasitism observed on eggs of S. cosmioides and S. frugiperda, respectively. This association of T. pretiosum and T. remus in different proportions is very promising for biological control in IPM programs because it provides wide spectrum of control. RESUMO:Interação de Telenomus remus e Trichogramma pretiosum no manejo de Spodoptera spp. O uso de parasitóides de ovos é uma estratégia promissora dentro do manejo integrado de pragas (MIP), mas diferentes espécies de parasitóides têm maior ou menor eficiência dependendo da espécie praga. Recentemente, não apenas Anticarsia gemmatalis e Pseudoplusia includens, mas também Spodoptera cosmioides e S. eridania estão entre as principais larvas de Lepidoptera que estão atacando a cultura da soja. Assim, este trabalho avaliou a possibilidade do uso associado de Telenomus remus e Trichogramma pretiosum no controle de ovos do complexo Spodoptera, objetivando uma maior eficiência de parasitismo com um maior espectro de ação entre as pragas-chave desta cultura. O experimento foi conduzido em condições controladas (25 ± 2ºC; 70 ± 10% e fotofase de 14 h) no delineamento inteiramente casualizado com 7 tratamentos e 10 repetições e ovos de S. frugiperda, S. cosmioides e S. eridania. Para cada repetição foi oferecida aos parasitóides uma postura de cada uma das espécies de Spodoptera, com aproximadamente 100 ovos. As diferentes proporções dos parasitóides (tratamentos) avaliadas foram: 1) dez fêmeas de T. pretiosum 2) nove fêmeas de T. pretiosum e uma fêmea de T. remus 3) oito fêmeas de T. pretiosum e duas fêmeas de T. remus 4) sete fêmeas de T. pretiosum e três fêmeas de T. remus 5) seis fêmeas de T. pretiosum e quatro fêmeas de T. remus 6) cinco fêmeas de T. pretiosum e cinco fêmeas de T. remus 7) dez fêmeas de T. remus. O parâmetro avaliado foi à porcentagem de ovos parasitados. Os resultados mostraram que tratamentos combinando ambas as espécies de parasitóides com apenas 1 T. remus para cada 9 T. pretiosum (10%) e apenas 2 T. remus para cada 8 T. pretiosum (20%) foram suficientes para aumentar significativamente o parasitismo observado em ovos de S. cosmioides e S. frugiperda, respectivamente. Esta associação de T. pretiosum e T. remus em diferentes proporções é bastante promissora para utilização em programas de controle biológico dentro do MIP visto que poderá fornecer um bom espectro de controle

Host preference of the egg parasitoids Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in laboratory.

ABSTRACT: Host preference of the egg parasitoids Telenomus remus and Trichogramma pretiosum in laboratory. This research aimed to evaluate the host preference of the egg parasitoids Telenomus remus and Trichogramma pretiosum. Trials were carried out in laboratory, under controlled environmental conditions (25 ± 2ºC temperature; 70 ± 10% RH; and 14 h photophase). The parasitoid searching behavior was evaluated based on the distribution (%) of eggs parasitized by each parasitoid, on egg masses of each host species. Results showed the host preference of T. remus by Spodoptera cosmioides eggs. T. pretiosum, reared in A. gemmatalis eggs, choose to parasitize always eggs of the host where the parasitoid had been reared. The egg preference was not observed when T. pretiosum was reared in S. frugiperda eggs. These results show that, in general, host preference of T. remus is less influenced by the host where it is developed than T. pretiosum. Host preference is an important parameter for biological control programs because more than one pest species may occur in the field, different from those where they were reared in the laboratory. RESUMO: Preferência hospedeira dos parasitoides de ovos Telenomus remus e Trichogramma pretiosum em laboratório. Este trabalho objetivou avaliar a preferência hospedeira dos parasitóides de ovos Telenomus remus e Trichogramma pretiosum. Os experimentos foram conduzidos em laboratório, sob condições controladas (temperatura de 25 ± 2ºC; umidade relativa de 70 ± 10%; e fotofase de 14 horas). O comportamento de busca dos parasitóides foi avaliado através da distribuição (%) de ovos parasitados por espécie de parasitóide, em massas de ovos de cada hospedeiro na combinação estudada. Os resultados mostraram que T. remus preferiu parasitar ovos de S. cosmioides. T. pretiosum, criados em ovos de A. gemmatalis, preferiu parasitar sempre os ovos dos hospedeiros nos quais foram multiplicados. Essa preferência não foi observada quando T. pretiosum foi multiplicado em ovos de S. frugiperda. Esses resultados mostram que, em geral, a preferência hospedeira de T. remus é menos influenciada em relação a T. pretiosum pelo hospedeiro em que o parasitóide se desenvolveu. A preferência hospedeira é um importante parâmetro a ser considerado em programas de controle biológico porque em condições de campo mais de uma espécie praga pode estar presente, diferente daquela em que foi criado em laboratório

Using global analysis, partial specifications, and an extensible assertion language for program validation and debugging

We discuss a framework for the application of abstract interpretation as an aid during program development, rather than in the more traditional application of program optimization. Program validation and detection of errors is first performed statically by comparing (partial) specifications written in terms of assertions against information obtained from (global) static analysis of the program. The results of this process are expressed in the user assertion language. Assertions (or parts of assertions) which cannot be checked statically are translated into run-time tests. The framework allows the use of assertions to be optional. It also allows using very general properties in assertions, beyond the predefined set understandable by the static analyzer and including properties defined by user programs. We also report briefly on an implementation of the framework. The resulting tool generates and checks assertions for Prolog, CLP(R), and CHIP/CLP(fd) programs, and integrates compile-time and run-time checking in a uniform way. The tool allows using properties such as types, modes, non-failure, determinacy, and computational cost, and can treat modules separately, performing incremental analysis

Recent Advances in Chromospheric and Coronal Polarization Diagnostics

I review some recent advances in methods to diagnose polarized radiation with which we may hope to explore the magnetism of the solar chromosphere and corona. These methods are based on the remarkable signatures that the radiatively induced quantum coherences produce in the emergent spectral line polarization and on the joint action of the Hanle and Zeeman effects. Some applications to spicules, prominences, active region filaments, emerging flux regions and the quiet chromosphere are discussed.Comment: Review paper to appear in "Magnetic Coupling between the Interior and the Atmosphere of the Sun", eds. S. S. Hasan and R. J. Rutten, Astrophysics and Space Science Proceedings, Springer-Verlag, 200

Implementing Groundness Analysis with Definite Boolean Functions

The domain of definite Boolean functions, Def, can be used to express the groundness of, and trace grounding dependencies between, program variables in (constraint) logic programs. In this paper, previously unexploited computational properties of Def are utilised to develop an efficient and succinct groundness analyser that can be coded in Prolog. In particular, entailment checking is used to prevent unnecessary least upper bound calculations. It is also demonstrated that join can be defined in terms of other operations, thereby eliminating code and removing the need for preprocessing formulae to a normal form. This saves space and time. Furthermore, the join can be adapted to straightforwardly implement the downward closure operator that arises in set sharing analyses. Experimental results indicate that the new Def implementation gives favourable results in comparison with BDD-based groundness analyses

Seletividade de produtos fitossanitários utilizados na cultura da soja para pupas de Trichogramma pretiosum Riley, 1879 (Hymenoptera: Trichogrammatidae).

O objetivo do trabalho foi avaliar o efeito de produtos fitossanitários sobre pupas de Trichogramma pretiosum. Foram conduzidos três bioensaios em delineamento inteiramente casualizado com 11 tratamentos e cinco repetições. Em cada repetição, ovos de Anagasta kuehniella (Zeller, 1879) (Lepidoptera: Pyralidae) foram utilizados como hospedeiro alternativo, sendo aderidos em cartelas de cartolina de 1 cm2 com solução de goma arábica à 40% e oferecidos para o parasitismo por 24h. Após 168-192h do parasitismo, quando os parasitoides estavam na fase de pupa, as cartelas foram mergulhadas por cinco segundos nos tratamentos testados. Avaliou-se a sobrevivência dos indivíduos tratados e a redução na emergência dos parasitoides foi classificada segundo as normas da IOBC. Os inseticidas flufenoxurom (Cascade®) 10, diflubenzurom (Dimilin®) 20 e metoxifenozide (Intrepid 240SC®) 21,6 e 36 g i.a. ha-1 foram classificados como inócuos. Permetrina (Valon 384 CE®) 49,92; betaciflutrina 12,5 + imidacloprido 100 (Connect®) e gama-cialotrina (Stallion 150SC®) 3,75 g i.a. ha-1 foram levemente nocivos. Clorpirifós (Lorban 480BR®) 384 e espinosade (Tracer®) 24 g i.a. ha-1 foram moderadamente nocivos. Os herbicidas glifosato 720 + imazetapir 90 (Alteza®); s-metolacloro (Dual Gold®) 1920; flumioxazina (Flumyzin 500®) 60; clomazona (Gamit®) 1000; glifosato 2880 (Gliz 480SL®); dicloreto de paraquate 600 + diurom 300 (Gramocil®); glifosato 1200 (Roundup Ready®); foram classificados como inócuos e os herbicidas 2,4-D (DMA 806BR®) 1209; dicloreto de paraquate (Gramoxone®) 600; glifosato (Roundup Transorb®) 2592 g i.a. ha-1 classificados como levemente nocivos. Os fungicidas tiofanato-metílico (Cercobin 500 SC®) 400; flutriafol 60 + tiofanato-metílico 300 (Celeiro®); carbendazin (Derosal 500SC®) 250; tebuconazole (Folicur EC®) 150; flutriafol (Impact®) 125; tebuconazole 120 + trifloxistrobina 60 (Nativo®); epoxiconazole 30 + piraclostrobina 79,8 (Opera®); epoxiconazole (Opus SC®) 12,5; azoxistrobina (Priori®) 50; azoxistrobina 60 + ciproconazole 24 (Priori Xtra®) g i.a. ha-1 foram classificados como inócuos a T. pretiosum na fase de desenvolvimento avaliada (pupa). Dentre os produtos avaliados, aqueles classificados como inócuos devem ser priorizados no manejo integrado de pragas (MIP) por compatibilizar o uso do controle químico sem prejudicar o controle biológico. Do mesmo modo, os produtos classificados como moderadamente nocivos devem ser evitados sempre que possível ou substituídos por outro de menor impacto