A spatiotemporal nonparametric Bayesian model of multi-subject fMRI data

In this paper we propose a unified, probabilistically coherent framework for the analysis of task-related brain activity in multi-subject fMRI experiments. This is distinct from two-stage “group analysis” approaches traditionally considered in the fMRI literature, which separate the inference on the individual fMRI time courses from the inference at the population level. In our modeling approach we consider a spatiotemporal linear regression model and specifically account for the between-subjects heterogeneity in neuronal activity via a spatially informed multi-subject nonparametric variable selection prior. For posterior inference, in addition to Markov chain Monte Carlo sampling algorithms, we develop suitable variational Bayes algorithms. We show on simulated data that variational Bayes inference achieves satisfactory results at more reduced computational costs than using MCMC, allowing scalability of our methods. In an application to data collected to assess brain responses to emotional stimuli our method correctly detects activation in visual areas when visual stimuli are presented

Generalized Species Sampling Priors with Latent Beta reinforcements

Many popular Bayesian nonparametric priors can be characterized in terms of exchangeable species sampling sequences. However, in some applications, exchangeability may not be appropriate. We introduce a {novel and probabilistically coherent family of non-exchangeable species sampling sequences characterized by a tractable predictive probability function with weights driven by a sequence of independent Beta random variables. We compare their theoretical clustering properties with those of the Dirichlet Process and the two parameters Poisson-Dirichlet process. The proposed construction provides a complete characterization of the joint process, differently from existing work. We then propose the use of such process as prior distribution in a hierarchical Bayes modeling framework, and we describe a Markov Chain Monte Carlo sampler for posterior inference. We evaluate the performance of the prior and the robustness of the resulting inference in a simulation study, providing a comparison with popular Dirichlet Processes mixtures and Hidden Markov Models. Finally, we develop an application to the detection of chromosomal aberrations in breast cancer by leveraging array CGH data.Comment: For correspondence purposes, Edoardo M. Airoldi's email is [email protected]; Federico Bassetti's email is [email protected]; Michele Guindani's email is [email protected] ; Fabrizo Leisen's email is [email protected]. To appear in the Journal of the American Statistical Associatio

Suitability study of Endless Strip Production technology for fabrication of api grades

Production of hot rolled strip for oil and gas transport pipelines requires a fine and homogeneousmicrostructure and careful choice of chemical composition in order to meet strength, toughness, andweldability requirements. Whilst hot rolled coils to grade X80, produced by conventional continuous castingand hot rolling, are a commercial reality, there is great interest in producing API grades manufactured by thealternative (and more economical) thin slab direct rolling route.The current work has assessed the feasibility of producing hot rolled strip of grades X65-X70 using the endlessstrip production layout (ESP), originally developed at Arvedi. The study was carried out using a metallurgicalmodelling system based on empirical equations describing austenite evolution, transformation and mechanicalproperties. Using this approach it was possible to study the effects of initial slab thickness, reduction ratio andchemical composition on the mechanical properties of strips in a thickness range of 10 to 20 mm. In this way,for each grade, the optimum rolling schedules, microstructures and chemical compositions could be obtained

Controle de Linepithema micans (Hymenoptera: Formicidae) com iscas tóxicas de hidrogel na cultura da videira.

Linepithema micans (Forel, 1908) (Hymenoptera: Formicidae) é a principal formiga associada à dispersão da pérola-da-terra Eurhizococcus brasiliensis (Wille, 1922) (Hemiptera: Margarodidae) na cultura da videira. Uma alternativa para reduzir a infestação da cochonilha nos vinhedos seria o controle da formiga através do emprego de iscas tóxicas. Neste trabalho, foi avaliado o efeito de uma formulação de isca tóxica de hidrogel para o controle de L. micans em laboratório e em vinhedo comercial.(Embrapa Uva e Vinho. Documentos 99)

Efeito de iscas tóxicas no controle de Linepithema micans e estabelecimento de metodologia para estudos de dispersão da espécie na videira.

Linepithema micans é a principal espécie de formiga dispersora da pérola-daterra. Uma alternativa para reduzir a infestação da cochonilha é o controle da formiga. Aplicações de iscas tóxicas a base de hidrametilnona na dose de 450g/ha/semana por 19 semanas foram eficazes no controle dos insetos. No entanto, a necessidade de aplicação semanal é demandante de mão de obra inviabilizando o emprego prático da tecnologia. Uma estratégia para definir a densidade de porta iscas/área é o conhecimento do raio de forrageamento das operárias. Nesse trabalho foi avaliado o efeito da redução do número de aplicações de iscas tóxicas para o controle dos insetos e ajustado um protocolo para estudar a dispersão de L. micans(Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 99

Padrões nutricionais para lavouras arrozeiras irrigadas por inundação pelos métodos da CND e Chance Matemática.

Para o arroz irrigado, poucos trabalhos utilizam métodos de diagnose foliar desenvolvidos para as condições locais de clima, solo ou cultivares. O objetivo deste trabalho foi avaliar os métodos da Diagnose da Composição Nutricional e da Chance Matemática na definição dos padrões nutricionais de lavouras arrozeiras do Estado do Rio Grande do Sul. Resultados de produtividade de grãos e teores foliares de N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn, Zn e Mo de 356 lavouras arrozeiras cultivadas sob sistema de irrigação por inundação foram utilizados para a determinação das faixas de suficiência calculadas pelo método da Chance Matemática. As faixas de suficiência foram comparadas com valores críticos propostos pela literatura e com o intervalo de confiança do teor médio dos nutrientes em lavouras consideradas nutricionalmente equilibradas, identificadas pelo método Diagnose da Composição Nutricional. Observou-se pouca concordância entre os valores das faixas de suficiência indicados pelos métodos da Chance Matemática e da Diagnose da Composição Nutricional e os respectivos valores indicados na literatura. A faixa de teores foliares adequados, consistentes com maior produtividade média das lavouras arrozeiras, foi indicada ser de 23 a 28 g kg-1 para N; 11 a 14 g kg-1 para K; 1,4 a 2,0 g kg-1 para S; 6 a 12 mg kg-1 para B; e 70 a 200 mg kg-1 para Fe. Para os teores foliares de P, Ca, Mg, B, Cu, Mn e Zn e Mo nenhuma das faixas adequadas testadas indicou capacidade para distinguir as lavouras arrozeiras quanto à produtividade média

Arquitetura de ninhos de Acromyrmex em parreiras da Serra Gaúcha e Serra do Sudoeste no estado do Rio Grande do Sul.

Formigas cortadeiras do gênero Acromyrmex são de ocorrência comum em regiões produtoras de uva ocasionando danos severos a cultura. A arquitetura dos ninhos é um dos aspectos que pode interferir nos resultados de controle de formigas cortadeiras

Classes of Multiple Decision Functions Strongly Controlling FWER and FDR

This paper provides two general classes of multiple decision functions where each member of the first class strongly controls the family-wise error rate (FWER), while each member of the second class strongly controls the false discovery rate (FDR). These classes offer the possibility that an optimal multiple decision function with respect to a pre-specified criterion, such as the missed discovery rate (MDR), could be found within these classes. Such multiple decision functions can be utilized in multiple testing, specifically, but not limited to, the analysis of high-dimensional microarray data sets.Comment: 19 page