Global biogeography, cryptic species and systematic issues in the shrimp genus <i>Hippolyte</i> Leach, 1814 (Decapoda: Caridea: Hippolytidae) by multimarker analyses

Hippolyte is a genus of small bodied marine shrimps, with a global distribution. Here, we studied the phylogenetic and biogeographic relationships amongst the species of this genus with two mitochondrial and two nuclear markers, using Bayesian Inference, Maximum Likelihood, genetic divergence, molecular clock and S-DIVA. In addition, the Indo-West Pacific genus Alcyonohippolyte was included. Based on sequences from 57 specimens of 27 species, we recovered a robust biogeographic scenario that shows the Indo-West Pacific as the probable ancestral area of the genus Hippolyte, which emerged in the Paleocene, followed by dispersal in three general directions: (1) South Pacific, (2) eastern Atlantic and Mediterranean Sea and (3) Americas, the latter with a primary colonization in the eastern Pacific followed by a radiation into the western Atlantic. Our analysis reveals that the species of the H. ventricosa group do not constitute a monophyletic group and Alcyonohippolyte does not constitute a reciprocally monophyletic group to Hippolyte, with both genera herein synonimised. The relationships and systematic status of several transisthmian and Atlantic species are clarified

Avaliação dos camarões atiídeos (Decapoda: Atyidae).

Introdução. Distribuição geográfica. Habitat e ecologia. Biologia geral. Ameaças. Ações de conservação. Pesquisas necessárias. Bibliografia. Espécies avaliadas no processo conduzido pelo ICMBio.bitstream/item/165868/1/CNPASA-2016-cap5.pd

Global biogeography, cryptic species and systematic issues in the shrimp genus Hippolyte Leach, 1814 (Decapoda: Caridea: Hippolytidae) by multimarker analyses

Hippolyte is a genus of small bodied marine shrimps, with a global distribution. Here, we studied the phylogenetic and biogeographic relationships amongst the species of this genus with two mitochondrial and two nuclear markers, using Bayesian Inference, Maximum Likelihood, genetic divergence, molecular clock and S-DIVA. In addition, the Indo-West Pacific genus Alcyonohippolyte was included. Based on sequences from 57 specimens of 27 species, we recovered a robust biogeographic scenario that shows the Indo-West Pacific as the probable ancestral area of the genus Hippolyte, which emerged in the Paleocene, followed by dispersal in three general directions: (1) South Pacific, (2) eastern Atlantic and Mediterranean Sea and (3) Americas, the latter with a primary colonization in the eastern Pacific followed by a radiation into the western Atlantic. Our analysis reveals that the species of the H. ventricosa group do not constitute a monophyletic group and Alcyonohippolyte does not constitute a reciprocally monophyletic group to Hippolyte, with both genera herein synonimised. The relationships and systematic status of several transisthmian and Atlantic species are clarified

Distribución espacial y temporal del cangrejo ermitaño Pagurus exilis (Benedict, 1982) (Decapoda: Paguridae) en la costa sudoccidental de Brasil

Este estudio tuvo por objetivo determinar la distribución espacial y temporal del cangrejo ermitaño Pagurus exilis en la región de Caraguatatuba, caracterizando la abundancia y distribución en función de la estación del año y profundidad. Se determinaron las relaciones entre los individuos y algunos factores abióticos (temperatura, salinidad, profundidad, concentración de materia orgánica y textura del sedimento). Las capturas fueron realizadas mensualmente, entre julio de 2001 y junio de 2003, en siete profundidades (5, 10, 15, 20, 25, 30 y 35 m), utilizando dos redes de arrastres. Se obtuvo un total de 1960 individuos de P. exilis, incluyendo 1369 (69,9%) machos, 304 (15,5%) hembras no ovígeras y 287 (14,6%) hembras ovígeras. Los animales estuvieron distribuidos entre 15 y 35 m de profundidad y ausentes en 5 m. La mayor cantidad de individuos (40,6%) fue obtenida durante el invierno y así como 57,8% de las hembras ovígeras. La presencia de Pagurus exilis parece estar relacionada con la combinación de algunos factores abioticos tales como profundidad (15 y 35 m), alta salinidad (34 a 37 psu), temperatura baja (18 a 24ºC), y concentración de materia orgánica entre 1 y 9%

Distribución espacial y temporal del cangrejo ermitaño Pagurus exilis (Benedict, 1982) (Decapoda: Paguridae) en la costa sudoccidental de Brasil

Este estudio tuvo por objetivo determinar la distribución espacial y temporal del cangrejo ermitaño Pagurus exilis en la región de Caraguatatuba, caracterizando la abundancia y distribución en función de la estación del año y profundidad. Se determinaron las relaciones entre los individuos y algunos factores abióticos (temperatura, salinidad, profundidad, concentración de materia orgánica y textura del sedimento). Las capturas fueron realizadas mensualmente, entre julio de 2001 y junio de 2003, en siete profundidades (5, 10, 15, 20, 25, 30 y 35 m), utilizando dos redes de arrastres. Se obtuvo un total de 1960 individuos de P. exilis, incluyendo 1369 (69,9%) machos, 304 (15,5%) hembras no ovígeras y 287 (14,6%) hembras ovígeras. Los animales estuvieron distribuidos entre 15 y 35 m de profundidad y ausentes en 5 m. La mayor cantidad de individuos (40,6%) fue obtenida durante el invierno y así como 57,8% de las hembras ovígeras. La presencia de Pagurus exilis parece estar relacionada con la combinación de algunos factores abioticos tales como profundidad (15 y 35 m), alta salinidad (34 a 37 psu), temperatura baja (18 a 24ºC), y concentración de materia orgánica entre 1 y 9%

New primers for amplification of cytochrome c oxidase subunit I barcode region designed for species of Decapoda (Crustacea)

Abstract We designed 14 new primers for amplification of the COI barcode region of decapod crustacean species. We tested, with high level of success, the generation of ~ 640 ± 49 base-pair sequences in selected groups of decapods (hermit crabs, squat lobsters, marine and freshwater crabs and shrimps), encompassing representatives of 27 genera of 15 families, 11 of Pleocyemata (Anomura, Brachyura, and Caridea) and 4 of Dendrobranchiata. Based on the results we expect the applicability of these primers for several studies with different taxa within Decapoda