Characterization of a new large family of extinct short retroposons in the protozoan parasite Leishmania and their role in post-transcriptional regulation of gene expression

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2009-2010Les leishmanioses se caractérisent par divers symptômes allant de lésions cutanées guérissant spontanément, causées surtout par L. major, . à des infections viscérales potentiellement mortelles causées par le complexe L. donovani/L. infantum. Malgré des génomes presque identiques, des analyses comparatives sur biopuces ont révélé d'importantes différences d'expression génique entre l~s deux stades de vie, promastigotes et amastigotes chez ces deux espèces, ce qui pourrait contribuer aux différences dans les manifestations cliniques. Chez Leishmania, le contrôle de l'expression génique s' effectue au niveau posttranscriptionnel et implique surtout des séquences cis régulatrices situées dans les séquences 3' non-traduites (3 'UTRs) des transcrits. Jusqu'à maintenant, quelques séquences régulatrices seulement ont été caractérisées et les mécanismes contrôlant l'expression génique entre les différents stades et différentes espèces de Leishmania sont peu connus. Ce projet visait à mieux comprendre les voies exploitées par Leishmania pour pallier au manque .de contrôle transcriptionnel et contrôler globalement l'expression génique afin de s'adapter à ses différents environnements. Nous avons identifié deux nouvelles grandes familles de courts rétroposons éteints nommées SIDER1 (Short Interspersed DEgenerated Retroposons; 785 copies) et SIDER2 (1 073 copies), situés presqu'exclusivement dans les régions 3'UTRs. Nous avons caractérisé la famille SIDER2 et démontré qu'elle réprime l'expression génique en déstabilisant spécifiquement les transcrits portant ces éléments. La dégradation rapide des transcrits instables contenant un élément SIDER2 est amorcée par un clivage endonucléolytique séquence-spécifique sans raccourcissement préalable de la séquence poly(A). Le clivage se produit dans une région riche en C d'environ 20 nt) au début de la seconde séquence signature de 79 nt, qui est hautement conservée parmi les SIDER2 et essentielle pour l'instabilité de l'ARNm. Nous suggérons -l'hypothèse que Leishmania exploite les SIDER2 pour réprimer de manière coordonnée l'expression des transcrits devant être faiblement exprimés. L'effet répressif de SIDER2 est bloqué chez les amastigotes de L. infantum, possiblement pour produire une quantité suffisante de certains ARNm ou protéines. Cette inactivation sélective des SIDER2 chez L. infantum contribue aux différences d'expression génique chez les différentes espèces et différents stades de Leishmania. À notre connaissance, ceci est le premier exemple chez les eucaryotes d'une famille entière d' éléments mobiles domestiqués pour participer au contrôle posttranscriptionnel de l'expression génique

Wert-Abjektion als grundlegende Herrschaftsform des patriarchalen Kapitalismus – ‘Sorge(n)freie’ Gesellschaft als Resultat

The article delivers a contribution to theorise (the devaluation of ) care-work in patriarchal capitalism and to connect the theorization with the empirical analysis of the German ambulant care sector in neoliberal times. The central theorem of ‘value-abjection’ transforms Marxist value theory and conceptualizes the abjection of care work as constitutive mechanism of domination in patriarchal capitalism. Transferred to a concrete level of argumentation the theoretical perspective of value-abjection helps not only to analyse the structural tendency of abjection of care work. It also enables to identify empirically- concrete which specific aspects of care and for what reason are structured as abject

Komplexe Mensch-Umwelt-Systeme im Geographieunterricht mit Hilfe von Argumentationen erschließen - am Beispiel der Trinkwasserproblematik in Guadalajara (Mexiko)

Megacities in Entwicklungs- und Schwellenländern, speziell Bewohner*innen mit geringen sozioökonomischen Status, sind vom Mangel an sauberen Wasser betroffen. Durch das theoretische Konzept komplexer Mensch-Umwelt-Systeme wird die Trinkwasserproblematik beispielhaft an der werdenden Megacity Guadalajara (Mexiko) analysiert. Mensch-Umwelt-Beziehungen sind wesentlicher Gegenstand moderner Geographiedidaktik und -unterrichts. Trotzdem erste Konzepte existieren, die durch die Bildungsstandards gestützt werden, bleibt der Transfer von komplexen Mensch-Umwelt-Systemen in den Unterricht und die Darstellung in Schüler*innentexten offen. Aktuelle fachdidaktische Forschung impliziert ein besseres Erfassen von komplexen Inhalten durch komplexe Sprachhandlungen, wie Argumentationen. Zur Klärung im Geographieunterricht am Beispiel komplexer Mensch-Umwelt-Systeme wird ein Modell für die Didaktik entwickelt, welches Konzepte und Methoden der Geographie, der Soziologie, der Physik und der Informationstheorie vereint und auf die Trinkwasserproblematik in Guadalajara überträgt. Es mündet in einem Kompetenzstufenmodell als Instrument zur Beschreibung und Messung der Darstellung von komplexen Systemen in Schüler*innentexten. Untersuchung der Kategorien des Systems, der Kompetenzstufen, der Kernbegriffe mit ihrer Kollokation sowie die Analyse des Argumentationsanteils und der Argumentationsqualität im Bezug auf die Darstellung von komplexen Systemen in empirischen Daten überprüfen die Modelle. Grundsätzlich werden in Schüler*innentexte komplexe Mensch-Umwelt-Systeme dargestellt, jedoch wenig komplex und tief gehend analysiert. Argumentation können bei der Darstellung von Aspekten des Vernetzungsgrades und der raumzeitlichen Dynamik tendenziell unterstützen. Die Kernbegriffe mit Kollokation zeigen ebenfalls eine wesentliche Bedeutung zur Darstellung komplexer Aspekte. Implikationen für eine moderne Geographiedidaktik sowie für einen Geographieunterricht werden abschließend diskutiert

Wert-Abjektion als konstituierende und strukturierende Kraft von Care-Arbeit im patriarchalen Kapitalismus

"Der Artikel verfolgt den Anspruch einen Beitrag zur Theoretisierung der Care-Arbeit im patriarchalen Kapitalismus zu leisten. Auf einer abstrakten Ebene wird versucht die permanente Abwertung der Care-Arbeit durch eine Verknüpfung marxistisch-feministischer und psychoanalytischer Perspektiven analytisch fassbar zu machen. Zunächst wird dabei das Wert-Abspaltungstheorem von Roswitha Scholz im Kontext marxistisch-feministischer Debatten, skizziert und kritisiert und in zweifacher Weise (formanalytisch und psychoanalytisch) re-konzeptualisiert Im Ergebnis wird dabei die Marx'sche Wertform als Wert-Abjektionsform konzipiert, die als soziale Form die strukturierende und konstituierende Kraft der Care-Arbeit darstellt und so deren permanente Abwertung erklärt." (Autorenreferat)"This paper aims to deliver a contribution to theorise care-work in patriarchal capitalism. On an abstract level of argumentation and linking marxist-feminist and psychoanalytical perspectives, it explains the permanent devaluation of care-work. In this respect it describes and criticises the theorem of 'value-dissociation' by Roswitha Scholz in the context of marxist-feminist debates and re-conceptualises the concept in a twofold manner (formanalytically and psychoanalytically). In conclusion the marxist value-form always appears as a value-abjection-form, which as social form is a constitutive and structuring force of care work in patriarchal capitalism and explains their permanent devaluation. The article discusses current analyses and assessments of the contemporary 'multiple crisis' from the perspectives of feminist and neo-Gramscian International Political Economy (IPE). We argue for a conceptual linkage of these approaches in order to analyze the role of gendered subjectivation in currently dominant forms of crisis management. The Troika's policies in Greece are presented as an example for how the - implicitly organized - redistribution of responsibilities for socially necessary care- and reproduction work can be understood as 'subjectivation as crisis management': the displacement of crisis management into the gendered subjects themselves." (author's abstract

Changes in oro-facial function and hand-grip strength during a 2-year observation period after stroke

Objectives: Recovery from stroke-related oro-facial impairment has rarely been investigated. In this longitudinal study chewing efficiency, maximum lip and bite force as well as masseter muscle thickness were evaluated and compared with hand-grip force. Materials and methods: Thirty-one hospitalized stroke patients and 24 controls were recruited for this cohort study with 2-year follow-up. Chewing efficiency was evaluated with a color mixing ability test, lip forces with a traction dynamometer, bite force with a digital gauge, masseter muscle thickness using ultrasound measurements and grip strength with a hand dynamometer. Results: During the 2-year observation period, patients were evaluated four times. A total of 21 patients dropped out of the study. Stroke patients showed significantly impaired chewing efficiency and lower lip forces than controls with no significant improvement over time. Bite forces were not different between ipsi- and contralesional sides, in contrast to contralesional hand-grip strength which was significantly impaired and did not improve during the observation period. On the first examination with a median of 40days after stroke, masseter thickness was reduced contralesional, but did not continue to show significant side-differences during follow-up. Conclusions: Stroke affects the upper limb and the masseter muscles differently on a functional and morphological level. Further research is needed to evaluate the predictive value of oro-facial parameters on functional outcome after stroke. Clinical relevance: Impaired chewing efficiency and reduced lip force are quantifiable symptoms in stroke patients which seem not to improve in absence of oro-facial rehabilitation procedure

Mimicking of the histidine brace structural motif in molecular copper(I) compounds

L-Nτ-methylhistidine methyl ester, MeHisOMe, has been employed as a potential ligand to mimic the histidine brace-type coordination of copper ions in enzymes such as the particulate methane monoxygenase or lytic polysaccharide monooxygenases. MeHisOMe was prepared by double-methylation of histidine methyl ester. Subsequently, its complexation by diphosphine copper(I) precursors [Cu(P^P)(MeCN)2]BF4 was tested, which led to the complexes [Cu(P^P)(MeHisOMe)]BF4 (P^P=dpePhos: 1, P^P=XantPhos: 2, P^P=dppf: 3). 1–3 were fully characterized, also by single crystal X-ray analysis, thus providing first structural data for copper complexes with a synthetic, authentic histidine brace. The complexes proved inert in contact with dioxygen. To improve the biomimetic character attempts were made to formally replace the diphosphine ligands by bis(pyrazolyl)methanes, Bpm. Correspondingly, [BpmCu(NCMe)x]BF4 precursors were synthesized, with different substituents at the 3-positions of the pyrazolyl (i. e. Bpm=di(3-(phenyl)-1H-pyrazol-1-yl)diphenylmethane, di(3-(mesityl)-1H-pyrazol-1-yl)methane and di(3-(tert-butyl)-1H-pyrazol-1-yl)diphenylmethane). Addition of MeHisOMe to these complexes led to products that were so sensitive towards oxidation by the environment that they eluded isolation. One experiment provided blue crystals as a product of such a reaction. They belonged to a salt with a complex cation consisting of a Cu(μ-OH)2Cu core ligated by two MeHisOMe ligands, which dimerises in the solid state to give [Cu4(OH)4(MeHisOMe)4]4+.Peer Reviewe

Controlling the Activation at NiII−CO22− Moieties through Lewis Acid Interactions in the Second Coordination Sphere

Nickel complexes with a two-electron reduced CO2 ligand (CO22−, “carbonite”) are investigated with regard to the influence alkali metal (AM) ions have as Lewis acids on the activation of the CO2 entity. For this purpose complexes with NiII(CO2)AM (AM=Li, Na, K) moieties were accessed via deprotonation of nickel-formate compounds with (AM)N(iPr)2. It was found that not only the nature of the AM ions in vicinity to CO2 affect the activation, but also the number and the ligation of a given AM. To this end the effects of added (AM)N(R)2, THF, open and closed polyethers as well as cryptands were systematically studied. In 14 cases the products were characterized by X-ray diffraction and correlations with the situation in solution were made. The more the AM ions get detached from the carbonite ligand, the lower is the degree of aggregation. At the same time the extent of CO2 activation is decreased as indicated by the structural and spectroscopic analysis and reactivity studies. Accompanying DFT studies showed that the coordinating AM Lewis acidic fragment withdraws only a small amount of charge from the carbonite moiety, but it also affects the internal charge equilibration between the LtBuNi and carbonite moieties