Development of a non-radioactive molecular hybridization probe for detecting Strawberry mottle virus in strawberry

La propagación vegetativa del cultivo de frutilla favorece la transmisión de patógenos sistémicos, como es el caso de los virus, que constituyen uno de los principales factores limitantes. Se han descripto más de 20 virus que infectan esta especie; el Strawberry mottle virus (SMoV) es uno de los más frecuentes y responsable de importantes pérdidas económicas. Debido a la falta de antisuero disponible comercialmente para un diagnóstico serológico, el SMoV es detectado fundamentalmente mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción reversa (RT-PCR). En este estudio se desarrolló una sonda de hibridación molecular no radioactiva para su detección. Se sintetizó cDNA con cebadores específicos diseñados a partir de la región 3’ no codificante del genoma viral. El cDNA obtenido fue clonado, marcado y utilizado como sonda. Se evaluaron seis protocolos de extracción de ARN viral a partir de plantas infectadas, de los cuales el método de bromuro de cetiltrimetilamonio modificado (CTAB) fue el más eficiente. Se evaluaron hojas de diferentes estados fenológicos y pecíolos, y fueron las hojas viejas y los pecíolos los que mostraron mayor reacción.The vegetative propagation of strawberries favors transmission of systemicpathogens, such as viruses, which are one of the main yield-limiting factorsfor this crop. More than 20 viruses have been described as infecting thisspecies; one of the most frequent is the Strawberry mottle virus (SMoV), whichis responsible for significant economic losses. SMoV is usually detected byreverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), given that serum isnot available for serological tests. In this study, a non-radioactive molecularprobe was developed for SMoV detection. The cDNA was synthesized byRT-PCR using specific primers designed from the 3?UTR region of the viralgenome. The cloned cDNA segment was labeled and used as a probe. Six RNAextraction protocols were evaluated, and the modified cetyltrimethylammoniumbromide (CTAB) method showed the highest sensitivity level. Leaves at differentphenological stages and petioles were evaluated; the highest reaction wasobserved in old leaves and in petioles.Fil: Asinari, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Cafrune, Eva Encarnacion. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Guzman, F. A.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentin

Phytoplasmas diversity and identification of new aster yellows subgroup (16SrI) associated with weed species in Argentina

Symptoms of phytoplasma infection were observed in different weed species, Bidens subalternans, Conyza bonariensis, Heterosperma ovatifolium and Conium maculatum, collected from diverse geographical regions in Argentina. To confirm the association of phytoplasma infection with symptomatic plants, PCR, RFLP and phylogenetic analyses based on 16S rRNA-encoding sequences were performed. In this work, we report the presence of phytoplasmas from group 16SrVII (subgroup 16VII-B) infecting C. bonariensis and B. subalternans and from group 16SrIII (subgroup 16SrIII-X) B. subalternans, H. ovatifolium, and C. maculatum. Phytoplasmas from the aster yellows group were detected infecting C. bonariensis and B. subalternans. Analysis of 16S rRNA-encoding genes revealed the presence of two distinct operons, rrnB (16SrI-B) and newly described rrnA, which is different from the reference RFLP patterns of all previously established 16SrI-subgroups. A single rp operon sequence analysis reveals the presence of simple infection and confirms a description of a novel subgroup. On the basis of these results we propose a designation of new subgroup 16SrI-(B/AJ) AJ (rp-AJ). To our knowledge, this is the first report of phytoplasmas infecting Bidens subalternans¸ Heterosperma ovatifolium and Conium maculatum.Fil: Fernandez, Franco Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Galdeano, Ernestina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentin

Detection and identification of a novel 16SrXIII subgroup phytoplasma associated with strawberry red leaf disease in Argentina

Strawberry red leaf phytoplasma was found in strawberry plants from production fields in Lules (Tucumán province) and Bella Vista (Corrientes province), Argentina. Characteristic strawberry red leaf symptoms were stunting, young leaves with yellowing at the edges, mature leaves which curled and were reddish at the abaxial face, flower and fruit deformation and death. The pathogen was detected with phytoplasma-universal primer pairs P1/P7 followed by R16F2n/R16R2 as nested primers in 13 diseased plants. Based on RFLP and sequence analysis of the amplified 16S rRNA gene, the phytoplasma was related to the 16SrXIII group (Mexican periwinkle virescence). In silico the RFLP profile of all the samples analysed revealed the presence of a unique pattern, showing that the novel phytoplasma is different from all the phytoplasmas currently composing the 16SrXIII group. The phylogenetic analysis was consistent with RFLP analysis as the strawberry red leaf phytoplasma was grouped within the 16SrXIII group, but formed a particular cluster. On this basis, the Strawberry red leaf phytoplasma associated with strawberry red leaf disease was assigned to a new subgroup, 16SrXIII-F.Fil: Fernandez, Franco Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Meneguzzi, Natalia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Guzman, Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Kirschbaum, Daniel Santiago. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; ArgentinaFil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Universidad Católica de Córdoba; Argentin

Draft Genome Sequence of " Candidatus Phytoplasma pruni" (X-Disease Group, Subgroup 16SrIII-B) Strain ChTDIII from Argentina

Herein, we report the draft genome sequence of “Candidatus Phytoplasma pruni” strain ChTDIII (subgroup 16SrIII-B). The final assembly consists of 790,517 nucleotides organized in 67 contigs (minimal size, 1 kb), with a G+C content of 29.4% and encoding 672 proteins.Instituto de Patología VegetalFil: Fernandez, Franco Daniel . Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); Argentina.Fil: Zübert, Christina. University of Hohenheim. Integrative Infection Biology Crops-Livestock; AlemaniaFil: Huettel, Bruno. Max Planck Genome Centre Cologne. Max Planck Institute for Plant Breeding; AlemaniaFil: Kube, Michael. University of Hohenheim. Integrative Infection Biology Crops-Livestock; AlemaniaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); Argentina

Fitoplasma del duraznero Candidatus Phytoplasma pyri

Los fitoplasmas son bacterias carentes de pared celular, de naturaleza parasítica y restringida a dos tipos de hospedantes: plantas e insectos. Se ha mencionado a los fitoplasmas como los responsables de producir enfermedades en más de 1000 especies vegetales, que abarcan cultivos de gran importancia económica (industriales, hortalizas, frutales, cereales), plantas ornamentales y hasta árboles maderables y de sombra, entre otros (Bertaccini et al., 2014). Recientemente en Mendoza, en las zonas Valle de Uco y Este (departamentos de Tunuyán y San Martín), se detectó la presencia de fitoplasmas en plantas de duraznero y se demostró que pertenecen al grupo 16SrX-C “Candidatus Phytoplasma pyri” (Fernández et al., 2017). En el año 2018 se detectó el mismo fitoplasma afectando lotes de perales en la principal área productora del país, en establecimientos comerciales de Alto Valle y Valle Medio de la provincia de Río Negro (Fernández et al., 2019). Tras la confirmación del diagnóstico por parte de INTA, se dio aviso al SENASA. En la actualidad es considerado plaga cuarentenaria bajo control oficial. El Ca. P. pyri ha sido descrito como el agente causal de la enfermedad conocida como Pear Decline (PD) en peral y el Peach Yellow Leaf Roll (PYLR) una variante que afecta duraznero en EEUUEEA JuninFil: Marini, Diana Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Junin; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto De Investigación en Patología Vegetal; Argentin

UM ESTUDO SOBRE A ADPF 709: ENTRE LEGITIMIDADE DEMOCRÁTICA E PARALISIA DECISÓRIA

RESUMOObjetivo: O objetivo do presente artigo é analisar o papel do Supremo Tribunal Federal, no enfrentamento da pandemia, a partir de uma mudança de rumo feita pelo tribunal, que usou do poder de coerção durante praticamente todo o tempo transcorrido até a presente data, mas que, em determinado momento, adotou uma postura menos incisiva, ao usar a técnica dos diálogos institucionais para a solução de elaboração de política pública para comunidades indígenas, na ADPF 709. Analisa-se os resultados de tal viragem no processo decisório e a adequação da medida.Metodologia: Para investigar a utilização da técnica dos diálogos institucionais durante a pandemia da COVID-19, foi, inicialmente, realizado um estudo de caráter exploratório, por meio de levantamentos bibliográficos, documental legal e institucional, em sites oficiais e acervos acadêmicos. Depois, foi conduzido um estudo de caso, que busca a apresentação de alguns dados empíricos sobre uma relação mais complexa e interativa entre formas comuns e alternativas para o exercício da jurisdição constitucional. A grande vantagem desta metodologia é que, da mesma forma que os experimentos, estudos de casos são generalizáveis a proposições teóricas. Nesse sentido, o estudo de caso, como o experimento, não representa uma “amostragem”, e seu objetivo é expandir e generalizar teorias (generalização analítica) e não enumerar frequências (generalização estatística)(YIN, 2001, p. 54). Busca-se fazer uma análise “generalizante” e não “particularizante”, a fim de contestar em que medida a  técnica é reconhecida pelo STF. Ainda que seja um caso detentor de significado próprio, será preciso observar, em outros casos futuros, o desdobramento desse precedente.Resultados: Conclui-se que a utilização da técnica dos diálogos institucionais deve ser reconhecida como um esforço importante para o reforço da legitimidade da jurisdição constitucional brasileira. Todavia, ao explorar os seus limites, percebe-se que, para o enfrentamento da pandemia da COVID-19, seus resultados são insatisfatórios, pois lentos e ineficientes, além de demonstrar o pouco interesse dos agentes governamentais em buscar uma solução consensuada para a elaboração de política pública que demanda urgência. Neste sentido, é o caso de se usar o poder coercitivo para a proteção dos direitos fundamentais de tais comunidades indígenas.Contribuições: Entende-se que estudar a dinâmica da jurisdição constitucional, seu funcionamento, exige trabalhar com situações de crise, também. Nestes casos, o recurso a um mecanismo como a técnica dos diálogos institucionais se mostrou ineficiente e precisa ser repensada a possibilidade de sua utilização novamente, especialmente em situações como a que se discute, pois, dentre os seus limites, deve ser tida a indisponibilidade dos atores ao diálogo como ponto central para o recurso a ela e a urgência na construção de determinada decisão judicial.Palavras-chaves: Pandemia; Covid 19; Diálogos Institucionais; Jurisdição Constitucional. ABSTRACTObjective: The present article aims to critically analyze the role of the Supreme Federal Court, in facing the pandemic, from a change of course made by the court, which used the power of coercion during practically all the time elapsed until the present date, but, at a certain moment, adopted a less incisive stance, when using the technique of institutional dialogues for the solution of public policy development for indigenous communities, in ADPF 709. We analyze the results of such a turning point in the decision-making process and its result.Methodology: To investigate the use of the institutional dialogues technique during the COVID-19 pandemic, an exploratory study was initially carried out, through bibliographic, legal and institutional documentary surveys, on official websites and academic collections. Then, a case study was conducted, which seeks to present some empirical data on a more complex and interactive relationship between common and alternative forms for the exercise of constitutional jurisdiction. The great advantage of this methodology is that, like the experiments, case studies are generalizable to theoretical propositions. In this sense, the case study, like the experiment, does not represent “sampling”, and its objective is to expand and generalize theories (analytical generalization) and not to enumerate frequencies (statistical generalization) (YIN, 2001, p. 54). An attempt is made to perform a “generalizing” and not “particularizing” analysis, in order to challenge the extent to which the technique is recognized by the STF. Even if it is a case with its own significance, it will be necessary to observe, in other future cases, the unfolding of this precedent.Results: It is concluded that the use of the technique of institutional dialogues should be recognized as an important effort to reinforce the legitimacy of the Brazilian judicial review. However, when exploring its limits, it is clear that, to face the COVID-19 pandemic, its results are unsatisfactory, as they are slow and inefficient, in addition to demonstrating the little interest of government agents in seeking a consensual solution for the elaboration of a public policy that demands urgency. In this sense, it is the case of using coercive power to protect the fundamental rights of such indigenous communities.Contributions: It is well known that studying the dynamics of judicial review, its functioning, requires working with crisis situations, too. In these cases, the use of a mechanism such as the technique of institutional dialogues proved to be inefficient and the possibility of using it again in a similar situation needs to be reconsidered, especially in moments such as the ones discussed, because, within its limits, the availability of actors to the dialogue is as central point for the recourse to it and the urgency in the construction of a determined judicial decision must be analised by the court.Keywords: Pandemic; Covid 19; Institutional Dialogues; Judicial Review

O “CABO DE GUERRA” DA REGULAMENTAÇÃO DO NOVO FUNDEB

In 2020, the right to education was the subject of an important agenda in the Congress: the approval of “New Fundeb” (EC. 108/2020) and its regulamentation. This article aims to discuss, from the perspective of law and public policies, based on a descriptive analysis, the process of approval of the constitutional amendment to the Brazilian Constitution, comparing the processes of transition of the funds, as well as the analysis of the movement of politicians and those involved in the construction of the “New Fundeb” regulation text, demonstrating the government and parliamentary expedients of political movement in the legislative process, the expedients used both for the approval of Amendments to the Constitution, as well as for its regulation, in order to understand the role of political agents and the strategies used to realize the right to education.No ano de 2020, o direito à educação foi alvo de uma importante pauta no Congresso Nacional: a aprovação do Novo Fundeb (EC. 108/2020) e a sua regulamentação. Este artigo tem por objetivo discutir, a partir da abordagem de direito e políticas públicas, calcado em uma análise descritiva, o processo de aprovação da emenda constitucional, comparando os processos de transição dos fundos. Far-se-á a análise da movimentação dos atores políticos e interesses envolvidos na construção do texto de regulamentação do Novo Fundeb demonstrando os expedientes governamentais e parlamentares de movimentação política no processo legislativo, utilizados tanto para aprovação de Emendas á Constituição quanto para a sua regulamentação, de modo a compreender o papel dos agentes políticos e as estratégias utilizadas para concretização do direito à educação

La "tristeza" del ajo : una enfermedad causada por fitoplasmas

Es frecuente que en los cultivos de ajo aparezcan plantas aisladas que cambian el color de sus hojas y luego mueran. Pueden morir cuando son jóvenes durante el otoño, o cuando son adultas durante la primavera. Si esto ocurre podríamos estar ante la presencia de una enfermedad caudada por un fitoplasma trasmitido por algunos insectos, por lo general los llamados “chicharritas”.EEA La ConsultaFil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; ArgentinaFil: Lanzavechia, Silvina Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; ArgentinaFil: Ocañas, Ramon Orlando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria La Consulta; Argentin

‘Ca. Phytoplasma pruni’ and ‘Ca. Phytoplasma meliae’ are affecting plum in Argentina

We report for the first time the presence of phytoplasmas in association with Plum (Prunus domestica) yellowing in Argentina. Molecular analysis of 16S rDNA gene sequence (RFLP, phylogeny) reveals the existence of two different 16Sr-subgroups, 16SrIII-B and novel 16SrXIII-L. These results contribute to a better understanding of the diversity of phytoplasmas associated with Prunus genera in South America.Instituto de Patología VegetalFil: Bongiorno, Vanina Aylén. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Bongiorno, Vanina Aylén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Alessio, Florencia Ivette. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Alessio, Florencia Ivette. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Curzel, Viviana Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Salta. Agencia De Extensión Rural Perico; ArgentinaFil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina.Fil: Nome Docampo, Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel . Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Fernandez, Franco Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); Argentina.Fil: Conci, Luis Rogelio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Conci, Luis Rogelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas.Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola (UFYMA); Argentina