Investigação de coliformes totais e Escherichia coli em água de consumo da comunidade Lago do limão, Município de Iranduba – AM/ Investigation of total coliforms and Escherichia coli in drinking water of the Lago do Limão community, Municipality of Iranduba - AM

A água é indispensável à vida, contudo é necessário que seja potável. Um dos parâmetros microbiológicos importantes no padrão de potabilidade é a ausência de contaminação por bactérias do grupo coliforme, que assume relevância como indicador da existência de microrganismos responsáveis pela transmissão de doenças de veiculação hídrica. Surtos dessas doenças são observados com frequência tanto no cenário urbano quanto rural, devido principalmente à contaminação da água de consumo. Esse problema pode ser reduzido, desde que a população tenha acesso à água potável e informações sobre os cuidados necessários.   Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi verificar o padrão bacteriológico da água de consumo da comunidade do Lago do Limão – Iranduba/AM. Foi utilizado o método quali-quantitativo Colilert® (IDEXX laboratories, EUA) para detecção de coliformes totais e Escherichia coli na água. Foram aplicados questionários com perguntas relacionadas ao saneamento básico e tratamento da água consumida. As coletas foram realizadas em 2015, totalizando 209 amostras advindas de domicílios e reservatórios comunitários, sendo 107 do primeiro semestre e 102 do segundo. No primeiro semestre 87% das amostras foram positivas para coliformes totais, 30% positivas para Escherichia coli. No segundo semestre, 71% apresentaram positividade para coliformes totais e 19% para Escherichia coli. O intervalo de quantificação predominante em ambos os semestres foi de 0 a 200 NMP/100mL para coliformes totais e 0 a 50 NMP/100mL para Escherichia coli. O motivo dessa elevada contaminação pode está relacionado ao perfil de saneamento básico, onde 88% dos domicílios havia coleta do lixo pela prefeitura, 82% possuía vaso sanitário ligado à fossa séptica e 65% dispunham de água encanada dentro de casa. De acordo com o depoimento a respeito do tratamento da agua destinada para o consumo, observou-se que no primeiro semestre apenas 46% dos moradores afirmaram realizar algum tipo de tratamento, já no segundo semestre esse percentual caiu para 39%. O Hipoclorito de sódio foi o tipo de tratamento predominante em ambos os períodos. As consequências pela falta de saneamento básico, infraestrutura,  instalações operacionais de abastecimento de água, esgotamento sanitário, limpeza e drenagem urbana, manejos de resíduos sólidos e de águas pluviais, trazem riscos à saúde da população, ficando vulneráveis às doenças com maiores incidências devido à exposição a esses ambientes. Foi perceptível que ainda há falta de informação por parte de muitos comunitários, porém diante do alerta sobre as causas consequentes e das medidas corretivas propostas, a população em estudo demonstrou-se disposta à mudança de hábitos

Perfil de virulência dos Staphylococcus spp. provenientes da orofaringe e da água de consumo da Comunidade Lago do Limão/Iranduba – AM / Virulence profile of Staphylococcus spp. from the oropharynx and drinking water samples in the community Lago do Limão in Iranduba – Amazonas, Brazil

As populações que habitam em áreas rurais sofrem com a falta de saneamento e precariedade no abastecimento de água. A proposta do trabalho foi de estudar os aspectos saúde-ambiente, com ênfase em Staphylococcus spp. isolados da água de consumo e de amostras da orofaringe da Comunidade lago do Limão. As cepas foram submetidas ao teste de susceptibilidade antimicrobiana pelo método disco difusão e, detecção de genes de virulência que codificam a produção de biofilme, enterotoxinas e resistência à oxacilina. Foram encontradas 26 cepas de Staphylococcus spp., 15 da água de consumo e 11 das amostras de orofaringe. No teste antimicrobiano, as cepas isoladas da água foram resistentes à ampicilina, azitromicina e eritromicina, e as cepas da orofaringe mostraram resistência à clindamicina e gentamicina. Dentre os genes analisados, o gene IcaD, ETa e IcaA foram encontrados nas cepas isoladas. As cepas de Staphylococcus aureus mostraram similaridade nas cepas de S. aureus presentes na água e na orofaringe, tanto para a resistência ao antibiótico quanto na presença dos genes de virulência. Com esses dados, foi possível detectar genes de virulência entre as cepas isoladas, tanto da água de consumo da comunidade quanto da secreção da orofaringe desses moradores. Palavras-chaves: amostras ambientais, resistência antimicrobiana, Staphylococcus aureus, Técnica de PCR. ABSTRACTPopulations living in rural areas are subject to poor sanitation and poor water supply. The purpose of the work was to study the health-environment aspects, with an emphasis on Staphylococcus spp. isolated from drinking water and samples from the oropharynx of the Lago do Limão Community. The strains were subjected to the antimicrobial susceptibility test by the disc diffusion method and, detection of virulence genes that encode the production of biofilm, enterotoxins and oxacillin resistance. 26 strains of Staphylococcus spp. were isolated,  being 15 in the drinking water samples and 11 in the oropharynx samples. . In the antimicrobial test, strains isolated from water were resistant to ampicillin, azithromycin and erythromycin, and the strains isolated from oropharynx were resistant to clindamycin and gentamycin. Among the analyzed genes, the IcaD, ETa and IcaA genes were found in the isolated strains. The strains of Staphylococcus aureus showed similarity in the strains of S. aureus present in the water and in the oropharynx, both for antibiotic resistance and in the presence of virulence genes. With these results, it was possible to detect virulence genes among strains isolated, both from community drinking water and oropharyngeal secretion from these residents. 

Tipagem molecular de Neisseria meningitidis e investigação da doença meningocócica no Amazonas, 2000 A 2010

Submitted by Gilvan Almeida ([email protected]) on 2017-01-10T13:40:57Z No. of bitstreams: 1 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)Approved for entry into archive by Anderson Silva ([email protected]) on 2017-05-04T15:42:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 luciete_silva_ioc_dout_2016.pdf: 2984696 bytes, checksum: c07c017f839d1c6218820246d39b8ac5 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)Made available in DSpace on 2017-05-04T15:42:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 luciete_silva_ioc_dout_2016.pdf: 2984696 bytes, checksum: c07c017f839d1c6218820246d39b8ac5 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2016Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, BrasilNeisseria meningitidis, uma bactéria capsulada, é o agente etiológico da doença meningocócica, a qual é reconhecida como uma das principais emergências médicas. Há uma carência de estudos epidemiológicos sobre a doença meningocócica (DM) no Amazonas, o que a torna uma doença negligenciada pela sua importância no diagnóstico diferencial das febres hemorrágicas. Este trabalho teve como objetivo analisar o padrão da doença meningocócica no Estado do Amazonas entre 2000 e 2010, num período que antecede a introdução no programa nacional de imunização infantil da vacina conjugada contra o sorogrupo C no ano de 2010. O estudo inclui a análise dos casos notificados e a tipagem genética dos isolados clínicos pela técnica de Multilocus Sequence Typing (MLST) e o sequenciamento de três genes codificadores de proteínas da membrana externa, além do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos. Os resultados mostraram que no período do estudo, 948 casos de DM foram notificados por 58 dos 62 municípios do estado, com uma maior concentração em Manaus (81%; 769/948). Houve uma mudança no perfil epidemiológico com o aumento dos casos de doença pelo sorogrupo C a partir de 2007 (2007-2010 = 68%), associado a um maior número de casos acima de 10 anos de idade e alta letalidade (2007-2010 = 25%) O deslocamento dos casos clínicos para indivíduos acima de 10 anos tem implicação para a atual estratégia de imunização apenas para crianças com menos de 2 anos. A genotipagem revelou uma população de N. meningitidis bastante diversa, prevalecendo o ST-5996 (complexo clonal [cc]32) do sorogrupo B (43%) e o ST-11401 (cc103) do sorogrupo C (61%), o qual é um novo ST identificado neste estudo. Mudança de cápsula de B para C foi identificado dentre as cepas do cc32: ST-639 e ST-5996. A resistência aos principais antibióticos de importância clínica foi um evento raro entre as bactérias estudadas. Com esses resultados espera-se contribuir para melhoria das medidas de controle e na avaliação futura do impacto da introdução da vacina conjugada na epidemiologia da doença meningocócica no AmazonasNeisseria meningitidis, a capsulated bacterium, is the causative agent of meningococcal disease, which is recognized as major medical emergencies. There is a lack of epidemiological studies on meningococcal disease (MD) in the Amazon, which makes it a disease neglected by its importance in the differential diagnosis of hemorrhagic fevers. This study aimed to analyze the pattern of meningococcal disease in the state of Amazonas between 2000 and 2010, a period before the introduction in the national childhood immunization program of the serogroup C conjugate vaccine in 2010. The study includes the analysis of reported cases and genetic typing of clinical isolates by Multilocus Sequence Typing technique (MLST) and sequencing of genes encoding three outer membrane proteins, in addition to the antimicrobial susceptibility profile. During the study period, 948 cases of MD were reported by 58 of the 62 municipalities in the state, with a higher concentration in Manaus (81%; 769/948). There was a change in the epidemiological profile with the increase in cases of disease caused by serogroup C from 2007 (2007-2010 = 68%), associated with an increased number of cases above 10 years of age and high case fatality rate (2007-2010 = 25%) The displacement of clinical cases for individuals above 10 years has implications for the current strategy for immunization only for children under 2 years. Genotyping revealed a diverse population of N. meningitidis, prevailing ST-5996 (clonal complex [cc] 32) of serogroup B (43%) and ST-11401 (cc103) of serogroup C (61%), which is a new ST identified in this study. Capsular switching from B to C was identified among strains of cc32: ST-639 and ST-5996. Resistance to antibiotics of clinical significance was a rare event among the studied bacteria. These results are expected to contribute to improved control measures and the future impact assessment of the introduction of the conjugate vaccine in the epidemiology of meningococcal disease in the Amazo

Seroprevalence of and risk factors for leptospirosis in the City of Manaus, State of Amazonas, Brazil

Abstract INTRODUCTION Leptospirosis is caused by a bacterium of the genus Leptospira. This study aimed at investigating the seroprevalence of and risk factors for leptospirosis in humans in Manaus, State of Amazonas. METHODS Interviews were performed, and 1,000 blood serum samples were examined using a microscopic agglutination test. RESULTS Forty-three cases were positive; there were 10 serotypes, with coagglutination in 8 cases. The most frequently occurring serotypes were Icterohaemorrhagiae (20.7%), Cynopteri (20.7%), Australis (18.8%), and Copenhageni (16.9%), and the Midwest (54.7%) and South (23.8%) had the most cases; these areas lack basic sanitation. CONCLUSIONS Disease occurrence might be reduced through improved basic infrastructural conditions

Outbreaks of cholera-like diarrhoea caused by enterotoxigenic escherichia coli in the Brazilian Amazon rainforest.

The relationship between enteropathogens and severe diarrhoea in the Brazilian Amazon is poorly understood. In 1998, outbreaks of acute diarrhoea clinically diagnosed as cholera occurred in two small villages localized far from the main cholera route in the Brazilian rainforest. PCR was performed on some enteropathogens and heat-labile (LT) and/or heat-stable (STh) toxin genes, the virulence determinants of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC), were detected. Further characterization of ETEC isolates revealed the presence of two clones, one from each outbreak. One presenting serotype O167:H5 harboured LT-I and STh toxin genes and expressed the CS5CS6 colonization factor. The other, a non-typeable serotype, was positive for the LT-I gene and expressed the CS7 colonization factor. The current study demonstrates the importance of molecular diagnosis in regions such as the Amazon basin, where the enormous distances and local support conditions make standard laboratory diagnosis difficult. Here we also show that the mis-identified cholera cases were in fact associated with ETEC strains. This is the first report of ETEC, molecularly characterized as the aetiological agent of severe diarrhoea in children and adults in the Brazilian Amazon Rainforest. © 2005 Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved