Extraction and characterization of chitin and chitosan from crustacean by-products: Biological and physicochemical properties

Chitin has been extracted from two Tunisian crustacean species. The obtained chitin was transformed into the more useful soluble chitosan. These products were characterized by their biological activity as antimicrobial and antifungal properties. The tested bacterial strains were Escherichia coli American Type Cell Culture (ATCC) 25922, Pseudomonas aeruginosa ATCC 27950 and Staphylococcus aureus ATCC 25923. Four fungi strains were also tested Candida glabrata, Candida albicans, Candidaparapsilensis and Candida kreusei. Squilla chitosan showed a minimum inhibitory concentration (MIC) against the different fungi exceptionally for C. kreusei. Their antioxidant activity was investigated with 2,2-diphenyl-1-picrylhydrazyl (DPPH) radical scavenging activity and inhibition of linoleic acid peroxidation. Parapenaeus longirostris Chitosan showed the highest radical scavenging properties. Chitin and chitosan produced were also characterized with Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR).Key words: Antibacterial, antifungal, antioxidant, chitin, chitosan, crustacean

Identification et localisation des impacts par analyse inverse - Poutre et plaque

L’estimation des forces d’impact par des mesures directes, pour des structures qui sont dans des conditions réelles d’utilisation, est en pratique très difficile voire même impossible. Pour répondre à ce besoin il est souvent fait recours aux méthodes inverses, qui correspondent à la démarche inverse du problème direct : des réponses mesurées sur une structure donnée sont exploitées pour tenter d’en identifier les causes, qui en sont à l’origine. L'approche conduit à créer des fonctions de transfert entre les points d'impact et de mesure sur la structure que ce soit expérimentalement ou numériquement, à mesurer les réponses, et à reconstruire l’effort par déconvolution du signal. Il est connu que ce type de problème est souvent mal posé, et que les solutions trouvées peuvent ne pas être représentatives du problème réel, du fait de bruits de mesures. Pour obtenir une solution stable avec un sens physique, nous utilisons l’une des méthodes classiques de régularisation, tels que Tikhonov qui semble la plus appropriée. Le problème de caractérisation de l'impact devient plus complexe lorsque le point d’impact est inconnu, par conséquent, nous devons créer les fonctions de transfert entre plusieurs points d'impact et de mesure, et minimiser la fonctionnelle permettant dans un premier temps de localiser l’impact, et dans un second temps d’identifier la force d’impact

Partitioning clustering algorithms for protein sequence data sets

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Genome-sequencing projects are currently producing an enormous amount of new sequences and cause the rapid increasing of protein sequence databases. The unsupervised classification of these data into functional groups or families, clustering, has become one of the principal research objectives in structural and functional genomics. Computer programs to automatically and accurately classify sequences into families become a necessity. A significant number of methods have addressed the clustering of protein sequences and most of them can be categorized in three major groups: hierarchical, graph-based and partitioning methods. Among the various sequence clustering methods in literature, hierarchical and graph-based approaches have been widely used. Although partitioning clustering techniques are extremely used in other fields, few applications have been found in the field of protein sequence clustering. It is not fully demonstrated if partitioning methods can be applied to protein sequence data and if these methods can be efficient compared to the published clustering methods.</p> <p>Methods</p> <p>We developed four partitioning clustering approaches using Smith-Waterman local-alignment algorithm to determine pair-wise similarities of sequences. Four different sets of protein sequences were used as evaluation data sets for the proposed methods.</p> <p>Results</p> <p>We show that these methods outperform several other published clustering methods in terms of correctly predicting a classifier and especially in terms of the correctness of the provided prediction. The software is available to academic users from the authors upon request.</p

Identification et localisation des impacts par analyse inverse - Poutre et plaque

Colloque avec actes et comité de lecture. Internationale.International audienceL’estimation des forces d’impact par des mesures directes, pour des structures qui sont dans des conditions réelles d’utilisation, est en pratique très difficile voire même impossible. Pour répondre à ce besoin il est souvent fait recours aux méthodes inverses, qui correspondent à la démarche inverse du problème direct : des réponses mesurées sur une structure donnée sont exploitées pour tenter d’en identifier les causes, qui en sont à l’origine. L'approche conduit à créer des fonctions de transfert entre les points d'impact et de mesure sur la structure que ce soit expérimentalement ou numériquement, à mesurer les réponses, et à reconstruire l’effort par déconvolution du signal. Il est connu que ce type de problème est souvent mal posé, et que les solutions trouvées peuvent ne pas être représentatives du problème réel, du fait de bruits de mesures. Pour obtenir une solution stable avec un sens physique, nous utilisons l’une des méthodes classiques de régularisation, tels que Tikhonov qui semble la plus appropriée. Le problème de caractérisation de l'impact devient plus complexe lorsque le point d’impact est inconnu, par conséquent, nous devons créer les fonctions de transfert entre plusieurs points d'impact et de mesure, et minimiser la fonctionnelle permettant dans un premier temps de localiser l’impact, et dans un second temps d’identifier la force d’impact

Parametric study of the earth dam's behaviour subjected to earthquake

Static stability of an earth dam can be established by estimating the static safety factor equal to the ratio of the shear strength to the shear stress along a critical sliding area. In contrast, it is more complicated to evaluate the dynamic stability during an earthquake. The water filling the interstices of the earth dams cannot drain during the short duration of an earthquake. An excess pore water pressure ΔU develops, and its role is predominant in the destabilisation of the dam. The pore water increase causes a decrease in the soil shear strength. It is, therefore, crucial to evaluate and take into consideration ΔU in the dam dynamic stability analysis. This research is a contribution to reach this objective. A parametric study was conducted by varying the physical and mechanical soil characteristics constituting the dam, as well as its geometrical values, in order to evaluate their effects on the dynamic safety factor. The dynamic safety factor is calculated using the pseudo-static method, taking into account the excess pore water pressure that develops during cyclic loading into the granular soil of the earth dam upstream face. The results of the parametrical analytical study were also compared to the results of numerical simulations of the dam seismic stability trough pseudo-static method. The numerical simulations were done with three different software: PLAXIS and ABAQUS (based on the finite element method) and GEOSTAB (deals with the problem at the limit equilibrium using the simplified Bishop method). At the end, on one hand, we were able to describe how and at what level of the dam upstream face the sliding occurs, and on the other hand, we were able to underline the adequate combination between the dam geometric parameters and the mechanical soil characteristics which may ensure seismic stability

Identification et localisation des impacts par analyse inverse - Poutre et plaque

Colloque avec actes et comité de lecture. Internationale.International audienceL’estimation des forces d’impact par des mesures directes, pour des structures qui sont dans des conditions réelles d’utilisation, est en pratique très difficile voire même impossible. Pour répondre à ce besoin il est souvent fait recours aux méthodes inverses, qui correspondent à la démarche inverse du problème direct : des réponses mesurées sur une structure donnée sont exploitées pour tenter d’en identifier les causes, qui en sont à l’origine. L'approche conduit à créer des fonctions de transfert entre les points d'impact et de mesure sur la structure que ce soit expérimentalement ou numériquement, à mesurer les réponses, et à reconstruire l’effort par déconvolution du signal. Il est connu que ce type de problème est souvent mal posé, et que les solutions trouvées peuvent ne pas être représentatives du problème réel, du fait de bruits de mesures. Pour obtenir une solution stable avec un sens physique, nous utilisons l’une des méthodes classiques de régularisation, tels que Tikhonov qui semble la plus appropriée. Le problème de caractérisation de l'impact devient plus complexe lorsque le point d’impact est inconnu, par conséquent, nous devons créer les fonctions de transfert entre plusieurs points d'impact et de mesure, et minimiser la fonctionnelle permettant dans un premier temps de localiser l’impact, et dans un second temps d’identifier la force d’impact

Buckling behavior of metallic cylindrical shell structures strengthened with CFRP composite

The objective of this study is to evaluate the effect of a CFRP composite layer on the buckling behavior of metallic cylindrical shells. To enhance the bearing capacity of steel shells, classical solutions consider internal or external metallic stiffeners (stringers and/or rings) welded or riveted to the shell. Here, an external skin of composite material which wraps the whole metallic skin of the shell is studied. To be valid for metallic shells structures (storage tanks like silos) as well as for metal pipes (gas or oil pipeline), the procedure for setting up and implementing the composite must be simple. The recommended solution is therefore tested through experimental tests to find their limits and the configuration of optimal behavior. A consistent enhancement of bearing capacity is observed. This experimental base serves also to consolidate a numerical model which corroborates the experimental results. The good correlation between experimental and numerical results is confirmed for the whole loading process, for unstiffened and stiffened shells. For metallic unstiffened shell, an adequacy between experiment and simulation is noticed in the mainly membrane precritical behavior, during the buckling initiation characterized by the boundary layer problem corresponding to axisymmetric wavelength appearance near boundaries and in the postcritical domain associated to localization of the buckling mode at one extremity of the shell. For stiffened configuration, the enhancement of the bearing capacity of the shell is correctly gauged; this confirms the possibility to use finite element simulation for the design

Buckling Behavior of Metallic Cylindrical Shell Structures Strengthened with CFRP Composite

International audienceThe objective of this study is to evaluate the effect of a CFRP composite layer on the buckling behavior of metallic cylindrical shells. To enhance the bearing capacity of steel shells, classical solutions consider internal or external metallic stiffeners (stringers and/or rings) welded or riveted to the shell. Here, an external skin of composite material which wraps the whole metallic skin of the shell is studied. To be valid for metallic shells structures (storage tanks like silos) as well as for metal pipes (gas or oil pipeline), the procedure for setting up and implementing the composite must be simple. The recommended solution is therefore tested through experimental tests to find their limits and the configuration of optimal behavior. A consistent enhancement of bearing capacity is observed. This experimental base serves also to consolidate a numerical model which corroborates the experimental results. The good correlation between experimental and numerical results is confirmed for the whole loading process, for unstiffened and stiffened shells. For metallic unstiffened shell, an adequacy between experiment and simulation is noticed in the mainly membrane precritical behavior, during the buckling initiation characterized by the boundary layer problem corresponding to axisymmetric wavelength appearance near boundaries and in the postcritical domain associated to localization of the buckling mode at one extremity of the shell. For stiffened configuration, the enhancement of the bearing capacity of the shell is correctly gauged; this confirms the possibility to use finite element simulation for the design

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