Phosphorus-nitrogen compounds. Part 48. syntheses of the phosphazenium salts containing 2-pyridyl pendant arm: structural characterizations, thermal analysis, antimicrobial and cytotoxic activity studies

533-550The phosphazenium salts (protic ionic liquids, PILs/protic molten salts, PMOSs) (6a-6d and 7a) of the free phosphazene bases (4a-4d and 5a) have been prepared by the reactions of the corresponding cyclotriphosphazenes with the bulky gentisic acid. The structures of the PMOS have been evaluated using the elemental analyses, FTIR, 1H, 13C{1H} and 31P{1H} NMR data. The molecular and crystal structures of 4a and 6c are established by X-ray crystallography. The thermal properties of the PMOS are determined using TG and DTA techniques. On the other hand, the antimicrobial activities of the free phosphazene bases (4a-4d and 5a-5d) and PMOSs (6a-6d and 7a) are screened against the selected bacteria and yeast strains. The antimicrobial activities of the free phosphazene bases and the PMOSs are compared. The interactions of the phosphazenes and their salts with plasmid DNA are elucidated by the agarose gel electrophoresis. The evaluations of the cytotoxic activities of these compounds are also studied against to L929 fibroblast and breast cancer cells (MDA-MB-231)

Biological activities and DNA interactions of aqueous extract of Phlomis linearis (Boiss. & Bal.)

Phlomis linearis Boiss. & Bal. of the Lamiaceae family is one of the endemic species in Turkey, i.e., growing in the east, central, and southeast parts of Anatolia and used for herbal tea. This study was designed to identify the biochemical and bioactivity properties of this endemic species by DPPH scavenging activity, metal chelating activity, total phenolic content, HPLC-DAD analysis, and MTT assay. Furthermore, the plant extract was evaluated for its antimicrobial activity against bacteria and fungi by using the microdilution method. The interactions between extract and plasmid DNA and their restriction endonuclease reactions were investigated by agarose gel electrophoresis. To support our hypothesis, we performed a molecular docking analysis. The DPPH scavenging activity of the plant extract was 53.86 ± 0.50 µg/ml in terms of IC50 value. The IC50 value of the plant extract was determined as 14.71 ± 4.01 mg/ml for metal chelating assay. The phenolic content of the extract was 231.55 ± 2.11 mg/g dry weight expressed as gallic acid equivalents (GAE). HPLC-DAD results revealed that the phenolic compounds were mainly derivatives of rosmarinic acid, chlorogenic acid, luteolin, luteolin-7-glycoside, luteolin derivatives, rutin derivatives, and apigenin derivatives. Besides, the cytotoxic activity of the plant extract against L929 fibroblast, H1299 non-small-cell lung carcinoma, and Caco-2 colorectal adenocarcinoma cell lines was determined by MTT assay. Phenolic content and molecular docking results correlated with each other

Subklinik inek mastitislerinden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının protein paterni, antibiyotik direnci ve plazmid profili yönünden karakterizasyonu

Hatay bölgesindeki subklinik inek mastitislerinden izole edilen toplam 50 Staphylococcus aureus susunun protein paterni, antibiyotik dirençliliği ve plazmid profili yönünden karakterizasyonu yapıldı. S. aureus suşlarının SDS-PAGE ile analizinde moleküler ağırlığı 116 kDa arasında değişen 17-49 bant elde edildi. Elektroforetik protein bantlarının bilgisayar destekli numerikal analizi sonucunda S. aureus suşları 2 gruba ayrıldı. S. aureus suşları trimethoprim-sülfametoksazol, danofloksasin, amoksisilin-klavulanik asit, sulbaktam-ampisilin, eritromisin, linkomisin, sefoperazon, oksitetrasiklin, amoksisilin, streptomisin ve penisilin'e sırasıyla % 4, % 4, % 10, % 14, % 30, % 34, % 36, % 38, % 50, % 54 ve % 68 oranlarında dirençli bulundu. İncelenen izolatların 47'sinde, büyüklüğü 1.7->24 kb arasında değişen plazmidler saptandı.A total of 50 Staphylococcus aureus strains isolated from bovine subclinical mastitis in Hatay region were characterized by protein patterns, antibiotic resistance and plasmid profiles. SDS-PAGE analysis of whole-cell protein extracts belong to S. aureus strains produced patterns containing 17-49" discrete bands with molecular weights of >14.4-<116 kDa. S. aureus strains clustered into two cluster on the basis of a computer-assisted numerical analysis. The resistance rates of 50 of 5". aureus strains to trimethoprim-sulphamethoxazole, danoflqxacin, amoxicillin-clavulanic, sulbactam-ampicillin, erythromycin, lincomycin, cefoperazone, oxytetracycline, amoxicillin, streptomycin and penicillin were 4 %, 4 %, 10 %, 14 %, 30 %, 34 %, 36 %, 38 %, 50 %, 54 % and 68 %, respectively. Plasmid profiling demonstrated that 47 of the 50 S. aureus strains contained plasmid ranging from 1.7 to >24 kb

Bupleurum lycaonicum snogerup bitki türünün DNA üzerine etkisi

Ulusal Biyolojik Bilimler Kongresi (1. : 2021)Özet Amaç Apiaceae familyası üyeleri, dünyada ekonomik öneme sahip bitki gruplarındandır. Bu çalışmada, Apiaceae familyasına ait çiçekli endemik bitki türü olan Bupleurum lycaonicum, bitki özütlerinin DNA üzerine etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Bitki türlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme mekanizması, etkili antitümör ilaç tasarlanmasında önemlidir. Bu tür ilaçların başarısı, DNA’ya olan ilgilerine ve bağlanma şekillerine göre belirlenir. Gereç-Yöntem Amacı gerçekleştirmek üzere, bitkinin metanol ve etanol özütleri çıkarılmıştır. Çıkarılan bu özütler, DMSO içerisinde 100 mg/mL konsantrasyonda çözülerek hazırlanmış ve özütlerin pBR322 plazmid DNA üzerinde etkisi, agaroz jel elektroforez yöntemi ile araştırılmıştır. Bu yöntemle, yüksek konsantrasyondan düşük konsantrasyona seyreltilerek hazırlanan bu özütler, pBR322 plazmid DNA ile 37°C’de 24, 48 ve 72 saat inkübe edilmiştir. Kontrol olarak özütler ile muamele edilmemiş pBR322 plazmid DNA’sı jeldeki birinci kuyucuğa konularak karşılaştırma yapılmıştır. Bulgular DNA-özüt karışımı, %1’lik agaroz jel elektroforezinde yürütülerek ultraviyole ışık altında fotoğrafları çekilmiştir. Böylece bitki özütlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme aktivitesine bakılmıştır. Özütlerin DNA üzerinde hangi nükleotitlere bağlandığı restriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesilerek belirlenmiştir. Elde edilen bulgular, bitki özütleriyle etkileşime girmiş DNA’nın, BamHI ve HindIII enzimleriyle inkübasyona bırakıldıktan sonra enzimlerin DNA’yı kesmediğini göstermiştir. Bu da, özütlerin DNA’sında Adenin-Adenin’in Guanin-Guanin’e bağlandığını gösterir. Bu bağlanma olduğu için enzimler DNA’yı kesememiştir. Sonuç-Öneri Elektroforez sonucu, plazmid DNA’nın üç farklı biçimi (Form I, Form II, Form III) ve bu formların jeldeki göç sırası gözlenmiştir. Elde edilen bulgular sonucunda da, bu bitkinin DNA ile etkileşime girme yeteneği potansiyel bir antikanser ajan olabileceği ihtimalini göstermektedir. Bu sebeple yapılacak ileri çalışmalarda da bu bitkinin çeşitli kanser hücre hatlarında sitotoksik etkilerinin araştırılması önerilmektedir.No sponso

Bupleurum lycaonicum snogerup bitki türünün DNA üzerine etkisi

Ulusal Biyolojik Bilimler Kongresi (1. : 2021)Özet Amaç Apiaceae familyası üyeleri, dünyada ekonomik öneme sahip bitki gruplarındandır. Bu çalışmada, Apiaceae familyasına ait çiçekli endemik bitki türü olan Bupleurum lycaonicum, bitki özütlerinin DNA üzerine etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Bitki türlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme mekanizması, etkili antitümör ilaç tasarlanmasında önemlidir. Bu tür ilaçların başarısı, DNA’ya olan ilgilerine ve bağlanma şekillerine göre belirlenir. Gereç-Yöntem Amacı gerçekleştirmek üzere, bitkinin metanol ve etanol özütleri çıkarılmıştır. Çıkarılan bu özütler, DMSO içerisinde 100 mg/mL konsantrasyonda çözülerek hazırlanmış ve özütlerin pBR322 plazmid DNA üzerinde etkisi, agaroz jel elektroforez yöntemi ile araştırılmıştır. Bu yöntemle, yüksek konsantrasyondan düşük konsantrasyona seyreltilerek hazırlanan bu özütler, pBR322 plazmid DNA ile 37°C’de 24, 48 ve 72 saat inkübe edilmiştir. Kontrol olarak özütler ile muamele edilmemiş pBR322 plazmid DNA’sı jeldeki birinci kuyucuğa konularak karşılaştırma yapılmıştır. Bulgular DNA-özüt karışımı, %1’lik agaroz jel elektroforezinde yürütülerek ultraviyole ışık altında fotoğrafları çekilmiştir. Böylece bitki özütlerinin DNA’ya bağlanma ve kesme aktivitesine bakılmıştır. Özütlerin DNA üzerinde hangi nükleotitlere bağlandığı restriksiyon endonükleaz enzimleri ile kesilerek belirlenmiştir. Elde edilen bulgular, bitki özütleriyle etkileşime girmiş DNA’nın, BamHI ve HindIII enzimleriyle inkübasyona bırakıldıktan sonra enzimlerin DNA’yı kesmediğini göstermiştir. Bu da, özütlerin DNA’sında Adenin-Adenin’in Guanin-Guanin’e bağlandığını gösterir. Bu bağlanma olduğu için enzimler DNA’yı kesememiştir. Sonuç-Öneri Elektroforez sonucu, plazmid DNA’nın üç farklı biçimi (Form I, Form II, Form III) ve bu formların jeldeki göç sırası gözlenmiştir. Elde edilen bulgular sonucunda da, bu bitkinin DNA ile etkileşime girme yeteneği potansiyel bir antikanser ajan olabileceği ihtimalini göstermektedir. Bu sebeple yapılacak ileri çalışmalarda da bu bitkinin çeşitli kanser hücre hatlarında sitotoksik etkilerinin araştırılması önerilmektedir.No sponso