Phylogenetic classification of the world's tropical forests

Knowledge about the biogeographic affinities of the world’s tropical forests helps to better understand regional differences in forest structure, diversity, composition, and dynamics. Such understanding will enable anticipation of region-specific responses to global environmental change. Modern phylogenies, in combination with broad coverage of species inventory data, now allow for global biogeographic analyses that take species evolutionary distance into account. Here we present a classification of the world’s tropical forests based on their phylogenetic similarity. We identify five principal floristic regions and their floristic relationships: (i) Indo-Pacific, (ii) Subtropical, (iii) African, (iv) American, and (v) Dry forests. Our results do not support the traditional neo- versus paleotropical forest division but instead separate the combined American and African forests from their Indo-Pacific counterparts. We also find indications for the existence of a global dry forest region, with representatives in America, Africa, Madagascar, and India. Additionally, a northern-hemisphere Subtropical forest region was identified with representatives in Asia and America, providing support for a link between Asian and American northern-hemisphere forests.</p

Implicaciones de la precipitación sobre la evolución del tamaño corporal y distancia interaxilar en el complejo Aspidoscelis gularis (Squamata: Teiidae)

Las historias de vida son atributos altamente variables que maximizan la adecuación de los organismos. Se ha documentado la relación del peso y el tamaño corporal sobre estos atributos, los cuales además estan influidos por variaciones ambientales y la heterogeneidad del hábitat. El tamaño y forma corporal son considerados atributos de historia de vida, los cuales estan principalmente asociados a la precipitación que promueve la cantidad de recursos disponibles en el ambiente. En el género Aspidoscelis el tamaño y masa relativa de la nidada estan asociados principalmente a la latitud y altitud. En Aspidoscelis gularis la precipitación de invierno favorece dos temporadas reproductoras, lo que determina que el tamaño de nidada sea variable en cada puesta. Las muestras fueron tomadas de mayo-julio 2013 y mayo-septiembre 2015. Se obtuvieron un total de 65 individuos de los cuales se tomaron medidas de longitud del cuerpo y distancia interaxilar, así como muestras de tejido hepático para la extracción de ADN y obtener las relaciones filogenéticas con respecto a un análisis de Inferencia Bayesiana para posteriormente aplicar los Métodos Comparados Filogenéticos como señal filogenética, contrastes filogenéticamente independientes y la reconstrucción del carácter ancestral. Por lo tanto, nuestros resultados muestran que en el tamaño y forma del cuerpo existe poca señal filogenética, en tanto que los contrastes filogenéticamente independientes y la reconstrucción del carácter ancestral sugieren que los tamaños corporales pequeños están asociadas a localidades con mayor cantidad de precipitación, lo que puede estar relacionado con un establecimiento de la madurez sexual temprana lo cual es el reflejo de la talla máxima de los adultos. Además, de acuerdo a un ANOVA y un ANCOVA hubo diferencias estadísticamente significativas en el tamaño y forma corporal respectivamente, lo que promueve un sistema para la competencia sexual para machos y un sistema para la fecundidad en hembras. Estos resultados son importantes para determinar el efecto de la precipitación sobre algunas características de historia de vida, lo que indica que las lagartijas del complejo sureste del complejo A. gularis son capaces de enfrentar diferentes presiones de selección, impuestas por el ambiente

Cigarette Smoking Alters the Expression of Circulating microRNAs and Its Potential Diagnostic Value in Female Lung Cancer Patients

Cigarette smoking is a known risk factor for the development of lung cancer. We investigated whether circulating microRNA expression levels and their potential diagnostic value are affected by cigarette smoking in adenocarcinoma (AD) patients and healthy (H) participants. In total, 71 female AD patients and 91 H individuals were recruited, including 42 AD never-smokers (AD/CS−), 29 AD smokers (AD/CS+), 54 H never-smokers (H/CS−), and 37 H smokers (H/CS+). PCR array (754 microRNAs) and qPCR were performed on sera from the discovery and validation cohorts, respectively. The expression levels of miR-532-5p, miR-25-3p, and miR-133a-3p were significantly higher in adenocarcinoma patients than in healthy participants, independent of their smoking status. Multivariate analysis showed that levels of miR-133a-3p were independently associated with smoking. ROC analysis showed that only miR-532-5p discriminated AD patients from H controls (AUC: 0.745). However, when making comparisons according to cigarette smoking status, miR-532-5p discriminated AD/CS− patients from H/CS− controls with a higher AUC (AUC:0.762); miR-25-3p discriminated AD/CS+ patients from H/CS+ controls (AUC: 0.779), and miR-133a discriminated AD/CS+ patients from H/CS+ controls with the highest AUC of 0.935. Cancer and lung-cancer-enriched pathways were significantly associated with the three miRNAs; in addition, nicotinate/nicotinamide metabolism, inflammation, and pulmonary hypertension were associated with miR-133a-3p. Our findings highlight how cigarette smoking affects the reliable identification of circulating miRNAs as diagnostic biomarkers in lung cancer and suggest a smoking-dependent pathogenic role of miR-133a-3p in smokers