Особливості геному великої рогатої худоби

Boss taurus is not only an important agricultural species, which during the last 8–10 thousand years since domestication served to humanity as a reliable source of milk, meat, skin, and cattle, is a successful object for the study of obesity, gynecological and infectious diseases of man. Cows are successfully used as a model organism in endocrinology, physiology and reproductive biotechnology. Today, in the world, the number of ruminants – large and small cattle, namely – buffaloes, sheep and goats is estimated at around 3.4 billion. About three-fourths of the world's agricultural land produces fodder suitable for the grazing of these ruminants, which have an amazing ability to effectively convert low-quality vegetable fibers, which are often not suitable for human use, into energy-intensive fat, muscle and milk. This biological process has long been used by humanity, which in the process of breeding has created more than 800 breeds of cattle, which is an important world heritage and a unique scientific resource. The B. taurus genome is estimated at 3000 MB, arranged in 29 pairs of acrocentric autosomes and two sex chromosomes. The sequencing of the bovine genome was conducted by a consortium of more than 300 scientists from 25 different countries. The results of the analysis of the genome are presented in the database ncbi. For the first time, it was sequenced by the genome of one inverted cow of the Hereford breed, L1 Dominette. In addition, today's well-known information on the sequence of six species animals, which identified SNP, was the main resource for the HapMap project, which used 34.470 of them in their analyzes, the EST collection and about 10.000 full-screen cDNA sequences. A genomic card of cattle based on high-density bonds is also reported. The World Society has created and actively used databases containing information on the sequence of genomes, genes, proteins, and their polymorphism. Particular attention deserves descriptions of the results of the analysis of single-nucleotide polymorphism, which allows us to analyze the evolutionary history of phylogenetic bonds in the middle of the species and between different species. The analysis of the associated quantitative features of the loci gives the scientific community additional confidence in identifying the polymorphism of genes, which is the basis of animal productivity. The QTL database contains data on 108 040 bovine cattle, which are associated with 579 different quantitative features. With the polymorphism of individual genes, harmful mutations are associated with the genetic load of populations. To date, 519 traits (disorders) have been described, 203 of them are considered by potential models for research on human diseases. A connection was found between the mutations that caused the 145 polymorphisms.Boss taurus – не лише важливий сільськогосподарський вид, який протягом останніх 8–10 тисяч років з моменту одомашнення слугує людству надійним джерелом молока, м’яса, шкіри, тварини великої рогатої худоби є вдалим об’єктом для дослідження ожиріння, гінекологічних та інфекційних захворювань людини. Корів успішно використовують як модельний організм в ендокринології, фізіології та репродуктивній біотехнології. На сьогодні у світі поголів’я жуйних тварин – великої та малої рогатої худоби, а саме – буйволів, овець та кіз налічує близько 3,4 мільярда. Близько трьох чвертей світових сільськогосподарських угідь землі продукують корм, придатний для випасу цих жуйних тварин, які мають дивовижну здатність ефективно перетворювати низькоякісне рослинне волокно, що часто не підходить для людського використання, в енергоємний жир, м’язи та молоко. Цей біологічний процес давно використовується людством, яке в процесі селекції створило понад 800 порід великої рогатої худоби, що є важливою всесвітньою спадщиною та унікальним науковим ресурсом. Геном B. taurus оцінюється у 3000 МБ, організованих в 29 пар акроцентричних аутосом і дві статеві хромосоми. Секвенування геному великої рогатої худоби було проведено консорціумом, що налічував понад 300 вчених з 25 різних країн. Результати аналізу геному подані в базі даних ncbi. Вперше було секвеновано геном однієї інбредної корови породи Херефорд, L1 Dominette. Крім того, на сьогодні відома інформація про послідовності тварин шести порід, що дозволило виявити SNP, основний ресурс для проекту HapMap, який використовував 34 470 з них у своїх аналізах, EST колекції та близько 10 000 повноекранних послідовностей кДНК . Також повідомляється про геномну карту великої рогатої худоби на основі зв'язків високої щільності. На сьогодні накопичені значні масиви даних, які стосуються аналізу геномів тварин. Світовим товариством були створені й активно використовуються бази даних, що містять інформацію про послідовності геномів, генів, білків, їх поліморфізм. Особливої уваги заслуговують описи результатів аналізу однонуклеотидного поліморфізму, який дозволяє проаналізувати еволюційну історію філогенетичних зв’язків всередині виду та між різними видами. Аналіз локусів, асоційованих з кількісними ознаками, дає науковому співтовариству додаткову впевненість у ідентифікації поліморфізму генів, що є основою продуктивності тварин. База даних QTL містить дані щодо 108 040 локусів великої рогатої худоби, які асоційовані з 579 різними кількісними ознаками. З поліморфізмом окремих генів пов’язані шкодочинні мутації, що складають генетичний вантаж популяцій. На сьогодні описано 519 ознак великої рогатої худоби, 203 з них вважються потенційними моделями для досліджень захворювань людини. Знайдено зв'язок з мутаціями, що були причиною поліморфізму 145 ознак

Efficiency of SSR and PawS markers for evaluation of genetic polymorphism among red clover (Trifolium pratense L.) cultivars

Background. Identification of crop varieties is presently one of the most important aspects due a significant annual increase in the number of newly developed cultivars. Application of molecular markers makes it possible to identify cultivars and secure protection of plant breeders’ rights. Marker techniques based on SSR loci and PawS markers were evaluated for their efficiency in revealing the DNA polymorphism in Russian red clover cultivars, and the research results are presented in this publication.Materials and Methods. The total genome DNA was extracted by a modified SDS method from 30 seedlings per each cultivar. Nine simple sequence repeats (SSR) and 4 PawS markers were used for genotyping. The basic genetic diversity parameters were measured and analyzed using the software resources GelAnalyzer 2010а, MStools v.3, and Statistica 7.0.Results and conclusion. The mean level of intervarietal DNA polymorphism in red clover was 38.6%. Cultivar-specific amplicons were obtained for 4 accessions (cvs. ‘Trifon’, ‘Topaz’, ‘Trio’ and ‘Mars’) with SSR loci RCS1307 and RCS3095. These loci were found appropriate for identification and certification of such cultivars. The tested PawS markers (individually and in combinations) proved non-informative for the analysis of intervarietal DNA polymorphism in red clover. The only primer pair PawS5+PawS16 generated reproducible PCR products, but unique amplicons were absent in the DNA profiles. The data obtained in this study may be helpful for further identification and certification of Russian red clover cultivars and promising breeding materials

Стратегії вищої освіти ХХІ століття: філософські засади та гуманістичний підхід

The paper is dedicated to philosophical consideration of the transformation strategies for higher education, particularly those revealed by the current Covid-19 pandemic. The situation of the latter is presented as a particular form of the general VUCA characteristics of the today’s world of uncertainty, unpredictability and qualitative complexity (‘supercomplexity’). It is argued that the main result of our acknowledgement of the VUCA situation in the world for higher education is the image of the developed human personality becoming the main value and at the same time the main goal of higher education. Under the conditions of volatility and ambiguity, any existing ‘ready-made’ knowledge, as well as any instructions for effective rational behavior, turns to be inadequate. Because of that, it is no longer sufficient to have a set of ‘competences’ as a final result of the educational process at today’s university, and higher education has to turn to developing in its graduates certain multidisciplinary qualities, like critical independent thinking and ability to create one’s own knowledge, up to aiming at an all-round development of cultured personality. The paper argues that the education of critical and creative thinking is closely related to the transition to student-centered learning, as each individual student is to become a full-powered subject of the educational process according to one’s own interests, abilities and curricula, with the role of a teacher starting to resemble that of a moderator, the one who is to help his or her undergraduates to navigate through the vast ocean of available information in order for them to choose and to create their own, personal knowledge. The latter task is especially enforced by the distant and online learning having become popular during the Covid-19 pandemic: that form of learning puts especially high demands on self-discipline and self-responsibility of a student’s personality, while presenting itself as rather a supplement than a replacement to more traditional forms of higher education with personal communication between student and teacher.Статтю присвячено філософському розгляду стратегій трансформації вищої освіти, зокрема тих, які виявила нинішня пандемія Covid-19. Ситуація останньої представлена ​​як особлива форма загальних характеристик сучасного світу - VUCA: невизначеності, непередбачуваності та якісної складності («суперкомплексності»). Стверджується, що основним результатом нашого визнання ситуації VUCA у світі для вищої освіти є образ розвиненої людської особистості, який стає головною цінністю і водночас головною метою вищої освіти. В умовах мінливості та неоднозначності будь-які існуючі «готові» знання, як і будь-які інструкції щодо ефективної раціональної поведінки, виявляються неадекватними. Через це вже недостатньо мати набір «компетенцій» як кінцевий результат навчального процесу в сучасному університеті, і вища освіта має звернутись до розвитку у своїх випускників певних мультидисциплінарних якостей, таких як критичне незалежне мислення та здатність створювати власні знання, аж до спрямованості на всебічний розвиток культурної особистості. У статті стверджується, що виховання критичного та креативного мислення тісно пов’язане з переходом до студентоорієнтованого навчання, оскільки кожен окремий учень має стати повноправним суб’єктом освітнього процесу відповідно до власних інтересів, здібностей та навчальної програми, а роль викладача починає нагадувати роль модератора - того, хто має допомогти своїм студентам орієнтуватись у величезному океані доступної інформації, щоб вони могли вибирати та створювати власні, особисті знання. Останнє завдання особливо посилюється дистанційним та онлайн-навчанням, яке стало популярним під час пандемії Covid-19: така форма навчання висуває особливо високі вимоги до самодисципліни та самовідповідальності особистості студента, виступаючи скоріше як доповнення. ніж як заміна більш традиційним формам вищої освіти з особистим спілкуванням між студентом і викладачем

Поліморфізм качок породи shaoxing за мікросателітними локусами

Microsatellite markers are now been widely used for the detection and description of micropopulation processes occurring in the populations of domestic animals for the effects of various factors of breeding pressure. Microsatellite loci distributed throughout eukaryotic genomes, making them the preferred genetic marker for high resolution genetic mapping. In recent years, rapid advances have been made in the development of molecular genetic maps. High-density linkage maps are now available for many farm animals, such as cattle, pigs, and goats. In contrast, mapping studies in avian species are much less advanced except in the chicken. According to FAO about 70% of ducks are bred in China. This country is a leader in growing ducks. The Shaoxing breed is one of the three major duck breeds in China. Ducks of this breed are characterized by high performance. According to the Bureau of Product Quality, the age of maturity (the beginning of egg laying) in these birds occurs at 130–140 days. The characteristics of the Shaoxing breed include the fact that the peak period of laying eggs lasts from eight to ten months. On average, one duck in 500 days gives from 290 to 310 eggs, which is one of the highest rates for egg breeds. That is why the purpose of our study was the microsatellite analysis of two populations of Shaoxing breed with 9 locuses was conducted. The selection of birds for the study were carried out on a duck farms in Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. and Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd., and at the laboratory of the Jjejiang Academy of Sciences Institute. Samples collection and  DNA  preparation: Venous blood  samples  were  collected  from 480 ducks (240 ducks of population I and 240 ducks of population II of the Shaoxing breeds)  of  both populations  into  3  ml  tubes  containing  EDTA  as anticoagulant agent. In total of 9 investigated loci in the Shaoxing breed population, only one locus was monomorphic (SMO10). The number of different alleles (Na) for each polymorphic locus ranged from 2 (SMO12) to 13 (APL79, CMO11) in population I and from 2 (APL78, SMO12) to 7 (APL79) in population II. On average, one locus had 5.889 alleles in population I and 3.889 of alleles in the population II. The effective number of alleles (Nе) was 1.735 in population I and 1.599 in population II. The number of alleles and the expected heterozygosity (Hexp) values can provide important information for the discrimination of individuals and breeds. The index of expected heterozygosity in population I was 0.336 and 0.307 in population II. The information index (I) was 0,702 in population I and 0,576 in population II. For each population was found private alleles, in population I 6 alleles and in population II just 4 alleles. The results show high level of polymorphism of the studied populations of ducks. The obtained results can be used in the creation of new lines of ducks.У статті наведені результати досліджень генетичної структури двох популяцій качок породи шаосінь за використання дев’яти мікросателітних локусів. Птицю досліджували на качиних фермах компаній Zhejiang Generation Biological Science and Technology Co., Ltd. та Zhuji Guowei Poultry Development Co, Ltd. за підтримки лабораторії Poultry Genetics Laboratory of the Zhejiang Academy of Sciences (Zhejiang Province, PRC). Було встановлено, що середнє число ефективних алелів (Ne) на локус у популяції І складало 1,735, а для популяції ІІ – 1,599. Показники інформаційного індексу становили 0,702 (популяція І) та 0,576 (популяція ІІ). Фактична гетерозиготність у популяції І була 0,298, а у популяції ІІ – 0,269. У результаті нашого дослідження для кожної популяції були виявлені приватні алелі. З 9 досліджених локусів, у популяції І було виявлено 6 приватних алелів, в той час, коли популяція ІІ мала лише 4 локуси. Загалом у популяції І виявлено 23 приватних алелів, а у популяції ІІ – 5. Найбільша кількість приватних алелів була в локусі CMO11 (9), а найменша – 1 алель у локусі SMO7 та SMO10 в популяції І. Популяція ІІ була бідніша на приватні алелі, так у локусі APL79 було 2 та по 1 у CMO11, SMO7, SMO10. Отримані результати свідчать про високий рівень внутрішньопородного поліморфізму шаосінь, що дозволяє розробку стратегій збереження та використання генетичних ресурсів качки за використання аналізу поліморфних локусів мікросателіті

Characteristic of mycoplasma pneumonia in children and quality analysis of antimicrobial therapy

This article presents a comparative analysis of the clinical, radiological, and laboratory signs of mycoplasma pneumonia (MP) in children and community-acquired pneumonia (VP) of another etiology. The study is based on the problem of early etiological diagnosis of MP and the adequacy of antimicrobial therapy. The study included 69 children with CAP between the ages of 2 to 17 years, examined serologically for mycoplasmosis in the ELISA. MP was identified in 40.6% of patients. As a result of the analysis, reliable radiological and laboratory signs that distinguish MP from EP of other etiology were not obtained, except for the predominance of dry wheezing and prolonged cough in children with MP. Detection of IgM antibodies makes it possible to reliably diagnose MP in children in the acute period of the disease, however, delayed etiological identification leads to the late administration of macrolides in children with MP.В настоящей статье представлен сравнительный анализ клинических, рентгенологичексих и лабораторных признаков микоплазменной пневмонии (МП) у детей и внебольничной пневмонии (ВП) другой этиологии. В основе исследования лежит проблема ранней этиологической диагностики МП и адекватности назначения антимикробной терапии. В исследование включены 69 детей с ВП в возрасте от 2-х до 17-ти лет, обследованные серологически на микоплазмоз в реакции ИФА. МП идентифицирована у 40,6% пациентов. В результате анализа не получено достоверных рентгенологических и лабораторных признаков, отличающих МП от ВП другой этиологии, за исключением преобладания сухих свистящих хрипов и длительного кашля у детей с МП. Обнаружение IgM-антител позволяет достоверно диагностировать МП у детей в остром периоде болезни, однако отсроченная этиологическая идентификация обусловливает позднее назначение макролидов у детей с МП

Influence of nanosized silica oxide suspension on free radical damage to testes in rats exposed to chronic nitrate-fluore intoxication

Целью исследования являлось изучение влияняе суспензии нанодисперсного оксида кремния на продукцию супероксидного анион-радикала, активность антиоксидантных ферментов, процессы перекисного окисления липидов в условиях 4 хронической нитратно-фторидной интоксикации в семенниках крыс. Опыты проведены на 15 половозрелых самцах линии Вистар. Хроническую интоксикацию воспроизводили путём интрагастрального введения нитрата натрия и фторида натрия в дозах 500 мг/кг и 10 мг/кг, соответственно. Было установлено, что хроническая нитратно-фторидная интоксикация увеличивает продукцию супероксидного анион-радикала, снижает активность антиоксидантных систем и увеличивает содержание продуктов, реагирующих с тиобарбитуровой кислотой. В этих условиях снижается толщина сперматогенного эпителия и увеличивается толщина соединительно-тканных элементов. Применение суспензии нанодисперсного оксида кремния снижает продукцию супероксида, повышает активность антиоксидантных ферментов, снижает концентрацию продуктов, реагирующих с тиобарбитуровой кислотой. Морфологически отмечается восстановление сперматогенного эпителия. Таким образом, суспензия нанодисперсного оксида кремния эффективна для коррекции изменений в семенниках крыс вызванных хронической нитратно-фторидной интоксикацией; The aim of the present work is to study the influence of a suspension of nanosized silica oxide on the production of superoxide anion radical, the activity of antioxidant enzymes, and the processes of lipid peroxidation in testes of rats exposured to chronic nitrate-fluoride intoxication. Experiments were carried out on 15 mature male rats of the Wistar line. Chronic intoxication was modelled by intragastric administration of sodium nitrate and sodium fluoride in doses of 500 mg/kg and 10 mg/kg respectively. It was found out that chronic nitrate-fluoride intoxication increases the production of superoxide anion radical, reduces the activity of antioxidant enzymes and increases the content of TBA-reactants. Under these conditions, the thickness of the spermatogenic epithelium becomes thinned, while the thickness of the connective tissue elements increases. The use of a suspension of nanosized silica oxide reduces the production of superoxide, increases the activity of antioxidant enzymes, lowers the concentration of TBA reactants. Morphologically, recovery of the spermatogenic epithelium is observed. The suspension of nanosized silica oxide is effective in correcting changes in testes of rats caused by chronic nitrate-fluoride intoxicatio

Способ изготовления кетгута

Способ изготовления кетгута, включающий отбор биологического сырья с последующей его кислотно-щелочной обработкой, высушиванием, полированием, калибровкой, упаковкой и стерилизацией, отличающийся тем, что в качестве исходного сырья используют свиные черева с последующим их обезжириванием путем обработки диэтиловым эфиром

Objectives of the Millimetron Space Observatory science program and technical capabilities of its realization

We present the scientific program of the Spectr-M project aimed at the creation and operation of the Millimetron Space Observatory (MSO) planned for launch in the late 2020s. The unique technical capabilities of the observatory will enable broadband observations of astronomical objects from 50 μm to 10 mm wavelengths with a record sensitivity (up to ~ 0.1 μJy) in the single-dish mode and with an unprecedented high angular resolution (~ 0.1 μas) in the ground-space very long baseline interferometer (SVLBI) regime. The program addresses fundamental priority issues of astrophysics and physics in general that can be solved only with the MSO capabilities: 1) the study of physical processes in the early Universe up to redshifts z ~ 2 × 106 through measuring μ-distortions of the cosmic microwave background (CMB) spectrum, and investigation of the structure and evolution of the Universe at redshifts z < 15 by measuring y-distortions of the CMB spectrum; 2) the investigation of the geometry of space-time around supermassive black holes (SMBHs) in the center of our Galaxy and M87 by imaging surrounding shadows, the study of plasma properties in the shadow formation regions, and the search for observational manifestations of wormholes; 3) the study of observational manifestations of the origin of life in the Universe - the search for water and biomarkers in the Galactic interstellar medium. Moreover, the technical capabilities of the MSO can help solve related problems, including the birth of the first galaxies and SMBHs (z ≳ 10), alternative approaches to measuring the Hubble constant, the physics of SMBHs in 'dusty' galactic nuclei, the study of protoplanetary disks and water transport in them, and the study of 'ocean worlds' in the Solar System

Varespladib and cardiovascular events in patients with an acute coronary syndrome: the VISTA-16 randomized clinical trial

IMPORTANCE: Secretory phospholipase A2(sPLA2) generates bioactive phospholipid products implicated in atherosclerosis. The sPLA2inhibitor varespladib has favorable effects on lipid and inflammatory markers; however, its effect on cardiovascular outcomes is unknown. OBJECTIVE: To determine the effects of sPLA2inhibition with varespladib on cardiovascular outcomes. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: A double-blind, randomized, multicenter trial at 362 academic and community hospitals in Europe, Australia, New Zealand, India, and North America of 5145 patients randomized within 96 hours of presentation of an acute coronary syndrome (ACS) to either varespladib (n = 2572) or placebo (n = 2573) with enrollment between June 1, 2010, and March 7, 2012 (study termination on March 9, 2012). INTERVENTIONS: Participants were randomized to receive varespladib (500 mg) or placebo daily for 16 weeks, in addition to atorvastatin and other established therapies. MAIN OUTCOMES AND MEASURES: The primary efficacy measurewas a composite of cardiovascular mortality, nonfatal myocardial infarction (MI), nonfatal stroke, or unstable angina with evidence of ischemia requiring hospitalization at 16 weeks. Six-month survival status was also evaluated. RESULTS: At a prespecified interim analysis, including 212 primary end point events, the independent data and safety monitoring board recommended termination of the trial for futility and possible harm. The primary end point occurred in 136 patients (6.1%) treated with varespladib compared with 109 patients (5.1%) treated with placebo (hazard ratio [HR], 1.25; 95%CI, 0.97-1.61; log-rank P = .08). Varespladib was associated with a greater risk of MI (78 [3.4%] vs 47 [2.2%]; HR, 1.66; 95%CI, 1.16-2.39; log-rank P = .005). The composite secondary end point of cardiovascular mortality, MI, and stroke was observed in 107 patients (4.6%) in the varespladib group and 79 patients (3.8%) in the placebo group (HR, 1.36; 95% CI, 1.02-1.82; P = .04). CONCLUSIONS AND RELEVANCE: In patients with recent ACS, varespladib did not reduce the risk of recurrent cardiovascular events and significantly increased the risk of MI. The sPLA2inhibition with varespladib may be harmful and is not a useful strategy to reduce adverse cardiovascular outcomes after ACS. TRIAL REGISTRATION: clinicaltrials.gov Identifier: NCT01130246. Copyright 2014 American Medical Association. All rights reserved