Prokaryote genome fluidity is dependent on effective population size

Many prokaryote species are known to have fluid genomes, with different strains varying markedly in accessory gene content through the combined action of gene loss, gene gain via lateral transfer, as well as gene duplication. However, the evolutionary forces determining genome fluidity are not yet well understood. We here for the first time systematically analyse the degree to which this distinctive genomic feature differs between bacterial species. We find that genome fluidity is positively correlated with synonymous nucleotide diversity of the core genome, a measure of effective population size Ne. No effects of genome size, phylogeny or homologous recombination rate on genome fluidity were found. Our findings are consistent with a scenario where accessory gene content turnover is for a large part dictated by neutral evolution

Fatores influenciando a estrutura e distribuição espacial dos peixes nos Igarapés de cabeceira do Parque Nacional do Jaú, Amazônia Central

The aim of this study was to investigate the influence of spatial variation in river channels and habitats on the distribution of fish communities in the headwater streams of the Jaú River System, a blackwater tributary of the Negro River. Collections and measurements were made in 34 headwater streams during the period of November-December, 1998. Fish were captured with fish traps and hand nets along standard reaches of two meanders. Data on benthic habitat structure, stream depth and width were collected along lateral transects in each sample reach. A total of 66 fish species from 24 families were collected and classified into seven trophic guilds: allocthonous insectivore, autochthonous insectivore, general insectivore, piscivore, detritivorous planktivore, detritivorous insectivore and insectivorous piscivore. Variations in the distribution and diversity of bottom substrates were important factors influencing fish community structures in these systems. Also, variation in stream size explained the observed variability in fish communities. © 2014, Instituto Internacional de Ecologia. All right reserved

On nutrition of tropical fresh-water fishes from South America. - Some selected species of the Anostomidae, Curimatidae, Hemiodidae and Characidae (Pisces, Characoidei)

Von einigen Fischarten, die wegen ihrer besonderen Maulstellung oder besonderen Zahnformen ausgewählt wurden, werden die Mageninhalte mitgeteilt. Die Arten gehören zu den characoiden Familien: Anostomidae, Cürimitidae, Heñriodiàae und Characidae. Sie stammen aus allen Teilen des tropischen Südamerikas und sind von Dr. J. GERY zur Verfügung gestellt worden. Die Ergebnisse (Mageninhalte) werden in den Tabellen 1 - 4 darqestellt. Es zeigt sich, wie erwartet werden konnte, daß eine Beziehung zwischen der Form oder Anordnung der Zähne und dem Mageninhalt gefunden werden kann. Die schwach bezahnten Hemiodidae und die zahnlosen Curimaiidae fressen Pilze und Algen, die sie in Verbindung mit Sand und Detritus aufnehmen. Die Characinae mit stark ausgeprägten Zähnen sind räuberisch. Dagegen sind bei den Arten von Anostomìdae, die durch relative Gleichförmigkeit im Gebiß auffallen, ebenfalls deutliche Unterschiede in den Nahrungsgewohnheiten zu vermerken. Nur schwer läßt sich eine Beziehung finden zwischen den verschiedenen Maulstellngen (unter-, end-, oberständig) und dem Mageninhalt. Es werden dafür einige Erklärungen angedeutet. Aber solange diese nicht durch Beobachtung oder Experiment belegt werden können, bleibt der Eindruck bestehen, daß die morphologischen Besonderheiten der Maulstellung (und die Bezahnung) nicht eine so große Rolle für die Nahrungsgewohnheiten der Fische spielen, wie man bisher glauben mochte. Die meisten der untersuchten Fischarten können das Angebot ihres Biotops ausnutzen (nur wenige sind wirklich eng spezialisiert); mögliche Unterschiede, der Biotope, die bezüglich ihrer Vegetationsregion bezeichnet sind, treten in der Nahrungsauswahl kaum in Erscheinung