Development and evaluations of the ancestry informative markers of the VISAGE Enhanced Tool for Appearance and Ancestry

The VISAGE Enhanced Tool for Appearance and Ancestry (ET) has been designed to combine markers for the prediction of bio-geographical ancestry plus a range of externally visible characteristics into a single massively parallel sequencing (MPS) assay. We describe the development of the ancestry panel markers used in ET, and the enhanced analyses they provide compared to previous MPS-based forensic ancestry assays. As well as established autosomal single nucleotide polymorphisms (SNPs) that differentiate sub-Saharan African, European, East Asian, South Asian, Native American, and Oceanian populations, ET includes autosomal SNPs able to efficiently differentiate populations from Middle East regions [...]The study was supported by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Programme under grant agreement No. 740580 within the framework of the VISible Attributes through GEnomics (VISAGE) Project and Consortium. M.d.l.P. is supported by a post-doctorate grant funded by the Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria e da Consellería de Economía, Emprego e Industria from Xunta de Galicia, Spain (ED481D-2021–008). J.R. is supported by the “Programa de axudas á etapa predoutoral” funded by the Consellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria e da Consellería de Economía, Emprego e Industria from Xunta de Galicia, Spain (ED481A-2020/039). C.P., A.F.A., A.M.M., M.d.l.P., M.V.L. and the work to compile ancestry informative tri-allelic SNPs and microhaplotypes are supported by MAPA, ‘Multiple Allele Polymorphism Analysis’ (BIO2016–78525-R), a research project funded by the Spanish Research State Agency (AEI) and co-financed with ERDF funds. The population studies by S.O. at University of Santiago de Compostela, were financed by the Fundação de Apoio a Pesquisa do Distrito Federal (FAPDF), BrazilS

Etude cartographique des orchidées de Kabylie, Numidie, Aurès (Algérie)

International audienceThis document is a summary of recent data about orchids from north-eastern Algeria. The areas concerned are the Kabylia in the broad sense and the historic Algerian Numidia with its adjacent mountains of Hodna and Aurès. They are very diverse territories in terms of geography (from the coast up to + 2000m altitude), bioclimate (from the semi-arid stage to the per-humid stage) and lithology (alluvium, limestone, dolomite, clays, shales, sandstones, granites, etc.).All the data published from 2005 have been synthesised and a lot of unpublished data observed from 2002 has been gathered thanks to around fifteen collaborators. Despite this, many sectors are still untouched for exploration and will need to be investigated in the future.Thus, 55 species have been illustrated and mapped. 8 others are known historically but have not yet been found. Finally, a last one has been reported in the past by mistake. The main synonyms are reminded. The taxonomic choice is following a similar recent work carried out on the Tunisian Orchids, with some rearrangements at the genus levela. A new nomenclatural combination has been created for the needs (Androrchis pauciflora subsp. laeta).A call for contributions is launched to all professional and amateurs Algerian botanists in order to continue the work through the whole Algerian TellCe document est un travail de synthèse des données récentes concernant les Orchidées du nord-est de l’Algérie. Les régions concernées sont la Kabylie au sens large et la Numidie historique algérienne avec ses montagnes adjacentes du Hodna et de l’Aurès. Ce sont des territoires très divers sur le plan géographique (du littoral jusqu’à + de 2000m d’altitude), bioclimatique (de l’étage semi-aride à l’étage per-humide) et lithologique (alluvions, calcaires, dolomies, argiles, schistes, grès, granites, etc.). Toutes les données publiées à partir de 2005 ont été synthétisées et beaucoup de données inédites observées à partir de 2002 ont été rassemblées grâce à une quinzaine de collaborateurs. Malgré cela de nombreux secteurs sont encore vierges de prospection et devront être investigués à l’avenir.C’est donc 55 espèces qui ont été illustrées et cartographiées. 8 autres sont connues historiquement mais n’ont pas encore été retrouvées. Enfin une dernière a été signalée par le passé par erreur. Les principaux synonymes sont rappelés. Le choix taxonomique s’inspire d’un travail récent similaire effectué sur les Orchidées de Tunisie, à quelques réarrangement près au niveau des genres. Une combinaison nomenclaturale nouvelle a été créée pour l’occasion (Androrchis pauciflorasubsp. laeta).Un appel à contribution est lancé auprès de tous les botanistes professionnels et amateurs algériens afin de poursuivre le travail à l’échelle de tout le Tell algérien

Etude cartographique des orchidées de Kabylie, Numidie, Aurès (Algérie)

International audienceThis document is a summary of recent data about orchids from north-eastern Algeria. The areas concerned are the Kabylia in the broad sense and the historic Algerian Numidia with its adjacent mountains of Hodna and Aurès. They are very diverse territories in terms of geography (from the coast up to + 2000m altitude), bioclimate (from the semi-arid stage to the per-humid stage) and lithology (alluvium, limestone, dolomite, clays, shales, sandstones, granites, etc.).All the data published from 2005 have been synthesised and a lot of unpublished data observed from 2002 has been gathered thanks to around fifteen collaborators. Despite this, many sectors are still untouched for exploration and will need to be investigated in the future.Thus, 55 species have been illustrated and mapped. 8 others are known historically but have not yet been found. Finally, a last one has been reported in the past by mistake. The main synonyms are reminded. The taxonomic choice is following a similar recent work carried out on the Tunisian Orchids, with some rearrangements at the genus levela. A new nomenclatural combination has been created for the needs (Androrchis pauciflora subsp. laeta).A call for contributions is launched to all professional and amateurs Algerian botanists in order to continue the work through the whole Algerian TellCe document est un travail de synthèse des données récentes concernant les Orchidées du nord-est de l’Algérie. Les régions concernées sont la Kabylie au sens large et la Numidie historique algérienne avec ses montagnes adjacentes du Hodna et de l’Aurès. Ce sont des territoires très divers sur le plan géographique (du littoral jusqu’à + de 2000m d’altitude), bioclimatique (de l’étage semi-aride à l’étage per-humide) et lithologique (alluvions, calcaires, dolomies, argiles, schistes, grès, granites, etc.). Toutes les données publiées à partir de 2005 ont été synthétisées et beaucoup de données inédites observées à partir de 2002 ont été rassemblées grâce à une quinzaine de collaborateurs. Malgré cela de nombreux secteurs sont encore vierges de prospection et devront être investigués à l’avenir.C’est donc 55 espèces qui ont été illustrées et cartographiées. 8 autres sont connues historiquement mais n’ont pas encore été retrouvées. Enfin une dernière a été signalée par le passé par erreur. Les principaux synonymes sont rappelés. Le choix taxonomique s’inspire d’un travail récent similaire effectué sur les Orchidées de Tunisie, à quelques réarrangement près au niveau des genres. Une combinaison nomenclaturale nouvelle a été créée pour l’occasion (Androrchis pauciflorasubsp. laeta).Un appel à contribution est lancé auprès de tous les botanistes professionnels et amateurs algériens afin de poursuivre le travail à l’échelle de tout le Tell algérien