FUNGAL BIOREACTOR WITH ULTRAMEMBRANE SEPARATION FOR DEGRADATION OF COLORED-AND ENDOCRINE DISRUPTING-SUBSTANCES

Joint Research on Environmental Science and Technology for the Eart

Replacement of Transport Documents : The Function of Sea Waybill

松谷勉教授古稀記念特

Myofibroblasts proliferation of idiopathic and collagen vascular disorders associated nonspecific interstitial pneumonia.

Nonspecific interstitial pneumonia (NSIP) has been recognized as a separate histological classification of interstitial lung disease. Similar features are found not only in idiopathic NSIP, but also in NSIP associated with collagen vascular disorder (CVD-NSIP). We examined the clinical symptoms, laboratory findings, and prognosis of 13 cases of idiopathic NSIP and 11 cases of CVD-NSIP. Immunohistochemical staining was performed using the streptavidin/biotin/peroxidase method with anti-alpha-smooth muscle actin antibody. No differences in the distribution of clinical features, laboratory findings, and prognosis were observed between idiopathic NSIP and CVD-NSIP. In immunohistochemical staining of the fibrosing areas, myofibroblasts were observed in 7 of 13 idiopathic NSIP cases, but in 10 of 11 CVD-NSIP cases. With regards to intra-alveolar organization, myofibroblasts were observed in all 10 CVD-NSIP cases, but they were observed in only 2 of 9 idiopathic NSIP cases. We found a significantly higher myofibroblast proliferation in the intra-alveolar organization of CVD-NSIP compared to idiopathic NSIP. Clinically, idiopathic NSIP and CVD-NSIP are similar, but are pathologically different.</p

DStretchによって強調処理された画像の色空間を復元するCycleGANの学習

本研究は、文化財の経年変化により劣化した画像を、鮮明化し元の色調に復元する技術の確立を目指している。具体的には、無相関ストレッチ技術を用いたDStretchによって、変色・褪色・汚れにより劣化した画像を鮮明化し、CycleGANという深層学習を用いた画像生成技術を用いて元の色調に復元する手法を提案した。実験には、Colbaseからダウンロードした紺紙金字経の画像を使用した。46点の劣化が起きている画像と、52点の劣化の見られない画像を学習データとして使用した。また、JPEGで圧縮された画像に対してDStretch処理を行うと、モザイク状のノイズが現れることがわかったため、無圧縮ないし圧縮率の低い設定を使用した。CycleGANの学習にあたり、識別器の学習率を生成器よりも小さく設定することで、学習がうまくいくことを確認した。また、生成器の学習において、背景が白く飛んでしまう現象や他の学習用画像に起因すると思われる元画像にないパターンが出現することがあるが、これを抑えるために損失関数のパラメータ（λ）を調整することが有効であることも確認した。なお、TensorFlow版CycleGANでは、入力画像のサイズが大きくなると畳み込みが不足するため、干渉のような現象が発生し、メモリ不足の問題も発生した。このため、PyTorch版CycleGANに切り替え、U-Net版のGeneratorの畳み込み回数を増やすなど改良を行った。今後の展望としては、他の色空間でDStretch処理した画像の学習や、複数の色空間で処理した画像をまとめて学習するモデルを構築し、性能の向上を図ることが挙げられる。また、他の文化財の画像に対しても適用可能かどうかを検討する予定である

Impact of laparoscopic surgery on short‐term and long‐term outcomes in elderly obese patients with colon cancer

[Background] Laparoscopic surgery is reported to be useful in obese or elderly patients with colon cancer, who are at increased risk of postoperative complications because of comorbidities and physical decline. However, its usefulness is less clear in patients who are both elderly and obese and may be at high risk of complications. [Methods] Data for obese patients (body mass index ≥25) who underwent laparoscopic or open surgery for stage II or III colon cancer between January 2009 and December 2013 were collected by the Japan Society of Laparoscopic Colorectal Surgery. Surgical outcomes, postoperative complications, and relapse-free survival (RFS) were compared between patients who underwent open surgery and those who underwent laparoscopic surgery according to whether they were elderly (≥70 y) or nonelderly (<70 y). [Results] Data of 1549 patients (elderly, n = 598; nonelderly, n = 951) satisfied the selection criteria for analysis. Length of stay was shorter and surgical wound infection was less common in elderly obese patients who underwent laparoscopic surgery than in those underwent open surgery. There were no significant between-group differences in overall complications, anastomotic leakage, ileus/small bowel obstruction, or RFS. There were also no significant differences in RFS after laparoscopic surgery according to patient age. [Conclusion] Laparoscopic surgery is safe in elderly obese patients with colon cancer and does not worsen their prognosis. There was no significant difference in the effectiveness of laparoscopic surgery between obese patients who were elderly and those who were nonelderly

Pasteurella multocida pneumonia with hemoptysis: A case report

Pasteurella multocida, which colonizes upper respiratory and digestive tracts, is a leading cause of respiratory diseases in many host species. Here, we describe a case of P. multocida pneumonia with hemoptysis. A 72-year-old female diagnosed with bronchiectasis with a 36-year history presented with a worsened infiltrative and granular shadow in the lower right lobe and lingular segment. Bronchial lavage fluid culturing suggested Pasteurella pneumonia. P. multocida was confirmed by 16S rRNA sequencing. The patient was readmitted to our hospital because of hemoptysis, and she was treated successfully with antibiotic therapy. The possibility of P. multocida infection must be considered in patients who own pets

Comparative Outcomes of Laparoscopic Gastrectomy and Open Gastrectomy for Scirrhous Gastric Cancer: A Multicenter Retrospective Cohort Study

Objective: A multicenter retrospective cohort study was performed to compare the outcomes of laparoscopic gastrectomy (LG) versus open gastrectomy (OG) for scirrhous gastric cancer (GC) as a unique subtype also known as type 4 gastric cancer or linitis plastica. Background: Although data on the efficacy and safety of LG as an alternative to OG are emerging, the applicability of LG to scirrhous GC remains unclear. Methods: Patients with clinical type 4 GC undergoing gastrectomy at 13 hospitals from 2005 to 2015 were retrospectively reviewed. As the primary endpoint, we compared overall survival (OS) between the LG and OG groups. To adjust for confounding factors, we used multivariate Cox regression analysis for the main analyses and propensity-score matching for sensitivity analysis. Short-term outcomes and recurrence-free survival were also compared. Results: A total of 288 patients (LG, 62; OG, 226) were included in the main analysis. Postoperative complications occurred in 25.8% and 30.1%, respectively (P = 0.44). No significant difference in recurrence-free survival was observed (P = 0.72). The 5-year OS rates were 32.4% and 31.6% in the LG and OG groups, respectively (P = 0.60). The hazard ratio (LG/OG) for OS was 0.98 (95% confidence interval [CI], 0.65–1.43) in the multivariate regression analysis. In the sensitivity analyses after propensity-score matching, the hazard ratio for OS was 0.92 (95% CI, 0.58–1.45). Conclusions: Considering the hazard ratios and 95% CIs for OS, LG for scirrhous GC was not associated with worse survival than that for OG

縄文土器における修復部位検出のための点群セグメンテーション手法の検討

近年の目覚ましい3Dコンピュータグラフィックス技術向上などの影響を受け，文化財を3Dデータ化する動きが始まっている．容易に触れられない文化財を様々な角度から観察可能になること，これを解析対象とし新たな知見を得られる可能性があること，など様々な利点が挙げられる．ただし，文化財は必ずしも往時の姿を保っているとは限らない．例えば縄文土器の場合，大多数が割れた状態で発掘され，更に部分的に失われていることは珍しくない．このような土器の破片を専門家が緻密に修復し，数多の知見が得られてきた．その一方で，修復後にスキャンした縄文土器の3Dデータは，修復部位が解析を阻害してしまう場合もある．修復部位には本来の縄文土器とは本質的に無関係な情報も含まれる可能性があるため，区別して分析することが望ましい．しかし，修復後に3Dスキャンされた縄文土器の修復部位は，専門家による目視では瞭然に区別可能でも，数値データ上では区別されていない状態である．人間が個別に目視によって確認しながら，修復部位を数値データ上でも区別可能な形式へ3Dデータを編集していく作業は非常に労力が大きい．本稿の最終目的は，縄文土器の3Dデータ上で修復部位を区別可能な形式とし解析時における影響を低減するための，本来の縄文土器の部位と修復部位を区分（セグメンテーション）する作業において，部分的に自動化し人間の労力を削減することである．3Dデータの形式は，色情報RGBを付加したPointCloud（点群）とする．点群セグメンテーション手法として，今回はクラスタリングアルゴリズムを検討した．最終的には縄文土器の部位と修復部位の2集団（2クラスター）へ区分するが，それぞれの部位が混在すると人手による選別作業の負荷が大きく増加する．そのため，先ずは混在しないよう多数のクラスターへ分割してから，順次統合していく手法を検討した．最初にクラスタリングアルゴリズムとして著名なk-meansを検討したが，修復部位と本来の縄文土器の部位が混在する傾向が見られた．k-meansはクラスターの大きさが不均一である場合には向いていないため，1つの縄文土器内で各部位（破片）の大きさが不均一であると，混在するクラスターが生成されやすいと考えられた．クラスターの大きさが不均一でも対応可能，かつメモリ効率が良好なクラスタリング手法として，Topological Mode Analysis Tool（ToMATo）の利用を検討した．初期のクラスター数は細かく分割されるが，クラスター数の上限を設定することで近いクラスター同士が自動的に統合される．これにより， k-meansよりも少ないクラスター数で修復部位を区別でき，人手による修正作業に掛かる労力が削減できる可能性あると見られる．今後の課題として，k-means，ToMATo，他のクラスタリングアルゴリズムを比較するための指標を検討する．また，様々な形態の縄文土器3Dデータへ適用した場合でも，このアルゴリズムによって修復部位を区別できるか，現実的な人手で統合ならびに修正が可能なクラスター数であるか，有効性を評価する方法を検討する

縄文土器3D深層学習クラスター解析に向けたVoxel解像度差の影響評価

新潟県の中期縄文時代遺跡出土の土器分類では、突起などを含む器形、器面の文様などを基準に、地域性を反映した系統や年代的変遷を設定することが多い。本研究は多数の出土資料を光学スキャナにて3D-RGB計測・Voxel化し、深層クラスター解析による「ヒトの判断が介在しない」クラスタと、「ヒトの判断基準による」専門家の分類クラスとの比較検証を行うことで、縄文土器分類群の再概念化、考古学的解釈・評価を更新することを最終目的とする。縄文土器の属性を深層学習・クラスター解析に反映させるために、3D-RGB計測したポリゴン・テクスチャーデータをVoxel化したデータを用いる。計測にはアメテック株式会社クレアフォーム事業部ハンディ3DスキャナーGo!SCAN SPARKとVXelements8.0を使用。解像度0.5mmで計測したデータを開発済プログラムでVoxel化する。今回、試行的に計測した糸魚川市六反田南遺跡出土資料44点について、3段階の解像度（64x64x64、128x128x128、 256x256x256）にてVoxel化し、解像度の異なるVoxel別に4層の3DCNN（三次元畳込みニューラルネットワーク）で深層学習クラスター解析し、解像度差の影響評価した。なお同じ解像度でも計測対象の大きさにより1Voxelあたりの実寸は異なる。その結果、解像度の違いによってクラスタ形成が異なることが確認された。64x64x64Voxelの深層学習クラスター解析では明らかな解像度不足を評価できるが、128x128x128 Voxelと256x256x256 Voxelそれぞれの深層学習クラスター解析では解像度差以外の影響が考えられる。今回使用したクラスター解析モデルには疑似ラベルによる自己学習をクラスタリング前に組み込んでいるため、解像度の違いによる学習が異なることによるものと推測された

Phamacogenomics of Clozapine-Induced Agranulocytosis

Background: Clozapine-induced agranulocytosis (CIA)/clozapine-induced granulocytopenia (CIG) (CIAG) is a life-threatening event for schizophrenic subjects treated with clozapine. Methods: To examine the genetic factor for CIAG, a genome-wide pharmacogenomic analysis was conducted using 50 subjects with CIAG and 2905 control subjects. Results: We identified a significant association in the human leukocyte antigen (HLA) region (rs1800625, p = 3.46 × 10−9, odds ratio [OR] = 3.8); therefore, subsequent HLA typing was performed. We detected a significant association of HLA-B*59:01 with CIAG (p = 3.81 × 10−8, OR = 10.7) and confirmed this association by comparing with an independent clozapine-tolerant control group (n = 380, p = 2.97 × 10−5, OR = 6.3). As we observed that the OR of CIA (OR: 9.3~15.8) was approximately double that in CIG (OR: 4.4~7.4), we hypothesized that the CIG subjects were a mixed population of those who potentially would develop CIA and those who would not develop CIA (non-CIA). This hypothesis allowed the proportion of the CIG who were non-CIA to be calculated, enabling us to estimate the positive predictive value of the nonrisk allele on non-CIA in CIG subjects. Assuming this model, we estimated that 1) ~50% of CIG subjects would be non-CIA; and 2) ~60% of the CIG subjects without the risk allele would be non-CIA and therefore not expected to develop CIA. Conclusions: Our results suggest that HLA-B*59:01 is a risk factor for CIAG in the Japanese population. Furthermore, if our model is true, the results suggest that rechallenging certain CIG subjects with clozapine may not be always contraindicated