CHAMMI: A benchmark for channel-adaptive models in microscopy imaging

Most neural networks assume that input images have a fixed number of channels (three for RGB images). However, there are many settings where the number of channels may vary, such as microscopy images where the number of channels changes depending on instruments and experimental goals. Yet, there has not been a systemic attempt to create and evaluate neural networks that are invariant to the number and type of channels. As a result, trained models remain specific to individual studies and are hardly reusable for other microscopy settings. In this paper, we present a benchmark for investigating channel-adaptive models in microscopy imaging, which consists of 1) a dataset of varied-channel single-cell images, and 2) a biologically relevant evaluation framework. In addition, we adapted several existing techniques to create channel-adaptive models and compared their performance on this benchmark to fixed-channel, baseline models. We find that channel-adaptive models can generalize better to out-of-domain tasks and can be computationally efficient. We contribute a curated dataset (https://doi.org/10.5281/zenodo.7988357) and an evaluation API (https://github.com/broadinstitute/MorphEm.git) to facilitate objective comparisons in future research and applications.Comment: Accepted at NeurIPS Track on Datasets and Benchmarks, 202

Towards automated composition of convergent services: a survey

A convergent service is defined as a service that exploits the convergence of communication networks and at the same time takes advantage of features of the Web. Nowadays, building up a convergent service is not trivial, because although there are significant approaches that aim to automate the service composition at different levels in the Web and Telecom domains, selecting the most appropriate approach for specific case studies is complex due to the big amount of involved information and the lack of technical considerations. Thus, in this paper, we identify the relevant phases for convergent service composition and explore the existing approaches and their associated technologies for automating each phase. For each technology, the maturity and results are analysed, as well as the elements that must be considered prior to their application in real scenarios. Furthermore, we provide research directions related to the convergent service composition phases

Selección de descriptores de tensión para localización de fallas en redes de distribución de energía

Permanent and transient power supply interruption affects power quality indexes related to continuity and causes negative effects in industry, commercial and residential users.As alternative to solve this problem,transmission networks have efficient fault location and protection schemes. Distribution facilities are constrained by technical,economical and operative aspects to implement fault identification and location strategies. In this paper an alternative solution of the fault location problem in power distribution systems, having a minimum of investment from utilities and giving appropriate information which helps to prevent and attend faults. By means of voltage signal characterization measured at the distribution substation and using an optimization and learning technique known as Support Vector Machines (SVM), the most probable zone where the fault was happened is located. The obtained results help to reduce time to locate faults in power distribution systems having a relatively low economical investment.La interrupción del suministro de energía eléctrica en forma permanente o transitoria, afectan los índices de calidad asociados con la continuidad y ocasionan efectos negativos en usuarios industriales, comerciales y residenciales. Para resolver este problema, las redes de transmisión cuentan con esquemas eficientes de protección y localización de fallas; las empresas de distribución, en razón de sus implicaciones técnicas, económicas y operativas,están limitadas para implementar estrategias de identificación y localización de fallas. En este artículo se presenta una alternativa de solución al problema de localización de fallas en redes de distribución de energía eléctrica, con un mínimo de inversión por parte de estas empresas y que proporcione la información apropiada para la prevención y atención oportuna de fallas. Mediante la caracterización de la señal de tensión medida en la subestación de distribución y utilizando la técnica de optimización y aprendizaje conocida como Máquinas de Soporte Vectorial (SVM), se localiza la zona probable donde ocurrió la falla.Los resultados obtenidos, permiten con muy bajo costo, mejorar los tiempos de localización de fallas en los sistemas de distribución

Radiomarcaje y estudios de biodistribución de nanopartículas poliméricas como adyuvantes para la vacunación oftálmica frente a la brucelosis

Objetivos: Optimizar el radiomarcaje con 99mTc de nanopartículas de Gantrez® manosiladas y cargadas con el antígeno de Brucella Ovis (Man-NP-HS) y llevar a cabo estudios de biodistribución en ratón tras la administración de las nanopartículas por vía ocular. Metodología: Las Man-NP-HS se obtuvieron por el método de desplazamiento de disolvente. Se purificaron, liofilizaron y caracterizaron. A continuación, se marcaron con 74 MBq de 99mTcO4 - previamente reducido con una disolución ácida de cloruro de estaño, trabajando en ausencia de oxígeno y con un pH final de 4. El rendimiento del marcaje se evaluó mediante TLC. Los estudios de biodistribución se llevaron a cabo en ratones tras la administración oftálmica de la formulación y de un control de 99mTcO4 - libre. Para ello, se sacrificaron los animales a las 2 y a las 24 horas tras la administración ocular y se contaron los órganos en un contador gamma. Resultados: Se obtuvo un rendimiento de marcaje superior al 90%. Los estudios de biodistribución de 99mTc-Man-NP-HS permitieron detectar la actividad concentrada en mucosa nasal y ocular y tracto gastrointestinal tanto a las 2 como a las 24 horas, frente a la biodistribución de 99mTcO4 - libre que permaneció concentrado en la piel alrededor del ojo y en tracto gastrointestinal. Conclusión: Los estudios de biodistribución de 99mTc-Man-NP-HS tras administración oftálmica han permitido demostrar su biodistribución en mucosas y tracto gastrointestinal, característica indispensable como sistema de liberación de antígenos a través de mucosa ocular. Esto, junto con su elevada respuesta inmune, efectiva protección y no virulencia, convierte a estas nanopartículas en una vacuna ideal anti Brucelosis

Evaluation of macroscopic lesions of different lung lobes in swine using a percentage classification model

Las enfermedades respiratorias en porcinos tienen un gran impacto económico, considerándose uno de los principales problemas en la producción intensiva porcina. El objetivo de este estudio fue evaluar macroscópicamente los diferentes lóbulos pulmonares en una planta de beneficio del centro-occidente de Risaralda, usando un modelo de calificación porcentual. Mediante un estudio descriptivo, se evaluaron 358 pulmones durante la fase de eviscerado, provenientes de 9 lotes de diferentes granjas; se recolectaron datos porcentuales según el grado de lesión macroscópica observada para cada uno de los lóbulos pulmonares. Con estos datos se calcularon los promedios para cada uno de los lóbulos y se compararon entre el total de muestras observadas y para cada uno de los lotes. El análisis de las observaciones macroscópicas permitió establecer una prevalencia de lesiones pulmonares del 85% (305/358), mientras que el 15% (53/358) no evidenciaron ningún tipo de lesión. El 13% (43/358) presentaron lesiones indicativas de pleuritis y el 71% (253/358) de cicatrización. La comparación de los promedios de lesión entre los diferentes lóbulos pulmonares mostró que el más afectado fue el cardiaco derecho, con un valor promedio de 2,1%, mientras que el menos afectado fue el accesorio con un valor promedio de 0,97%. En este estudio se encontró que los lóbulos cardiacos derecho e izquierdo fueron los más afectados del total de pulmones evaluados, estos resultados se pueden relacionar con los signos respiratorios, el estado sanitario y los parámetros productivos de los diferentes lotes en la granja, lo que contribuye a establecer, junto con otras pruebas complementarias un diagnóstico presuntivo en el caso de afecciones respiratorias. Mostrando que el método de evaluación porcentual podría ser una herramienta rápida y eficaz de estudio de lesiones postmorten en plantas de beneficio.Respiratory diseases in pigs have a great economic impact, considering it is one of the main problems in intensive swine production. The objective of this study was to macroscopically evaluate the different pulmonary lobes in a processing plant located center-west of Risaralda, using a percentage qualification model. Through a descriptive study, 358 lungs were evaluated during the evisceration phase, the specimens came from 9 lots of different farms. Data was collected according to the degree of macroscopic lesion observed for each of the pulmonary lobes in percentages. With this data, averages were taken for each of the lobes and compared between the total of samples observed and for each of the lots. In addition, more specific lesions were evaluated on a scale of 0-5 as indicators of pleurisy and scarring. The analysis of the macroscopic observations showed that the majority of the lungs, presented some degree of lesion with an 85% (305/358) while only 15% (53/358) showed no type of lesion. 13% (43/358) presented lesions indicative of pleurisy and 71% (253/358) showed scarring. The comparison of the lesion averages between the different pulmonary lobes showed that the most affected was the right cardiac lobe with an average value of 2.10% while the least affected was the accessory lobe with an average value of 0.97%. In this study it was found that the right and left cardiac lobes were the most affected out of the totality of lungs evaluated, these results can be related to the respiratory signs, the health status and the productive parameters of the different batches in the farm, helping to determine a presumptive or final etiological diagnosis. This shows that the percentage evaluation method could be a quick and effective tool for the study of postmortem lesions in processing plants

Impacto de la pizarra luminosa en estudiantes de contaduría pública de estadística inferencial y fundamentos de matemáticas.

Diagnosticar el uso de la pizarra luminosa en cursos cuantitativos.El uso de recursos que inviten al estudiante a estar más comprometido con su proceso educativo puede incrementar su desempeño. El objetivo del estudio es encontrar el nivel de apreciación percibido en el uso de la pizarra luminosa en dos cursos cuantitativos y establecer las diferencias entre el sexo y la situación laboral de los estudiantes participantes. Se utilizó como instrumento una encuesta que diligenciaron los 97 participantes. Se encontró que el 82% de los estudiantes preferían los videos elaborados por el mismo profesor que orientaba la asignatura, el 82% prefirió verle la cara al profesor mientras escribe en el tablero. En las 3 dimensiones, comprensión, compromiso y satisfacción, se obtuvo 97%, 94% y 95% respectivamente en la categoría “Totalmente de acuerdo”. La apreciación total en relación con el sexo no presentó diferencias significativas, al igual que con la situación laboral

Towards automated composition of convergent services: A survey

A convergent service is defined as a service that exploits the convergence of communication networks and at the same time takes advantage of features of the Web. Nowadays, building up a convergent service is not trivial, because although there are significant approaches that aim to automate the service composition at different levels in the Web and Telecom domains, selecting the most appropriate approach for specific case studies is complex due to the big amount of involved information and the lack of technical considerations. Thus, in this paper, we identify the relevant phases for convergent service composition and explore the existing approaches and their associated technologies for automating each phase. For each technology, the maturity and results are analysed, as well as the elements that must be considered prior to their application in real scenarios. Furthermore, we provide research directions related to the convergent service composition phases