Gene Deletion in Barley Mediated by LTR-retrotransposon BARE

A poly-row branched spike (prbs) barley mutant was obtained from soaking a two-rowed barley inflorescence in a solution of maize genomic DNA. Positional cloning and sequencing demonstrated that the prbs mutant resulted from a 28 kb deletion including the inflorescence architecture gene HvRA2. Sequence annotation revealed that the HvRA2 gene is flanked by two LTR (long terminal repeat) retrotransposons (BARE) sharing 89% sequence identity. A recombination between the integrase (IN) gene regions of the two BARE copies resulted in the formation of an intact BARE and loss of HvRA2. No maize DNA was detected in the recombination region although the flanking sequences of HvRA2 gene showed over 73% of sequence identity with repetitive sequences on 10 maize chromosomes. It is still unknown whether the interaction of retrotransposons between barley and maize has resulted in the recombination observed in the present study.Peer reviewe

Роль хемокинов в рекрутировании клеток-предшественников в опухолевую нишу при раке молочной железы

Развитие первичной опухоли сопровождается формированием опухолевой ниши, котораясоздает благоприятные условия для выживания и пролиферации раковых клеток. Одним из ключевых элементов эволюции опухолевой ниши является рекрутирование костномозговых клеток-предшественников, включая клетки-предшественники макрофагов, мезенхимальные столовые клетки, эндотелиальные и гемопоэтические клетки-предшественники. Миграция упомянутых клеток в опухоль регулируется рядом хемокинов, в том числе CCL2, CXCL12, MSP (macrophage stimulating protein) и MIF (macrophage inhibitory factor). Целью настоящего исследования являлось изучение параметров опухолевой ниши при раке молочной железы. Исследование включало 24 больных с инвазивной карциномой неспецифического типа молочной железы. В суспензии опухолевых клеток методом проточной цитофлюориметрии определяли содержание клеток-предшественников. Концентрацию хемокинов CCL2, CXCL12, MSP и MIF в венозной крови больных оценивали с помощью твердофазного иммуноферментного анализа. Достоверных различий в содержании исследованных клеточных популяций, а также концентрации изученных хемокинов между пациентами, разделенными на группы взависимости от наличия или отсутствия лимфогенных метастазов и неоадъювантного лечения, обнаружено не было. В то же время, установлена прямая корреляционная связь между содержанием гемопоэтических клеток-предшественников в опухоли и концентрацией CXCL12 и MIF в крови

RET/PTC rearrangement occurring in primary peritoneal carcinoma.

RET/PTC rearrangements are initiating events in the development of a significant proportion of papillary thyroid carcinomas. Activated RET/PTC mutations are thought to be restricted to thyroid disease, but this study proposes that these events may also occur in nonthyroid tumors. A total of 57 nonthyroid papillary tumors were examined for RET/PTC rearrangements using interphase fluorescence in situ hybridization, Taqman reverse transcriptase polymerase chain reaction, and immunohistochemistry. Taqman single nucleotide polymorphism detection was used to analyze for expression of mutated BRAF T1799A. In all, 20% (3/15) of primary peritoneal carcinoma had detectable RET/PTC1 rearrangements by all 3 methodologies. A further case of similar histotype had an alternate RET/ PTC rearrangement. No RET/PTC1 rearrangements were detected in the remaining tumor cohort. All 57 tumors were homozygous for wild-type BRAF. The results indicate that RET/PTC rearrangements occur in a small subset of nonthyroid papillary tumors. These rearrangements may not be directly implicated in tumor growth; rather representing "passenger" mutations reflecting RET instability in secondary tumor subclones