Mezimolekulové interakce v proteinech

Mezimolekulové interakce v proteinech - Abstrakt Mgr. Jiří Kysilka Nekovalentní interakce jsou zodpovědné za folding proteinů i za molekulární rozpoznávání během interakce proteinů s dalšími molekulami, například s různými ligandy, dalšími proteiny či molekulami solventu. Abychom těmto procesům, kterých se proteiny účastní, mohli porozumět, je třeba kvalitního popisu nekovalentních interakcí. Většina metod, které jsou výpočetně dostupné pro biologicky zajímavé systémy, však má problém se správným popisem disperzního členu. V této práci je využito korekční schéma DFT/CC pro výpočet interakčních energií malých molekul interagujících s grafitickým povrchem. Tyto výsledky slouží jako benchmark pro interakci funkčních skupin proteinů s hydrofobním prostředím. V následující části práce je zkoumána role nekovalentních interakcí při procesech protein-protein interakce a hydratace proteinu. Na souboru 69 proteinových dimerů byly lokalizovány interakční interface a bylo charakterizováno jejich složení. Bylo ukázáno, že interface dává přednost rozvětveným hydrofobním aminokyselinám (Ile, Leu, Val) a aromatickým aminokyselinám (Phe, Tyr), zatímco vylučuje nabité aminokyseliny kromě Arg. Relativní preference pro výběr interakčního partnera je podobný pro aminokyseliny na interface i uvnitř proteinu, avšak interakce párů...Intermolecular Interactions in Proteins - Abstract Mgr. Jiří Kysilka Non-covalent interactions are responsible for the protein folding and the molecular recognition during the protein interaction with other molecules, including various ligands, other proteins and solvent molecules. In order to understand these processes, exhibited by protein molecules, a proper description of non-covalent interactions is needful. Most methods that are computationally available for the systems of biological interest have difficulties handling with the dispersion term. In this thesis, a density functional theory / coupled clusters (DFT/CC) correction scheme is utilized for a set of small molecules, interacting with a graphitic surface. The results serve as a benchmark for the interaction of the functional groups of proteins with hydrophobic environment. In the following part of this thesis, the role of non-covalent interactions in proteins was studied for the processes of protein-protein interaction and protein hydration. Interaction interfaces has been localized in a set of 69 protein dimers and their composition has been characterized. Interfaces has been shown to prefer branched-chain hydrophobic amino acids (Ile, Leu, Val), aromatic amino acids (Phe, Tyr) and exclude the charged amino acids except of Arg. It was...Katedra fyzikální a makromol. chemieDepartment of Physical and Macromolecular ChemistryPřírodovědecká fakultaFaculty of Scienc

Intermolecular interactions in proteins

Intermolecular Interactions in Proteins - Abstract Mgr. Jiří Kysilka Non-covalent interactions are responsible for the protein folding and the molecular recognition during the protein interaction with other molecules, including various ligands, other proteins and solvent molecules. In order to understand these processes, exhibited by protein molecules, a proper description of non-covalent interactions is needful. Most methods that are computationally available for the systems of biological interest have difficulties handling with the dispersion term. In this thesis, a density functional theory / coupled clusters (DFT/CC) correction scheme is utilized for a set of small molecules, interacting with a graphitic surface. The results serve as a benchmark for the interaction of the functional groups of proteins with hydrophobic environment. In the following part of this thesis, the role of non-covalent interactions in proteins was studied for the processes of protein-protein interaction and protein hydration. Interaction interfaces has been localized in a set of 69 protein dimers and their composition has been characterized. Interfaces has been shown to prefer branched-chain hydrophobic amino acids (Ile, Leu, Val), aromatic amino acids (Phe, Tyr) and exclude the charged amino acids except of Arg. It was..

Use of circuit training in fitness preparation in football

Tématem této bakalářské práce je "Využití kruhového tréninku v kondiční přípravě ve fotbale." Práce je rozdělena na dvě části, teoretickou a praktickou. V první části práce je stručně popsána charakteristika fotbalu, pokračuje seznámením s ročním tréninkovým cyklem ve fotbalu. Kapitola končí výčtem nejvíce zapojovaných svalů a svalových skupin u hráčů fotbalu. Další kapitola je věnována charakteristice kruhového tréninku a cvičebních pomůcek, které jsme v kruhovém tréninku použili. V poslední kapitole teoretické části práce charakterizujeme kondiční přípravu, popisujeme formy kondiční přípravy, kondiční schopnosti a cíl kondiční přípravy. Druhá, praktická část obsahuje zásobník cviků na všechny svalové skupiny s podrobným popisem a fotodokumentací. Závěrem práce jsou tři modelové tréninkové jednotky se zaměřením na rozvoj motorických schopností formou kruhového tréninku. Tato práce by mohla být zdrojem informací o kruhovém tréninku pro širokou veřejnost, studenty tělesné výchovy, či trenéry, kteří mají zájem o novější metody cvičení.ObhájenoThe topic of the bachelor's work is "Use of circuit training in fitness preparation in football." The work is divided into two sections, theoretical and practical. In the first section of the bachelor's work is briefly described the characteristics of football, continues familiarization with the annual training cycle in football. The chapter ends with a list of the most involved muscles and muscle groups for football players. The next chapter is devoted to characteristics of circuit training and the training aids that are used in circuit training. In the last chapter of the theoretical part of the work we describe fitness preparation, we describe the forms of fitness training, fitness abilities and the target of fitness training. The second, practical section, involves tray of exercises for all muscle groups with detail descriptions and photographs. In conclusion, there are three model training unit focused on the development of motor abilities in the form of circuit training. The work could be as an information source about circuit training for a wide public, students studying physical education or trainers who are interested in the incoming exercise methods