Construction and characterization of a genomic BAC library for the Mus m. musculus mouse subspecies (PWD/Ph inbred strain)

BACKGROUND: The genome of classical laboratory strains of mice is an artificial mosaic of genomes originated from several mouse subspecies with predominant representation (>90%) of the Mus m. domesticus component. Mice of another subspecies, East European/Asian Mus m. musculus, can interbreed with the classical laboratory strains to generate hybrids with unprecedented phenotypic and genotypic variations. To study these variations in depth we prepared the first genomic large insert BAC library from an inbred strain derived purely from the Mus m. musculus-subspecies. The library will be used to seek and characterize genomic sequences controlling specific monogenic and polygenic complex traits, including modifiers of dominant and recessive mutations. RESULTS: A representative mouse genomic BAC library was derived from a female mouse of the PWD/Ph inbred strain of Mus m. musculus subspecies. The library consists of 144 768 primary clones from which 97% contain an insert of 120 kb average size. The library represents an equivalent of 6.7 × mouse haploid genome, as estimated from the total number of clones carrying genomic DNA inserts and from the average insert size. The clones were arrayed in duplicates onto eight high-density membranes that were screened with seven single-copy gene probes. The individual probes identified four to eleven positive clones, corresponding to 6.9-fold coverage of the mouse genome. Eighty-seven BAC-ends of PWD/Ph clones were sequenced, edited, and aligned with mouse C57BL/6J (B6) genome. Seventy-three BAC-ends displayed unique hits on B6 genome and their alignment revealed 0.92 single nucleotide polymorphisms (SNPs) per 100 bp. Insertions and deletions represented 0.3% of the BAC end sequences. CONCLUSION: Analysis of the novel genomic library for the PWD/Ph inbred strain demonstrated coverage of almost seven mouse genome equivalents and a capability to recover clones for specific regions of PWD/Ph genome. The single nucleotide polymorphism between the strains PWD/Ph and C57BL/6J was 0.92/100 bp, a value significantly higher than between classical laboratory strains. The library will serve as a resource for dissecting the phenotypic and genotypic variations between mice of the Mus m. musculus subspecies and classical laboratory mouse strains

Comparation Attitudes And Opinions Of The Adolescents At The Age Of 15–18 To The Sport And Movement Activities

V článku předkládáme výsledky výzkumného šetření uskutečněného v roce 2015, které se zaměřovalo na zjišťování názorů a postojů adolescentní mládeže (15–18 let) k pohybovým aktivitám a sportu. Dílčí úkol spočíval v komparaci těchto výsledků s výzkumem, který byl proveden v roce 2000 (Slepička et al., 2001), a to v kompatibilních položkách dotazníku PASA. Pracovní hypotéza předpokládala určité diference v reálných odhadech vlastních sportovních a pohybových aktivit včetně výběru provozovaných sportů. Údaje byly zjišťovány dotazníkem PASA (pohybové aktivity a sport adolescentů), který byl předložen adolescentům středních škol (gymnázií). Celkově bylo vyšetřeno 1067 respondentů, z toho bylo 468 chlapců a 599 dívek. Z výsledků je zřejmé, že v roce 2000 více než 50 % chlapců ve věku 15 až 18 let nedělá pohybově vůbec nic nebo jen stěží udržují existující kondici. V roce 2015 se skupina zmenšila na 40 %, nastalo tedy zlepšení o 10 % ve prospěch pohybových aktivit a sportu u souboru chlapců. U dívek činily podíly ve stejných letech 61 % (2000) a 45 % (2015), nastalo tedy překvapivé zlepšení ve prospěch pohybových aktivit a sportu o 16,1 %. Po patnácti letech jsou výběry sportů u chlapců téměř shodné, preferují fotbal a cyklistiku, na třetím místě byly v roce 2000 úpoly, a v roce 2015 běhání, jogging. Výsledky dívek se odlišují více, v roce 2000 byly prvními třemi sporty v pořadí aerobik, volejbal a cyklistika, zatímco v roce 2015 beachvolejbal, posilování (domácí cvičení) a orientační běh.In this article we present the research results carried out in 2015. The research was focused on recognition of adolescents’ opinions and attitudes (15–18 years of age) towards physical activities and sport from different points of view. A sub-task dealt with comparing the research of compatible items resulting from the questionnaire PASA conducted in 2000 (Slepička et al., 2001). The hypothesis assumed certain differences in the real estimates of sporting and physical activities including the selection of practised sports. Data was analysed by the questionnaire PASA (physical activities and sport in adolescents), which was presented to adolescents at secondary schools (Grammar schools). In general, 1067 respondents were included, 468 of them boys and 599 girls. Regarding the results, it is clear that in 2000 more than 50 % of boys aged 15 to 18 years of age did not do any physical activity or were just barely keeping current physical condition. In 2015 only 40 %, which was an improvement of about 10 % in favour of physical activities and sports among boys. As for the girls it was over 61 % (2000) and 45 % (2015), and that was a surprising improvement in favour of physical activities and sports of 16,1 %. Within the fifteen-year period, the selection of sports among boys, was almost identical. They preferred football and cycling. There was a sight difference in 2000, where sport preference was for martial arts while in the year 2015 it was jogging. The girls differed more in the year 2000, the ranking was – aerobics, volleyball and cycling, but in 2015 – beach volleyball, workout (home exercise) and orienteering

Studies on glycosphingolipids as immune targets in bioprosthetic heart valves

Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Petr Jansa Školitel: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Školitel - specialista: prof. Susann Teneberg, M.D., Ph.D. Název: Studie glykosfingolipidů jako imunitních cílů v bioprotetických srdečních chlopních Léčba vad srdečních chlopní představuje přibližně 20% všech kardiochirurgických operací. Jednou z možností léčby je náhrada vadné chlopně pomocí bioprotetické srdeční chlopně (BSCh). Tyto BSCh jsou zhotovovány z různých lidských nebo zvířecích tkání, např. ze srdečního perikardu. Ačkoli tato léčba je prospěšná pro určité skupiny pacientů, pojí se k ní komplikace jako odhojení xenotransplantátu, či časné opotřebení BSCh. V obou případech je zapojena reakce imunitního systému a oba mohou vyústit ve ztrátu funkce BSCh. Tato práce si klade za cíl izolovat a charakterizovat významné cíle imunitní odpovědi - glykosfingolipidy (GSL). Proto bylo z prasečího perikardu izolováno 8 nekyselých a 7 kyselých GSL, které byly charakterizovány pomocí hmotnostní spektrometrie a carbohydrate binding assay. Z kozích erytrocytů byly izolovány a charakterizovány kyselé GSL. Za zmínku stojí charakterizace nového GSL obsahujícího NeuGc - NeuGc-GT1b gangliosidu. Nakonec byla pomocí 60 binding assayí...Charles University in Prague Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Pharmaceutical Chemistry and Drug Control Candidate: Petr Jansa Supervisor: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. Supervisor - specialist: prof. Susann Teneberg, M.D., Ph.D. Title: Studies on glycosphingolipids as immune targets in bioprosthetic heart valves The treatment of valvular heart disease represents approximately 20% of all cardiac surgery. One alternative of this treatment is replacement of diseased valve with bioprosthetic heart valves (BHV). These BHV are manufactured from divergent human or animal tissues e.g. porcine pericardium. Although this treatment is beneficial for certain groups of patients, it is susceptible to some complications such as rejection of the xenograft or early BHV deterioration. In both of them the immune system is involved and both might result in BHV failure. This study aims to isolate and characterize important targets of this immune response - glycosphingolipids (GSL). Therefore, 8 non-acidic and 7 acidic GSL from porcine pericardium have been isolated and characterized by mass spectrometry and carbohydrate binding assays. The acidic GSL from goat erythrocytes have been isolated and characterized. Notable is characterization of a new NeuGc-containing GSL - NeuGc-GT1b ganglioside....Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzyDepartment of Pharmaceutical Chemistry and Pharmaceutical AnalysisFaculty of Pharmacy in Hradec KrálovéFarmaceutická fakulta v Hradci Králov

Attitudes and opinions of the adolescents at the age of 15 - 18 to the sport and movement activities

Title: Attitudes and opinions of the adolescents at the age of 15 - 18 to the sport and movement activities Objectives: The establishment and comparaison of the opinions and attitudes to movement activities and sport in teenagers was the main objective of this thesis. PASA questionnaire focused on15 - 18 years old secondary schools students was applied. Methods: A method of the written interviewing using PASA questionnaire was used. This questionnaire was widespread some 15 years ago, yet we made a pre- testing sample and some questions were modified. By means of the PASA questionnaire we asked about opinions and attitudes of the adolescents concerning the movement acitivities and sport in light of the psycho-social, real movement and sport activities, of the exploitation of the available physical education and sport facilities etc. The research was effected at selected secondary schools in the Czech Republic. Results: The obtained data were statistically processed and the results are presented in the aggregate tables stating the statistically significant differencies between sex, age groups. A part of the thesis is the comparaison of our result with a research carried out in 2000 (Slepička et. al., 2001). Key words: adolescent, physical activity, sports, interviews, secondary schoolNázev: Postoje a názory adolescentů ve věku 15-18 let ke sportu a pohybovým aktivitám Cíle: Hlavním cílem této práce bylo zjišťování a komparování dotazníkem PASA názory a postoje k pohybovým aktivitám a sportu u adolescentní mládeže, zaměřené na studenty 15 - 18leté ze středních škol (gymnázia). Metody: V diplomové práci využíváme metodu dotazování respektive techniku písemného dotazování v rámci dotazníku PASA. Dotazník byl využíván před patnácti lety, přesto jsme provedli na menším vzorku pilotáž a některé otázky jsme upravili. Prostřednictvím dotazníku PASA se dotazujeme na některé názory a postoje adolescentní mládeže k pohybovým aktivitám a sportu z hlediska psychosociálního, reálných pohybových a sportovních aktivit, využití dostupných tělovýchovných a sportovních zařízení aj. Výzkumné šetření jsme prováděli na vybraných středních školách-gymnáziích v České republice. Výsledky: Získané údaje jsme statisticky zpracovali a výsledky uvádíme v souhrnných tabulkách s konstatováním statisticky významných rozdílů mezi pohlavím, věkovými kategoriemi. Součástí práce je srovnávání našich výsledků s výzkumem uskutečněným v roce 2000 (Slepička et. al., 2001). Klíčová slova: adolescent, pohybová aktivita, sport, dotazování, gymnáziumPedagogika, psychologie a didaktikaFaculty of Physical Education and SportFakulta tělesné výchovy a sport

Interrogation tactics

87 Interrogation tactics ABSTRACT This thesis deals with interrogation tactics. The topic is still relevant as it is one of the most important and used criminal evidence. The aim of this work was to summarize available knowledge from Czech and foreign literature about conducting the interrogation, with a focus on the mistakes caused by interrogators. In addition to describing these mistakes, the work also recommends how to avoid them. Practical examples were obtained from available case-law and interrogation protocols. The analytical-descriptive and comparative method of research was used. The work is divided into five parts, introduction and conclusion. These parts are divided into individual chapters and subchapters. The first part is focused on the interrogation from the perspective of criminalistics, criminal law and forensic psychology. It defines the meaning and the purpose of interrogation and statement, different types and legal regulation. It also deals with psychological aspects of interrogation tactics. The second part discusses the preparation of the interrogation, an important aspect that should not be underestimated. The preparation is divided into analytical and synthetic phases. The third part of the thesis describes the construction of the interrogation and its three stages - the initial...85 Taktika výslechu ABSTRAKT Tato diplomová práce se věnuje taktice výslechu. Téma je stále aktuální, neboť se jedná o jeden z nejdůležitějších a nejvyužívanějších důkazních prostředků. Cílem bylo shrnout dostupné poznatky o vedení výslechu z domácí i zahraniční odborné literatury, se zaměřením na chyby, kterých se vyslýchající osoby mohou dopustit. Kromě upozornění na tyto nedostatky se také práce zabývá jejich možným předcházením. Poznatky byly čerpány také z dostupné judikatury a jsou doplněny o praktické příklady z protokolů o výsleších. Při zpracovávání byla využívána analyticko-deskriptivní a komparativní metoda. Práce je rozčleněna na pět částí, úvod a závěr. Tyto části se dělí na jednotlivé kapitoly a podkapitoly. První část se věnuje výslechu z pohledu kriminalistiky, trestního práva a forenzní psychologie. Vymezuje pojem výslechu a výpovědi, jeho předmět, možná dělení a právní úpravu. Také se zabývá psychologickými aspekty taktiky výslechu. Ve druhé části je podrobně rozebrána příprava výslechu. Jedná se o důležitou etapu, která by neměla být opomíjena. Podle tradičního dělení je členěna na analytickou a syntetickou fázi. Třetí část práce popisuje konstrukci výslechu a jeho dělení do třech stadií - úvodní fáze, souvislé líčení a stadium kladení otázek a odpovědí. Věnuje se také způsobu, jakým lze...Katedra trestního právaDepartment of Criminal LawFaculty of LawPrávnická fakult

The Daily Regime and Regimen of Secondary School Teachers

V článku uvádíme některé názory a postoje učitelů středních škol (bez aprobace tělesné výchovy) na denní režim a životosprávu, dále na psychosociální funkce pohybových aktivit a sportu, získané dotazníkovou metodou.Dotazovaní učitelé působili v době šetření na různých typech škol (gymnázia, střední odborné školy a střední odborná učiliště s maturitou). Výsledky prezentujeme podle pohlaví a celkový počet respondentů činil 709 osob (309 mužů a 400 žen).Za pozitivní zjištění považujeme, že většina učitelů podporuje přiměřené pohybové aktivity a sport, pravidelně se stravuje, za negativní pak, že přibližně třetina souboru se denně pracovně stresuje, a ti kteří jsou kuřáci, zpravidla také pravidelně pijí alkohol. Podrobnější informace uvádíme v textu.In this paper we discuss the evaluation of a daily regime and routine of secondary school teachers´ (without PE teaching qualification), and further their opinions and attitudes towards motion activities and sport. The data was gained by a method of questionnaire. The survey (school year 2016/2017) interviewed teachers that were employed in different types of secondary school (grammar school and vocational school with GCSE exam). The results we present from the viewpoint of gender. The number of respondents was 709 individuals (309 men and 400 women). We consider as a positive finding that the majority of teachers support adequate motion activities and sport along with taking meals regularly. The negative findings are that approximately one third of the research sample got stressed because of their daily work and those who are smokers regularly drink alcohol as a rule. More detailed information is presented in the text of our paper

Differential Expression of Non-Coding RNAs and Continuous Evolution of the X Chromosome in Testicular Transcriptome of Two Mouse Species

BACKGROUND: Tight regulation of testicular gene expression is a prerequisite for male reproductive success, while differentiation of gene activity in spermatogenesis is important during speciation. Thus, comparison of testicular transcriptomes between closely related species can reveal unique regulatory patterns and shed light on evolutionary constraints separating the species. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Here, we compared testicular transcriptomes of two closely related mouse species, Mus musculus and Mus spretus, which diverged more than one million years ago. We analyzed testicular expression using tiling arrays overlapping Chromosomes 2, X, Y and mitochondrial genome. An excess of differentially regulated non-coding RNAs was found on Chromosome 2 including the intronic antisense RNAs, intergenic RNAs and premature forms of Piwi-interacting RNAs (piRNAs). Moreover, striking difference was found in the expression of X-linked G6pdx gene, the parental gene of the autosomal retrogene G6pd2. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: The prevalence of non-coding RNAs among differentially expressed transcripts indicates their role in species-specific regulation of spermatogenesis. The postmeiotic expression of G6pdx in Mus spretus points towards the continuous evolution of X-chromosome silencing and provides an example of expression change accompanying the out-of-the X-chromosomal retroposition

Genetically enhanced asynapsis of autosomal chromatin promotes transcriptional dysregulation and meiotic failure

During meiosis, pairing of homologous chromosomes and their synapsis are essential prerequisites for normal male gametogenesis. Even limited autosomal asynapsis often leads to spermatogenic impairment, the mechanism of which is not fully understood. The present study was aimed at deliberately increasing the size of partial autosomal asynapsis and analysis of its impact on male meiosis. For this purpose, we studied the effect of t12 haplotype encompassing four inversions on chromosome 17 on mouse autosomal translocation T(16;17)43H (abbreviated T43H). The T43H/T43H homozygotes were fully fertile in both sexes, while +/T43H heterozygous males, but not females, were sterile with meiotic arrest at late pachynema. Inclusion of the t12 haplotype in trans to the T43H translocation resulted in enhanced asynapsis of the translocated autosome, ectopic phosphorylation of histone H2AX, persistence of RAD51 foci, and increased gene silencing around the translocation break. Increase was also on colocalization of unsynapsed chromatin with sex body. Remarkably, we found that transcriptional silencing of the unsynapsed autosomal chromatin precedes silencing of sex chromosomes. Based on the present knowledge, we conclude that interference of meiotic silencing of unsynapsed autosomes with meiotic sex chromosome inactivation is the most likely cause of asynapsis-related male sterility

Synthesis and structure of 1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid derivatives

Byla studována příprava derivátů kyseliny 1,2,3,4-tetrahydroisochinolin-3-harboxylové. Byly připraveny deriváty této kyseliny. Struktura připravených derivátů byla studována pomocí 1H a 13C NMR spektroskopie, Xray difrakce a pomocí výpočetních metod. 36 připravených látek bylo odesláno na testování jejich biologické aktivity.Katedra organické chemieDokončená práce s úspěšnou obhajobo

Efficient one-pot synthesis of polysubstituted 6-[(1H-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]uracils through the "click" protocol

Synthesis of triazoloacyclic nucleosides and nucleoside phosphonates was developed as the one-pot Cu(I)-catalyzed azide alkyne Huisgen "click" cycloaddition. A novel Cu(I)-catalyzed decarboxylation reaction of 1-substituted 1H-1,2,3-triazole-4-carboxylates at room temperature was observed and used for the preparation of 1-substituted 1H-1,2,3-triazoles