Portinari: A Data Exploration Tool to Personalize Cervical Cancer Screening

Socio-technical systems play an important role in public health screening programs to prevent cancer. Cervical cancer incidence has significantly decreased in countries that developed systems for organized screening engaging medical practitioners, laboratories and patients. The system automatically identifies individuals at risk of developing the disease and invites them for a screening exam or a follow-up exam conducted by medical professionals. A triage algorithm in the system aims to reduce unnecessary screening exams for individuals at low-risk while detecting and treating individuals at high-risk. Despite the general success of screening, the triage algorithm is a one-size-fits all approach that is not personalized to a patient. This can easily be observed in historical data from screening exams. Often patients rely on personal factors to determine that they are either at high risk or not at risk at all and take action at their own discretion. Can exploring patient trajectories help hypothesize personal factors leading to their decisions? We present Portinari, a data exploration tool to query and visualize future trajectories of patients who have undergone a specific sequence of screening exams. The web-based tool contains (a) a visual query interface (b) a backend graph database of events in patients' lives (c) trajectory visualization using sankey diagrams. We use Portinari to explore diverse trajectories of patients following the Norwegian triage algorithm. The trajectories demonstrated variable degrees of adherence to the triage algorithm and allowed epidemiologists to hypothesize about the possible causes.Comment: Conference paper published at ICSE 2017 Buenos Aires, at the Software Engineering in Society Track. 10 pages, 5 figure

Numerical simulation of the road bus structure submitted a offset frontal impact against a rigid wall

Neste trabalho se apresenta um estudo paramétrico do impacto semifrontal em um ônibus, no qual se avalia independentemente a influência de cada variável envolvida neste tipo acidente. O cenário de impacto semifrontal é sem dúvida um dos mais severos acidentes envolvendo ônibus, pois parte da lateral do ônibus é totalmente danificada, podendo deixar um elevado número de vítimas. A simulação numérica utiliza um modelo de análise explícita formado por elementos de vigas que utiliza uma lei constitutiva elasto‐plástica, a qual leva em conta a influência da taxa de deformação. Com este modelo se realiza um estudo paramétrico das variáveis globais que permitem caracterizar este tipo de cenário. Também são avaliados de forma qualitativa acidentes deste tipo acontecidos nas estradas brasileiras. A discussão dos resultados é finalmente apresentada e serve como um primeiro passo na busca de melhorias a serem introduzidas nas estruturas dos ônibus, objetivando minimizar os danos.This paper presents a parametric study of the offset frontal impact on a bus, in which is assessed independently an influence of each variable involved in this accident type. The scenario of offset frontal impact is surely one of the most severe accidents involving buses, once the same has part of your lateral totally damaged and can leave a large number of victims. The numerical simulation model uses an explicit analysis formed by beams elements which uses elastic‐plastic constitutive law, which takes into account the influence of strain rate. With this model a parametric study of global variables that can characterize this type of scenario is realized. Also are evaluated qualitatively real accidents happened on Brazilian roads. The discussion is finally presented, and serves as a first step in the search for improvements to be made to the structures of the bus, aiming to minimize the damage.Peer Reviewe

A Human-machine Cooperation Protocol for Machine Translation Output Edit Annotation

We report on a study exploring automatic edit annotation in a post-editing corpus with a new method for computing edit types. We examine edit type association with quality scores assigned to the machine translation output and the post-edited texts. Finally, we account for shortcomings in our method and point out edit types worth leveraging.Presentem un estudi que explora la detecció automàtica d'errors en un corpus de postedició amb un mètode inèdit per calcular tipus d'edició. Examinem la seva associació amb les puntuacions de qualitat assignades a la producció de traducció automàtica i als textos posteditats. Finalment, expliquem les deficiències del nostre mètode i assenyalem els tipus d'edició que val la pena aprofitar.Presentamos un estudio que explora la detección automática de errores en un corpus de posedición con un método novedoso para computar los diferentes tipos de corrección. Examinamos su asociación con la puntuación asignada a la calidad de los resultados de la traducción automática y de los textos poseditados. Por último, analizamos algunos defectos de nuestro método y destacamos los tipos de correcciones que conviene aprovechar

Retenção de fósforo em solos da Zona da Mata de Pernambuco

A laboratory study was conducted to determine the P adsorption maxima in soil as calculated by the Langmuir isotherm. The samples analyzed were from the topsoil (A Horizon) of 16 soil units from reconnaissance survey of the soils of the Zona da Mata of Pernambuco, conducted by the Divisão de Pedologia e Fertilidade do Solo (DPFS) and Instituto de Pesquisas e Experimentação Agropecuárias do Nordeste (IPEANE). Equilibrium concentration of P was established between 0 and 20 ppm. The statistical analysis revealed good correlations between the adsorption maxima (ŷ, µg of P adsorbed per g of soil) and moisture equivalents (x), as shown by the following coeficients and regression equations: r= 0.65*** and ŷ = 6.439 + 11.069x for 17 samples without correction for the effect of exchangeable Al; r = 0.74*** e ŷ = -101.978 + 12.673x for 17 samples with correction for the effect of exchangeable Al. By comparative study between the above correlation coefficients, it was concluded that for the soils studied P in the soil was retained both by adsorption of soil particles and a P exchangeable Al interaction. Surface adsorption of P was the dominant factor in the retention of P in these soils. Only when exchangeable aluminum was approximately 1 me per 100 g, did the P exchangeable Al interaction become important. It was assumed in this work, that all of the exchangeable aluminum in the soil reacted completely with the (PO)4 ions. It was observed that in clay textured soils the P adsorption maxima, as expected, were larger than in sandy textured soils.Foi realizado um estudo de laboratório com o objetivo de determinar a adsorção máxima de fósforo no solo calculada pela isoterma de Langmuir. As amostras analisadas pertencem à camada superficial (Horizonte A), de 16 unidades de mapeamento do Levantamento de Reconhecimento dos Solos da Zona da Mata de Pernambuco, realizado pela Divisão de Pedologia e Fertilidade do Solo e pelo Instituto de Pesquisas e Experimentação Agropecuárias do Nordeste. A concentração de equilíbrio de fósforo foi estabelecida entre 0 e 20 ppm. A análise estatística revelou uma boa correlação entre a adsorção máxima de fósforo (ŷ, µg de P adsorvido/g solo) e a umidade equivalente (x), apresentando os seguintes valores para os coeficientes de correlação e equações de regressão: r = 0,65*** e 6,439 + 11,069X  para 17 amostras sem correção do efeito do alumínio trocável; r = 0,74*** e ŷ = -101,978 + 12,673 x para 17 amostras com correção do efeito do alumínio trocável. Pelo estudo comparativo entre os valores dos coeficientes de correlação acima, concluiu-se que o fósforo no solo é retido por ambos: adsorção pelas partículas de solo e a interação P x AI trocável nos solos estudados. A adsorção superficial de P foi fator dominante na retenção de P nestes solos. Somente quando o Al3+ se aproxima de 1,0 me por 100 gramas, P x Al torna-se importante. Admitimos no presente trabalho a hipótese de que todo o alumínio trocável do solo reage completamente com o (PO4)3-. Constatou-se ainda que, nos solos com textura argilosa, a adsorção máxima de fósforo, como se esperava, apresentou-se maior do que naqueles com textura arenosa

Influência dos fatores sexuais e etários sobre a proteína total, fração albumina e atividade sérica de aspartato-aminotransferase e gama-glutamiltransferase de ovinos da raça Santa Inês

O presente estudo estabelece valores de referência dos teores séricos de proteínas totais, albumina, AST e GGT em ovinos da raça santa Inês e avalia a interferência de fatores sexuais e etários sobre estas variáveis. Foram colhidas amostras de sangue de 161 ovelhas. O resultado encontrado para os valores padrões séricos foram 5,86 + 0,96 g/dL para proteínas totais, 2,33+0,43 g/dL para albumina, 63,25+27,52 U/L para AST e 28,45+14,53 U/L para GGT. A análise dos resultados permite afirmar que os valores referentes à concentração sérica de albumina e à atividade sérica de AST sofrem influência de fatores sexuais e etários, e os valores referentes à atividade sérica de GGT sofrem influência somente de fatores etários. Não foram encontradas influências dos fatores sexuais e etários para os outros parâmetros estudados.This work establishes reference values for serum protein and albumin and serum activities of AST and GGT of Santa Inês sheep and evaluates the sexual and age influence on these values. Blood samples were collected from 161 clinically healthy sheep. The results allowed to establish the following reference values 5,86 + 0,96 g/dL (P>;0,05) for serum protein, 2,33+0,43 g/dL (P>;0,05) for albumin, 63,25+27,52 U/L (P>;0,05) for AST and 28,45+14,53 U/L (P>;0,05) for GGT. The result's analysis also allowed concluding that age and sex influence on albumin serum concentrations and AST serum activity and that GGT serum activity suffer age influence

Identificação das capacidades motoras essenciais em judocas iniciantes e habilidosos

O objetivo da presente pesquisa foi identificar as capacidades motoras essenciais em judocas iniciantes e habilidosos. Por meio de uma pesquisa descritiva de opinião, foram analisadas duas situações: 1) de judocas iniciantes com aproximadamente 10 horas de treino e 2) de judocas habilidosos, de nível internacional que disputavam semi-final das Olimpíadas de Sidney. Os vídeos foram avaliados por 16 avaliadores, que tinham o objetivo de analisar cada luta e enumerar as capacidades motoras mais importantes. Os resultados indicaram diferença entre judocas iniciantes e habilidosos: para iniciantes, as capacidades motoras mais importantes foram o equilíbrio estático e dinâmico e o tempo de reação; para habilidosos, destacaram-se as capacidades de: controle do grau de velocidade, tempo de reação, velocidade de movimento de braço, destreza manual e equilíbrio dinâmico. Pode-se concluir, portanto, que não é possível prever o desempenho futuro de judocas iniciantes, uma vez que a importância das capacidades motoras varia ao longo da prática da modalidade

Adherence to secondary prophylaxis and disease recurrence in 536 Brazilian children with rheumatic fever

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>More than 15 million people worldwide have rheumatic fever (RF) and rheumatic heart disease due to RF. Secondary prophylaxis is a critical cost-effective intervention for preventing morbidity and mortality related to RF. Ensuring adequate adherence to secondary prophylaxis for RF is a challenging task. This study aimed to describe the rates of recurrent episodes of RF, quantify adherence to secondary prophylaxis, and examine the effects of medication adherence to the rates of RF in a cohort of Brazilian children and adolescents with RF.</p> <p>Methods</p> <p>This retrospective study took place in the Pediatric Rheumatology outpatient clinic at a tertiary care hospital (Instituto de Puericultura e Pediatria Martagão Gesteira) in Rio de Janeiro, Brazil, and included patients with a diagnosis of RF from 1985 to 2005.</p> <p>Results</p> <p>536 patients with RF comprised the study sample. Recurrent episodes of RF occurred in 88 of 536 patients (16.5%). Patients with a recurrent episode of RF were younger (p < 0.0001), more frequently males (p = 0.003), and less adherent (p < 0.0001) to secondary prophylaxis than patients without RF recurrence. Non-adherence to medication at any time during follow-up was detected in 35% of patients. Rates of non-adherence were higher in the group of patients that were lost to follow-up (42%) than in the group of patients still in follow-up (32%) (p = 0.027). Appointment frequency was inadequate in 10% of patients. Higher rates of inadequate appointment frequency were observed among patients who were eventually lost to follow-up (14.5%) than in patients who were successfully followed-up (8%) (p = 0.022). 180 patients (33.5%) were lost to follow up at some point in time.</p> <p>Conclusions</p> <p>We recommend implementation of a registry, and a system of active search of missing patients in every service responsible for the follow-up of RF patients. Measures to increase adherence to secondary prophylaxis need to be implemented formally, once non-adherence to secondary prophylaxis is the main cause of RF recurrence. Detection of irregularity in secondary prophylaxis or in appointments should be an alert about the possibility of loss of follow-up and closer observation should be instituted.</p