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Validation of microsatellite markers for assisted selection of soybean resistance to cyst nematode races 3 and 14
O objetivo deste trabalho foi validar marcadores microssatélites associados à resistência às raças 3 e 14 do nematóide-de-cisto (Heterodera glycines Ichinohe) da soja (Glycine max L.), para serem utilizados em programas de seleção assistida por marcadores moleculares (SAM). Microssatélites dos grupos de ligação A2, D2 e G da soja foram testados em duas populações, e suas eficiências de seleção foram determinadas. As populações foram 65 famílias F2:3, do cruzamento Msoy8001 (resistente) x Conquista (suscetível), e 66 famílias F2:3, do cruzamento S5995 (resistente) x Renascença (suscetível), avaliadas para a resistência às raças 3 e 14, respectivamente. Famílias com índice de fêmeas de até 30% foram consideradas moderadamente resistentes. Marcadores dos grupos de ligação A2 e G apresentaram associação com a resistência à raça 3. Os marcadores Satt309 e GMENOD2B explicaram a maior proporção da variância fenotípica nos diferentes grupos. As combinações Satt309+GMENOD2B e Satt309+Satt187 apresentaram eficiência de seleção de 100%. A resistência à raça 14 foi associada com marcadores do grupo de ligação G, e a eficiência de seleção da combinação Satt309+Satt356 foi de 100%. Os diferenciais de seleção fenotípica e de seleção assistida mostraram que os dois tipos de seleção podem proporcionar ganhos similares.The objective of this work was to validate microsatellite markers associated with resistance to soybean cyst nematode (Heterodera glycines Ichinohe) races 3 and 14, in soybean (Glycine max L.) genotypes, for use in marker-assisted selection (MAS) programs. Microsatellites of soybean linkage groups A2, D2 and G were tested in two populations, and their selection efficiencies were determined. The populations were 65 F2:3 families from Msoy8001 (resistant) x Conquista (susceptible) cross, and 66 F2:3 families of S5995 (resistant) x Renascença (susceptible) cross, evaluated for resistance to races 3 and 14, respectively. Families with female index up to 30% were considered moderately resistant. Markers of A2 and G linkage groups were associated with resistance to race 3. Markers Satt309 and GMENOD2B explained the greatest proportion of phenotypic variance in the different groups. The combinations Satt309+GMENOD2B and Satt309+Satt187 presented 100% selection efficiency. Resistance to race 14 was associated with markers of G linkage group, and selection efficiency in the Satt309+Satt356 combination was 100%. The selection differential obtained by phenotypic and marker assisted selection showed that both can result in similar gains
Genetic parameters for soybean resistance to Race 1 cyst nematode
O trabalho objetivou verificar o comportamento de Linhagens Endogâmicas Recombinantes (RIL's - Recombinant Imbred Lines), obtidas do cruzamento entre Hartwig (genitor resistente) e EMGOPA-316 (genitor suscetível) em relação à resistência ao nematóide de cisto da soja - NCS (raça 1) e a estimação de parâmetros genéticos e de progressos de seleção como implicação no melhoramento de plantas. Os parâmetros envolveram o índice de fêmeas (IF) obtido na avaliação de 176 linhagens F6 de soja quanto à resistência ao NCS. Avaliaram-se os genótipos quanto à resposta ao NCS em casa de vegetação e calcularam-se as médias dos IF dos genótipos avaliados. Posteriormente, foram realizadas a distribuição de freqüência e a análise de variância e, então, estimado o número de locos segregantes envolvidos na resistência das linhagens ao NCS (raça 1). Estimou-se o progresso de seleção (i = -2,154) entre as linhagens avaliadas (com diferentes números de repetições), bem como a herdabilidade em nível de média (h²). Assim conclui-se que: a) A distribuição de normalidade das médias dos IF, bem como a estimativa da herdabilidade e a estimativa do número de locos segregantes indicam que a resposta das linhagens ao NCS (raça 1) tem caráter de herança poligênica; b) Foram encontradas linhagens promissoras para resistência ao NCS, porém, como este é de difícil avaliação recomenda-se utilizar maior número de linhagens F6 na avaliação fenotípica e maior número de repetições para avaliação da reação ao NCS; c) A necessidade de se fazer correção para efeitos macroambientais aumentou o erro das estimativas.This study aimed at verify the behavior of Recombinant Inbreed Lines, resulting of a cross between Hartwig (resistant parental) and EMGOPA-316 (susceptible parental) to NCS soybean nematode (race 1) and to estimate genetic parameters and those of selection progress. Estimated parameters used the mean female index (IF) obtained through the evaluation of 176 F6 lines for NCS resistance. The genotypes were evaluated in greenhouse. The frequency distribution and the variance analyses were performed to estimate the number of segregating loci involved in the resistance to NCS. The selection progress was estimated (i = -2,154) among the lines evaluated using different numbers of repetitions, as well the herdability (h²). It was concluded that: a) The normality distribution of the average IF, as well the estimated herdability and the number o segregation loci indicated the resistance to NCS (race 1) is poligenic; b) Promising NCS resistant lines were found. However, as the resistance test is difficult a larger number of F6 lines and a larger number of repetitions should be evaluated; c) The necessity of correction due to macroenvironment effects increased the bias of the estimatives
Quebra da resistência da cv. Hartwig por população de campo do nematóide de cisto da soja (Heterodera glycines)
In February 1997, during a current evaluation of soybean cyst nematode (SCN) in Brazil, a field population collected at Sorriso county – State of Mato Grosso – was identified in the greenhouse as race 4. This race was also found to infect soybean cv. Hartwig which had been until that time, resistant in all tests even with race 4. The present work aimed to confirm the race of the nematode, to investigate its multiplication in the cv. Hartwig and other breeding lines, and to compare the capacity of infection of Sorriso population with that one of another population from Chapadão do Céu. It was found that nematode population from Sorriso, identified as race 4, could infect 'Hartwig' and also three breeding lines from the cross 'Hartwig'4 X BR92-31830 with the same reaction. The genotype PI 437654 remained resistant in all tests. The two nematode populatios proved to be different in relation to parasitism in soybean cv. Hartwig. This is the first report of SCN population collected in the field infecting 'Hartwig'. It is suggested that 'Hartwig' be added to the four differential genotypes used for race identification in Brazil and that this specific population of Sorriso be called race 4+ (four-plus).Em fevereiro de 1997, como parte de um monitoramento de raças do nematóide de cisto da soja (NCS) no Brasil, foi coletada uma população do nematóide em Sorriso (MT), identificada como raça 4, mas que foi capaz de se reproduzir na cv. Hartwig. Como essa cultivar sempre mostrou resistência a todas as raças de Heterodera glycines, o presente trabalho objetivou confirmar a raça e a multiplicação do nematóide nessa cultivar e em outras linhagens e comparar a capacidade de multiplicação dessa população com a de outro isolado da raça 4, proveniente de Chapadão do Céu (GO). Os resultados obtidos confirmaram que a população proveniente de Sorriso era da raça 4 e que possuía habilidade de reproduzir-se na cv. Hartwig e em três linhagens oriundas do cruzamento 'Hartwig'4 X BR92-31830, mas não no genótipo PI 437654. Constatou-se ainda que esse isolado difere do outro também pertencente à raça 4, com relação ao parasitismo em 'Hartwig'. Esse é o primeiro relato de quebra da resistência de 'Hartwig' por uma população de campo do NCS. Por essa razão, sugere-se a inclusão de 'Hartwig' nos testes para identificação de raças do NCS no Brasil, acrescentando o sinal positivo (+) ao número da raça sempre que a suscetibilidade dessa cultivar for constatada
Caracterização molecular de populações do nematóide-de-cisto-da-soja com diferentes índices de parasitismo na cultivar Hartwig
Recently, a new race of soybean cyst nematode (SCN) (Heterodera glycines) was discovered, which breaks the resistance of cultivar Hartwig, resistant to all known races of SCN. This population was obtained from soybean plants collected in the Sorriso county, state of Mato Grosso, Brazil, and is characterized as race 4. To verify if this isolate was different from others classified as races 4 and 9, their genetic diversity was analyzed by using the RAPD technique. Nine populations of SCN were analyzed, and only four populations were able to parasitize soybean plants cultivar Hartwig. Based on this study, it was verified that the populations that break Hartwig resistance were different from the other populations. Based on cluster analysis, the populations were separated into three groups. Race 4 populations were placed in the first group, while the race 9 population was placed in the second group and those capable of breaking cultivar Hartwig's resistance were placed in group three. This work confirms that the SCN population found in Sorriso is different from other isolates classified as race 4, and was called race 4+.Recentemente, foi descoberta uma raça do nematóide-de-cisto-da-soja (NCS; Heterodera glycines) que apresentou a capacidade de quebrar a resistência da cultivar Hartwig, até então considerada resistente a todas as raças conhecidas do nematóide. Essa população foi coletada no Município de Sorriso, Estado do Mato Grosso, e foi caracterizada como raça 4. Para verificar a diversidade genética entre esta e outras populações pertencentes às raças 4 e 9, foi feita uma caracterização molecular pela técnica de marcadores moleculares RAPD. Foram utilizadas nove populações do NCS, das quais quatro apresentavam a capacidade de parasitar 'Hartwig'. Foi verificado que as populações capazes de parasitar 'Hartwig' foram bastante diferentes das demais. Por meio de análise de agrupamento, com base nas distâncias genéticas encontradas, foram obtidos três grupos: o primeiro, constituído por indivíduos classificados como raça 4, mas que não parasitam 'Hartwig'; o segundo, constituído por quatro populações capazes de parasitar 'Hartwig', e o terceiro, por apenas uma população, classificado como raça 9, e que também não parasita 'Hartwig'. Este estudo confirmou que a população de NCS, encontrada em Sorriso, é geneticamente distinta das demais populações da raça 4 encontradas e constitui uma nova raça, denominada 4+
Size of AT(n) Insertions in Promoter Region Modulates Gmhsp17.6-L mRNA Transcript Levels
During earlier experiments, an SSR molecular marker (176 Soy HSP) showing high correlation (70%) with resistance/susceptibility to javanese root-knot nematode Meloidogyne javanica was identified in soybean. After being sequenced, results indicated that the SSR 176 Soy HSP marker was inserted in the promoter region of Gmhsp17.6-L gene. It was also detected in this region that resistant genotypes presented insertions between AT(31) and AT(33) in size and susceptible genotypes, AT(9). Gmhsp17.6-L gene coding region presented a perfect match in amino acid sequence in all soybean genotypes. A ribonuclease protection assay showed that Gmhsp17.6-L gene mRNA transcripts were present in all genotypes. A real-time relative quantification (qPCR) indicated in the resistant individuals higher mRNA transcripts levels, which presented in the sequencing more AT(n) insertions. These results suggest that the number of AT(n) insertions inside this promoter region could modulate up or down gene levels. Those findings can lead to the possibility of manipulating, between some limits, the mRNA transcripts levels using different sizes of AT(n) insertions
Inheritance of resistance to soybean cyst nematode races 3 and 14 in soybean RIL and F2 populations
O objetivo deste trabalho foi avaliar, em soja, as heranças da resistência ao nematóide de cisto da soja, raças 3 e 14. As seguintes populações foram avaliadas: uma linhagem endogâmica recombinante (RILs) [Hartwig (resistente) x Y23 (suscetível)], para as raças 3, 14 e 9; uma população de famílias F2:3 [(M-SOY 8001 (resistente) x MB/BR 46 – Conquista (suscetível)], para a raça 3; e uma população de famílias F2:3 [S5995 (resistente) x BRSMG Renascença (suscetível)], para a raça 14. Foram identificados nas populações RILs quatro genes epistáticos que condicionaram resistência à raça 14 e três genes epistáticos para a resistência às raças 3 e 9. A falta de um dos genes proporcionou resistência moderada em todas as situações. Na população F2:3 de M-SOY 8001 x MB/BR 46 – Conquista, foi identificado um gene recessivo para resistência moderada à raça 3 e dois genes recessivos para a resistência completa. Na população F2:3 do cruzamento S5995 x BRSMG Renascença foram identificados dois genes recessivos que condicionaram resistência moderada à raça 14. Estes resultados visam contribuir no delineamento de cruzamentos, que envolvem estes parentais, com maior possibilidade de acumular genes que conferem resistência às diversas raças do nematóide de cisto da soja.The objective of this work was to evaluate the soybean inheritance of resistance to cyst nematode races 3 and 14. The following populations where evaluated: one population of recombinant inbred lines (RILs) [Hartwig (resistant) x Y23 (susceptible line)] for races 3, 14 and 9; one population of families F2:3 [M-SOY 8001 (resistant) x MB/BR 46 – Conquista (susceptible)] for race 3; and one population of families F2:3 [(S5995 (resistant) x BRSMG Renascença (susceptible)] for race 14. In RIL populations, four epistatic genes were identified which conditioned resistance to race 14, and three epistatic ones for resistance to races 3 and 9. The lack of one gene provided moderate resistance under all situations. The highest number of genes for resistance to race 14 points out that genes responsible for lower effects might be involved. In population F2:3 from M-SOY 8001 x MB/BR 46 – Conquista, one recessive gene for moderate resistance and two recessive genes complete resistance to race 3 were identified. Two recessive genes conditioning moderate resistance to race 14 were identified in population F2:3 from the crossing S5995 x BRSMG Renascença. These results will be useful in designing crossings, involving these parentals, with higher possibility to accumulating genes that provide resistance to several SCN races
Intervalo de confiança "bootstrap" como ferramenta para classificar raças do nematóide de cisto da soja
Inheritance of resistance to soybean cyst nematode races 3 and 14 in soybean RIL and F2 populations
EXAMES DE IMAGEM NA AVALIAÇÃO DA ESTEATOSE HEPÁTICA
The current work aims to analyze and expose the use of imaging tests in the evaluation of hepatic steatosis. This study is an integrative review, which was carried out from the research of the following descriptors in health sciences (DeCS): hepatic; steatosis; diagnosis; image. Of these, only articles published in the year 2023, until July 5, were selected, selecting 17 articles, where 7 were excluded and only 10 were analyzed for the preparation of the work. The imaging evaluation of hepatic steatosis is of great relevance, both in confirming the diagnosis and in measuring its severity, however each method of examination has its particular limitations, such as the high cost of Magnetic Resonance and the ineffectiveness of Ultrasound in the assessment of steatosis light. In view of this information, a meeting of the main studies on this topic is necessary to assist in the therapeutic plan.El presente trabajo tiene como objetivo analizar y exponer el uso de las pruebas de imagen en la evaluación de la esteatosis hepática. Este estudio es una revisión integradora, que se realizó a partir de la investigación de los siguientes descriptores en ciencias de la salud (DeCS): hepática; esteatosis; diagnóstico; imagen. De estos, solo se seleccionaron artículos publicados en el año 2023, hasta el 5 de julio, seleccionando 17 artículos, donde 7 fueron excluidos y solo 10 fueron analizados para la elaboración del trabajo. La evaluación por imágenes de la esteatosis hepática es de gran relevancia, tanto para confirmar el diagnóstico como para medir su gravedad, sin embargo cada método de examen tiene sus limitaciones particulares, como el alto costo de la Resonancia Magnética y la ineficacia del Ultrasonido en la evaluación de la esteatosis. luz. Ante esta información, se hace necesaria una reunión de los principales estudios sobre este tema para auxiliar en el plan terapéutico.O atual trabalho objetiva analisar e expôr a utilização de exames de imagem na avaliação da esteatose hepática. Este estudo é uma revisão integrativa, que foi realizada a partir da pesquisa dos seguintes descritores em ciências da saúde (DeCS): hepatic; steatosis; diagnostic; image. Destes, foram selecionados apenas artigos publicados no ano de 2023, até a data de 05 de julho, selecionando-se 17 artigos, onde 7 foram excluídos e apenas 10 foram analisados para a confecção do trabalho. A avaliação por imagem da esteatose hepática possui grande relevância, tanto na confirmação diagnóstica quanto na mensuração da sua gravidade, no entanto cada método de exame possui as suas particulares limitações, como o alto custo da Ressonância Magnética e a ineficácia da Ultrassonografia na avaliação da esteatose leve. Tendo em vista estas informações, faz-se necessária uma reunião dos principais estudos acerca deste tema para auxiliar no plano terapêutico
Análise dos pacientes com Câncer Renal no Hospital Geral de Fortaleza no período de 2017 a 2022
Introdução: Dentre as neoplasias urológicas, o câncer de rim é considerado o mais letal, com 17% dos pacientes apresentando metástase a distância no momento do diagnóstico e aproximadamente 40% dos pacientes morrendo devido à progressão da doença. Objetivo: Analisar o perfil clínico e epidemiológico dos pacientes diagnosticados com câncer renal submetidos a nefrectomia radical ou parcial no Hospital Geral de Fortaleza no período de julho de 2017 a junho de 2022. Método: Coorte retrospectivo utilizando dados secundários disponibilizados pelo Departamento de Estatística do Hospital e análise de prontuários médicos. Resultados: Foram analisados 102 procedimentos cirúrgicos, dos quais 63,1 % corresponderam a nefrectomia radical e 30,1% nefrectomia parcial. A proporção entre homens e mulheres foi de 1,5:1. Houve predomínio de incidência na sexta e sétima década de vida. A maioria dos pacientes foram tratados em estágios iniciais da doença, com 60% apresentando estadio I ao diagnóstico. O subtipo histológico mais comum foi o carcinoma renal de células claras. As complicações pós-operatórias foram raras. Conclusão: O presente trabalho apresentou resultados similares aos apresentados nos estudos epidemiológicos mais recentes a respeito das neoplasias renais. Estudos retrospectivos como este podem contribuir para a compreensão das características dos pacientes portadores de câncer renal atendidos no estado do Ceará