SWAP Version 3.2. Theory description and user manual

SWAP 3.2 simulates transport of water, solutes and heat in the vadose zone. It describes a domain from the top of canopy into the groundwater which may be in interaction with a surface water system. The program has been developed by Alterra and Wageningen University, and is designed to simulate transport processes at field scale and during whole growing seasons. This is a new release with special emphasis on numerical stability, macro pore flow, and options for detailed meteorological input and linkage to other models. This manual describes the theoretical background, model use, input requirements and output tables

Nikolay Ivanovich Pirogov (1810-1881): A pioneering Russian surgeon and medical scientist

Nikolay Pirogov qualified as a physician from Moscow University in 1828 and then studied surgery and anatomy at University of Dorpat. He developed new surgical techniques, including the eponymous osteoplastic foot amputation. His application of scientifically based techniques extended surgery from a craft to a science. During the Crimean War he initiated the deployment of women as nurses and used triage for dealing with mass casualties. His textbook on field surgery became the standard reference on the subject and his principles remained virtually unchanged until the Second World War. Pirogov died on 5 December 1881 at his estate in Vishnya

Cross species transmission of ovine Johnes Disease - Phase 1 : National Ovine Johne’s Disease Control and Evaluation Program.

Johne’s disease was investigated in fibre goats on several farms. The disease was caused by sheep [S] strains of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis. The infection appeared to be less severe than the same infection in sheep in that fewer goats than sheep became infected, and fewer goats than sheep developed obvious signs of the infection. However, infected goats shed the organism in their faeces and therefore were able to spread the infection to other goats and sheep. Therefore inclusion of goats in the control program for ovine Johne’s disease is justified. A communication program is recommended to advise producers that ovine Johne’s disease in goats may not be obvious and that testing should be undertaken to ensure disease is not present. The impact of ovine Johne’s disease on the fibre goat industry is projected not to be great due to the small number of herds likely to be infected

Fosfaatverliezen door uitspoeling in relatie tot het fosfaatoverschot en de bemestingstoestand; een onderzoek in het kader van de P-desk studie

Fosfaatuitspoelingsverliezen die op lange termijn bij een bepaald fosfaatoverschot zijn te verwachten, zijn berekend voor grasland op zand- en veengronden. Geen rekening is gehouden met naijleffecten die op kortere termijn bij fosfaatverzadigde gronden optreden, maar wel met de fosfaattoestand zoals gehanteerd in het bemestingsadvies. De berekende verliezen zijn vaak veel hoger dan de milieukundig acceptabele. De verschillen tussen berekende en milieukundig acceptabele verliezen hangen af van de procesformulering in het model en het criterium voor de waterkwaliteit. De termijn waarop de verliezen het oppervlaktewater bereiken, is voor niet-fosfaatverzadigde zandgronden zeer lang en voor veengronden met krimpscheuren of ondiepe ontwatering zeer kor

Actualisatie schadefuncties voor de landbouw, tussenfase 2a: plausibiliteitstoets SWAP en enkele verkennende berekeningen

Dit rapport bevat de resultaten van een onderzoek naar de plausibiliteit van de uitkomsten van een nieuw modelinstrumentarium om ingrepen in de waterhuishouding te vertalen naar effecten in landbouwopbrengsten. Doet het instrument wat je ervan verwacht en sluit het aan bij de praktijk? Hiervoor is een vergelijking gemaakt met bestaande modellen en met meetgegevens uit de praktijk. Voor het bepalen van de effecten van de ingrepen in de waterhuishouding op de landbouwopbrengsten zijn in Nederland drie methodes operationeel: de HELP-tabellen, de TCGB-tabellen en AGRICOM. In bijna elke berekening wordt gebruik gemaakt van deze methodes. De landbouwsector, de waterbeheerders en de waterleidingbedrijven dringen al langere tijd aan op een herziening van deze methodes. De aanleiding is dat de methodes toe zijn aan actualisatie en aan 'klimaatrobuustheid'. De huidige methoden zijn gebaseerd op verouderderde meteorologische gegevens. Daarnaast geven ze alleen langjarige gemiddelde schades. Een ander belangrijk punt is dat in de huidige methoden zout niet of beperkt wordt meegenomen. Met een droger klimaat gaat zout en het sturen met water op zout, juist een belangrijkere rol spelen in het waterbeheer. Daarnaast is er een nieuw concept ontwikkeld voor het duiden van natschade. Met de nieuwe insteek kan straks door het jaar heen gerekend worden, zodat waterbeheerders een beter beeld krijgen welke waterhuishoudkundige maatregelen ze kunnen nemen en kunnen ze beter inspelen op klimaatverandering. Recent is een belangrijke eerste stap gezet naar een breed gedragen methode voor het bepalen van de klimaatrobuuste relaties tussen waterhuishoudkundige condities en opbrengstdepressies. Deze nieuwe methode zal de huidige schadetabellen kunnen vervangen.Voor de aanpak is een traject voorzien van 2013 tot en met 2016. Het is de bedoeling dat de nieuwe methode in een aantal fasen wordt gerealiseerd. De eerste fase is afgerond. De conceptuele verbeteringen die zijn doorgevoerd, zijn vastgelegd in STOWA-rapport 2013-22 ‘Actualisatie schadefuncties landbouw: fase 1’. Voordat de bij de ontwikkeling betrokken partijen verder wilden gaan, was er behoefte om een toetsing uit te voeren naar de plausibiliteit van de uitkomsten van het nieuwe modelinstrumentarium. Doet het instrument wat je er van verwacht en sluit het aan bij de praktijk. Hiervoor is een vergelijking gemaakt met bestaande modellen en met meetgegevens van de locaties Zegveld, Cabouw en Roswinkel. Dit om uiteindelijk, in 2016, te komen tot een klimaatbestendig en geactualiseerd instrument om te sturen op waterstromen en opbrengsten, rekening houdend met droogte-, nat en zoutschade. Daarmee is er straks een instrument dat onmisbaar is bij het doorrekenen van o.a. peilbesluiten en inrichtingsplannen

Design of the e-Vita diabetes mellitus study: effects and use of an interactive online care platform in patients with type 2 diabetes (e-VitaDM-1/ZODIAC-40)

Background Due to ongoing rise in need for care for people with chronic diseases and lagging increase in number of care providers, alternative forms of care provision and self-management support are needed. Empowering patients through an online care platform could help to improve patients’ self-management and reduce the burden on the healthcare system. Methods Access to laboratory results and educational modules on diabetes will be offered through a platform for subjects with type 2 diabetes mellitus treated in primary care. Differences in socio-demographic and clinical characteristics between subjects expressing interest vs. disinterest to use the platform will be explored. Platform usage will be tracked and compared. Patient satisfaction and quality of life will be measured by validated questionnaires and economic analyses will be performed. Discussion This study is designed to assess the feasibility of use of an online platform in routine primary healthcare for subjects with type 2 diabetes mellitus in the Netherlands, and to study effects of use of the platform on treatment satisfaction, quality of life and clinical parameters. Although providing access to a online platform is not a novel intervention, usage and effects have not yet been studied in this patient population

Ibrutinib directly reduces CD8+T cell exhaustion independent of BTK

Introduction: Cytotoxic CD8+ T cell (CTL) exhaustion is a dysfunctional state of T cells triggered by persistent antigen stimulation, with the characteristics of increased inhibitory receptors, impaired cytokine production and a distinct transcriptional profile. Evidence from immune checkpoint blockade therapy supports that reversing T cell exhaustion is a promising strategy in cancer treatment. Ibrutinib, is a potent inhibitor of BTK, which has been approved for the treatment of chronic lymphocytic leukemia. Previous studies have reported improved function of T cells in ibrutinib long-term treated patients but the mechanism remains unclear. We investigated whether ibrutinib directly acts on CD8+ T cells and reinvigorates exhausted CTLs. Methods: We used an established in vitro CTL exhaustion system to examine whether ibrutinib can directly ameliorate T cell exhaustion. Changes in inhibitory receptors, transcription factors, cytokine production and killing capacity of ibrutinib-treated exhausted CTLs were detected by flow cytometry. RNA-seq was performed to study transcriptional changes in these cells. Btk deficient mice were used to confirm that the effect of ibrutinib was independent of BTK expression. Results: We found that ibrutinib reduced exhaustion-related features of CTLs in an in vitro CTL exhaustion system. These changes included decreased inhibitory receptor expression, enhanced cytokine production, and downregulation of the transcription factor TOX with upregulation of TCF1. RNA-seq further confirmed that ibrutinib directly reduced the exhaustion-related transcriptional profile of these cells. Importantly, using btk deficient mice we showed the effect of ibrutinib was independent of BTK expression, and therefore mediated by one of its other targets. Discussion: Our study demonstrates that ibrutinib directly ameliorates CTL exhaustion, and provides evidence for its synergistic use with cancer immunotherapy.</p