Analysis of diversity genetic of Moroccan net blotch populations using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers

Net blotch caused by Pyrenophora teres f. teres is the most harmful foliar disease in barley generating significant economic losses in Morocco. Populations of P. teres f. teres were collected from different regions of Morocco. Thirty five (35) P. teres f. teres isolates, single conidial, were isolated and were subjected to molecular study using amplified fragment length polymorphism (AFLP) technique. Out of the fourteen primers combinations tested, four primers combinations were selected to disclose the polymorphism between the different P. teres f. teres isolates. The molecular characterization of these isolates showed high degree of polymorphism reaching 95% and identifying 25 specific genotypes. The genetic variability of the different isolates of P. teres f. teres within and between Moroccan regions was highlighted, disclosing no linkage between the isolates and their geographical origins. This result might be due to informal material flow between regions.Key words: Barley, net blotch, Pyrenophora teres f. teres, amplified fragment length polymorphism (AFLP), genetic diversity

Evaluation in vitro de l’effet antifongique de l’extrait aqueux de Daphne gnidium sur Rhynchosporium secalis, agent de la rhynchosporiose de l’orge

Au Maroc, l’orge (Hordeum vulgare) est une culture à double fin, d’une part elle sert pour l’alimentation humaine et d’autre part pour l’alimentation animale. Malheureusement, cette culture est sujette à plusieurs stress dont les stress biotiques. Parmi ces derniers, figure la rhynchosporiose causée par Rhynchosporium secalis, provoquant des pertes de rendement considérables chez la culture de l’orge. Pour développer un moyen de contrôle efficace contre ce pathogène autre que les techniques chimiques et culturelles poursuivies et pour éviter l’intoxication de l’espèce animale qui la consomme à l’état frais, on a eu recours à la lutte biologique. Pour ce faire, on s’est proposé de tester in-vitro l’activité antifongique des extraits de la plante médicinale Daphne gnidium sur la croissance diamétrale de deux souches RS1 et RS2 de Rhynchosporium secalis originaires respectivement de Khémisset et du Gharb. Sept concentrations de D. gnidium ont été testées 20, 40,60, 80, 100, 120 et 140 g/l. Les résultats des tests ont montré que la décoction de D. gnidium a induit une réduction très importante de la croissance mycélienne des deux souches. En effet, le Pourcentage d’inhibition de la croissance diamétrale a atteint 71.58% pour l’isolat RS1 et 68.44% pour l’isolat RS2 à la même concentration de 140g/l

Détermination de la diversité génétique d’une population de Septoria tritici sur blé tendre via une caractérisation culturale et pathogénique

The study of the genetic diversity of a population of Septoria tritici (Rob. ex Desm.) on bread wheat was carried out by morphologic and pathogenic characterization of isolates secured from the major wheat growing areas in Morocco. Morphologic characterization of 38 isolates showed a very marked difference between theses isolates and between/within regions. Indeed, the fungus presented 2 forms, aspect of yeast and aspect of stromatic pads. Concerning the color, 6 colors were noted: pink, orange, white, green olives, brown and black. We underlined the predominance (77 %) of the pink, orange and white color. Also, the classification of the 26 isolates studied on the basis of percentage of the leaf area necrosed with detached leaves technique gave resulting in three groups (Avirulent- Moderately virulent- Virulent). Moreover, the hierarchical classification of 14 isolates gave place to 9 pathotypes. Our results suggested that there were significant differences within isolates indicating a high genetic diversity of the pathogen in Morocco.L’étude de la diversité génétique d’une population de Septoria tritici (Rob. ex Desm.) sur blé tendre a été réalisée par la caractérisation culturale et pathogénique d’isolats collectés dans différentes régions céréalières du Maroc. La caractérisation culturale de 38 isolats in vitro a montré une différence très marquée entre les isolats étudiés et entre/intra régions. En effet, le champignon a présenté 2 formes, l’aspect de levure et l’aspect de bourrelets stromatiques. Concernant la couleur: 6 couleurs ont été notées. Elle varie entre rose, orange, blanche, vert olivâtre, marron, et noir. On a noté la dominance de la couleur rose, orange et blanche avec 77% du total des cultures. Aussi, la classification des 26 isolats étudiés sur la base du pourcentage de la surface foliaire nécrosée moyennant la technique des feuilles détachées a donné lieu à trois groupes (Avirulent- Moyennement virulent- Virulent). De plus, la classification hiérarchique de 14 isolats a donné lieu à 9 pathotypes. Cette différence nette entre les isolats montre qu’il y’a une grande diversité au sein de cette population

Evaluation of the antifungal effect of Thymelaea sp. aqueous extract on Pyrenophora teres

La rayure réticulée, causée par Pyrenophora teres Drechs. f. teres est l’une des maladies majeures de l’orge (Hordeum vulgare L.). Cette céréale est connue au Maroc par son importance agronomique, zootechnique et socioéconomique. La stratégie de lutte la plus utilisée contre la maladie est le traitement chimique. Face aux nombreux problèmes environnementaux liés aux produits chimiques, l’efficacité des extraits naturels, issus des végétaux, sur la croissance des agents pathogènes de culture a été évaluée.L’extrait aqueux de Thymelaea sp colléctée dans la forêt de Maamora, a été testé pour ses effets fongicides, sur cinq isolats de l’agent pathogéne. Ce travail a été réalisé dans le but d’établir une stratégie de protection naturelle des cultures de l’orge. L’extrait obtenu par la décoction de la plante est testé in vitro sur la croissance diamétrale de cinq isolats marocains de Pyrenophora teres Drechs. f. teres. Douze concentrations sont testées: 0, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 55 et 60 g/l . L’extrait aqueux de Thymelaea sp a induit in vitro l’inhibition totale des cinq isolats du pathogène à partir de 40mg/ml. Les isolats inhibés par l’extrait de la plante médicinale et transférés sur le milieu de culture seul n’ont pas repris vie. L’effet de Thymelea sp. sur Pyrenophora teres f. Sp. teres est donc fongicide.Net Blotch caused by Pyrenophora teres Drechs. f. teres is one of the main barley (Hordeum vulgare L.) diseases. This cereal is known in Morocco for its agronomic, zootechnical and socio-economic importance. The most common control is chemical. Because of many environmental issues related to chemicals, the effectiveness of natural plants extracts on the growth of crops pathogens was assessed. Aqueous extract of a medicinal plant Thymelaea sp from the forest of Maamora was tested for its fungicidal effects on five isolates of the pathogen. The objective of the work is to propose a strategy for natural barley protection. The extract from a plant decoction is tested in vitro on the diameter growth of five Moroccan isolates of Pyrenophora teres. Twelve concentrations were tested: 0, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 55 and 60 g/l. The aqueous extract of Thymelaea sp induced a complete inhibition of the five isolates of the pathogen beginning at the concentration of 40mg/ml. The isolates inhibited by the medicinal plant were transferred to a growth medium alone. No growth has been observed. The effect of Thymelea sp. On Pyrenophora teres Drechs. f. teres is fungicidal

Valorisation du lentisque «Pistacia lentiscus L.»: Étude ethnobotanique, Screening phytochimique et pouvoir antibactérien

Objectif : Cette étude consiste en une contribution à la valorisation du lentisque, très répandu dans la région de Meknès via une investigation ethnobotanique, un screening phytochimique et des tests antibactériens.Méthodologie et résultats : Une étude ethnobotanique a été menée à l’aide de fiches questionnaires auprès de la majorité des herboristes de la ville de Meknès ; ceci, afin de récolter le maximum d’informations sur les vertus et usages traditionnels de P. lentiscus L. L’enquête a révélé que le lentisque est couramment utilisé en thérapie (96%), surtout dans le  traitement des affections gastrointestinales (88%), et dermatologiques (28%). Le feuillage et les jeunes rameaux sont utilisés sous forme de tisane (50%) et d’huiles essentielles (33%). A travers l’investigation phytochimique et des tests d'activité antibactérienne conduits avec des extraits de feuilles et de jeunes rameaux, il apparait que P.lentiscus L. est riche en métabolites secondaires. De son côté, l’huile essentielle et les différents extraits testés sont dotés d’une activité antibactérienne considérable.Conclusion et application de la recherche : L’étude ethnobotanique nous a permis de dévoiler le large éventail d’utilisation du feuillage de P. lentiscus L. dans le traitement de pathologies, notamment celles du tube digestif. Aussi, P. lentiscus L. est potentiellement important grâce à ses atouts en termes de biomasse, d’abondance sur le terrain, de richesse en  métabolites secondaires (tanins, flavonoïdes, Stérols, triterpènes, et saponosides), d’effets antibactériens et de faible toxicité en rapport avecl’absence d’alcaloïdes et d’hétérosides cyanogénétiques.Mots clés : Pistacia lentiscus L., Enquête ethnobotanique, Screening phytochimique, Activité antibactérienne, Meknès, MarocObjective : The present study is a contribution to the popularization through an ethno botanical investigation, phytochemical screening and antibacterial tests of mastic tree “Pistacia lentiscus L.” widespread in Meknes region.Methods and results: A survey of most of Meknes town herbalists was conducted using a questionnaire in order to collect as much information on traditional virtues and uses of Pistacia lentiscus L. That investigation revealed that mastic tree is frequently used in therapy (96%), especially to treat digestive diseases (88%) and skin pains (28%). Leaves and young twigs are the most used parts mainly under inthe form of an herb tea (50%) and essential oils (33%).The phytochemical screening and antibacterial tests undertaken on leaves and young twig showed that Pistacia lentiscus L. is rich in secondary metabolites. Also, essential oils and the different plant extracts tested had an important antibacterialactivity.Conclusion and application of research: Ethnobotany study revealed the wide range of uses of the foliage of P. lentiscus L. in the treatment of diseases, including those of the digestive tract. Also, P. lentiscus L. is potentially important because of its biomass, abundance in secondary metabolites (tannins, flavonoids, sterols, triterpenes and saponins) antibacterial effects and low toxicity related to the absence of alkaloids and cyanogenic glycosides.Keywords: Ethnobotany, Pistacia lentiscus L., antibacterial activity, phytochemical screening, Meknes, Morocco

Valorisation des extraits de trois espèces du genre Urtica: Urtica urens L., Urtica membranacea Poiret et Urtica pilulifera L.

Objectif : Le présent travail consiste à la valorisation de trois espèces du genre Urtica, Urtica urens L., Urtica membranacea Poiret et Urtica pilulifera L. très abondantes dans la région de Meknès, via un screening phytochimique et des tests antibactériens.Méthodologie et résultats : Les extraits bruts et fractionnés des parties aériennes ont fait l’objet d’une étude phytochimique qualitative, d’un dosage des polyphénols et des flavonoïdes et d’une évaluation de l’activité antibactérienne par la méthode de diffusion en milieu solide contre cinq bactéries pathogènes, Escherichia coli 1 et 2, Staphylococcus aureus, Pseudomonas putida et Klebsiella pneumoniae. Les résultats montrent que les trois espèces recèlent une diversité de métabolites secondaires aussi bien des tanins galliques et des flavonoïdes que des stérols, des triterpènes et des leucanthocyanes ; aussi, seule U.urens contient des mucilages. Avec l’analyse quantitative, il apparaît que les teneurs des extraits respectivement en flavonoïdes et en phénols totaux sont plus élevées chez Urtica pilulifera L (0,337±0,037 mg EQ/30 g MS ; 2,313±0,3 mg EAG/30 g MS) ; Urtica urens L., elle, est la moins pourvue en ces composants. En fin, aucun des extraits testés, bruts ou fractionnés n’a d’effet inhibiteur sur les bactéries pathogènes utilisées.Conclusion et application de la recherche : Cette étude a permis de dévoiler que les trois espèces du genre Urtica sont potentiellement importantes grâce à ces atouts en termes de biomasse, d’abondance sur le terrain, de richesse en métabolites secondaires (tanins, flavonoïdes, Stérols, triterpènes, et saponosides).Mots clés : Urtica urens L ; Urtica piluliferae L ; Urtica membranacea Poiret ; Extraits ; Phénols, Flavonoïdes, Activité antibactérienne

Assessment of the Biological Nitrogen Fixation in Soybean Sown in Different Types of Moroccan Soils

The present study aims to assess the biological nitrogen fixation in the soybean tested in different Moroccan soils combined with the rhizobial inoculation. These effects were evaluated by the plant growth mainly by the aerial biomass production, total nitrogen content and the proportion of the nitrogen fixed. This assessment clearly shows that the inoculation with bacteria increases the growth of soybean. Five different soils and a control (peat) were used. The rhizobial inoculation was performed by applying the peat that contained a mixture of 2 strains Sinorhizobium fredii HH103 and Bradyrhizobium. The biomass, the total nitrogen content and the proportion of nitrogen fixed were evaluated under different treatments. The essay was realized at the greenhouse the Faculty of Sciences, Moulay Ismail University. The soybean has shown a great response for the parameters assessed. Moreover, the best response was reported by the inoculated plants compared to non- inoculated and to the absolute control. Finally, good production and the best biological nitrogen fixation present an important ecological technology to improve the sustainable production of soybean and to ensure the increase of the fertility of soils