Loss of genetic diversity among pirarucu broodstocks in fish farms: a pilot study

Molecular markers can be used to monitor genetic variability in cultivated fish stocks with the aim of developing better aquaculture techniques and increasing productivity. Our objective was to evaluate genetic variability in pirarucu broodstocks in fish farms in the southeast and northeast of Pará state, Brazil. The samples were genotyped using four microsatellite markers, and genetic diversity indices were calculated for each broodstock. A total of 16 alleles were identified from the four loci tested in the 33 pirarucu samples, with means of 3.00, 2.75, and 2.25 alleles per locus in broodstocks from Tucumã, Parauapebas, and Moju municipalities, respectively. The Parauapebas broodstock had the highest mean observed heterozygosity. In the broodstocks from Tucumã and Parauapebas, the markers AgCAm16 and AgCAm18 were not at Hardy-Weinberg equilibrium. We can suggest that there were considerable losses of genetic variability in the pirarucu breeding centers of the municipalities of Tucumã, Parauapebas and Moju, compared to natural populations.Molecular markers can be used to monitor genetic variability in cultivated fish stocks with the aim of developing better aquaculture techniques and increasing productivity. In view of the above, the objective of the present work was to evaluate the genetic variability in pirarucu broodstocks in fish farms in the southeast and northeast of the of Pará state, Brazil. The samples were genotyped using four microsatellite markers, and genetic diversity indices were calculated for each broodstock. A total of 16 alleles were identified from the four loci tested in the 33 pirarucu samples, with means of 3.00, 2.75, and 2.25 alleles per locus in broodstocks from Tucumã, Parauapebas, and Moju municipalities, respectively. The Parauapebas broodstock had the highest mean observed heterozygosity. In the broodstocks from Tucumã and Parauapebas, the markers AgCAm16 and AgCAm18 were not at Hardy-Weinberg equilibrium. This pilot study showed that there were considerable losses of genetic variability in pirarucu breeding centers in the municipalities of Tucumã, Parauapebas and Moju compared to the variability in the natural populations of this fish species

Perfil do plantel de reprodutores utilizados na produção de peixes da região dos Carajás, Pará / Breeding stock profile used in fish production in the Carajás region, Pará

Neste estudo buscou-se caracterizar o perfil do plantel de reprodutores de peixes, reunindo informações sobre as práticas de manejo, origem e as espécies produzidas na região dos Carajás. Os laboratórios de alevinagem onde os dados foram levantados, localizam-se nos municípios de Tucumã, Xinguara, Breu Branco, Parauapebas e Marabá. Os dados coletados foram tabulados e submetidos à análise estatística descritiva. Em relação aos plantéis de reprodutores, em média seis espécies são produzidas, Tambaqui (Colossoma macropomum), Piau (Leporinus obtusidens), Curimatã (Prochilodus spp), Pirarucu (Arapaima gigas), Piabanha (Brycon insignis) e Pirapitinga (Piaractus brachypomus), num total de 651 matrizes, onde 83,33% dos produtores possuem ciência de sua origem. A frequência de reposição dos casais utilizados, 16,67% dos entrevistados afirmaram repor os plantéis a cada 2 ou 3 anos, 16,67% realizam reposição entre 4 e 5 anos, 16,67% adicionam durante todo o ano e 33,33% dividem-se entre os produtores que não fazem reposição e os que não adquirem por meio de compra, utilizando reprodutores do próprio empreendimento. As propriedades utilizam-se de três critérios para a seleção dos reprodutores: maior estímulo à ovulação e espermiação, conformação das gônadas e o porte do animal. Quanto a densidade de estocagem, 16,67% responderam realizar diferenciação por espécie de peixe - um peixe/m2 (redondo) e um peixe/10m2 (carnívoro) - e 83,33% afirmam que não o fazem. Entretanto, 100% dos produtores entrevistados não possuem informações referentes a quantidade de lipídios e de energia comestível constituinte da ração ou alimento natural. O custo mensal com ração para os produtores nessas regiões (safra 2015/2016) foi em torno de R$ 1.667,75 ao mês, representando um alto custo para o sistema produtivo. Contudo, foi observado que um maior número de informações técnicas, juntamente com o planejamento dos sistemas de rastreabilidade, são fatores importantes para piscicultura na região, que oportunizariam significativa melhoria dos plantéis de reprodutores, visto que alguns ajustes técnicos, científicos e boas indicações práticas de manejo são capazes de garantir maior desenvolvimento para a piscicultura na região.

Caracterização da assistência técnica prestada em unidades produtoras de alevinos na mesorregião Sudeste do Pará / Characterization of technical assistance provided in alevine producing units in the southeast Mesoregion of Pará

Dentre os entraves pertinentes à piscicultura paraense, a falta de conhecimento técnico apresenta-se como um dos mais agravantes, visto que resulta em manejo e instalações inadequadas, tanto do ponto de vista produtivo, quanto do ambiental. O objetivo deste estudo foi caracterizar o perfil da assistência técnica prestada em unidades produtoras de alevinos, na Mesorregião Sudeste do Estado do Pará. Os dados foram obtidos através de entrevistas aos produtores no período de setembro a outubro de 2016, visando levantar dados referentes à assistência técnica ofertada aos empreendimentos durante a safra 2015/2016. Dentre as propriedades, 33% estão localizadas no Município de Tucumã, e os 67% restantes dividem-se entre os Municípios de Breu Branco, Parauapebas, Marabá e Xinguara, totalizando seis propriedades na região. Ao serem questionados quanto a utilização de assistência técnica em suas propriedades, cerca de 50% dos produtores de alevinos afirmaram ter acesso aos serviços, enquanto que 33,33% não o utilizam e 16,67% utilizam apenas em casos excepcionais, ou seja, raramente. Sobre a formação técnica dos profissionais que os atendem, apenas 50% dos entrevistados souberam afirmá-las, enquanto que os restantes alegaram não ter certeza ou ainda, que tal informação seria irrelevante. Quanto às entidades que prestam serviços de assistência técnica, 33% dos produtores afirmaram adquiri-la por meio da Empresa de Assistência Técnica e Extensão Rural (EMATER), 50% declararam que, a mesma ocorre por meio de empresas de consultoria ou técnicos autônomos, e 17% através da prefeitura de seu Município, que neste caso é ofertada pela Secretaria de Produção Rural (SEMPROR). De maneira geral, 100% dos produtores asseguraram estar satisfeitos com a piscicultura no Estado, além de possuir planos de ampliação de seus empreendimentos para os próximos anos. Quanto à satisfação referente à oferta e qualidade dos serviços de assistência técnica prestados, este ainda é considerado um gargalo na produção de alevinos, o que pode ser confirmado por meio da listagem das principais dificuldades enfrentadas pelos larvicultores, com destaque para a assistência técnica e aquisição de insumos, principalmente de ração (66,7%); estando os restantes segmentados entre parcerias com entidades governamentais e privados, oferta de subsídios e qualidade de água. A partir do contexto, foi possível verificar que as unidades produtoras de alevinos visitadas encontram-se carentes de informações técnicas, mesmo que sejam oferecidos serviços de assistência técnica, a qual ainda é incipiente e não especializada, visto que se trata de um fator fundamental para a evolução dos empreendimentos no sistema, ao passo em que a cadeia produtiva de peixes tropicais tem sido encarada como um importante elo para o desenvolvimento da piscicultura na região, onde possíveis ajustes nos campos de gestão e planejamento, aliado ao suporte técnico, poderiam garantir a sustentabilidade da produção. 

Prevalence of hereditary risk factors for thrombophilia in Belém, Brazilian Amazon

Different risk factors for venous thromboembolism (VTE) have been identified, including hereditary abnormalities in the mechanisms of coagulation and fibrinolysis. We investigated five genetic polymorphisms (FVL G1691A, FII G20210A, MTHFR C677T, TAFI A152G and TAFI T1053C) associated with VTE in individuals from the city of Belém in the Brazilian Amazon who had no history of VTE. No significant difference was found between the observed and expected genotype frequencies for the loci analyzed. We found high frequencies of MTHFR C677T (33.9%) and TAFI T1053C (74%) and low frequencies of FVL (1.6%), FII G20210A (0.8%) and TAFI A152G (0.8%). The FVL G1691A, FII G20210A and MTHFR C677T frequencies were similar to those for European populations and populations of European descent living in the city of Ribeirão Preto in the Brazilian state of São Paulo. The frequency of the two TAFI mutations in the Belém individuals was not significantly different from that described for individuals from Ribeirão Preto. We suggest that the risks for VTE in the population of Belém are of the same magnitude as that observed in European populations and in populations with an expressive European contribution

Distribution of CCR5- 32, CCR2-64I, and SDF1-3 A Mutations in Populations from the Brazilian Amazon Region

The frequency distribution of the CCR5- 32, CCR2-64I, and SDF1-3 A alleles was studied in the urban population of Bele´m and in Afro- Brazilians, Amerindians, and Japanese immigrants in the state of Para´, Brazil. The results suggest that Amerindians may be genetically more susceptible to HIV-1 infection and disease progression than the other human groups studied

Myxobolus marajoensis sp. n. (Myxosporea: Myxobolidae), parasita do bagre de água doce Rhamdia quelen da região da Amazônia brasileira

This study provides morphological and molecular data of a new parasite species found in the muscle layer of the intestinal tract of the South American silver catfish, Rhamdia quelen from Marajó Island region (Pará State, Brazil), an important fishery resource with recognized potential for fish farming. The morphology of these parasites was reanalyzed and phylogenetic analyses were run on their 18S rDNA gene sequences. The spores were morphologically distinct from those of other Myxobolus species described previously. The obtained partial sequence of the 18S rDNA gene sequences of the new species were compared to those of 24 other Myxobolus and Henneguya species available in GenBank. The results of morphological and molecular analyses indicated clearly the existence of a new species, Myxobolus marajoensis sp. n.Este estudo fornece dados morfológicos e moleculares de um novo parasita encontrado na parede intestinal do jandiá, Rhamdia quelen coletado na região da ilha do Marajó (Estado do Pará, Brasil), um importante recurso pesqueiro com potencial para aquicultura. Foram realizadas comparações morfológicas deste parasita e análises filogenéticas da região do gene 18S rDNA sequenciada. Os esporos foram morfologicamente distintos das espécies de outros Myxobolus descritos anteriormente. A sequência parcial obtida do gene 18S rDNA da nova espécie foi comparada com outras 24 espécies de Myxobolus e Henneguya retiradas do GenBank. Os resultados de análises morfológica e molecular indicaram claramente a existência de uma nova espécie, Myxobolus marajoensis sp. n

High genetic diversity and connectivity in Colossoma macropomum in the Amazon basin revealed by microsatellite markers

Colossoma macropomum is the second largest scaled fish of the Amazon. It is economically important for commercial fisheries and for aquaculture, but few studies have examined the diversity and genetic structure of natural populations of this species. The aim of this study was to investigate the levels of genetic variability and connectivity that exist between three natural populations of C. macropomum from the Amazon basin. In total, 247 samples were collected from the municipalities of Tefé, Manaus, and Santarém. The populations were genotyped using a panel of 12 multiplex microsatellite markers. The genetic diversity found in these populations was high and similar to other populations described in the literature. These populations showed a pattern of high gene flow associated with the lack of a genetic structure pattern, indicating that the number of migrants per generation and recent migration rates are high. The values of the FST, RST, and exact test of differentiation were not significant for pairwise comparisons between populations. The Bayesian population clustering analysis indicated a single population. Thus, the data provide evidence for high genetic diversity and high gene flow among C. macropomum populations in the investigated region of the Amazon basin. This information is important for programs aiming at the conservation of natural populations

High genetic diversity and connectivity in Colossoma macropomum in the Amazon basin revealed by microsatellite markers

Abstract Colossoma macropomum is the second largest scaled fish of the Amazon. It is economically important for commercial fisheries and for aquaculture, but few studies have examined the diversity and genetic structure of natural populations of this species. The aim of this study was to investigate the levels of genetic variability and connectivity that exist between three natural populations of C. macropomum from the Amazon basin. In total, 247 samples were collected from the municipalities of Tefé, Manaus, and Santarém. The populations were genotyped using a panel of 12 multiplex microsatellite markers. The genetic diversity found in these populations was high and similar to other populations described in the literature. These populations showed a pattern of high gene flow associated with the lack of a genetic structure pattern, indicating that the number of migrants per generation and recent migration rates are high. The values of the FST, RST, and exact test of differentiation were not significant for pairwise comparisons between populations. The Bayesian population clustering analysis indicated a single population. Thus, the data provide evidence for high genetic diversity and high gene flow among C. macropomum populations in the investigated region of the Amazon basin. This information is important for programs aiming at the conservation of natural populations

Genetic variability of tambaqui broodstocks in the Brazilian state of Pará

The present study evaluated the genetic variability of the broodstocks of tambaqui hatcheries in the Brazilian state of Pará. Samples were obtained from the caudal fin of 110 broodstocks from one hatchery in each of four municipalities (Santarém, Peixe-Boi, Breu-Branco, and Ulianópolis), representing all the individuals of each hatchery stock. The samples were genotyped using the multiplex system microsatellite markers. Data were used to calculate observed and expected heterozygosity, number of alleles per locus, and allelic richness. The effective population size and inbreeding coefficient were also calculated. The genetic differentiation between populations was evaluated by using FST, and population structuring by the most likely number of genetically homogenous populations and Unweighted Pair Group Method (UPGMA); the arithmetic means were based on Nei’s. The indices indicated a loss of genetic variability in the broodstocks from Ulianópolis, Peixe-Boi, and Breu-Branco in comparison with wild tambaqui populations, although this was not apparent in the Santarém stock. A moderate level of genetic differentiation was found among the tambaqui broodstocks based on the FST estimates, which were reinforced by the structuring found in the Bayesian analysis and UPGMA. This reflects the domestication process, given that no such structuring is found in natural tambaqui populations. This moderate genetic differentiation associated with the loss of genetic variability found in the four tambaqui broodstocks from the state of Pará provides important insights for the development of future programs of genetic improvement, as well as the conservation of the genetic diversity of these stock