Detection and epidemiological analysis of animal emerging diseases for control purpose: how to take up the challenge?

The presentation first presents the global framework for the study of emerging diseases aiming at disease control, sanitary crises avoidance and promotion of sustainable agriculture. Then, the different stages, methods and tools that are needed for emerging disease study are presented. These can be either available, under development or awaiting for research studies. They mainly concern information system, biomathematics, epidemiology and molecular biology. Finally, some of the main organizational principles (synergy between health protagonists) are introduced. These principles have to be realized if we want to reach an efficient vigilance towards potentially emerging diseases and to take up the challenge that is facing animal populations and human societies en route for globalization.La communication présente d'abord le cadre global de l'étude des maladies émergentes à des fins de contrôle, d'évitement des crises sanitaires et de promotion de l'agriculture durable. Sont ensuite présentés les différentes étapes, méthodes et outils existants, en cours de mise au point ou nécessitant un travail de recherche (en matière de systèmes d'information, de biomathématiques, d'épidémiologie et de biologie moléculaire), en vue d'être utilisés dans l'étude des émergences. Au bout du compte, sont posés quelques principes d'organisation (synergies entre les acteurs du sanitaire) qui seraient à concrétiser pour aboutir à une vigilance efficace vis à vis des maladies potentiellement émergentes et pouvoir relever au mieux le défi qu'elles posent aux sociétés animales et humaines en voie de globalisation

Lyme borreliosis in Europe.

Despite improvements in prevention, diagnosis and treatment, Lyme borreliosis (LB) is still the most common arthropod-borne disease in temperate regions of the northern hemisphere, with risk of infection associated with occupation (e.g. forestry work) and certain outdoor recreational activities (e.g. mushroom collecting). In Europe, LB is caused by infection with one or more pathogenic European genospecies of the spirochaete Borrelia burgdorferi sensu lato, mainly transmitted by the tick Ixodes ricinus. Recent surveys show that the overall prevalence of LB may be stabilising, but its geographical distribution is increasing. In addition, much remains to be discovered about the factors affecting genospecific prevalence, transmission and virulence, although avoidance of tick bite still appears to be the most efficient preventive measure. Uniform, European-wide surveillance programmes (particularly on a local scale) and standardisation of diagnostic tests and treatments are still urgently needed, especially in the light of climate change scenarios and land-use and socio-economic changes. Improved epidemiological knowledge will also aid development of more accurate risk prediction models for LB. Studies on the effects of biodiversity loss and ecosystem changes on LB emergence may identify new paradigms for the prevention and control of LB and other tick-borne diseases

Genetic diversity of Anaplasma Phagocytophilum, the causative agent of granulocytic anaplasmosis, implications for epidemiology and control in france

Anaplasma phagocytophilum is a tick-borne bacterium and the etiologic agent of granulocytic anaplasmosis, an emerging disease that affects a wide range of mammals. In this paper, we present the recent knowledge gained from studies on the genetic diversity of this pathogen in France. Multilocus sequence analysis (MLSA) was used to characterize the genetic diversity of A. phagocytophilum in populations of French cattle, horses, dogs, and roe deer. MLSA was based on nine loci (ankA, msp4, groESL, typA, pled, gyrA, recG, polA, and an intergenic region). Phylogenic analysis revealed three genetic clusters of bacterial variants in domesticated animals. The two principal clusters included 98% of the bacterial genotypes found in cattle, which were only distantly related to those in roe deer. One cluster comprised only cattle genotypes, while the second contained genotypes from cattle, horses, and dogs. The third contained all roe deer genotypes and three cattle genotypes. These results suggest that roe deer do not contribute to the spread of A. phagocytophilum in cattle in France. A Multiple-Locus Variable number tandem repeat (VNTR) Analysis typing technique was developed for A. phagocytophilum. Five VNTRs were selected based on the HZ human-derived strain genome, and were tested on the Webster human-derived strain and on 123 DNA samples. This study confirmed that A. phagocytophilum from roe deer or domestic ruminants belong to two different clusters, while A. phagocytophilum from red deer and domestic ruminants locate within the same cluster, questioning the respective roles of roe vs red deer as reservoir hosts for domestic ruminant strains in Europe. The molecular techniques recently developed have great potential to provide detailed information on A. phagocytophilum isolates,improving both epidemiological and phylogenic investigations, thereby helping in the development of relevant prevention and control measures.A. phagocytophilum, bactérie transmise par les tiques, est responsable de l’anaplasmose granulocytaire, une maladie émergente qui infecte une large gamme de mammifères dont l’homme. L’objectif de cet article est de présenter les nouvelles connaissances acquises sur la diversité génétique d’A. phagocytophilum chez différentes espèces d’hôtes en France, afin de déterminer quelles espèces participent au même cycle épidémiologique. Une analyse par séquençage multi-locus (MLSA) a été effectuée dans des populations de bovins, chevaux, chiens et chevreuils. Trois groupes de génotypes infectant les bovins ont été identifiés. Les deux groupes principaux incluent 98% des génotypes bactériens trouvés chez les bovins et sont éloignés de ceux des chevreuils. Un cluster ne comprenait que les génotypes de bovins, tandis que le second génotype contenant des bovins comprenait également des chevaux et des chiens. Le troisième cluster contenait tous les génotypes de chevreuils et trois génotypes de bovins. Ces résultats suggèrent que les chevreuils ne contribuent pas à la propagation d’A. phagocytophilum chez les bovins en France. Puis, une technique MLVA (Multiple Loci VNTR Analysis) a été développée pour A. phagocytophilum. Cinq VNTR ont été sélectionnés sur la base du génome de la souche d’origine humaine HZ, et ont été testés sur 123 échantillons d’ADN provenant d’animaux domestiques ou sauvages. Cette étude a confirmé que les souches d’A. phagocytophilum retrouvées chez les chevreuils et les ruminants domestiques appartiennent à deux groupes différents, alors que les souches identifiées chez les cerfs et les ruminants domestiques sont localisées dans le même cluster. Ces résultats remettent en question les rôles respectifs des chevreuils et des cerfs comme hôtes réservoirs pour les souches d’A. phagocytophilum de ruminants domestiques en Europe. Ces techniques moléculaires ont un grand potentiel pour améliorer nos connaissances sur les cycles épidémiologiques d’A. phagocytophilum, contribuant ainsi à l’élaboration de mesures de prévention et de contrôle pertinents

Detecting Emerging Diseases in Farm Animals through Clinical Observations

Clinical observations will allow early detection of emerging diseases in animal to enhance response time and capabilities

Unité d’Epidémiologie Animale, who are we ? What are we doing? What are our research on tick and tick-borne diseases ?

International audienc

Biodiversity and animal breeding : friends or foes for infectious diseases?

International audienc

Distribution of ticks (and tick-borne diseases) in relation to climate change. Illustration with soft and hard ticks

International audienc

Importance de la circulation d’agents pathogènes entre faune sauvage et domestique dans l’émergence de maladies

National audienc