La tique dure Amblyomma variegatum (Acari, Ixodidae) à Madagascar : détermination de seuils de température pour la métamorphose de la nymphe gorgée en adulte

Depuis les 30 dernières années, la tique tropicale Amblyomma variegatum (Acari, Ixodidae) a étendu sa répartition sur les Hauts plateaux de Madagascar. Le contrôle des populations d'Amblyomma variegatum et des maladies associées (cowdriose et dermatophilose) serait plus facile si nous étions capables de prédire la répartition de la tique dans différents environnements. Un modèle de dynamique de population du stade nymphal au stade adulte a été élaboré pour étudier les effets de la température sur le développement de la tique. Des nymphes gorgées ont été placées dans des cages à 6 altitudes différentes et la température a été mesurée toutes les 15 minutes sur chaque site. Les taux de métamorphose de la tique ont été modélisés selon des temps d'attentes température-dépendants, en utilisant les données obtenues sur les Hauts Plateaux de Madagascar. Par une approche bayésienne et un algorithme de simulation Monte Carlo de chaînes de Markov (MCMC), nous avons déterminé les paramètres seuils de température définissant la métamorphose nymphale d'Amblyomma variegatum. Les résultats ont montré que les conditions actuelles de température à Madagascar sont convenables pour la tique, même aux altitudes les plus élevées auxquelles l'élevage bovin est pratiqué (jusqu'à environ 2000 m), bien qu'elles puissent diminuer le taux de métamorphose et probablement augmenter le taux de mortalité. Toutes les zones d'élevage sont donc maintenant exposées au risque d'infestation par Amblyomma variegatum, hormis les régions les plus arides du sud-ouest malgache. Concernant les paramètres contrôlant la métamorphose nymphale d'Amblyomma variegatum, la température de l'air permettant la métamorphose a été estimée à 1,0°C (IC 95% = [0,5 ; 1,5]) ; d'autre part, pour que la métamorphose puisse se produire, le cumul minimal au-dessus de ce seuil a été estimé à 442° Celsius * jours (IC 95% = [428 ; 456]). Des recherches supplémentaires sur les relations entre la température et la métamorphose des nymphes sont attendues pour que le modèle de prédiction puisse évaluer le risque potentiel d'expansion de la tique

Inferring within-flock transmission dynamics of highly pathogenic avian influenza H5N8 virus in France, 2020.

Following the emergence of highly pathogenic avian influenza (H5N8) in France in early December 2020, we used duck mortality data from the index farm to investigate within-flock transmission dynamics. A stochastic epidemic model was fitted to the daily mortality data and model parameters were estimated using an approximate Bayesian computation sequential Monte Carlo (ABC-SMC) algorithm. The model predicted that the first bird in the flock was infected 5 days (95% credible interval, CI: 3-6) prior to the day of suspicion and that the transmission rate was 4.1 new infections per day (95% CI: 2.8-5.8). On average, ducks became infectious 4.1 h (95% CI: 0.7-9.1) after infection and remained infectious for 4.3 days (95% CI: 2.8-5.7). The model also predicted that 34% (50% prediction interval: 8%-76%) of birds would already be infectious by the day of suspicion, emphasizing the substantial latent threat this virus could pose to other poultry farms and to neighbouring wild birds. This study illustrates how mechanistic models can help provide rapid relevant insights that contribute to the management of infectious disease outbreaks of farmed animals. These methods can be applied to future outbreaks and the resulting parameter estimates made available to veterinary services within a few hours

La tique dure Amblyomma variegatum (Acari, Ixodidae) à Madagascar (détermination de seuils de température pour la métamorphose de la nymphe gorgée en adulte)

Depuis les 30 dernières années, la tique tropicale Amblyomma variegatum (Acari, Ixodidae) a étendu sa répartition sur les Hauts plateaux de Madagascar. Le contrôle des populations d'Amblyomma variegatum et des maladies associées (cowdriose et dermatophilose) serait plus facile si nous étions capables de prédire la répartition de la tique dans différents environnements. Un modèle de dynamique de population du stade nymphal au stade adulte a été élaboré pour étudier les effets de la température sur le développement de la tique. Des nymphes gorgées ont été placées dans des cages à 6 altitudes différentes et la température a été mesurée toutes les 15 minutes sur chaque site. Les taux de métamorphose de la tique ont été modélisés selon des temps d'attentes température-dépendants, en utilisant les données obtenues sur les Hauts Plateaux de Madagascar. Par une approche bayésienne et un algorithme de simulation Monte Carlo de chaînes de Markov (MCMC), nous avons déterminé les paramètres seuils de température définissant la métamorphose nymphale d'Amblyomma variegatum. Les résultats ont montré que les conditions actuelles de température à Madagascar sont convenables pour la tique, même aux altitudes les plus élevées auxquelles l'élevage bovin est pratiqué (jusqu'à environ 2000 m), bien qu'elles puissent diminuer le taux de métamorphose et probablement augmenter le taux de mortalité. Toutes les zones d'élevage sont donc maintenant exposées au risque d'infestation par Amblyomma variegatum, hormis les régions les plus arides du sud-ouest malgache. Concernant les paramètres contrôlant la métamorphose nymphale d'Amblyomma variegatum, la température de l'air permettant la métamorphose a été estimée à 1,0C (IC 95% = [0,5 ; 1,5]) ; d'autre part, pour que la métamorphose puisse se produire, le cumul minimal au-dessus de ce seuil a été estimé à 442 Celsius * jours (IC 95% = [428 ; 456]). Des recherches supplémentaires sur les relations entre la température et la métamorphose des nymphes sont attendues pour que le modèle de prédiction puisse évaluer le risque potentiel d'expansion de la tique.TOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocSudocFranceF

The percentage of indication of clinical signs suggestive of ASF by the farmers who indicated that they did not know the clinical signs (<i>n</i> = 36, dark grey) and the farmers who claimed to know the clinical signs (<i>n</i> = 73, light grey).

<p>The percentage of indication of clinical signs suggestive of ASF by the farmers who indicated that they did not know the clinical signs (<i>n</i> = 36, dark grey) and the farmers who claimed to know the clinical signs (<i>n</i> = 73, light grey).</p

Duck production systems and highly pathogenic avian influenza H5N8 in France, 2016–2017

In winter 2016–2017, Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI) H5N8 virus spread across Europe, causing unprecedented epizootics. France was massively affected, resulting in the culling of over 6 million poultry. Boosted regression tree (BRT) models were used to quantify the association between spatial risk factors and HPAI H5N8 infection in poultry holdings and to generate predictive maps for HPAI infection. Three datasets were combined to build the model: a dataset of the reported outbreaks in poultry, a dataset of the poultry holdings where the virus has not been reported and a set of relevant spatial risk factors, including poultry production and trade, and water bird habitat. Results identified key associations between the ‘foie gras’ production systems and HPAI H5N8 risk of occurrence and indicate that strengthening surveillance of fattening duck production systems and making the transportation of fattening ducks more secure would be key priority options for HPAI prevention and control.SCOPUS: ar.jinfo:eu-repo/semantics/publishe

What can phylodynamics bring to animal health research?

International audienceInfectious diseases are a major burden to global economies, and public and animal health. To date, quantifying the spread of infectious diseases to inform policy making has traditionally relied on epidemiological data collected during epidemics. However, interest has grown in recent phylodynamic techniques to infer pathogen transmission dynamics from genetic data. Here, we provide examples of where this new discipline has enhanced disease management in public health and illustrate how it could be further applied in animal health. In particular, we describe how phylodynamics can address fundamental epidemiological questions, such as inferring key transmission parameters in animal populations and quantifying spillover events at the wildlife-livestock interface, and generate important insights for the design of more effective control strategies.Highlights: Phylodynamics, an increasingly popular statistical framework to infer pathogen transmission dynamics from genetic data, remains overlooked in animal health research. This restricts our ability to design more effective disease control strategies. Phylodynamics can be valuable when investigating the determinants of disease spread, allowing the better targeting of animal populations for disease control and reducing the impact of epidemics. The wildlife–livestock–human interface is critical for disease emergence; thus, promoting phylodynamics at this interface should improve our ability to manage complex epidemics. There is a critical need to improve capacity-building efforts for infectious disease detection in hard-to-sample populations, such as wildlife. Collaborative efforts are needed to make genetic data publicly available in a timely manner during animal disease outbreaks

Risk factor variables statistically significantly associated with the outcome variable “I would immediately report ASF if I suspected ASF on my farm” in the multivariable analysis (p < 0.05).

<p>Risk factor variables statistically significantly associated with the outcome variable “I would immediately report ASF if I suspected ASF on my farm” in the multivariable analysis (p < 0.05).</p