Épidémiologie moléculaire des avipoxvirus chez l’Outarde houbara

L’Outarde houbara (Chlamydotis undulata et Chlamydotis macqueenii), dont les populations sont en déclin, fait l’objet d’élevages conservatoires en Afrique du Nord, Asie centrale et Moyen Orient. Des épisodes de variole aviaire y sont régulièrement rapportés malgré une vaccination systématique. En nous appuyant sur une approche épidémiologique et moléculaire, nous avons montré que cette maladie, fréquemment observée dans ces élevages, présente des fluctuations saisonnières et est causée par une grande diversité d’avipoxvirus. L’évaluation de ses impacts sur les performances de reproduction des oiseaux a révélé qu’ils sont minimes. Cependant, l’étude de la phylogénie et de l’évolution de ces virus, en montrant des introductions répétées de virus dans les élevages, a prouvé que les avipoxvirus sont un risque pour les projets de conservation. Enfin, un modèle d’infection expérimentale, développé chez l’Outarde houbara, permet d’envisager de futurs travaux de recherche sur les avipoxvirus. ABSTRACT : The Houbara Bustard (Chlamydotis undulata and Chlamydotis macqueenii), whose populations are declining, is captive-bred for conservation purposes in North Africa, Central Asia and the Middle East. Avian pox is regularly reported in captive-bred birds despite systematic vaccination. By using epidemiological and molecular approaches, we showed that the disease, caused by a wide diversity of avipoxviruses in captive-bred houbara bustards, is frequently reported in captive-flocks, and seasonal variations of incidence are observed. Impacts assessment of the disease on breeding performances has shown they are very limited. However, the study of avipoxviruses phylogeny and evolution has demonstrated repeated virus introductions in captive-flock and thus, prove that avipoxviruses are a risk for conservation projects. Finally, an experimental model developed in the Houbara Bustard offers further opportunities of research on avipoxviruses

Aspergillus fumigatus in Poultry

Aspergillus fumigatus remains a major respiratory pathogen in birds. In poultry, infection by A. fumigatus may induce significant economic losses particularly in turkey production. A. fumigatus develops and sporulates easily in poor quality bedding or contaminated feedstuffs in indoor farm environments. Inadequate ventilation and dusty conditions increase the risk of bird exposure to aerosolized spores. Acute cases are seen in young animals following inhalation of spores, causing high morbidity and mortality. The chronic form affects older birds and looks more sporadic. The respiratory tract is the primary site of A. fumigatus development leading to severe respiratory distress and associated granulomatous airsacculitis and pneumonia. Treatments for infected poultry are nonexistent; therefore, prevention is the only way to protect poultry. Development of avian models of aspergillosis may improve our understanding of its pathogenesis, which remains poorly understood

Episode H5N8 d'influenza aviaire en France en 2016-2017 : quel rôle pour la faune sauvage ?

L'influenza aviaire (IA) est une menace permanente, qui arrive parfois en Europe par le biais des oiseaux migrateurs. Un dispositif de surveillance est en place en permanence pour surveiller les mortalités dans l'avifaune, et particulièrement celles des oiseaux d'eau migrateurs. En octobre 2016, un épisode d'IA H5N8 qui était surveillé depuis sa survenue en République de Touva (Fédération de Russie, avril 2016) s'est déclaré en Europe. Il a entraîné des pertes conséquentes dans certaines populations d'oiseaux sauvages en Europe, ainsi que dans des filières avicoles. La situation en France s'est révélée paradoxale : l'atteinte a été majeure dans la filière avicole de canards gras du Sud- Ouest, mais les cas dans la faune sauvage sont restés peu nombreux et circonscrits. Ce n'est pas faute d'avoir renforcé la surveillance, soit événementielle (analyse des oiseaux trouvés morts) soit active autour des foyers domestiques. Plus de 800 cadavres d'oiseaux sauvages ont été analysés, dont beaucoup d'anatidés, 90 ont été détectés infectés regroupés en 55 cas dans l'avifaune libre et captive, et dix sites stratégiques ont fait l'objet d'une recherche intensifiée des cadavres et n'ont permis de trouver aucun cas positif supplémentaire. Plus de 300 oiseaux commensaux des élevages domestiques foyers ont été analysés et se sont tous révélés négatifs. Les performances du système de surveillance ne semblent pas pouvoir être mises en cause, et il apparaît donc qu'il y a bien eu des différences de circulation du virus par rapport à nos voisins d'outre-Rhin, mal expliquées à ce stade mais la situation en France est similaire à celle observée en Italie et en Espagne cet hiver, et correspond assez bien à l'épisode H5N8 qui avait circulé en Europe fin 2014/début 2015, sans toucher la France. (Résumé d'auteur

Molecular epidemiology of avipoxviruses in the Houbara Bustard

L’Outarde houbara (Chlamydotis undulata et Chlamydotis macqueenii), dont les populations sont en déclin, fait l’objet d’élevages conservatoires en Afrique du Nord, Asie centrale et Moyen Orient. Des épisodes de variole aviaire y sont régulièrement rapportés malgré une vaccination systématique. En nous appuyant sur une approche épidémiologique et moléculaire, nous avons montré que cette maladie, fréquemment observée dans ces élevages, présente des fluctuations saisonnières et est causée par une grande diversité d’avipoxvirus. L’évaluation de ses impacts sur les performances de reproduction des oiseaux a révélé qu’ils sont minimes. Cependant, l’étude de la phylogénie et de l’évolution de ces virus, en montrant des introductions répétées de virus dans les élevages, a prouvé que les avipoxvirus sont un risque pour les projets de conservation. Enfin, un modèle d’infection expérimentale, développé chez l’Outarde houbara, permet d’envisager de futurs travaux de recherche sur les avipoxvirus.The Houbara Bustard (Chlamydotis undulata and Chlamydotis macqueenii), whose populations are declining, is captive-bred for conservation purposes in North Africa, Central Asia and the Middle East. Avian pox is regularly reported in captive-bred birds despite systematic vaccination. By using epidemiological and molecular approaches, we showed that the disease, caused by a wide diversity of avipoxviruses in captive-bred houbara bustards, is frequently reported in captive-flocks, and seasonal variations of incidence are observed. Impacts assessment of the disease on breeding performances has shown they are very limited. However, the study of avipoxviruses phylogeny and evolution has demonstrated repeated virus introductions in captive-flock and thus, prove that avipoxviruses are a risk for conservation projects. Finally, an experimental model developed in the Houbara Bustard offers further opportunities of research on avipoxviruses

Diagnostic sérologique de l'aspergillose chez les oiseaux

L'aspergillose est une maladie fréquente chez les oiseaux. Son diagnostic clinique est très difficile et peu d'examens complémentaires permettent un diagnostic de certitude. Le galactomannane, polysaccharide constituant de la paroi d'Aspergillus fumigatus, est l'antigène dont la détection par ELISA (Plateliâ Aspergillus) permet le diagnostic de l'aspergillose invasive humaine. Nous avons recherché la présence de galactomannane dans 123 sérums provenant de 116 oiseaux prélevés soit pour un dépistage soit parce qu'ils étaient suspects d'aspergillose. Pour chaque sérum, une recherche d'anticorps précipitants par électrosynérèse a aussi été effectuée. Le but de cette étude était d'évaluer la valeur diagnostique de test ELISA Plateliâ ainsi que son intérêt dans le suivi clinique de l'aspergillose pour l'échantillon étudié. A partir des signes cliniques et des résultats de l'électrosynérèse, 3 groupes d'oiseaux ont été constitués : le groupe A (aspergillose très probable), le groupe B (aspergillose possible), le groupe C (aspergillose peu probable). En supposant que les oiseaux du groupe A soient malades et ceux du groupe C indemnes, il nous a été possible de calculer la sensibilité et la spécificité du test ELISA Platelia® (30% et 86%) pour ces oiseaux. Etant donné la faible sensibilité du test pour l'échantillon étudié ce test ne serait pas intéressant, utilisé seul, pour le diagnostic de l'aspergillose chez les oiseaux. Trop peu d'oiseaux ont été prélevés plusieurs fois et le test Plateliâ n'a pu être évalué dans le cadre du suivi thérapeutique. Le test Platelia® serait en revanche intéressant pour diagnostiquer des cas d'aspergillose avant les premières manifestations cliniques puisque 8 oiseaux prélevés pour un dépistage ont eu un résultat positif à l'ELISA. Enfin, nous avons pu observer que les oiseaux présentant des signes d'aspergillose invasive ont plus souvent un résultat positif au test Plateliâ (45%) que les oiseaux présentant uniquement des signes d'aspergillose respiratoire (23%). Le test Platelia® serait donc plus indiqué pour le diagnostic de l'aspergillose invasive que pour celui des formes localisées. D'autre part un test statistique nous a permis de démontrer que les résultats de l'électrosynérèse et ceux du test ELISA étaient indépendants.MAISONS-ALFORT-Ecole Vétérin (940462302) / SudocSudocFranceF

Exposure assessment for avian influenza and Newcastle disease viruses from peridomestic wild birds in a conservation breeding site in the United Arab Emirates

International audienceWorldwide, wild birds are frequently suspected to be involved in the occurrence of outbreaks of different diseases in captive-bred birds although proofs are lacking and most of the dedicated studies are insufficiently conclusive to confirm or characterize the roles of wild birds in such outbreaks. The aim of this study was to assess and compare, for the most abundant peridomestic wild birds, the different exposure routes for avian influenza and Newcastle disease viruses in conservation breeding sites of Houbara bustards in the United Arab Emirates. To do so, we considered all of the potential pathways by which captive bustards could be exposed to avian influenza and Newcastle disease viruses by wild birds, and ran a comparative study of the likelihood of exposure via each of the pathways considered. We merged data from an ecological study dedicated to local wild bird communities with an analysis of the contacts between wild birds and captive bustards and with a prevalence survey of avian influenza and Newcastle disease viruses in wild bird populations. We also extracted data from an extensive review of the scientific literature and by the elicitation of expert opinion. Overall, this analysis highlighted those captive bustards had a high risk of being exposed to pathogens by wild birds. This risk was higher for Newcastle disease virus than avian influenza virus, and House sparrows represented the riskiest species for the transmission of both viruses through direct exposure from direct contact with an infectious bird that got inside the aviary and indirect exposure from consumption of water contaminated from the faeces of an infected bird that got inside the aviary for Newcastle disease virus and avian influenza virus, respectively. These results also reaffirm the need to implement biosecurity measures to limit contacts between wild and captive birds and highlight priority targets for a thoughtful and efficient sanitary management strategy

Quantification and characterisation of commensal wild birds and their interactions with domestic ducks on a free-range farm in southwest France

The role of commensal birds in the epidemiology of pathogens in poultry farms remains unclear. Our study aimed to identify potential key species for interactions with domestic ducks on one free-range duck farm in southwest France. Methods combined direct individual observations on duck outdoor foraging areas, network analysis, and general linear mixed models of abundances. Results showed a wide diversity of wild bird species visiting foraging areas, heavily dominated in frequency by White wagtails (Motacilla alba) and Sparrows (Passer domesticus and Passer montanus). These also were the only species seen entering duck premises or perching on drinkers in the presence of ducks. Moreover, White wagtails were the species most frequently observed on the ground and in close proximity to ducks. Network analysis suggested the role of White wagtails and Sparrows in linking ducks to other wild birds on the farm. The abundance of White wagtails was positively associated with open vegetation, with the presence of ducks and particularly in the afternoon, while the abundance of Sparrows was positively associated only with the fall-winter season. By precisely characterising interactions, the study was able to identify few wild bird species which should be prioritized in infectious investigations at the interface with poultry.ISSN:2045-232

Risk of Anticoagulant Rodenticide Exposure for Mammals and Birds in Parc National des Pyrénées, France

International audienceThe extensive use of anticoagulant rodenticides (ARs) to control rodent populations poses intoxication risks for wildlife: persistence of ARs in rodents can cause secondary exposure and poisoning of predators or scavengers. We investigated risk factors for wildlife exposure to ARs in the Parc National des Pyrenees (PNP), France, using a multivariable logistic regression analysis. A total of 157 liver samples were collected from carcasses of 10 mammal and three bird species found in the PNP between 2010 and 2018 and screened for presence of AR residues. First- and second-generation ARs were detected in more than 60% of red fox (Vu/pes vulpes) and stone marten (Martes foina) samples and in around 40% of wild cat (Fells silvestris), European pine marten (Martes martes), American mink (Neovison vison), and Eurasian Buzzard (Buteo buteo) samples. Wildlife exposure to ARs was significantly associated with species having a regular consumption of small mammals (odds ratio [OR]: 2.5, 95% confidence interval [CI]: 1.1-5.8) being collected in the Ossau valley (OR: 2.5, 95% CI: 1.1-6.1) and between 2013 and 2015 (OR: 4.8, 95% CI: 2.0-11.7). We identified wild species that could be targeted for risk-based surveillance program for AR secondary exposure and determined high risk areas in which alternative measures should be applied for rodent control

Detection of circulating serum galactomannan for the diagnosis of avian aspergillosis

National audienc