anotação e versatilidade dos recursos para PLE

UIDB/03213/2020 UIDP/03213/2020The automatic diagnosis and analysis of the production of foreign language learners can contribute to overcome linguistic barriers that hinder the integration of migrant populations. The richness and complexity of the phenomena observed in this context and the multiplicity of objectives served by automatic analysis tools demonstrate the inevitability of manual annotation of data and the importance of producing versatile resources, in order to maximize their usability. The present study aims, therefore, to contrast the needs of automatic diagnosis systems and the analysis of the phenomena reflected in the annotations for European Portuguese, based on COPLE2 and the corpora analysis conducted within the scope of the POR Nível project, proposing a system of annotation that includes error annotation and annotation of structures associated with complexity. The results highlight the need to enhance the usability of resources, to acknowledge their value and to promote the necessary investment in their development.publishersversionpublishe

“O RICO É DA DIREITA PARA CIMA”: MÚLTIPLOS OLHARES SOBRE A PRESENÇA DOS PIVÔS CENTRAIS E A GESTÃO DAS ÁGUAS NO POLO AGRÍCOLA DE MUCUGÊ- IBICOARA, BAHIA

Conhecida por seu patrimônio natural, a Chapada Diamantina, considerada a caixa d´água da Bahia, também desempenha um importante papel no equilíbrio da rede hidrográfica estadual. A motivação deste artigo surgiu em uma das expedições vinculadas ao projeto “Chapada Diamantina: meio ambiente, turismo e desenvolvimento”, mantido pelo Grupo de Pesquisa em Turismo e Meio Ambiente (GPTURIS) da Universidade Salvador – UNIFACS. Naquela oportunidade constatou-se que, a despeito de sua relevância ambiental, a região vivencia um processo de expansão acelerada do agronegócio irrigado se constituindo, atualmente, na maior concentração de pivôs centrais do país. Isto posto, o presente trabalho objetivou compreender a percepção dos moradores dos municípios de Mucugê, Ibicoara e Barra da Estiva sobre as implicações deste cenário para gestão sustentável das águas na região. A reflexão teórica aliada à análise da estrutura fundiária e à pesquisa de campo, baseada em entrevistas semiestruturadas e na aplicação de questionários, permitiram concluir que os pivôs centrais, enquanto parte de um sistema de objetos, são a marca da concentração de terra, do uso de água e de uma organização espacial que reflete a natureza classista da produção. Também ficou evidenciado o desconhecimento, por parte dos entrevistados, do funcionamento da gestão ambiental nos munícipios, bem como da necessidade de participação popular nesse sistema

anotação e versatilidade dos recursos

UID/LIN/03213/2019Automatização no diagnóstico de nível de língua: anotação e versatilidade dos recursos O diagnóstico e a análise automáticos da produção de aprendentes de língua estrangeira são atualmente um tópico de investigação muito relevante na medida em que permitem responder diretamente e de forma mais imediata a necessidades decorrentes das migrações de populações. As técnicas de automatização deste diagnóstico estão em pleno desenvolvimento desde há já alguns anos (Meurers, 2009) e inserem-se, grosso modo, em dois grandes grupos – análise de erro e análise de complexidade –, servindo-se de sistemas mais ou menos complexos do ponto de vista computacional e de processamento (Ripley, 2009; Amaral et al., 2006; Curto et al., 2014; Chen & Meurers, 2019). No entanto, quer as técnicas baseadas em métodos de aprendizagem automática (supervisionada ou não) que extraem/identificam traços relevantes a partir de dados anotados, quer as técnicas de análise multidimensional de vetores de medida de complexidade linguística pressupõem a análise e a anotação manual de dados, seja para construir os corpora de treino e teste necessários aos sistemas de aprendizagem automática, seja para testar e indiretamente informar os sistemas de análise no que respeita aos vetores de complexidade. Apesar disso, os fenómenos e as tipologias de anotação necessárias são distintas: i) anotação de erro: e.g., Ortografia: nasalidade, acentuação; Morfossintaxe: flexão verbal, concordância nominal (projeto Por Nível, CLUNL; COPLE2, Mendes et al., 2016 ). ii) anotação de complexidade: e.g., dimensão média da oração; constituintes coordenados por oração; nomes complexos por oração; rácio de orações subordinadas (projeto SyB, EKUT). Por outro lado, a análise de dados linguísticos de aprendizagem de língua estrangeira, e respetiva compilação e construção de corpora de aprendizagem, pela riqueza e complexidade dos fenómenos que abrangem e pela multiplicidade de objetivos que servem, são em si temas de estudo produtivos e, mais importante ainda, dependentes da(s) língua(s) em análise (por exemplo, Alexandre & Pinto, 2014; Alexandre & Gonçalves, 2015; Antunes & Mendes, 2015; Cabrera & Zubizarreta, 2005; Castelo et al., 2015; Mendes et al., 2016, Talhadas, 2016). É essencialmente a partir desta investigação que os sistemas de anotação são desenhados (Tono, 2003; Nicholls, 2003; Dagneaux et al., 2005). Esta conjugação de fatores demonstra-nos, por um lado, a inevitabilidade da anotação humana dos dados, um processo moroso e dispendioso, e por outro, a importância de garantir a versatilidade dos recursos criados, de modo a maximizar a sua usabilidade e o investimento realizado. A análise dos sistemas de anotação de corpora de aprendizagem e das necessidades dos sistemas automáticos é essencial e implica perceber que formato terá uma anotação que permita viabilizar ambas as técnicas, ou seja, como desenhar o sistema de modo a que este permita uma anotação de erro e de estruturas associadas à complexidade e que permita também associar os dados de produção a níveis de proficiência, de modo a permitir o diagnóstico de nível. A presente comunicação visa, assim, o contraste das necessidades dos sistemas de diagnóstico automático e a análise dos fenómenos refletidos nas atuais anotações para o Português, tendo como base o COPLE2 (Mendes et al., 2016) e os resultados da análise conduzida no âmbito do projeto POR Nível (Gramacho et al., 2018), propondo um sistema de anotação que contemple a anotação de erro (negativa) e a anotação de estruturas associadas à complexidade (positiva). Para além de sistematizar os fenómenos em causa em ambas as estratégias de diagnóstico, o trabalho pretende também potenciar a usabilidade dos recursos, valorizando-os e fomentando o tão necessário investimento no seu desenvolvimento.publishersversionpublishe

Construção e validação de um teste de colocação para o Português Língua Estrangeira–resultados de um estudo-piloto

UID/LIN/03213/2013 UID/LIN/03213/2019Placement tests are a form of assessment that aims at placing students in appropriate levels. Placement tests must, therefore, be based on validity and reliability arguments to ensure appropriateness and consistency of assessment. Despite the growing interest in Portuguese as a Foreign Language (PFL), both nationally and internationally, to our knowledge there is no validated placement test that informs on general language abilities of adult PFL learners across levels. The POR Nível project aims at designing and validating a placement test for PFL adult learners, from A1 to C1 CEFR levels in grammar, vocabulary, listening and reading components. Corpora of written productions of 15 learners of 3 native languages (English, Mandarin and Spanish) from certified exams of PFL provide the empirical basis for items construction. Also, items’ specifications follow national and international guidelines (CEFR, Camões Profile for PFL), validity, reliability and practicality requirements, and also ALTE and ILTA recommendations. The results found thus far will provide empirical ground for item specification in a validated placement test and eventually contribute to the discussion of the contents of PFL teaching programs.publishersversionpublishe

A genome survey of Moniliophthora perniciosa gives new insights into Witches' Broom Disease of cacao

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The basidiomycete fungus <it>Moniliophthora perniciosa </it>is the causal agent of Witches' Broom Disease (WBD) in cacao (<it>Theobroma cacao</it>). It is a hemibiotrophic pathogen that colonizes the apoplast of cacao's meristematic tissues as a biotrophic pathogen, switching to a saprotrophic lifestyle during later stages of infection. <it>M. perniciosa</it>, together with the related species <it>M. roreri</it>, are pathogens of aerial parts of the plant, an uncommon characteristic in the order Agaricales. A genome survey (1.9× coverage) of <it>M. perniciosa </it>was analyzed to evaluate the overall gene content of this phytopathogen.</p> <p>Results</p> <p>Genes encoding proteins involved in retrotransposition, reactive oxygen species (ROS) resistance, drug efflux transport and cell wall degradation were identified. The great number of genes encoding cytochrome P450 monooxygenases (1.15% of gene models) indicates that <it>M. perniciosa </it>has a great potential for detoxification, production of toxins and hormones; which may confer a high adaptive ability to the fungus. We have also discovered new genes encoding putative secreted polypeptides rich in cysteine, as well as genes related to methylotrophy and plant hormone biosynthesis (gibberellin and auxin). Analysis of gene families indicated that <it>M. perniciosa </it>have similar amounts of carboxylesterases and repertoires of plant cell wall degrading enzymes as other hemibiotrophic fungi. In addition, an approach for normalization of gene family data using incomplete genome data was developed and applied in <it>M. perniciosa </it>genome survey.</p> <p>Conclusion</p> <p>This genome survey gives an overview of the <it>M. perniciosa </it>genome, and reveals that a significant portion is involved in stress adaptation and plant necrosis, two necessary characteristics for a hemibiotrophic fungus to fulfill its infection cycle. Our analysis provides new evidence revealing potential adaptive traits that may play major roles in the mechanisms of pathogenicity in the <it>M. perniciosa</it>/cacao pathosystem.</p

Manifestação ocular incomum em paciente com incontinência pigmentar

RESUMO Incontinência pigmentar, também conhecida como síndrome de Bloch-Sulzberger, é uma doença rara de herança dominante ligada ao X cujas manifestações clínicas incluem lesões dermatológicas típicas combinadas com acometimento neurológico, oftalmológico e dentário. Alterações oculares são comuns e variadas, sendo o acometimento da retina o mais frequente e associado a perda visual severa. Foi relatado um caso de uma criança com perda visual grave decorrente de glaucoma, sem alteração retiniana significativa

The mitochondrial genome of the phytopathogenic basidiomycete Moniliophthora perniciosa is 109 kb in size and contains a stable integrated plasmid

We present here the sequence of the mitochondrial genome of the basidiomycete phytopathogenic hemibiotrophic fungus Moniliophthora perniciosa, causal agent of the Witches` Broom Disease in Theobroma cacao. The DNA is a circular molecule of 109103 base pairs, with 31.9 % GC, and is the largest sequenced so far. This size is due essentially to the presence of numerous non-conserved hypothetical ORFs. It contains the 14 genes coding for proteins involved in the oxidative phosphorylation, the two rRNA genes, one ORF coding for a ribosomal protein (rps3), and a set of 26 tRNA genes that recognize codons for all amino acids. Seven homing endonucleases are located inside introns. Except atp8, all conserved known genes are in the same orientation. Phylogenetic analysis based on the cox genes agrees with the commonly accepted fungal taxonomy. An uncommon feature of this mitochondrial genome is the presence of a region that contains a set of four, relatively small, nested, inverted repeats enclosing two genes coding for polymerases with an invertron-type structure and three conserved hypothetical genes interpreted as the stable integration of a mitochondrial linear plasmid. The integration of this plasmid seems to be a recent evolutionary event that could have implications in fungal biology. This sequence is available under GenBank accession number AY376688. (c) 2008 The British Mycological Society. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.CNPqCapesCNPq Regional Genoma ProgramSEAGRImFAPESP[02/09280-1

The mitochondrial genome of the phytopathogenic basidiomycete Moniliophthora perniciosa is 109 kb in size and contains a stable integrated plasmid

We present here the sequence of the mitochondrial genome of the basidiomycete phytopathogenic hemibiotrophic fungus Moniliophthora perniciosa, causal agent of the Witches' Broom Disease in Theobroma cacao. The DNA is a circular molecule of 109103 base pairs, with 31.9 % GC, and is the largest sequenced so far. This size is due essentially to the presence of numerous non-conserved hypothetical ORFs. It contains the 14 genes coding for proteins involved in the oxidative phosphorylation, the two rRNA genes, one ORF coding for a ribosomal protein (rps3), and a set of 26 tRNA genes that recognize codons for all amino acids. Seven homing endonucleases are located inside introns. Except atp8, all conserved known genes are in the same orientation. Phylogenetic analysis based on the cox genes agrees with the commonly accepted fungal taxonomy. An uncommon feature of this mitochondrial genome is the presence of a region that contains a set of four, relatively small, nested, inverted repeats enclosing two genes coding for polymerases with an invertron-type structure and three conserved hypothetical genes interpreted as the stable integration of a mitochondrial linear plasmid. The integration of this plasmid seems to be a recent evolutionary event that could have implications in fungal biology. This sequence is available under GenBank accession number AY3766881121011361152CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQCOORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPESFUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULO - FAPESPsem informaçãosem informação02/09280-

The Mitochondrial Genome Of The Phytopathogenic Basidiomycete Moniliophthora Perniciosa Is 109 Kb In Size And Contains A Stable Integrated Plasmid.

We present here the sequence of the mitochondrial genome of the basidiomycete phytopathogenic hemibiotrophic fungus Moniliophthora perniciosa, causal agent of the Witches' Broom Disease in Theobroma cacao. The DNA is a circular molecule of 109,103 base pairs, with 31.9% GC, and is the largest sequenced so far. This size is due essentially to the presence of numerous non-conserved hypothetical ORFs. It contains the 14 genes coding for proteins involved in the oxidative phosphorylation, the two rRNA genes, one ORF coding for a ribosomal protein (rps3), and a set of 26 tRNA genes that recognize codons for all amino acids. Seven homing endonucleases are located inside introns. Except atp8, all conserved known genes are in the same orientation. Phylogenetic analysis based on the cox genes agrees with the commonly accepted fungal taxonomy. An uncommon feature of this mitochondrial genome is the presence of a region that contains a set of four, relatively small, nested, inverted repeats enclosing two genes coding for polymerases with an invertron-type structure and three conserved hypothetical genes interpreted as the stable integration of a mitochondrial linear plasmid. The integration of this plasmid seems to be a recent evolutionary event that could have implications in fungal biology. This sequence is available under GenBank accession number AY376688.1121136-5

First large-scale study reveals important losses of managed honey bee and stingless bee colonies in Latin America

International audienceOver the last quarter century, increasing honey bee colony losses motivated standardized large-scale surveys of managed honey bees ( Apis mellifera ), particularly in Europe and the United States. Here we present the first large-scale standardized survey of colony losses of managed honey bees and stingless bees across Latin America. Overall, 1736 beekeepers and 165 meliponiculturists participated in the 2-year survey (2016–2017 and 2017–2018). On average, 30.4% of honey bee colonies and 39.6% of stingless bee colonies were lost per year across the region. Summer losses were higher than winter losses in stingless bees (30.9% and 22.2%, respectively) but not in honey bees (18.8% and 20.6%, respectively). Colony loss increased with operation size during the summer in both honey bees and stingless bees and decreased with operation size during the winter in stingless bees. Furthermore, losses differed significantly between countries and across years for both beekeepers and meliponiculturists. Overall, winter losses of honey bee colonies in Latin America (20.6%) position this region between Europe (12.5%) and the United States (40.4%). These results highlight the magnitude of bee colony losses occurring in the region and suggest difficulties in maintaining overall colony health and economic survival for beekeepers and meliponiculturists