Resistência e suscetibilidade diferencial de biótipos de Bidens pilosa e B. subalternans aos herbicidas inibidores da ALS

The frequent application of herbicides in agricultural areas may select resistant biotypes in weed populations, whose biological characteristics influence the speed and patterns of resistance. This research aims to charactere, simultaneously, resistance patterns and differential susceptibility of Bidens pilosa and B. subalternans biotypes to ALS-inhibiting herbicides of the imidazolinone and sulfonylurea chemical groups. Six hairy beggarticks biotypes, four suspected resistant and two known susceptible, were treated with eight rates of chlorimuron-ethyl or imazethapyr, in greenhouse conditions. Percent control and percent fresh weight of the plants were evaluated at 28 days after the application. B. subalternans is less susceptible to ALS-inhibiting herbicides than B. pilosa; B. subalternans biotypes were more resistant than B. pilosa biotypes; there are B. pilosa and B. subalternans biotypes with cross resistance to the ALS-inhibiting herbicides of the sulfonylurea and imidazolinone groups; there are different patterns of cross resistance to the diverse groups of ALS-inhibiting herbicides.A freqüente aplicação de herbicidas em áreas agrícolas pode selecionar resistência em biótipos de plantas daninhas, cujas características biológicas influenciam na velocidade e nos padrões da resistência. Este trabalho foi conduzido com o objetivo de caracterizar, simultaneamente, o padrão de resistência e a susceptibilidade diferencial de biótipos de Bidens pilosa e B. subalternans aos herbicidas inibidores da ALS dos grupos químicos das imidazolinonas e sulfoniluréias. Para tanto, seis biótipos de picão-preto, quatro supostamente resistentes e dois sabidamente suscetíveis, foram submetidos à aplicação de oito doses de chlorimoron-ethyl ou imazethapyr, em condição de casa-de-vegetação. Avaliou-se o controle e a massa fresca percentual das plantas aos 28 dias após a aplicação. B. subalternans é menos suscetível aos herbicidas inibidores da ALS que B. pilosa; os biótipos de B. subalternans mostraram-se mais resistentes que o biótipo de B. pilosa; há ocorrência de biótipos de B. pilosa e B. subalternans com resistência cruzada aos herbicidas inibidores da ALS do grupo das sulfoniluréias e imidazolinonas; há padrões diferenciados de resistência cruzada de picão-preto aos diversos grupos de herbicidas inibidores da ALS.13914

CORE COLLECTION OF COMMON BEAN FORMED FROM TRADITIONAL BRAZILIAN GERMPLASM

O objetivo deste trabalho foi, através de estratégias de análise por modelos multivariado, selecionar acessos tradicionais, compor uma coleção nuclear de feijoeiro comum e avaliar sua representatividade em relação à coleção base de coletas hospedadas no BAG da Embrapa. Utilizando dados de caracterização de 2903 acessos de coletas representando todas as regiões geográficas do Brasil quanto a três descritores morfológicos (cor de semente, tipos de crescimento e tamanho de semente) e quatro descritores ecogeográficos (regiões geográficas, unidades federativas, altitudes e classes de solos), foram selecionados 400 acessos utilizando modelos multivariado aplicados aos dados transformados em valores multibinários. Os acessos amostrados apresentaram similaridade máxima (100,0%) com a coleção tradicional, diversidade fenotípica e heterogeneidade representativa em relação à coleção tradicional. Na coleção nuclear os acessos tradicionais representaram 9,5% dos acessos tradicional e equivalente a 3% dos acessos da coleção base. Com isso conclui-se que é possível formar uma coleção nuclear representativa da coleção base, no que diz respeito à diversidade genética e a conservação de alelos raros

Caracterização genetica de duas especies cripticas de Tomoplagia (Diptera:Tephritidae)

Orientador: Vera Nisaka SolferiniDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaMestrad

A study in an specialist phytophagous, Tomoplagia reticulata (Diptera:Tephritidae), and its host plant, Eremanthus glomerulatus (Asteraceae)

Orientador: Vera Nisaka SolferiniTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Tomoplagia reticulata (Diptera: Tephritidae) é um fitófago especialista em Eremanthus glomerulatus (Asteraceae). Os adultos ovipõem nas inflorescências da planta hospedeira, onde as larvas se desenvolvem. O histórico de coletas de T. reticulata mostra uma grande variação na quantidade de insetos infestando cada indivíduo de E. glomerulatus. A fim de verificar se a variação no número de herbívoros nas populações do hospedeiro é associada a alguma característica química e/ou genética deste, comparamos as variabilidades genética e química entre indivíduos de E. glomerulatus com diferentes níveis de infestação por T. reticulata (cap. 1). Eremanthus glomerulatus tem baixa variabilidade genética, provavelmente associada à distribuição restrita desta espécie. Apesar da distribuição fragmentada, há pouca estruturação entre as populações desta planta, explicada pelo maior fluxo gênico entre ambientes fragmentados em espécies anemocóricas. As características genéticas e químicas de E. glomerulatus não explicam a variação no nível de herbivoria das populações do hospedeiro. No capítulo 2, testamos a hipótese de que fitófagos especialistas apresentam maior diferenciação genética e menor diversidade do que generalistas, comparando o nível de variabilidade e estrutura genética de T. reticulata com o de outros fitófagos com diferentes amplitudes de hospedeiro. As populações de T. reticulata apresentaram baixa variabilidade e grande estruturação genética, o que é associado à distribuição fragmentada da planta hospedeira, que restringe a distribuição das pequenas populações do inseto. No capítulo 3, caracterizamos a composição genética das populações de Tomoplagia reticulata e de T. pallens, uma espécie irmã. Ambas as espécies parasitam E. glomerulatus; T. reticulata ocorre em MG e T. pallens em GO. Há uma zona de contato entre as espécies no Sul de MG, onde elas hibridizam. Ocasionalmente T. pallens chega ao centro de MG (Santana do Riacho), região mais fria. Esta migração provavelmente está associada a anos excepcionalmente quentes.Abstract: Tomoplagia reticulata (Diptera: Tephritidae) is a phytophagous insect which is specialist on Eremanthus glomerulatus (Asteraceae). Adults oviposit in flower heads, where larvae develop. Sampling records for T. reticulata show that there is great variation in the number of insects parasitizing each plant. To verify if this variation is associated with chemical or genetic characteristics of the host plant, we assayed E. glomerulatus' genetic and chemical variability and compared between individuals with different levels of infestation by T. reticulata (chapter 1). Eremanthus glomerulatus has low genetic variability, probably related to its narrow geographic distribution. There is low genetic structure among populations despite its fragmented distribution, due to enhance gene flow in fragmented habitats in anemocoric species. E. glomerulatus' chemical and genetic characteristics don't explain variation in herbivory. In chapter 2, we tested the hypothesis that herbivorous insect species with narrow diet breadth are expected to be more prone to genetic differentiation and lower genetic diversity than insect species with a wider diet breadth, comparing T. reticulata's genetic variability and structure with other phytophagous with different host ranges. Tomoplagia reticulata has low genetic variability and great genetic structure, which is associated with its host fragmented distribution that restricts the distribution of insect populations. In chapter 3, we described genetic composition of Tomoplagia reticulata and T. pallens, a sister species. Both of them parasitize E. glomerulatus; T. reticulata occurs in MG and T. pallens in GO. There is a contact zone between them in southern MG, where they hybridize. Occasionally, T. pallens arrives in the center of MG (Santana do Riacho), a colder region. This migration is probably associated with extremely hot years.DoutoradoGenetica Animal e EvoluçãoDoutor em Genetica e Biologia Molecula

Genetic Diversity of <i>Giardia duodenalis</i>: Multilocus Genotyping Reveals Zoonotic Potential between Clinical and Environmental Sources in a Metropolitan Region of Brazil

<div><p>Background</p><p><i>Giardia duodenalis</i> is a flagellate protozoan that parasitizes humans and several other mammals. Protozoan contamination has been regularly documented at important environmental sites, although most of these studies were performed at the species level. There is a lack of studies that correlate environmental contamination and clinical infections in the same region. The aim of this study is to evaluate the genetic diversity of a set of clinical and environmental samples and to use the obtained data to characterize the genetic profile of the distribution of <i>G. duodenalis</i> and the potential for zoonotic transmission in a metropolitan region of Brazil.</p><p>Methodology/Principal Findings</p><p>The genetic assemblages and subtypes of <i>G. duodenalis</i> isolates obtained from hospitals, a veterinary clinic, a day-care center and important environmental sites were determined via multilocus sequence-based genotyping using three unlinked gene loci. Cysts of <i>Giardia</i> were detected at all of the environmental sites. Mixed assemblages were detected in 25% of the total samples, and an elevated number of haplotypes was identified. The main haplotypes were shared among the groups, and new subtypes were identified at all loci. Ten multilocus genotypes were identified: 7 for assemblage A and 3 for assemblage B.</p><p>Conclusions/Significance</p><p>There is persistent <i>G. duodenalis</i> contamination at important environmental sites in the city. The identified mixed assemblages likely represent mixed infections, suggesting high endemicity of <i>Giardia</i> in these hosts. Most <i>Giardia</i> isolates obtained in this study displayed zoonotic potential. The high degree of genetic diversity in the isolates obtained from both clinical and environmental samples suggests that multiple sources of infection are likely responsible for the detected contamination events. The finding that many multilocus genotypes (MLGs) and haplotypes are shared by different groups suggests that these sources of infection may be related and indicates that there is a notable risk of human infection caused by <i>Giardia</i> in this region.</p></div

Distribution of different haplotypes from each genetic assemblage within each gene.

<p>The different haplotypes identified in each genetic assemblage are presented for the glutamate dehydrogenase (<i>gdh</i>), beta-giardin (<i>bg</i>) and triose phosphate isomerase (<i>tpi</i>) genes. Bold numbers indicate the assemblage that contributed most to the haplotypes.</p><p>Distribution of different haplotypes from each genetic assemblage within each gene.</p

Distribution of haplotypes from each genetic assemblage within each source.

<p>The haplotypes identified in each genetic assemblage are presented for each gene. Bold numbers indicate the assemblage that contributed most to the haplotypes. * Hospital group (HC), day-care center group (DC), veterinary group (VET) and environmental group (ENV).</p><p>Distribution of haplotypes from each genetic assemblage within each source.</p

Multilocus genotypes (MLGs) in <i>G. duodenalis</i> assemblage A isolates.

<p>Subtypes of the sub-assemblage AII were grouped into seven different multilocus genotypes.</p><p>Multilocus genotypes (MLGs) in <i>G. duodenalis</i> assemblage A isolates.</p