Lethal and atypical fetopathy caused by cytomegalovirus recurrence with isolated intra-abdominal complication in an immune woman

International audienceA pregnant woman did not show any problem during the first trimester, but ultrasound exam, confirmed by RMI, showed a large intra-abdominal hyper-echogenic cystic image at 24 weeks of gestation. Meconial peritonitis was suspected, complicated by stable splenomegaly. No neurological signs, variation of the amniotic fluid volume, cardiologic dysfunction or thrombocytemia was observed. Serological assays done before and during pregnancy showed constant low IgM and high IgG anti-CMV levels. Amniocentesis showed a high viral load in amniotic fluid. Fetal and maternal bleed were positive. The pregnancy was interrupted at 31 weeks without post-mortem fetal examination. Placenta revealed hydrophic villi with cytomegalic anti-CMV positive inclusions. This case of CMV recurrence leads to severe complications of the fetal development in a pregnant woman. The isolated abdominal abnormalities were an atypical presentation of fetal CMV, causing inappropriate decisions. Multiplex examinations on amniotic fluid would be keys during the pregnancy examination to prevent fatal outcomes

Adaptive Multiscale Complexity Analysis of Fetal Heart Rate

International audiencePer partum fetal asphyxia is a major cause of neonatal morbidity and mortality. Fetal heart rate monitoring plays an important role in early detection of acidosis, an indicator for asphyxia. This problem is addressed in this paper by introducing a novel complexity analysis of fetal heart rate data, based on producing a collection of piecewise linear approximations of varying dimensions from which a measure of complexity is extracted. This procedure specifically accounts for the highly nonstationary context of labor by being adaptive and multiscale. Using a reference dataset, made of real per partum fetal heart rate data, collected in situ and carefully constituted by obstetricians, the behavior of the proposed approach is analyzed and illustrated. Its performance is evaluated in terms of the rate of correct acidosis detection versus the rate of false detection, as well as how early the detection is made. Computational cost is also discussed. The results are shown to be extremely promising and further potential uses of the tool are discussed. MATLAB routines implementing the procedure will be made available at the time of publication

HYDRINDIC : suivre et évaluer l’efficacité des opérations de restauration/création de zones humides avec un indicateur hydrologique

National audienceA large number of wetland restoration/creation operations are emerging in France. The efficiency of these operations must be evaluated in the short, medium and long term. It is also the case of compensation operations which, in order to demonstrate the efficiency of their restoration/creation operations, must have robust and easily mobilisable indicators. The HYDRINDIC indicator was thus developed to assess the efficiency of wetland restoration/creation operations from a hydrological point of view.that are now under an obligation to achieve results and must, in order to demonstrate the efficiency of their restoration/creation operations, have robust and easily mobilisable indicators. The HYDRINDIC indicator was thus developed to assess the efficiency of wetland restoration/creation operations from a hydrological point of view.Un grand nombre d’opérations de restauration/création de zones humides voient le jour en France. L’efficacité de ces dernières doit être évaluée à court, moyen et long terme. C’est d’ailleurs le cas des opérations de compensation qui sont désormais soumises à obligation de résultat et doivent, pour démontrer l’efficacité de leurs opérations de restauration/création, disposer d’indicateurs robustes et facilement mobilisables. L’indicateur HYDRINDIC a ainsi été construit pour permettre le suivi et l’évaluation de l’efficacité des opérations de restauration/création de zones humides d’un point de vue hydrologique

HYDRINDIC - Suivi et évaluation de la restauration/création de zones humides avec un indicateur hydrologique, Guide méthodologique

National audienceEn France, afin de pallier la dégradation et destruction des zones humides, de nombreux projets de restauration/création de zones humides voient le jour. Une partie de ces opérations sont réalisées dans le contexte réglementaire de la compensation écologique. Ces opérations sont désormais soumises à obligation de résultat et doivent, pour démontrer leur efficacité, disposer d’indicateurs robustes et facilement mobilisables. D’une façon plus générale, disposer d’indicateurs de suivi permet d’évaluer l’efficacité des opérations de restauration/création de zones humides et d’améliorer progressivement les pratiques.Malgré le développement de méthodes et d’indicateurs pour le suivi des zones humides (MhéO, RhoMeO…), l’utilisation de piézomètres simples (tubes de moins de 2 m) pour connaitre la profondeur et les fluctuations de la nappe d'eau superficielle restent peu fréquents. Ils sont pourtant particulièrement utiles en amont des opérations de restauration, afin de dimensionner le projet, et lors des suivis après travaux pour identifier les éventuelles causes d’échec du projet et y remédier. En effet, le maintien d’un bon fonctionnement hydrologique détermine l’avenir d’une zone humide sur le long terme. L’absence d’information sur le fonctionnement hydrologique d’une zone pressentie pour des travaux de restauration/création est un frein important à la réussite des projets. Ce guide méthodologique a été construit pour lever les freins actuels à la mise en place de piézomètres et compléter les indicateurs existants par un indicateur hydrologique (HYDRINDIC). Cet indicateur repose sur la comparaison annuelle de chroniques piézométriques entre une zone humide en voie de restauration/création et des zones humides correspondant à l'objectif de restauration/création (SCORs). Les données piézométriques récoltées sur les SCORs permettent de construire une enveloppe de référence, c’est-à-dire une gamme de variations de profondeur de nappe « autorisée » pour objectiver une conclusion sur le succès vraisemblable de la restauration/création d’un point de vue hydrologique.Le guide méthodologique aborde notamment la définition des sites suivis, la stratégie de déploiement des piézomètres, le matériel nécessaires, les coûts, la méthode d’analyse et d’interprétation, etc. et s’adresse à un public technique non spécialisé en hydrologie et statistique. Il est accompagné de deux outils téléchargeables gratuitement en ligne, permettant la visualisation des données, le calcul de l’indicateur et l’interprétation des résultats. Le guide et l’indicateur proposé ont vocation à être mis à jour régulièrement, en fonction de l’avancée des connaissance et des retours d’expérience

HYDRINDIC - Suivi et évaluation de la restauration/création de zones humides avec un indicateur hydrologique, Guide méthodologique

National audienceEn France, afin de pallier la dégradation et destruction des zones humides, de nombreux projets de restauration/création de zones humides voient le jour. Une partie de ces opérations sont réalisées dans le contexte réglementaire de la compensation écologique. Ces opérations sont désormais soumises à obligation de résultat et doivent, pour démontrer leur efficacité, disposer d’indicateurs robustes et facilement mobilisables. D’une façon plus générale, disposer d’indicateurs de suivi permet d’évaluer l’efficacité des opérations de restauration/création de zones humides et d’améliorer progressivement les pratiques.Malgré le développement de méthodes et d’indicateurs pour le suivi des zones humides (MhéO, RhoMeO…), l’utilisation de piézomètres simples (tubes de moins de 2 m) pour connaitre la profondeur et les fluctuations de la nappe d'eau superficielle restent peu fréquents. Ils sont pourtant particulièrement utiles en amont des opérations de restauration, afin de dimensionner le projet, et lors des suivis après travaux pour identifier les éventuelles causes d’échec du projet et y remédier. En effet, le maintien d’un bon fonctionnement hydrologique détermine l’avenir d’une zone humide sur le long terme. L’absence d’information sur le fonctionnement hydrologique d’une zone pressentie pour des travaux de restauration/création est un frein important à la réussite des projets. Ce guide méthodologique a été construit pour lever les freins actuels à la mise en place de piézomètres et compléter les indicateurs existants par un indicateur hydrologique (HYDRINDIC). Cet indicateur repose sur la comparaison annuelle de chroniques piézométriques entre une zone humide en voie de restauration/création et des zones humides correspondant à l'objectif de restauration/création (SCORs). Les données piézométriques récoltées sur les SCORs permettent de construire une enveloppe de référence, c’est-à-dire une gamme de variations de profondeur de nappe « autorisée » pour objectiver une conclusion sur le succès vraisemblable de la restauration/création d’un point de vue hydrologique.Le guide méthodologique aborde notamment la définition des sites suivis, la stratégie de déploiement des piézomètres, le matériel nécessaires, les coûts, la méthode d’analyse et d’interprétation, etc. et s’adresse à un public technique non spécialisé en hydrologie et statistique. Il est accompagné de deux outils téléchargeables gratuitement en ligne, permettant la visualisation des données, le calcul de l’indicateur et l’interprétation des résultats. Le guide et l’indicateur proposé ont vocation à être mis à jour régulièrement, en fonction de l’avancée des connaissance et des retours d’expérience

Une méthode nationale pour évaluer les fonctions des zones humides dans le cadre de la compensation écologique des impacts

Mieux comprendre les fonctions des zones humides permet aux techniciens et gestionnaires une meilleure mise en œuvre de la séquence éviter-réduire-compenser sur ces zones. Cet article présente la méthode nationale d’évaluation des fonctions des zones humides qui constitue une avancée opérationnelle pour évaluer la compensation écologique des impacts sur les fonctions des zones humides. Simple à mettre en œuvre, articulée avec les principes de la compensation écologique édictés dans le Code de l’environnement, basée sur des connaissances scientifiques, elle fournit aux bureaux d’études, maîtres d’ouvrage, services de l’État, services instructeurs… des éléments partagés pour évaluer les fonctions des zones humides et le résultat des mesures de compensation écologique

Prenatal diagnosis of 'isolated' Dandy-Walker malformation: imaging findings and prenatal counselling.

International audienceOBJECTIVE: The purpose of this article is to improve prenatal imaging diagnosis and counselling for cases of 'isolated' Dandy-Walker malformation (DWM) in the light of recent literature, which has demonstrated a potential good clinical and intellectual outcome of fetuses presenting with DWM characterised by partial vermian agenesis (identification of two fissures and three lobes) and absence of associated anatomical anomalies. METHODS: This is a retrospective observational study of six consecutive prenatal cystic posterior fossa malformations, diagnosed as DWM, encountered in a national reference centre for posterior fossa malformations over a 2-year period. RESULTS: In all cases, DWM was diagnosed as isolated (without any associated central nervous system or extra-central nervous system malformations and normal standard karyotype). Despite good-quality imaging, including fetal magnetic resonance imaging (MRI), prenatal analysis of the vermis was impossible because of limited identification of fissuration and lobulation. In three cases, a cytogenetic anomaly was found, including 6p subtelomeric deletion (n = 2) and partial 4 qter deletion associated with partial 7p trisomy (n = 1). One fetus with 6p deletion was terminated. In four of the five postnatal cases, MRI confirmed the diagnosis of DWM but provided only limited information for vermian analysis. In one case, postnatal MRI showed a large Blake's pouch cyst with rotated but complete vermis associated with a marked mass effect on the distal part of the tentorium. Of the four babies born with postnatal diagnosis of DWM, all required ventriculoperitoneal shunting because of early postnatal hydrocephalus. CONCLUSION: When fetal MRI is necessary to exclude additional cerebral lesions in the diagnosis of DWM, we highlight the inaccuracy of magnetic resonance for anatomical analysis of the vermis. We also emphasise the potential high incidence of subtelomeric anomalies in isolated DWM, especially 6p deletion. In the postnatal period, paediatricians should look for postnatal hydrocephalus even if the ventricular size is normal or slightly dilated on prenatal imaging

Contribution relative du sol, de la gestion et des traits des plantes aux covariations entre propriétés écosystémiques en prairie

International audienceEcological intensification promotes the better use of ecosystem functioning for agricultural production and as a provider of additional regulation and cultural services. We investigated the mechanisms underpinning potential ecological intensification of livestock production in the Vercors mountains (France). We quantified the variations in seven ecosystem properties associated with key ecosystem services: above-ground biomass production at first harvest, fodder digestibility, plant species richness, soil organic matter content, soil carbon content, total microbial biomass and soil bacteria:fungi ratio across 39 grassland plots representing varying management types and intensity. Our analyses confirmed joint effects of management, traits and soil abiotic parameters on variations in ecosystem properties, with the combination of management and traits being most influential. The variations explained by traits were consistent with the leaf economics spectrum model and its implications for ecosystem functioning. The observed independence between ecosystem properties relevant to production (forage biomass, digestibility and nutrient turnover) on the one hand and soil stocks (organic matter, carbon and microbial stocks) on the other hand suggests that an intensification of fodder production might be compatible with the preservation of the soil capital. We highlight that appropriate choices regarding various practices, such as the first date of grazing or mowing being dependent on soil moisture, have important consequences on a number of ecosystem properties relevant for ecosystem services and may influence biodiversity patterns. Such avenues for ecological intensification should be considered as part of further landscape- and farm-scale analyses of the relationships between farm functioning and ecosystem services

Correction: Impact of Pregnancy on Intra-Host Genetic Diversity of Influenza A Viruses in Hospitalised Women: A Retrospective Cohort Study. J. Clin. Med. 2020, 9, 1974

The authors wish to make the following corrections to this paper [...

Impact of Pregnancy on Intra-Host Genetic Diversity of Influenza A Viruses in Hospitalised Women: A Retrospective Cohort Study

International audienceCharacterising dynamics of Influenza A Viruses (IAV) within-host evolution is an active field of research which may lead to a better understanding of viral pathogenesis. Using a pregnant mouse model, a study has recently suggested that immune modulation during pregnancy could promote the emergence of IAV quasispecies with increased virulence. Herein, we assess the clinical relevance of these findings in humans. We studied IAV intra-host diversity (ihD) in pregnant (n = 36) and non-pregnant (n = 23) women hospitalized in Lyon for IAV infection (01/2015-05/2018). Whole IAV genomes present in nasopharyngeal samples were sequenced in duplicate to analyze reproducible intra-host single nucleotide variants (ihSNV). Counts, relative frequencies and locations of ihSNV were used as indicators of ihD. The median ihSNV/kb counts per segment were between 0 and 1.3. There was >81% ihSNV at relative frequencies between 1-5% for H1N1 and >51% for H3N2 IAV. No significant difference was noted between pregnant and non-pregnant women when considering all or only non-synonymous ihSNV. Seven convergent non-synonymous ihSNV were found; none were significantly associated with pregnancy. These results suggest that modulation of the immune system during pregnancy in humans does not impact IAV ihD, in contrast to mice