29 research outputs found

    Desarrollo de coordenadas del entorno para el estudio de la catálisis enzimática.

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    El impacto de la dinámica de proteínas en la constante de velocidad de la etapa química sigue siendo objeto de debate en la literatura científica. La cuestión que se plantea es si el efecto de los movimientos de la proteína sobre la constante de velocidad puede ser descrito con un marco teórico basado en la Teoría del estado de Transición (TST). Esta teoría proporciona las herramientas para el cálculo de la velocidad de la reacción, sin tener en cuenta explícitamente los efectos dinámicos. Sin embargo, es fácil imaginar que éstos podrían desempeñar un papel importante. Para un mejor entendimiento de los efectos dinámicos, necesitamos controlar la evolución del entorno y su comportamiento a lo largo de la transformación química. En estos términos proponemos dos diferentes soluciones: • Una opción es proyectar la superficie multidimensional de energía libre de la reacción enzimática en un modelo 2D obtenido como función de dos coordenadas, una de soluto y otra de entorno. Una superficie de energía libre como ésta nos permitirá estimar el acoplamiento entre el soluto y los movimientos del solvente a lo largo de la reacción. • La segunda solución es definir la RC en términos de las coordenadas de entorno, asumiendo que las partículas ligeras involucradas en la reacción se adaptan al entorno, permitiéndonos la inclusión de los efectos cuánticos en el cálculo de la constante de velocidad. El objetivo de esta tesis ha sido el desarrollo e implementación de dos coordenadas colectivas. Una de ellas es, la coordenada electrostática, que toma el potencial electrostático, creado por la parte MM en un sistema QM/MM, sobre un átomo directamente involucrado en el proceso de reacción, normalmente uno que sufre un cambio significativo de distribución de carga a lo largo de la reacción química. Esta metodología nos permitió estudiar los efectos del entorno y su importancia durante el paso químico de la reacción en tres sistemas diferentes, la Haloalkano Dehalogenasa, la Catecol O-metiltransferasa y la Dihidrofolato Reductasa. Los resultados obtenidos muestran una mejor preorganización del entrono en los sistemas enzimáticos frente a la reacción equivalente en agua, lo que implica una mayor reorganización en el sistema acuoso y por tanto una mayor implicación de los grados de libertad de las moléculas de agua en la transformación química. La segunda coordenada colectiva, que llamaremos coordenada de diferencia energética, está diseñada para el cálculo de reacciones enzimáticas en las que tiene lugar la transferencia de una partícula ligera como un protón o un hidruro. La definición de esta coordenada se basa en la diferencia de energía entre dos estados de referencia de “Reactivos” y “Productos” definidos en base a unas consideraciones geométricas y pretende capturar los cambios conformacionales, en el sistema químico y en el entorno, esenciales para que la reacción tenga lugar. Esta coordenada colectiva toma valores negativos en los reactivos, positivos en productos y cercanos a cero en el TS. Este tipo de coordenadas tienen la ventaja adicional de que permiten una introducción más sencilla del efecto túnel ya que no presuponen que el entorno se adapta a los cambios en la posición de la partícula ligera. Esto nos permitió el cálculo de los KIEs en la reacción de transferencia de hidruro catalizada por la Formato Deshidrogenasa con la inclusión de las propiedades quánticas del hidruro transferido y del hidrógeno secundario en el aceptor mostrando teniendo en cuenta el acoplamiento en el movimiento de ambos hidrógenos. También hemos podido comprobar que el conjunto de TS definido según esta coordenada muestra un amplio rango de distancias dador aceptor a los que la transferencia de hidruro puede ocurrir, cambiando la naturaleza de la transferencia de hidruro de adiabática (a distancias cortas dador-aceptor) a no-adiabática ( a distancias dador-aceptor mayores de 3.0 Å )

    Construcción de un pavimento rígido de carretera de montaña: el acceso al Valle de los Caídos

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    This article describes the construction of the reinforced concrete stiff pavement of road M-542, a side road to road C-600, leading to the Valley of the Fallen. This project has been carried out with the collaboration of the Stiff Pavement Section (SEPAR) of the Eduardo Torroja Institute, operating in their double role of advisers to the Public Administration in the design and site management of the project, and as participants in the actual construction contract, by lending machinery and skilled personnel.<br><br>Se describe la ejecución del pavimento rígido, de hormigón armado, de la carretera M-342, ramal de la C-800 al Valle de los Caídos. En la obra ha intervenido el Servicio de Pavimentos Rígidos (SEPAR) del Instituto Eduardo Torreja, en su doble papel de asesor de la Administración en proyecto y dirección de obra y auxiliar de la contrata {prestación de maquinaria y equipos)

    Construcción de un pavimento rígido de carretera de montaña: el acceso al Valle de los Caídos

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    This article describes the construction of the reinforced concrete stiff pavement of road M-542, a side road to road C-600, leading to the Valley of the Fallen. This project has been carried out with the collaboration of the Stiff Pavement Section (SEPAR) of the Eduardo Torroja Institute, operating in their double role of advisers to the Public Administration in the design and site management of the project, and as participants in the actual construction contract, by lending machinery and skilled personnel.Se describe la ejecución del pavimento rígido, de hormigón armado, de la carretera M-342, ramal de la C-800 al Valle de los Caídos. En la obra ha intervenido el Servicio de Pavimentos Rígidos (SEPAR) del Instituto Eduardo Torreja, en su doble papel de asesor de la Administración en proyecto y dirección de obra y auxiliar de la contrata {prestación de maquinaria y equipos)

    Cognitive reserve assessment scale in health (CRASH): its validity and reliability

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    Background: the cognitive reserve (CR) concept has not been precisely defined in severe mental disorders and has been estimated using heterogeneous methods. This study aims to investigate and develop the psychometric properties of the Cognitive Reserve Assessment Scale in Health (CRASH), an instrument designed to measure CR in people with severe mental illness; (2) Methods: 100 patients with severe mental illness (non-affective psychoses and affective disorders) and 66 healthy controls were included. The internal consistency and convergent validity of CRASH were assessed. Spearman's correlations coefficients were also performed to examine the relationship between CRASH and neuropsychological tests, psychosocial functioning, and clinical course; (3) Results: the internal consistency was high (Cronbach's alpha coefficient = 0.903). The CRASH global score had a large positive correlation with the Cognitive reserve questionnaire total score (r = 0.838, p < 0.001), demonstrating good convergent validity. The correlation coefficients between the CRASH total scores and clinical, functional, and neuropsychological performance were different between groups. In order to provide clinical interpretation, severity classification based on diagnosis (non-affective psychotic disorders, affective disorders, and healthy controls) have been created; (4) Conclusions: CRASH is the first CR measure developed specifically for patients with severe mental illness, facilitating reliable and valid measurement of this construct. The scale may aid in the stratification of patients and the implementation of personalized interventions

    Patients receiving a high burden of antibiotics in the community in Spain: a cross-sectional study.

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    Some patients in the community receive a high burden of antibiotics. We aimed at describing the characteristics of these patients, antibiotics used, and conditions for which they received antibiotics. We carried out a cross-sectional study. Setting: Thirty Health Primary Care Areas from 12 regions in Spain, covering 5,960,191 inhabitants. Patients having at least 30 packages of antibacterials for systemic use dispensed in 2017 were considered. Main outcome measures: Prevalence of antibiotic use, conditions for which antibiotics were prescribed, clinical characteristics of patients, comorbidities, concomitant treatments, and microbiological isolates. Patient's average age was 70 years; 52% were men; 60% smokers/ex-smokers; 54% obese. Overall, 93% of patients had, at least, one chronic condition, and four comorbidities on average. Most common comorbidities were cardiovascular and/or hypertension (67%), respiratory diseases (62%), neurological/mental conditions (32%), diabetes (23%), and urological diseases (21%); 29% were immunosuppressed, 10% were dead at the time of data collection. Patients received three antibiotic treatments per year, mainly fluoroquinolones (28%), macrolides (21%), penicillins (19%), or cephalosporins (12%). Most frequently treated conditions were lower respiratory tract (infections or prophylaxis) (48%), urinary (27%), and skin/soft tissue infections (11%). Thirty-five percent have been guided by a microbiological diagnosis, being Pseudomonas aeruginosa (30%) and Escherichia coli (16%) the most frequent isolates. In conclusion, high antibiotic consumers in the community were basically elder, with multimorbidity and polymedication. They frequently received broad-spectrum antibiotics for long periods of time. The approach to infections in high consumers should be differentiated from healthy patients receiving antibiotics occasionally

    Expected Performances of the NOMAD/ExoMars instrument

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    NOMAD (Nadir and Occultation for MArs Discovery) is one of the four instruments on board the ExoMars Trace Gas Orbiter, scheduled for launch in March 2016. It consists of a suite of three high-resolution spectrometers – SO (Solar Occultation), LNO (Limb, Nadir and Occultation) and UVIS (Ultraviolet and Visible Spectrometer). Based upon the characteristics of the channels and the values of Signal-to-Noise Ratio obtained from radiometric models discussed in [Vandaele et al., Optics Express, 2015] and [Thomas et al., Optics Express, 2015], the expected performances of the instrument in terms of sensitivity to detection have been investigated. The analysis led to the determination of detection limits for 18 molecules, namely CO, H2O, HDO, C2H2, C2H4, C2H6, H2CO, CH4, SO2, H2S, HCl, HCN, HO2, NH3, N2O, NO2, OCS, O3. NOMAD should have the ability to measure methane concentrations <25 parts per trillion (ppt) in solar occultation mode, and 11 parts per billion in nadir mode. Occultation detections as low as 10 ppt could be made if spectra are averaged [Drummond et al., Planetary Space and Science, 2011]. Results have been obtained for all three channels in nadir and in solar occultation

    Construcción de un pavimento rígido para autopistas (la variante de Torrejón de Ardoz)

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    The article describes the stiff mass concrete pavement at Torrejón bypass, which is the first motor road section (7 km long) made in Spain with this type of pavement. In the construction the Stiff Pavements Section (SEPAR) of the Instituto Eduardo Torroja has taken part, both as adviser at the design and construction stages of the work, and it has also helped with the loan of machinery and equipment.Se describe la ejecución del pavimento rígido de hormigón en masa de la variante de Torrejón, que constituye el primer tramo de autopista (de 7 km de longitud) construido en España con este tipo de pavimento. En la ejecución ha intervenido el Servicio de Pavimentos Rígidos (SE PAR) del Instituto Eduardo Torroja, en su doble papel de asesor de la Administración en proyecto y dirección de obra y auxiliar de la Contrata (prestación de maquinaria y equipos)
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