Estudio de fortalecimiento de prestadores de Servicios en las Cuencas Lecheras del Norte y Centro Sur de Nicaragua

El Objetivo General del estudio es identificar, caracterizar, clasificar y analizar la demanda y la oferta de servicios de apoyo a las empresas de los diferentes eslabones de las cadenas de lácteos, en los municipios de Camoapa, Matiguás y Santo Tomás para establecer las brechas existentes y trazar los lineamientos necesarios para el diseño de un programa de fortalecimiento y desarrollo de capacidades de los prestadores de Servicios de Desarrollo Empresarial (SDE). Estos municipios se consideraron representativos de los Departamentos de Boaco, Matagalpa y Chontales y los municipios ganaderos del Norte de la RAAS y del Sur de la RAAN, los que tienen más del 60 % de la población de ganado bovino de Nicaragua, y una producción conjunta de leche de 179.2 millones de galones (2005), o sea el 62 % del total producido en el país y 380,330 quintales de queso equivalente al 87 % de la producción total del país

The sea urchin kinome: A first look

AbstractThis paper reports a preliminary in silico analysis of the sea urchin kinome. The predicted protein kinases in the sea urchin genome were identified, annotated and classified, according to both function and kinase domain taxonomy. The results show that the sea urchin kinome, consisting of 353 protein kinases, is closer to the Drosophila kinome (239) than the human kinome (518) with respect to total kinase number. However, the diversity of sea urchin kinases is surprisingly similar to humans, since the urchin kinome is missing only 4 of 186 human subfamilies, while Drosophila lacks 24. Thus, the sea urchin kinome combines the simplicity of a non-duplicated genome with the diversity of function and signaling previously considered to be vertebrate-specific. More than half of the sea urchin kinases are involved with signal transduction, and approximately 88% of the signaling kinases are expressed in the developing embryo. These results support the strength of this nonchordate deuterostome as a pivotal developmental and evolutionary model organism

Analysis of the P. lividus sea urchin genome highlights contrasting trends of genomic and regulatory evolution in deuterostomes

Sea urchins are emblematic models in developmental biology and display several characteristics that set them apart from other deuterostomes. To uncover the genomic cues that may underlie these specificities, we generated a chromosome-scale genome assembly for the sea urchin Paracentrotus lividus and an extensive gene expression and epigenetic profiles of its embryonic development. We found that, unlike vertebrates, sea urchins retained ancestral chromosomal linkages but underwent very fast intrachromosomal gene order mixing. We identified a burst of gene duplication in the echinoid lineage and showed that some of these expanded genes have been recruited in novel structures (water vascular system, Aristotle's lantern, and skeletogenic micromere lineage). Finally, we identified gene-regulatory modules conserved between sea urchins and chordates. Our results suggest that gene-regulatory networks controlling development can be conserved despite extensive gene order rearrangement

Rôles des voies de signalisation Wnt et VEGF au cours de l'embryogenèse de l'oursin

Au cours de ma thèse, nous nous sommes penchés sur deux évènements particulièrement important du développement de l embryon d oursin : la formation du tube digestif et la morphogenèse du squelette larvaire. Nous avons pu mettre en évidence le rôle crucial de deux voies de signalisation dans ces processus : celui de la voie Frizzled/wnt dans l invagination du tube digestif, et celui de la voie VEGF dans la migration et la différenciation des cellules du mésenchyme primaire. La fonction maternelle de la voie Wnt/beta-caténine dans la mise en place de l axe antéropostérieur était bien connue et nous avons pu décrire une fonction zygotique de la voie Wnt, fondamentale pour la formation du tube digestif. Nous avons montré que l action de Wnt dans ce processus passait par l activation, via un récepteur frizzled, de la voie PCP (planar cell polarity) (Croce et al., 2006a). Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF) est le facteur clef de la formation des vaisseaux sanguins chez les vertébrés. Il est conservé chez l oursin et exprimé de façon localisée dans deux régions de l ectoderme. Les transcrits codant pour son récepteur à activité tyrosine kinase sont quant à eux restreints à une sous population de cellules mésodermiques, les cellules du mésenchyme primaire (PMCs). Ces PMCs sont les cellules qui forment le squelette de la larve d oursin. L influence de l ectoderme sur ces cellules est connue pour être nécessaire à la correcte morphogenèse du squelette mais les bases moléculaires de l interaction entre ces deux tissus étaient inconnues. Nous avons démontré par l étude fonctionnelle du ligand ectodermique VEGF et de son récepteur mésodermique VEGFR, que la source localisée de VEGF consiste en un repaire spatial nécessaire aux PMCS pour leur correcte migration à l intérieur du blastocoele et leur organisation spatiale. L activation de cette voie VEGF/VEGFR est également un facteur clef de la différenciation des PMCs (Duloquin et al., en préparation). Le laboratoire a également participé à l annotation du génome de l oursin Strongylocentrotus purpuratus, et je suis plus particulièrement attachée à caractériser les gènes de la voie Wnt (Croce et al., 2006b) et les récepteurs à activité tyrosine kinase (Lapraz et al., 2006).NICE-BU Sciences (060882101) / SudocSudocFranceF

Mécanismes de régionalisation de l'embryon d'oursin le long des axes animal-végétatif et oral-aboral

Chez l'embryon d'oursin, modèle classique en Biologie du Développement, l'établissement des principaux feuillets fait intervenir de nombreux gènes codant généralement pour des composants de voie de signalisation. Nous avons isolé trois facteurs de transcription à T-box : ske-T, Brachyury et coquillette. Le profil d'expression de ske-T et de coquillette ainsi que l'analyse fonctionnelle de ce dernier indiquent que ces deux gènes sont requis durant la squelettogenèse. Brachyury, exprimé de façon dynamique dans les cellules en cours d'invagination aux deux extrémités du tube digestif, jouerait un rôle important durant la gastrulation. L'expression zygotique de Frizzled, récepteur membranaire des ligands Wnt, est spatialement limitée. Elle est détectée au pôle animal et dans un anneau de cellules localisées autour du pôle végétatif et qui forment ensuite le sommet du tube digestif. La surexpression de formes dominantes-négatives de Frizzled n'interfère pas avec la spécification initiale des principales lignées cellulaires mais entraîne la perte de formation du tube digestif et la désorganisation du squelette. Frizzled serait donc requis dans les mouvements cellulaires associés à la gastrulation et à la squelettogenèse. La kinase Nlk est successivement exprimée dans les cellules précurseurs du mésenchyme primaire, du mésenchyme secondaire, dans l'endoderme et dans certaines cellules de l'ectoderme. Les anomalies causées par la surexpression de cette kinase révèlent qu'elle agit en synergie avec la voie de Notch. Elle paraît impliquée dans les mécanismes de la spécification des cellules du mésenchyme secondaire et de mise en place des frontières embryonnaires.In the sea urchin embryo, a traditional model in Developmental Biology, the establishment of the germ layers involve many genes whose generally encoded components of signalling pathways. We have isolated three different T-box transcription factors : ske-T, Brachyury and coquillette. The expression pattern of ske-T and coquillette and the functional analysis of coquillette indicate that these two genes are implicated in the skeletogenesis. Brachyury, which is expressed in a dynamic pattern in the invaginating cells at the two ends of the archenteron, seems to play a crucial role during gastrulation. The zygotic expression of Frizzled, the receptor of the Wnt ligands, is spatially restricted. It is detected at the animal pole and in a ring of cells around the vegetal pole which later form the tip of the gut. The overexpression of dominant-negatives forms of Frizzled does not interfere with the initial specification of the main territories but it blocks the formation of the gut and perturbs the organization of the skeleton. Frizzled seems to be required for the cellular movements that occur during gastrulation and skeletogenesis. The NLK kinase is successively expressed in the precursors of the primary mesenchyme cells, secondary mesenchyme cells, in the endodermic cells and in some ectodermic cells. The perturbations caused by the overexpression of the wild type form of this kinase reveal that it should act in synergy with Notch signalling. Nlk appears to be involved in specification of the secondary mesenchyme cells and in the establishment of the embryonic borders.NICE-BU Sciences (060882101) / SudocVILLEFRANCHE/MER-Observ.Océano (061592201) / SudocSudocFranceF

Expression pattern of Brachyury in the embryo of the sea urchin Paracentrotus lividus

International audienceBrachyury is a key transcription factor whose homologs have been identified in many animal species. Different Brachyury expression patterns have been observed amongst echinoderms. We have isolated PlBra, the Brachyury ortholog from the sea urchin Paracentrotus lividus and analyzed its expression during development. PlBra is first expressed at the end of cleavage in a ring of cells at the border between the presumptive endoderm and mesoderm territories. At later stages, PlBra is expressed around the blastopore and in the stomodaeum area as in most basal deuterostomes

Coquillette, a sea urchin T-box gene of the Tbx2 subfamily, is expressed asymmetrically along the oral-aboral axis of the embryo and is involved in skeletogenesis.

International audienceTranscription factors of the T-domain family regulate many developmental processes. We have isolated from the sea urchin a new member of the Tbx2 subfamily: coquillette. Coquillette has a late zygotic expression whose localization is dynamic: at the blastula stage it is restricted to the aboral side of most of the presumptive ectoderm and endoderm territories and from gastrulation on, to the aboral-most primary mesenchyme cells. Perturbation of coquillette function delays gastrulation and strongly disorganizes the skeleton of the larva. Coquillette is sensitive to alteration of the oral-aboral (OA) axis and we identify goosecoid, which controls oral and aboral fates in the ectoderm, as a probable upstream regulator. Coquillette appears to be an integral part of the patterning system along the OA axis

Expression of exogenous mRNAs to study gene function in echinoderm embryos

International audienceWith the completion of the genome sequencing projects, a new challenge for developmental biologists is to assign a function to the thousands of genes identified. Expression of exogenous mRNAs is a powerful, versatile and rapid technique that can be used to study gene function during development of the sea urchin. This chapter describes how this technique can be used to analyze gene function in echinoderm embryos, how it can be combined with cell transplantation to perform mosaic analysis and how it can be applied to identify downstream targets genes of transcription factors and signaling pathways. We describe specific examples of the use of overexpression of mRNA to analyze gene function, mention the benefits and current limitations of the technique and emphasize the importance of using different controls to assess the specificity of the effects observed. Finally, this chapter details the different steps, vectors and protocols for in vitro production of mRNA and phenotypic analysis

Envelysin

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