ESTUDO DA MORTALIDADE DOS MÉDICOS NO ESTADO DA BAHIA, BRASIL, NO PERÍODO 2008-2017

Introduction: The mortality study is widely used for the evaluation and follow-up of health programs around the world serving as an important tool to measure the efficiency of health programs besides serving as a parameter for the application of new health strategies that may have positive impacts health status of the population. Despite its importance, mortality studies in specific social groups such as physicians have been scarce in the world, including in Brazil. Aim: Here, our aim was to describe and analyze the mortality profile of physicians in the state of Bahia during a period of ten years (2008-2017). Methods: A descriptive, analytical and retrospective study was performed by analyzing all causes of death according to ICD-10. The categorical analyzes used were marital status, ethnicity, age, gender, and cause of death. Results: Among Bahian physicians, there were 489 deaths in the period, most among men (84%) which occurred in older ages. There was a predominance of white people in both sexes. The top three causes of death were diseases of the circulatory system (28%), neoplasia (27%) and external causes (12%). This pattern was the same among male population, but neoplasms were the most common cause of death among women. The coefficient of mortality of the medical population was about half of the total population, being able to reflect the great expansion of the Brazilian medical population in recent years. Conclusion: These findings show facts and tendencies which may contribute for the understanding mortality among physicians in Bahia, Brazil.Introdução: O estudo de mortalidade é utilizado para a avaliação e acompanhamento de programas de saúde em todo o mundo. Apesar de sua importância, estudos de mortalidade em grupos sociais específicos, como médicos, são escassos no mundo todo, incluindo o Brasil. Objetivo: Nosso objetivo foi descrever e analisar o perfil de mortalidade de médicos no estado da Bahia durante um período de dez anos (2008-2017). Métodos: Estudo descritivo, analítico e retrospectivo, analisando todas as causas de óbito segundo a CID-10. As análises categóricas utilizadas foram estado civil, etnia, idade, sexo e causa da morte. Resultados: Entre os médicos baianos, ocorreram 489 mortes no período, a maioria entre os homens (84%), que ocorreu em idades mais avançadas. Houve predomínio de pessoas brancas em ambos os sexos. As três principais causas de morte foram doenças do aparelho circulatório (28%), neoplasia (27%) e causas externas (12%). Esse padrão foi o mesmo entre a população masculina, mas as neoplasias foram a causa mais comum de morte entre as mulheres. O coeficiente de mortalidade da população médica é cerca da metade da população total, podendo refletir a grande expansão da população médica brasileira nos últimos anos. Conclusão: Os achados mostram fatos e tendências que podem contribuir para o entendimento da mortalidade entre médicos na Bahia, Brasil

Aeroalérgenos: prevalência de sensibilização ao teste cutâneo de puntura

Objetivo: Identificar aeroalérgenos de maior prevalência em pacientes de uma clínica particular em Salvador, Bahia. Método: Neste estudo descritivo e transversal foram analisados 2.227 prontuários de pacientes submetidos a testes cutâneos de puntura (TCP) para extratos de Der p, Der f, Blo t, Bla g, Can f, Fel d e mistura de fungos, no período de julho/2013 a julho/2018, para avaliar a sensibilidade a aeroalérgenos. Resultados: A prevalência de sensibilização foi de 55,28% entre os pacientes avaliados. Dentre estes, 27,94% tiveram sensibilidade a pelo menos dois aeroalérgenos e 36,4% a 3 ou mais, sendo Dermatophagoides pteronyssinus (33,72%), Blomia tropicalis (31,3%) e Dermatophagoides farinae (25,42%), os mais prevalentes. Também houve sensibilidade para Blatella germanica (9,65%), epitélio de cão (7,68%), epitélio de gato (7,5%) e fungos (6,96%). A faixa etária com maiores resultados positivos foi de 13 a 19 anos (26,73%) e o sexo, masculino (58,56%). Em face temporal, os meses de Julho a Dezembro apresentaram níveis mais elevados de sensibilização, e o Dermatophagoides pteronyssinus foi predominante na maioria dos anos. Conclusão: Dos indivíduos que realizaram o TCP, a maioria apresentou sensibilização aos aeroalérgenos. Os principais alérgenos sensibilizantes foram os ácaros de poeira domiciliar, com predomínio do Dermatophagoides pteronyssinus e Blomia tropicalis, especialmente no período de inverno e primavera brasileiro

Efeitos da metformina no perfil inflamatório em pacientes com tuberculose e diabetes tipo 2/ Effects of metformin on the inflammatory profile in patients with tuberculosis and type 2 diabetes

O diabetes mellitus (DM) aumenta o risco de tuberculose pulmonar (TB) e desfechos adversos ao tratamento. Sabendo que a metformina é a droga mais utilizada no controle da DM, diversos estudos sugerem um efeito pleiotrópico que aumenta a resposta imunológica contra o Mycobacterium tuberculosis (Mtb) através da modulação da resposta inflamatória em pacientes com TB. Assim, o objetivo geral do presente estudo foi investigar os efeitos da metformina na resposta imunológica e inflamatória contra o Mycobacterium tuberculosis durante o tratamento para TB em pacientes diabéticos. Trata-se de um estudo de coorte prospectivo com pacientes atendidos em centros conveniados de referência em Chennai, no Sul da Índia, no período entre 2016 a 2017. Os dados clínicos e imunológicos foram coletados em 4 diferentes períodos (avaliação inicial, segundo mês, sexto mês e decimo oitavo mês). Os pacientes com tuberculose e diabetes (TBDM) foram divididos de acordo com o uso de metformina, TBDM metformina (Met) 29 pacientes e o TBDM sem uso de metformina (NMet) 14 pacientes. Foram analisadas variáveis sociodemográficas, antropométricas e os hábitos de vida. Os pacientes TBDM Met eram mais velhos, com predominância do sexo masculino em ambos os grupos. Não houve diferença estatisticamente significativa em relação ao IMC, tabagismo e etilismo. Foram mensuradas 17 citocinas plasmáticas e fatores de crescimento. Houve uma diferença estatisticamente significativa nos níveis de 2 citocinas, a IL-17F no mês 2 e IL-5 no mês 6. A associação da HbA1c com os biomarcadores em cada tempo também foi examinada.As análises indicaram que os indivíduos com TBDM Met apresentaram uma melhor resposta a infecção pelo Mtb, produzindo citocinas pró-inflamatórias ou anti-inflamatória a depender do momento específico no tratamento, indicando assim que o uso da metformina pode ter gerado um menor estado inflamatório após o tratamento para tuberculose

Aplicação de técnicas sorológicas e moleculares na detecção de Leishmania em doadores de sangue na cidade de Salvador, Bahia

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2012-07-20T21:20:40Z No. of bitstreams: 1 Kiyoshi Ferreira Fukutani Aplicação de técnicas sorológicas e moleculares....pdf: 8948929 bytes, checksum: 731ecff23760ac556b55cf07dd7c1cc5 (MD5)Made available in DSpace on 2012-07-20T21:20:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kiyoshi Ferreira Fukutani Aplicação de técnicas sorológicas e moleculares....pdf: 8948929 bytes, checksum: 731ecff23760ac556b55cf07dd7c1cc5 (MD5) Previous issue date: 2011Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.Aplicação do Exame sorológico (ELISA) e do PCR na detecção de Leishmania chagasi em doadores de sangue na cidade de Salvador. A leishmaniose é causada por protozoários do gênero Leishmania e constitui um problema grave de saúde pública na Bahia. A transmissão do protozoário pela transfusão de sangue já foi relatada e existe a possibilidade dos hemoderivados serem um potencial risco para a manutenção da doença. O presente trabalho teve como objetivo avaliar positividade sorológica contra Leishmania e a presença deste parasita no sangue periférico de doadores, na cidade de Salvador, BA. Para estipulando a soroprevalência de leishmaniose em doadores de sangue, foram coletadas amostras de sangue periférico de 700 indivíduos, no Hemocentro da Bahia (HEMOBA/SESAB), de janeiro a setembro de 2010. As amostras foram processadas para a obtenção de plasma e de DNA. A sorologia anti-Leishmania foi feita por ELISA, empregando antígeno solúvel de Leishmania chagasi (SLA). A presença de parasitas foi determinada por PCR qualitativo e por PCR quantitativo (qPCR). A população amostral foi composta por 74.5% de indivíduos masculinos, com média de idade de 34 anos. A partir de uma curva ROC, empregando soros de pacientes com leishmaniose visceral e soros de pacientes residentes em área não endêmica, o ponto de corte para o teste sorológico foi estabelecido em 0,0167 (DO em 405nm). A sorologia anti-Leishmania foi positiva em 5.4% (38/700) das amostras. Destes indivíduos, 73% (28/38) apresentaram amplificação para uma região repetitiva do genoma de Leishmania, empregando-se o PCR qualitativo. Empregando o qPCR, foi possível determinar a presença de parasitas em 0.4% (3/700) amostras e, nestas, a quantificação foi inferior a 10 parasitas. Nossos resultados mostram a prevalência de sorologia anti-Leishmania é de 5.4%, em doadores do HEMOBA/SESAB, similar ao encontrado em outras área onde ocorre a leishmania.Application of serological examination (ELISA) and PCR detection of Leishmania chagasi infection in blood donors in Salvador. Leishmaniasis is caused by protozoa of the genus Leishmania and is a serious public health problem in Bahia. The transmission of the parasite by blood transfusion has been reported and the possibility of blood products being a potential risk for disease transmission currently exists. This study aimed to evaluate seropositivity against Leishmania and the presence of parasites in peripheral blood from blood donors in Salvador, Bahia. To assess the prevalence of anti-Leishmania antibodies in blood donors, we collected peripheral blood samples from 700 individuals in the Blood Bank of Bahia (HEMOBA/SESAB), from January to September 2010. The samples were processed to obtain plasma and DNA. The anti-Leishmania serology was performed by ELISA employing Leishmania chagasi soluble antigen (SLA). The presence of parasites was determined by qualitative PCR and quantitative PCR (qPCR). The sample population comprised 74.5% of males with a mean age of 34 years. From a ROC curve, using sera from patients with visceral leishmaniasis and sera from patients residing in non-endemic areas, the cutoff for the serologic test was set at 0.0167 (OD at 405nm). The anti-Leishmania serology was positive in 5.4% (38/700) samples. Of these, 73% (28/38) showed amplification of a repetitive region of the genome of Leishmania, using the qualitative PCR. Using the qPCR, we determined the presence of parasites in 0.4% (3 / 700) samples, and in these, the amount was less than 10 parasites. Our results show the prevalence of anti-Leishmania serology is 5.4% in donors, similar to that found in other areas where Leishmania is

HIV-1 Nucleotide Sequence Comprehensive Analysis: A Computational Approach

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-03-07T17:15:55Z No. of bitstreams: 1 Kasprzykowski JI HIV-1 Nucleotide Sequence ....pdf: 4566421 bytes, checksum: 19a37e850b2f602decac14374926dad0 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2018-03-07T17:31:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Kasprzykowski JI HIV-1 Nucleotide Sequence ....pdf: 4566421 bytes, checksum: 19a37e850b2f602decac14374926dad0 (MD5)Made available in DSpace on 2018-03-07T17:31:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kasprzykowski JI HIV-1 Nucleotide Sequence ....pdf: 4566421 bytes, checksum: 19a37e850b2f602decac14374926dad0 (MD5) Previous issue date: 2017Oswaldo Cruz Foundation and Feira de Santana State University.Feira de Santana State University. Applied Computing Post Graduate Program. Feira de Santana, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Imunoparasitologia. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Pós-graduação em Biotecnologia, Saúde e Investigação. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Imunoparasitologia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Imunoparasitologia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Imunoparasitologia. Salvador, BA, BrasilFeira de Santana State University. Applied Computing Post Graduate Program. Feira de Santana, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Imunoparasitologia. Salvador, BA, BrasilAbstract: Background: Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS) is a large-scale pandemic caused by the infection of Human Immunodeficiency Virus (HIV). This virus infects over 40 million people worldwide. In the search for pandemic control, many drug resistance tests have been performed, resulting in the generation of large genomic data amount. These data are stored in biological databases, increasing on a daily basis. However, the majority of genomic data lacks important information, regarding virus subtype distribution, in the primary databases, e.g. GenBank. Objective: A novel software tool to obtain, index and analyze highly mutational virus data, such as all HIV-1 sequence data from GenBank. Method: The software aligns all sequences containing a complete genome (HXB2) for mapping purposes. In addition, all sequences with subtype references are locally aligned to classify all data into genotypic niches. Results: Our results detail the prevalence of every subtype from a global HIV-1 sequence perspective, highlighting increases in the number of sequences related to recombinant subtypes. We were also able to identify country-based distribution of sequences according to geographical data distribution. All data were analyzed on a reasonable timescale, particularly in comparison to classic methods. Conclusion: Our software represents an important contribution to HIV molecular epidemiology and offers a technique to rapidly classify new sequences, in addition to providing insight about sequence coverage density, subtype and country distribution. This data, together with cross-referencing, will aid in the generation of a novel, comprehensive and updated HIV-1 database

Einstein

p. 491-497Avaliar o processo de implantação de um sistema de qualidade em um laboratório de pesquisa básica, avaliando a viabilidade e os impactos dessa melhoria. Métodos: Tratou-se de um estudo qualitativo prospectivo. Utilizou-se a norma NIT DICLA 035 – Princípios das Boas Práticas de Laboratório (BPL) e documentos da Organisation for Economic Co-operation and Development para complementar o planejamento e a implantação de um Sistema de Gestão da Qualidade, em um laboratório de pesquisa básica. Em paralelo, utilizou-se a ferramenta PDCA para definir os objetivos de cada etapa de implantação do sistema de qualidade. Resultados: Este trabalho possibilitou ao laboratório atender requisitos solicitados pela norma NT DICLA 035 e implementá-los durante a execução de um projeto, dentre eles a elaboração de documentos, bem como estabelecer rotinas importantes para o andamento do mesmo, como a identificação de não conformidades, rastreabilidade de dados e alibração de equipamentos. Conclusão: A implantação do Sistema da Qualidade BPL, nesse cenário, é viável, gerando impactos positivos na rotina do laboratório

Leveraging User-Friendly Network Approaches to Extract Knowledge From High-Throughput Omics Datasets

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2019-12-16T11:53:58Z No. of bitstreams: 1 Ramos Pablo I . Leveraging...pdf: 3323461 bytes, checksum: 578b227bea15bb4a3114f428396fddb2 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2019-12-16T12:16:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Ramos Pablo I . Leveraging...pdf: 3323461 bytes, checksum: 578b227bea15bb4a3114f428396fddb2 (MD5)Made available in DSpace on 2019-12-16T12:16:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ramos Pablo I . Leveraging...pdf: 3323461 bytes, checksum: 578b227bea15bb4a3114f428396fddb2 (MD5) Previous issue date: 2019Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), Brazil [Universal 28/2018; grant protocol 427183/2018-9]. LA received a postdoctoral fellowship from the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de 725 Nível Superior (CAPES). AQ acknowledges funding from Fundação Oswaldo Cruz (INOVA - Process VPPIS-001-FIO-18-45). Publication fees were defrayed by Fundação Oswaldo Cruz. The funders had no role in study design, analysis, decision to publish, or preparation of the manuscriptFundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Federal University of Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Laboratório de Genética Molecular e Biotecnologia Vegetal. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Federal do Ceará. Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular. Fortaleza, CE, Brasil.Fundação José Silveira. Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research. Salvador, BA, Brazil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil.Recent technological advances for the acquisition of multi-omics data have allowed an unprecedented understanding of the complex intricacies of biological systems. In parallel, a myriad of computational analysis techniques and bioinformatics tools have been developed, with many efforts directed towards the creation and interpretation of networks from this data. In this review, we begin by examining key network concepts and terminology. Then, computational tools that allow for their construction and analysis from high-throughput omics datasets are presented. We focus on the study of functional relationships such as co-expression, protein-protein interactions, and regulatory interactions that are particularly amenable to modeling using the framework of networks. We envisage that many potential users of these analytical strategies may not be completely literate in programming languages and code adaptation, and for this reason, emphasis is given to tools' user-friendliness, including plugins for the widely adopted Cytoscape software, an open-source, cross-platform tool for network analysis, visualization, and data integration

Serological survey of Leishmania infection in blood donors in Salvador, Northeastern Brazil

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2014-09-19T18:49:37Z No. of bitstreams: 1 Fukutani KF Serological....pdf: 882418 bytes, checksum: d9ab719e76833ecc713e416c22ff3ee0 (MD5)Approved for entry into archive by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2014-09-19T18:49:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Fukutani KF Serological....pdf: 882418 bytes, checksum: d9ab719e76833ecc713e416c22ff3ee0 (MD5)Made available in DSpace on 2014-09-19T18:58:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fukutani KF Serological....pdf: 882418 bytes, checksum: d9ab719e76833ecc713e416c22ff3ee0 (MD5) Previous issue date: 2014Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação de Hematologia e Hemoterapia da Bahia. HEMOBA/SESAB. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Investigação em Imunologia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Investigação em Imunologia. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Investigação em Imunologia. Salvador, BA, BrasilBACKGROUND: Visceral Leishmaniasis is endemic to Brazil, where it is caused by Leishmania infantum (syn. Leishmania chagasi). Following parasite inoculation, individuals may experience asymptomatic infection, raising the possibility of parasite transmission through the transfusion of contaminated blood products. In the present work, we evaluated the prevalence of asymptomatic Leishmania infection among blood donors in Salvador, northeastern Brazil. METHODS: Peripheral blood was collected from 700 blood donors attending the Blood Bank of Bahia (HEMOBA/SESAB), from January to September 2010. We evaluated anti-Leishmania serology by ELISA, employing Soluble Leishmania Antigen (sensitivity 90% and specificity 95%). The presence of parasite DNA was determined by qPCR, targeting a single copy gene (G6PD), and by end-point PCR, targeting multiple targets, namely a segment located in the Leishmania rRNA locus (ITS) and the conserved region of kinetoplastid DNA (kDNA) minicircles. RESULTS: The blood-donor population was comprised of 74.5% of males with a mean age of 34 years. Anti-Leishmania serology by ELISA was positive in 5.4% (38/700) individuals. One individual was also positive for Chagas' disease and another tested positive for Syphilis. Employing qPCR, parasite DNA was not found in any of 38 seropositive samples. However, by ITS PCR, 8/38 (21%) samples were positive and this positivity increased to 26/38 (68%) when we targeted kDNA amplification. Agreement between both techniques (ITS and kDNA PCR) was fair (kappa = 0.219). CONCLUSIONS: These results indicate that asymptomatic infection is present among the blood donor population of Salvador, a finding that warrants a broader discussion regarding the need to implement specific screening strategie

Follow up of a robust meta-signature to identify Zika virus infection in Aedes aegypti: another brick in the wall

<div><p>The mosquito Aedes aegypti is the main vector of several arthropod-borne diseases that have global impacts. In a previous meta-analysis, our group identified a vector gene set containing 110 genes strongly associated with infections of dengue, West Nile and yellow fever viruses. Of these 110 genes, four genes allowed a highly accurate classification of infected status. More recently, a new study of Ae. aegypti infected with Zika virus (ZIKV) was published, providing new data to investigate whether this “infection” gene set is also altered during a ZIKV infection. Our hypothesis is that the infection-associated signature may also serve as a proxy to classify the ZIKV infection in the vector. Raw data associated with the NCBI/BioProject were downloaded and re-analysed. A total of 18 paired-end replicates corresponding to three ZIKV-infected samples and three controls were included in this study. The nMDS technique with a logistic regression was used to obtain the probabilities of belonging to a given class. Thus, to compare both gene sets, we used the area under the curve and performed a comparison using the bootstrap method. Our meta-signature was able to separate the infected mosquitoes from the controls with good predictive power to classify the Zika-infected mosquitoes.</p></div