A sintaxe no brasil: notas historiográficas e eixos temáticos de investigação

This article sets out some thematic axes, particularly designed for the development of historiographic researches about knowledge, ideas, problems, theories and pedagogical models that involve the syntactic dimension of the grammatical studies in Brazil, between the 19th and the 21st centuries. The researching axes and the notes on the history of the syntax, which support them, are based on the grounds of Linguistic Historiography, according to Swiggers (2013, 2012, 2009) and Altman (2012, 2009, 1998). We have tried to draft some comprehension lines so as to implement the construction of descriptive, interpretative and explanatory narratives about the way how syntactic knowledge has been acquired, formulated, widespread, transformed, preserved, taught or forgotten in the Brazilian intellectual context. For this purpose, we have drawn up some sort of brief review of syntactic studies, considering, above all, the Greco-Roman scholarship, the grammatization process of Portuguese and the Brazilian pedagogical context. The narrative is closed with the systematization of three possible thematic axes, carried out in the form of research questions, in order to found a historiography of syntax in Brazil, involving theoretical, descriptive-normative and didacticpedagogical aspects.Este artigo estabelece alguns eixos temáticos apropriados à realização de investigações historiográficas sobre saberes, ideias, questões, teorias e modelos pedagógicos que envolvam a dimensão sintática dos estudos gramaticais no Brasil, entre os séculos XIX e XXI. Os eixos de investigação e as notas sobre a história da sintaxe que os fundamentam são desenvolvidos no campo da Historiografia da Linguística, nos termos de Swiggers (2013, 2012, 2009) e Altman (2012, 2009, 2004). Procura-se esboçar algumas linhas de compreensão capazes de conduzir a construção de narrativas descritivas, interpretativas e explicativas sobre como o conhecimento sintático foi adquirido, formulado, difundido, transformado, preservado, ensinado ou esquecido no contexto intelectual brasileiro. Para tanto, elabora-se uma espécie de trajetória concisa dos estudos sintáticos, considerando, sobretudo, o universo greco-latino, a gramatização do português e o cenário pedagógico brasileiro. A narrativa tecida deságua na sistematização, em forma de questões de pesquisa, de três possíveis eixos temáticos para uma historiografia da sintaxe no Brasil, envolvendo aspectos teóricos, descritivo-normativos e didático-pedagógicos

Using micropatterning of hiPSCs to induce PGC formation

Tese de mestrado, Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019O estudo in vitro do desenvolvimento dos gâmetas é essencial para compreender os aspetos determinantes da fertilidade em mamíferos e em particular em humanos. Nesse âmbito inclui-se nesta tese a investigação das células precursoras deste tipo celular, as Células Germinais Primordiais (PGCs). De acordo com estudos anteriores em ratinho, as células precursoras das PGCs (pPGCs) podem ser identificadas durante o período de gastrulação. Restrições éticas e legislativas relativas à utilização de embriões humanos em fase de gastrulação se insere impedem o estudo destas últimas com recurso a cultura de embriões humanos. Como estas restrições excluem a possibilidade de efetuar análises no período em que se estima abranger a gastrulação humana, não é possível atualmente estudar estes acontecimentos com base em observações feitas com embriões humanos. Por este motivo recorreu-se a um método de cultura celular usando diferenciação de células humanas pluripotentes induzidas (hiPSCs) e células estaminais embrionárias humanas (hESCs). Este método permite replicar até um certo ponto a gastrulação in vivo. O método 2D de cultura de células desenvolvido por Warmflash et al. (2014) foi escolhido como base. Este método apoia-se na micropadronização de lamelas (com fibronectina) para obter diferenciação celular, com estimulação da via da proteína morfogenética do osso (bone morphogenetic protein4, BMP4). Tentou-se reproduzir o aparecimento dos folhetos germinativos e a sua organização em domínios distintos mutuamente repressivos, devido a moléculas secretadas por cada folheto germinativo que asseguram que células características de um não se formem nos restantes folhetos. O método de Warmflash et al. (2014) recapitula, deste modo, a gastrulação in vitro. No entanto, tal organização foi impossível de obter devido a cobertura sub-ótima dos micropadrões. Este grau de cobertura terá resultado de incompatibilidades entre células e a proteína constituinte dos micropadrões, a fibronectina (FN1). Por este motivo, um outro método baseado na cultura de células estaminais embrionárias humanas (hESCs) em lamelas revestidas com matrigel foi usado, também almejando a geração de PGCs in vitro. Este método produziu resultados positivos, visto que células positivas para três marcadores-chave de PGCs foram detetadas. Estas células foram detetadas ao aplicar imunofluorescência (usando um painel de anticorpos) refinado por meio de análise bioinformática, a partir de marcadores extraídos da literatura. Estes marcadores permitiram evidenciar, por meio de imagiologia às lamelas, a presença de potenciais PGCs. Com este método foi possível induzir potenciais PGCs, abrindo-se um novo meio para investigar os mecanismos e vias de sinalização para estudar estas células sem ter de recorrer ao uso de animais ou embriões humanos em cultura.Understanding PGC development is key to uncover new strategies to assist the reproduction of humans and non-human organisms. However, the study of human early gametogenesis falls under the same restrictions associated with studying human early development. This means culturing human embryos past two weeks (14 days), the estimated stage at which gastrulation should begin is out of reach under the law. This motivated the current efforts for investigating methods that replicate gastrulation in vitro as closely as possible. A 2D protocol developed initially by Warmflash et al. (2014) potentially fulfils this necessity according to tests performed by the authors. This allows the use of micropatterning for differentiating colonies of human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) with supplementation of bone morphogenetic protein4(BMP4). The authors showed that colonies develop the three germ layers (ectoderm, mesoderm, endoderm and extraembryonic ectoderm). The promise that this 2D platform provides the means to recreate the cellular interactions of gastrulation prompted for the question driving this study: Can primordial germ cells (PGCs) be induced from hiPSCs by differentiating them in micropatterns? To answer this question, a search for genes, that could be used as markers, was first conducted. Thus, several genes were selected from established marker genes and others whose validation has been less extensive in the literature. This was followed by a bioinformatics analysis was performed on a data set containing both germ and somatic cells from Li et al. Cell (2017). This data set was analysed in parallel with one other containing primed and naïve stem cells from Messmer et al. Cell (2019). In this manner, the exploration of these datasets resulted in a basic analysis, which was the source of proposed antibody combinations to detect PGCs. After obtaining the appropriate marker combinations for immunostaining, the 2D method was tested for its suitability to induce PGCs. However, the seeding of these micropatterns with hiPSCs or human embryonic stem cells (hESCs) revealed to be technically challenging for this study. Continuous experimental difficulties with achieving uniform attachment (coverage) of hiPSCs to the micropatterns motivated searching for PGCs in vitro through a different method, while also relying on the previously identified marker combinations. The new method used seeding of hESCs on Matrigel coated glass coverslips in conjunction with BMP4 stimulation, as applied on the micropatterns. This protocol was then used to look for indications of possible human PGCs in culture through immunostaining of the fixed coverslips, for selected marker combinations. After imaging it was possible to observe cells with PGC morphology and co-expression of key PGC markers. Due to the resemblance of the observed cells to PGCs, it is likely that PGCs may have been generated using the proposed method of stimulation. The same that is used in micropatterns by Warmflash et al. (2014). Taken together, this thesis describes a potential method to study PGC specification without animal experimentation or resorting to human embryo culture

The role of attention in the processing of emotional vocalizations: ERP insights

Dissertação de mestrado integrado em Psicologia, (área de especialização em Psicologia Clínica e da Saúde)Identificar rapidamente as emoções transmitidas pela voz e pelas faces dos outros é fundamental para um funcionamento social adequado. Vários estudos comportamentais e electrofisiológicos analisaram o processamento dos sinais usados na comunicação emocional. Contudo, a maioria utilizou faces ou palavras faladas como estímulos. Assim, ainda pouco se sabe sobre os correlatos neuronais e o desenvolvimento temporal do processamento de vocalizações não-verbais. O presente estudo usou a técnica de ERP (potenciais relacionados com eventos) para estudar o processamento de vocalizações não-verbais emocionais (alegria e raiva) e neutras num estado tardio do processamento. O componente de onda P300 foi analisado. Foi descoberto um efeito modulatório da emoção sobre a amplitude deste. Vocalizações de alegria e raiva evocaram amplitudes mais positivas para o componente P300 em comparação com neutras. Mais, foi encontrado um efeito do contexto emocional no processamento de sons neutros. Vocalizações de neutralidade num contexto de raiva evocaram um componente P300 de amplitude mais positiva em comparação com vocalizações de neutralidade num contexto de alegria. Adicionalmente, foi observada uma diferença de género: verificou-se uma amplitude mais positiva do P300 para mulheres. Estes resultados sugerem um efeito da valência dos estímulos a um nível atencional e de memória imediata, indexado pelo componente P300.Rapidly and effectively identifying the emotions conveyed by others’ faces and voices is fundamental for an adequate social functioning. Several behavioral and electrophysiological studies have analyzed the processing of emotional communication signals. Nonetheless, the majority used faces or spoken words as stimuli. Yet, little is known about the neural correlates and temporal course of the processing of non-verbal vocalizations. The present study used the ERP (Event-Related Potential) methodology to study the processing of non-verbal emotional (angry and happy) versus neutral vocalizations at a later stage of processing. The P300 component was analyzed. Its amplitude was differently modulated as a function of emotion. Angry and happy vocalizations elicited more positive amplitudes for the P300 component in comparison with neutral ones. Furthermore, emotional context was found to have an effect on the processing of neutral sounds. Neutral vocalizations in an angry context elicited a more positive amplitude P300, in comparison to neutral vocalizations in a happy context. Furthermore, a gender difference was observed: the P300 amplitude was found to be more positive for female relative to male participants. Together, these findings suggest an effect of stimulus (non-verbal vocalizations) valence at an attentional and immediate memory level, as indexed by the P300 component

Resistência de Venturia inaequalis a estrobilurinas na Cova da Beira

Dissertação de Mestrado em Fruticultura Integrada apresentada à Escola Superior Agrária do Instituto Politécnico de Castelo Branco.O pedrado, causado pelo fungo Venturia inaequalis, e uma das doenças-chave da macieira. A aplicação de fungicidas, para o seu controlo, representa a maior parte das intervenções fitossanitárias realizadas num pomar. A conjugação do elevado risco de desenvolvimento de resistência por parte de V. inaequalis, com o elevado risco para induzir resistência inerente as estrobilurinas e o facto de se verificarem infecções de pedrado em pomares tratados com estrobilurinas, vaticinaram que podem existir fenómenos de resistência na região da Cova da Beira. Neste trabalho, foram realizados dois tipos de ensaios: ensaio de campo e ensaio in vitro. No ensaio de campo, foram testadas as duas estrobilurinas homologadas em Portugal para o pedrado (cresoxime-metilo e trifloxistrobina), utilizando como referência a dodina. Este ensaio foi realizado em dois pomares da Cova da Beira, com histórico diferente de aplicação de estrobilurinas, denominados pomar de alto risco e pomar de baixo risco. No ensaio in vitro, foram utilizados conídios de lesões de pedrado provenientes dos dois pomares, onde se efectuou o ensaio de eficácia de campo, e ainda de lesões, provenientes de zona não frutícola, nunca tratadas com os fungicidas testados. O ensaio in vitro revelou total resistência do pedrado as estrobilurinas do pomar de alto risco. Este facto foi comprovado pelo ensaio de campo, onde a maior parte das folhas e frutos apresentavam infecções a colheita. No pomar de baixo risco, verificou-se a existência de cerca de um terço de conidios germinados na presença de estrobilurinas, contudo, este nível de resistência, não se reflectiu numa perda significativa de eficácia no ensaio de campo

Pine wilt disease and red ring disease of coconut: opportunities and perspectives in the study of two nematodes Bursaphelenchus xylophilus and B. cocophilus.

The xylophagous nematodes Bursaphelenchus cocophilus and B. xylophilus (Nematoda: Parasitaphelenchidae), are causative agents of two serious diseases, “red ring disease” (RRD) with great importance to coconut and certain oil palm species in Central and South America, and in “pine wilt disease” (PWD), which has wreaked havoc in forest areas in the Far East and now more recently in Europe (Portugal and Spain). PWD has not yet been detected in Brasil or any other country in Central or South America, but there is great risk of introduction due to worldwide movement of wood and wood products through major sea ports. Recently, for example, wood shipments originating from Brasil, infested with B. xylophilus, have been intercepted in China. Due to the taxonomical proximity between these two nematodes (the only two plant pathogenic species within the genus Bursaphelenchus, containing nearly 100 species), the similarity of life cycles (with the insect vectors Rhynchophorus palmarum for B. cocophilus and Monochamus spp. for B. xylophilus) and the likely genomic and proteomic similarities, a comparative study between these two nematodes may provide important insights into understanding RRD, in particular through the genome sequencing of B. cocophilus, and comparison with the recently sequenced genome of B. xylophilus. Knowledge on specific pathogenicity genes, involved in the RRD process, combined with past and present knowledge, should be helpful in designing new and effective control methods for this major tropical disease of coconut and palm

Deep Learning for activity recognition in real-time video streams

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia InformáticaIn an ever more connected world, smart cities are becoming ever more present in our society. In these smart cities, use cases in which innovations that will benefit its inhabitants are also growing, improving their quality of life. One of these areas is safety, in which Machine Learning (ML) models reveal potential in real-time video-stream analysis in order to determine if violence exists in them. These ML approaches concern the field of Computer Vision, a field responsible for traducing digital images and videos, and be able to extract knowledge and understandable information from them, in order to be used in diverse contexts. Some of the available alternatives to recognise actions in video streams are based on ML approaches, such as Deep Learning (DL), that grew in popularity in the last years, as it was realised that it had massive potential in several applications that could benefit from having a machine recognising diverse human actions. In this project, the creation of a ML model that can determine if violence exists in a video-stream is proposed. This model will leverage technology being used in State of the Art methods, such as video classifiers, but also audio classifiers, and Early/Late Fusion (EF / LF) schemes that allow the merging different modalities, in the case of the present work: audio and video. Conclusions will also be drawn as to the accuracy rates of the different types of classifiers, to determine if any other type of classifiers should have more prominence in the State of the Art. This document begins with an introduction to the work being conducted, in which both the its context, mo tivation and objectives are explained. Afterwards, the methodology used in order to more efficiently conduct the research in this Thesis is clarified. Following that, the State of the Art concerning ML based approaches to Action Recognition and Violence Detection is explored. After being brought to date in what are the State of the Art approaches, one is able to move forward to the following chapter, in which the Training method that will be employed to train the models that were seen as the best candidates to detect violence is detailed. Subsequently, the selected models are scrutinized in an effort to better understand their architecture, and why they are suited to detect violence. Afterwards, the results achieved by these models are explored, in order to better comprehend how well these performed. Lastly, the conclusions that were reached after conducting this research are stated, and possibilities for expanding this work further are also presented. The obtained results prove the success and prevalence of video classifiers, and also show the efficacy of models that make use of some kind of fusion.Num mundo cada vez mais conetado, as cidades inteligentes tornam-se cada vez mais presentes na nossa sociedade. Nestas cidades inteligentes, crescem também os casos de uso nos quais podem ser aplicadas inovações que beneficiarão os seus habitantes, melhorando a sua qualidade de vida. Uma dessas áreas é a da segurança, na qual modelos de Aprendizagem Máquina (AM) apresentam potencial para analisar streams de vídeo em tempo real e determinar se nestas existe violência. Estas abordagens de AM são referentes ao campo de Visão por Computador, um campo responsável pela tradução de imagens e vídeos digitais, e pela extração de conhecimento e informação inteligível dos mesmos, de modo a ser utilizada em diversos contextos. Algumas das alternativas disponíveis para reconhecer ações em streams de vídeo são baseados em abordagens de AM, tais como Aprendizagem Profunda (AP), que cresceu em popularidade nos últimos anos, à medida que se tornou claro o massivo potencial que tinha em diversas aplicações, que poderiam beneficiar de ter uma máquina a reconhecer diversas ações humanas. Neste projeto, é proposta a criação de um modelo de Machine Learning que permita determinar a existência de violência numa stream de vídeo. Este modelo tomará partido de tecnologia utilizada em métodos do Estado da Arte como classificadores de vídeo, mas também de classificadores áudio, e esquemas de Fusão Antecipada / Tardia (FA / FT) que permitem a combinação de várias modalidades de dados, neste caso: áudio e vídeo. Serão tiradas também conclusões sobre as taxas de acerto dos diversos tipos de classificadores, de modo a determinar se algum outro tipo de classificador deveria de ter mais prominência Este documento começa com uma introdução ao trabalho levado a cabo, em que o seu contexto, motivação, e objetivos são explicados. Seguidamente, a metodologia utilizada de modo a mais eficientemente levar a cabo a pesquisa nesta Tese é clarificada. Após isso, o Estado da Arte no que concerne abordagens baseadas em AM para Reconhecimento de Ações e Deteção de Violência é explorado. Depois de ser atualizado em relação a quais são consideradas abordagens de Estado da Arte, é possível avançar para o capítulo seguinte, onde o método utilisado para treinar os modelos que foram considerados como os melhores candidatos para detetar violência é detalhado. Subsequentemente, os modelos selecionados são escrutinizados de modo a melhor entender a sua arquitetura, e porque são adequados para detetar violência. Depois, os resultados conseguidos por estes modelos são explorados, de modo a melhor compreender o desempenho conseguido. Finalmente, as conclusões que foram chegadas a são apresentadas, tais como possibilidades para expandir e melhorar esta pesquisa. Os resultados obtidos comprovam o sucesso e a prevalência dos classificadores de vídeo, e mostram também a eficácia dos modelos que tomam partido de algum tipo de fusão

Proposal of a Material Handling System Design Methodology – An Industrial Application on A Packaging and Depalletizing System

In modern competitive environment, cost reduction across various production functions is im- perative. Material handling is no exception, as achieving a well-designed MHS (Material Han- dling System) is key for lowering operational costs and improving the work environment. Companies offering services such as the design of MHSs often find themselves devel- oping MHS design concepts to present to their customers before proceeding with the remain- ing systems' development. Although there are currently several approaches to the design of MHSs, most of these approaches are tailored to design and develop these systems to comple- tion. The present dissertation proposes a MHS design methodology suitable for designing MHSs both up to a concept stage and a detailed stage (complete design). The proposed meth- odology mainly differs from conventional approaches by identifying, prioritizing, and evaluat- ing key system metrics before proceeding with the equipment selection and validation pro- cesses. Doing so increases the likelihood of detecting unforeseen problems or opportunities for improvement sooner in the design process. In addition, if performed, these steps allow the companies mentioned above to achieve and propose design concepts truer to the eventual complete systems. This dissertation was performed within the scope of an internship at Metal-Conser, a company that designs and manufactures material handling systems. To evaluate the proposed MHS design methodology, the last was applied to a packag- ing and depalletizing system and compared to a design concept of the same system proposed by Metal-Conser. Additionally, during the methodology application, simulation software was used both to simulate the system's pick and place operations and to model and simulate the system's operations. Both of these applications had the intent to validate the use of these tools in future operations at Metal-Conser.No ambiente competitivo moderno, a redução de custos em várias funções associadas com produção é imperativa. A manipulação de materiais não é exceção, visto que projetar correta- mente um sistema de manipulação de materiais é fundamental para reduzir custos operacio- nais e melhorar a logística operacional. Empresas que oferecem serviços como o projeto de sistemas de manipulação regular- mente desenvolvem conceitos de projeto para apresentar aos seus clientes antes de prosseguir com o restante desenvolvimento do projeto. Embora existam atualmente várias abordagens para o projeto deste tipo de sistemas, a maioria destas abordagens é adaptada para os projetar e desenvolver até ao fim. A presente dissertação propõe uma metodologia de projeto de sistemas de manipula- ção de materiais adequada para projetar estes sistemas tanto na fase de conceito de projeto como na fase de projeto de definição de pormenor (projeto completo). A metodologia pro- posta difere das abordagens convencionais principalmente por identificar, priorizar e avaliar os principais parâmetros do sistema antes de prosseguir com o processo de seleção e valida- ção de equipamento. A aplicação dos passos propostos, aumenta a probabilidade de detetar problemas imprevistos ou oportunidades de melhoria mais cedo, durante o desenvolvimento do projeto. Como consequência direta da aplicação destes passos as empresas previamente mencionadas, podem alcançar e propor conceitos de projeto mais fiéis aos eventuais sistemas completos. Esta dissertação foi realizada no âmbito de um estágio na Metal-Conser, uma empresa que projeta e fabrica sistemas de manipulação de materiais. Para avaliar a metodologia de projeto proposta, esta foi aplicada a um sistema de em- balamento e despaletização, sendo depois comparada a um conceito de projeto proposto pela Metal-Conser, para o mesmo sistema. Adicionalmente, durante a aplicação da metodologia, recorreu-se ao uso de software de simulação, tanto para simular operações de pick and place, como para modelar e simular as operações do sistema projetado. Ambos os casos tinham como objetivo validar o uso destessoftwares em futuras operações na Metal-Conse

Realistic vulnerability injections in PHP web applications

Tese de mestrado em Segurança Informática, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2011A injecção de vulnerabilidades é uma área que recebeu relativamente pouca atenção da comunidade científica, provavelmente por o seu objectivo ser aparentemente contrário ao propósito de fazer as aplicações mais seguras. Esta pode no entanto ser usada em variadas áreas que a fazem merecedora de ser investigada, tais como a criação automática de exemplos educacionais de código vulnerável, testar mecanismos de segurança em profundidade, e a avaliação de detectores de vulnerabilidades e de equipas de segurança. Esta tese propõe uma arquitectura para uma ferramenta de injecção de vulnerabilidades genérica que permite a inserção de vulnerabilidades num programa, e aproveita a vasta investigação existente sobre detecção de vulnerabilidades. A arquitectura é também extensível, suportando a adição de novas vulnerabilidades para serem injectadas. Foi também implementado e avaliado um protótipo baseado nesta arquitectura por forma a perceber se a arquitectura era implementável. O protótipo consegue injectar a maior parte das vulnerabilidades da class taint-style, desde que em aplicações web desenvolvidas em PHP. Esta tese contém também um estudo sobre as vulnerabilidades presentes nas últimas versões de algumas aplicações PHP bem conhecidas, que permite perceber quais os tipos de vulnerabilidade mais comuns. Este estudo conclui que as vulnerabilidades que o protótipo permite já incluem a maioria das vulnerabilidades que aparecem habitualmente em aplicações PHP. Finalmente, várias aplicações PHP foram usadas na avaliação. O protótipo foi usado para injectar diversas vulnerabilidades sobre estas aplicações, e após isso as injecções foram analisadas à mão para verificar se uma vulnerabilidade tinha sido criada ou não. Os resultados mostram que o protótipo consegue não só injectar uma grande quantidade de vulnerabilidades mas também que estas são atacáveis e realistas.Vulnerability injection is a field that has received relatively little attention by the research community, probably because its objective is apparently contrary to the purpose of making applications more secure. It can however be used in a variety of areas that make it worthy of research, such as the automatic creation of educational examples of vulnerable code, testing defense in depth mechanisms, and the evaluation of both vulnerability scanners and security teams. This thesis proposes an architecture for a generic vulnerability injection tool that allows the insertion of vulnerabilities in a program, and leverages from the vast work available on vulnerability detection. The architecture is also extensible, supporting the addition of new vulnerabilities to inject. A prototype implementing the architecture was developed and evaluated to analyze the feasibility of the architecture. The prototype targets PHP web applications, and is able to inject most taintstyle type vulnerabilities. The thesis also contains a study on the vulnerabilities present in the latest versions of some well known PHP applications, providing a better understanding of which are the most common types of vulnerabilities. This study shows that the vulnerabilities that the prototype is able to inject already includes the majority of the vulnerabilities that appear in PHP web applications. Finally, several PHP applications were used in the evaluation. These were subject to injections using the prototype, after which they were analyzed by hand to see whether a vulnerability was created or not. The results show that the prototype can not only inject a great amount of vulnerabilities but that they are actually attackable