Classifying Coding DNA with Nucleotide Statistics

In this report, we compared the success rate of classification of coding sequences (CDS) vs. introns by Codon Structure Factor (CSF) and by a method that we called Universal Feature Method (UFM). UFM is based on the scoring of purine bias (Rrr) and stop codon frequency. We show that the success rate of CDS/intron classification by UFM is higher than by CSF. UFM classifies ORFs as coding or non-coding through a score based on (i) the stop codon distribution, (ii) the product of purine probabilities in the three positions of nucleotide triplets, (iii) the product of Cytosine (C), Guanine (G), and Adenine (A) probabilities in the 1st, 2nd, and 3rd positions of triplets, respectively, (iv) the probabilities of G in 1st and 2nd position of triplets and (v) the distance of their GC3 vs. GC2 levels to the regression line of the universal correlation. More than 80% of CDSs (true positives) of Homo sapiens (>250 bp), Drosophila melanogaster (>250 bp) and Arabidopsis thaliana (>200 bp) are successfully classified with a false positive rate lower or equal to 5%. The method releases coding sequences in their coding strand and coding frame, which allows their automatic translation into protein sequences with 95% confidence. The method is a natural consequence of the compositional bias of nucleotides in coding sequences

Universal Features for the Classification of Coding and Non-coding DNA Sequences

In this report, we revisited simple features that allow the classification of coding sequences (CDS) from non-coding DNA. The spectrum of codon usage of our sequence sample is large and suggests that these features are universal. The features that we investigated combine (i) the stop codon distribution, (ii) the product of purine probabilities in the three positions of nucleotide triplets, (iii) the product of Cytosine, Guanine, Adenine probabilities in 1st, 2nd, 3rd position of triplets, respectively, (iv) the product of G and C probabilities in 1st and 2nd position of triplets. These features are a natural consequence of the physico-chemical properties of proteins and their combination is successful in classifying CDS and non-coding DNA (introns) with a success rate >95% above 350 bp. The coding strand and coding frame are implicitly deduced when the sequences are classified as coding

Hábitos saludables de los trabajadores del CSIC durante el confinamiento por la COVID-19 en España

Aim: COVID-19 crisis has caused a deep change in citizen’s lifestyle. Previous outbreaks have shown that people under confinement can develop mental health problems and cause effects on physical activity (PA) and changes in the diet habits. Subject and Methods: An online questionnaire about healthy habits during the Spanish lockdown was sent to workers from the Spanish National Research Council (CSIC). Results: A general improvement in the dietary patterns, except for the intake of snacks and bakery goods was observed. PA was substantially reduced, mostly in men, unlike the emotional changes, which were greater in women, mainly observed as anxiety and sleep disorders. Additionally, emotional eating (EE) behaviors were detected mainly in women, although the intake related to boredom was observed in both genders. Conclusions: Overall, the dietary patterns of CSIC workers followed the general recommendations for COVID-19 lockdown. However, half of the participants decreased their PA practice. Regarding to the emotional changes, emotional eating behaviors were associated with anxiety, especially in women, and boredom for both genders.Objeto: la crisis de la COVID-19 ha causado un cambio profundo en el estilo de vida de la ciudadanía. Las olas previas han demostrado que en régimen de confinamiento se pueden desarrollar problemas de salud mental y hay efectos sobre la actividad física y cambios en los hábitos dietéticos. Tema y metodología: se envió a los trabajadores del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) un cuestionario en línea sobre sus costumbres relacionadas con la salud durante el confinamiento en España. Resultados: en general se observó una mejora en los patrones dietéticos, excepto por la ingesta de aperitivos y de productos de panadería y bollería. La actividad física quedó sustancialmente reducida, especialmente en los hombres, al contrario que los cambios psicológicos, que fueron mayores en las mujeres, manifestados principalmente como ansiedad y desorden del sueño. Además, las conductas de ingesta alimentaria como escape emocional se detectaron principalmente en las mujeres, aunque la ingesta relacionada con el aburrimiento se observó en ambos géneros. Conclusión: los patrones dietéticos de los trabajadores del CSIC siguieron en general las recomendaciones para el confinamiento de la COVID-19, aunque la mitad de los participantes disminuyeron la práctica de actividad física. Con respecto a los cambios psicológicos, las conductas de ingesta alimentaria como escape emocional aparecieron asociadas a la ansiedad, especialmente en las mujeres, y al aburrimiento en ambos géneros

Plan de comunicación: Restaurante Donde Carol

El Trabajo de Fin de Grado es un plan de comunicación para el restaurante Donde Carol, situado en el centro de Zaragoza e inaugurado a finales del año 2014. Para conocer la situación del establecimiento se realizó un análisis interno y un análisis externo del entorno, con lo que se elaboró el DAFO del restaurante. Este permitió fijar dos objetivos y tres combinaciones objetivo-público objetivo para las que se han propuesto diferentes estrategias y acciones de comunicación. El plan se realizara de febrero a junio del 2016 con un presupuesto máximo de 5500€

New insights on the self-organization of PEG/alpha-cyclodextrin- based Polyrotaxanes in solution: an experimental and theoretical study

Size exclusion chromatography coupled with light scattering (SEC/MALS), dynamic light scattering (DLS), steady-state and time-resolved fluorescence, as well as molecular dynamics (MD) simulations are used to study the behavior of several poly(ethylene glycol) (PEG)/α-cyclodextrins (αCDs) polyrotaxanes (PRs) in solution. The number of CD units in any of the PRs studied is always smaller than that required to saturate the PEG chains. These PRs seem to aggregate in dimethyl sulfoxide (DMSO) solution. The presence of hairpins in the non-saturated PRs contributes to diminishing their expected large dimensions. Intra- and inter­molecular interactions and forces responsible for hairpins and aggregation are investigated.This work was supported by the University of Alcalá (GC2011–002 and UAH2011/EXP-036) and Nanomod (MAT2010–17091) from the Spanish Ministerio de Ciencia e Innovación. The authors acknowledge the assistance of M. L. Heijnen with the preparation of the manuscript

Insistencias: viejas inquietudes, nuevas preguntas a los game studies

El Proyecto de Investigación 18.4 avanza sobre el estudio de las nuevas preguntas y viejas inquietudes acerca de los game studies. Cuando los game studies empezaron a delimitarse como campo de estudio a comienzos del nuevo milenio tuvieron que luchar por hacerse un lugar propio dentro de la academia. Dos décadas después, la producción académica del campo exhibe, por debajo de sus quiebres, debates y novedades más espectaculares, líneas de continuidad que señalan inquietudes e interrogantes que se perpetúan. Estas continuidades confirman que los game studies, al igual que muchos otros espacios y disciplinas, se consolidan en torno a un conjunto de reflexiones e intereses cuya reiteración acaba por conferirle al campo un rostro singular, una identidad propia

Insistencias: Viejas inquietudes, nuevas inquietudes de los Game Studies

El juego, actividad lúdica inherente al ser humano, es fundamental para el desarrollo de las personas como elemento de exploración del mundo.&nbsp

Una propuesta flexible para acompañar las trayectorias de nuestros estudiantes

Objetivos de la propuesta: Ofrecer una opción pedagógica semipresencial a personas mayores de 18 años sin título secundario completo, que por razones de distinta índole no puedan asistir diariamente al CENS, garantizando la democratización de la enseñanza a partir de una oferta flexible. Destinatarios: adultos de la comunidad del Algarrobal sin sus estudios secundarios terminados y con poca disponibilidad para cursar presencialmente, estudiantes de la modalidad presencial del CENS que no pueden continuar cursando por problemas de horarios, egresados de CEBJA que concluyan sus estudios a mediados o final del ciclo académico y que no puedan incorporarse en la modalidad presencial.Fil: Almonacid, María Cecilia.Fil: De la Reta, Noelia.Fil: Frías, Julieta.Fil: Gómez, Diego

Diabetes mellitus gestacional: una aproximación a los conceptos actuales sobre estrategias diagnósticas

La diabetes mellitus gestacional (DMG) es un estado de intolerancia a los carbohidratos que se reconoce por primera vez durante la gestación. Los criterios iniciales para su diagnóstico fueron establecidos hace más de 50 años por O’Sullivan and Mahan, desde entonces se les han hecho modificaciones. En la actualidad, para el diagnóstico se tienen en cuenta dos métodos: el enfoque de un paso, consistente en una prueba de tolerancia oral a la glucosa (PTOG) de 2 horas con 75g de glucosa, y el enfoque de dos pasos, que se compone por una prueba de tamizaje inicial con 50g de glucosa y una PTOG con 100g de glucosa si el tamizaje fue positivo. Ambos enfoques diagnósticos han sido justificados por consensos de expertos, sin embargo aún no se ha establecido un concepto absoluto sobre qué método aplicar; para la elección del método, el clínico debe tener en cuenta diversos factores. Este artículo propone hacer una descripción histórica y exponer el estado actual del diagnóstico de la DMG.Gestational diabetes mellitus (GDM) is a state of carbohydrate intolerance that is first recognized during pregnancy. The initial criteria for diagnosis were established more than 50 years ago by O’Sullivan and Mahan, and since then, some modifications have been made. Currently, diagnosis considers two methods: the onestep approach, consisting of an oral glucose tolerance test (OGTT) for 2 hours with 75g of glucose, and the two-step approach, which involves an initial screening test with 50g of glucose and OGTT with 100g of glucose if screening is positive. Both diagnostic approaches have been justified by expert consensus; however, an absolute concept about the method to be applied has not been established yet. To select a method, the clinician must take into account various factors. This paper proposes a historical overview and the presentation of the current status of GDM diagnosis

Effects of Occupational Therapy Program Based on Active Meditation on Hair Cortisol Levels in Undergraduate Healthcare Students

Context. Meditation incorporation helps to fight against disorders such as depression, stress, and anxiety. Specifically, few studies have studied Osho's Active Meditation on young people, but observed evidence using passive meditation shows that it could improve stress well-management, emotional control, and other mental unhealthy conditions. Goal. The present study pointed to evaluate the results of an occupational therapy program centered on active meditation on hair cortisol concentration in a sample of undergraduate healthcare students. Methods. Undergraduate students from the University of Chile's health careers were divided at random into control (n=7) and treated groups (n=15). The treated group participated in an active meditation program once a week for three months. This treatment included different techniques such as Chakra Sounds, Nataraj, Mandala, Kundalini, Devavani, Gourishankar, and Nadabrahma. Hair samples were taken before and after the treatment period to measure cortisol. Results. The control group increased cortisol level 168.9±76.8 pg/mg compared with initial levels. The treated group shows a decrease of initial cortisol values in 28.5±12.8 pg/mg after meditation protocol application. Conclusions. Blending active meditation in students' daily routine through occupational therapy intervention might prevent undergraduate students' stress in healthcare careers.Fil: Espinosa, Alejandra. Universidad de Valparaíso; ChileFil: Morrison, Rodolfo. Universidad de Chile; ChileFil: Gonzalez, Diego Javier. Universidad de Chile; ChileFil: Jamardo, Juan. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; ArgentinaFil: Fortuna, Federico. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Díaz, Carmen Paz. Universidad de Chile; ChileFil: Gutiérrez, Pamela. Universidad de Chile; ChileFil: Frías, Carla. Universidad de Chile; ChileFil: Soto, Paula. Universidad de Chile; ChileFil: González, Alejandra. Universidad de Chile; ChileFil: Mella, Sandra. Universidad de Chile; ChileFil: Fabre, Bibiana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentin