Description of relevant aspects for genetic evaluation of patients with orofacial clefts in Alagoas

Orientador: Vera Lúcia Gil da Silva LopesDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: As fendas orofaciais (FOF) têm prevalência mundial em torno de 1:600 nascidos-vivos. Trata-se de um grupo heterogêneo, com significativa associação a comorbidades e que demanda assistência multiprofissional, integral e especializada. No Brasil, embora exista a Rede de Referência no Tratamento de Deformidades Craniofaciais (RRTDCF), com atuação na esfera de alta complexidade, não existem propostas para os demais níveis de atenção no Sistema Único de Saúde (SUS). O presente estudo representa uma abordagem pioneira em Alagoas, com o objetivo de contribuir para a atenção em genética de portadores de fendas orofaciais no estado, por meio do reconhecimento das características clínicas e genéticas de seus portadores. Os dados foram coletados entre setembro de 2009 e fevereiro de 2011, por meio de protocolo validado. A casuística foi composta por 104 indivíduos (M1,1:F1). Apenas 11,5% dos pacientes tinham idade inferior a um ano. Do total da amostra, 38/104 (36,5%) ainda necessitam de cirurgia primária para correção da FOF e, destes, 15/38 (39,5%) apresentam idade superior a 2 anos. Quanto ao tipo de FOF, 61,5% apresentavam fenda labiopalatal, 23,1%, fenda labial e 15,4%, fenda palatal. Setenta e cinco por cento dos casos eram de FOF isolada e 25,0%, de FOF sindrômicas. Os defeitos major acometiam os sistemas nervoso central, cardiovascular e esquelético. A taxa de consanguinidade parental foi 9,7% e de recorrência familial, 28,7%. Houve associação preferencial entre deficiência mental e FOF sindrômica (p=0,003). Os resultados retratam a realidade local, relativos ao diagnóstico e ao tratamento de FOF. As características clínicas apresentadas foram similares às descritas na literatura. Detectou-se acesso tardio à cirurgia e avaliação genético-clínica de parte significativa da amostra. Esses resultados poderão ser aplicados na estruturação da atenção à saúde de pessoas com FOF no SUS, de acordo com as necessidades de saúde específicas da população de AlagoasAbstract: Introduction: Orofacial clefts (OC) occur in approximately 1/600 newborns babies worldwide and are among the most common birth defects. Multidisciplinary, team-based, coordinated and family-centered healthcare is accepted as the state of the art in this field. Public healthcare for patients with orofacial clefts was structured in 1998 in Brazil through 21 units arranged as a network unevenly distributed. Alagoas is a poor state located in the Northeast region of the country in which there is not specialized center for care of patients with OC. Aim: to describe demographic and clinical-genetic characteristics as a subside to structure healthcare for patients with OC in Alagoas. Methods: All patients were systematically seen by two clinical geneticists using a pretested protocol from September 2009 to February 2011. Conventional and molecular cytogenetic analyses were performed in selected patients. Fisher Test was used for statistics with p-value<0.05. Results: majority of patients were males, country side residents, with isolated cleft lip with cleft palate. Ages ranged between 0-37 years. Thirty six percent had never undergone surgery while 100% had never attended to genetic evaluation. Isolated cleft was diagnosed in 75%, syndromes in 14.4%, multiple congenital defects in 9.6% cases and additive randomic defects in 1.0%. Organs systems most affected by major defects were central nervous, cardiovascular and skeletal systems. Recurrence and parental consanguinity were, respectively, 28.7% and 9.7%. Twenty-three individuals without cleft surgery were registered for multidisciplinary treatment. Conclusions: Clinical-genetic characteristics corroborate the literature. Findings revealed high levels of unmet medical needs and provided an evidence base for health care planningMestradoGenetica MedicaMestre em Ciências Médica

Contributions to formulation of the strategies for genetic investigation of syndromic orofacial clefts

Orientadores: Vera Lúcia Gil da Silva Lopes, Isabella Lopes MonlleóTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: Este estudo descreve características clínicas e genéticas de indivíduos com formas sindrômicas de fendas orais típicas (FOT) oriundos de seis serviços integrantes do Projeto Crânio-face Brasil (PCFB). A amostra foi constituída de 73 casos registrados na Base Brasileira de Anomalias Craniofaciais sendo 66 indivíduos com FOT associada a outros defeitos major sem etiologia reconhecida e 7 casos informativos com supeita de síndromes. Informações demográficas e clínicas foram obtidas por meio de protocolo padronizado, aplicado nos serviços participantes (http://www.fcm.unicamp.br/fcm/cranio-face-brasil/projeto-cranio-face-brasil). Exames complementares incluíram ecocardiografia, ultrassonografia abdominal e ressonância magnética do encéfalo, utilizando a estrutura do Sistema Único de Saúde (SUS) do serviço de origem, e cariótipo com bandas G, efetuado em quatro serviços participantes do estudo. O conjunto desses dados compuseram os critérios de seleção do caso para hibridização genômica em array (aGH) utilizando as plataformas GeneChip System CytoScan 750K e HD (Affymetrix®). Os resultados foram confirmados, individualmente, por meio das técnicas de Hibridação Genômica Comparativa em array (aCGH)(plataforma Human Genome CGH Microarray Kit 4x180K, Agilent Technologies®), Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array)(plataforma SNP-array 850K, Illumina®) e Hibridização in situ fluorescente (FISH) (sondas de clones BAC: RP11-35P16, RP11-27M24). Quanto à procedência, 31 (42,5%) sujeitos eram do Nordeste, 25 (34,2%) do Sul e 17 (23,3%) do Sudeste; 34 (46%) apresentavam idade inferior a um ano, sem diferenças quanto ao gênero. Recorrência familial e consanguinidade parental ocorreram em 18% e 5,6% dos casos, respectivamente. A investigação complementar foi concluída em 28 (38,4%) indivíduos, 22 dos quais foram investigados por aGH, tendo sido identificados 4 (18,24%) com CNVs patogênicas. Os resultados corroboram a eficácia da técnica de aGH na investigação etiológica em FOT sindrômica e explicitam dificuldades para realizar a investigação complementar por meio de exames básicos no SUS. Sendo estes essenciais para a correlação genótipo-fenótipo, espera-se que este estudo forneça subsídios para a formulação de estratégias de abordagem genética de indivíduos com de FOT sindrômicas no BrasilAbstract: This study describes clinical and genetic characteristics of individuals with syndromic forms of typical oral clefts (TOC) from six service members of Project skull-face Brazil (PCFB). The sample consisted of 73 cases recorded in the Brazilian Database on Craniofacial Anomalies with 66 individuals with TOC associated with other major defects without known etiology and 7 informative cases with suspicion of syndromes. Demographic and clinical information was obtained through a standardized protocol applied in the participating services (http://www.fcm.unicamp.br/fcm/cranio-face-brasil/projeto-cranio-face-brasil). Additional tests include echocardiography, abdominal ultrasound and MRI of the skull, using Unifyed System of Health (SUS) structure of the original service, and karyotyping with G bands, made in four study participants services. These data composed the case selection criteria for genomic hybridization array (aGH) by GeneChip System CytoScan 750K e HD (Affymetrix®). The results were confirmed individually by array Comparative Genomic Hibridization (aCGH)(Human Genome CGH Microarray Kit 4x180K, Agilent Technologies®), Single Nucleotide Polymorphism Array (SNP-array)(SNP-array 850K, Illumina®) and Fluorescent in situ Hibridization (FISH)(BAC clons: RP11-35P16, RP11-27M24). Considerering the referral origin, 31 (42.5%) subjects were in the Northeast, 25 (34.2%) South and 17 (23.3%) of the Southeast; 34 (46%) were younger than one year, there was no difference according to gender. Parental consanguinity and familial recurrence occurred in 18% and 5.6% of cases, respectively. A further investigation was completed in 28 (38.4%) patients, 22 of whom were investigated by aGH, 4 have been identified (18.2%) with pathogenic CNVs. The results support the effectiveness of aGH technique in the etiological investigation in syndromic TOC and explicit difficulties in carrying out further investigation through basic tests in SUS. These being essential for genotype-phenotype correlation, it is expected that this study supplies subsidies for the development of genetic approach strategies of individuals with syndromic TOC in BrazilDoutoradoGenetica MedicaDoutor em Ciências Médicas160391/2012-1CNP

Similar interstitial deletions of the KAL-1 gene in two Brazilian families with X-linked Kallmann Syndrome

Mutations in the KAL-1 gene localized at Xp22.3 have been shown to be responsible for the X-linked Kallmann syndrome (KS), a disorder characterized by the association of hypogonadotropic hypogonadism and anosmia. In this paper, we describe the investigation of two families with X-linked KS, in which similar interstitial deletions ning exons 5 to 10 of the KAL-1 gene were identified. The presence of interspersed repetitive DNA sequences within the KAL-1 gene might have predisposed to this type of mutation