Perfil epidemiológico nutricional de crianças de uma creche de Florianópolis, SC

Trabalho de Conclusão de Curso - Universidade Federal de Santa Catarina. Curso de Medicina. Departamento de Pediatria

Going forward and back : the complex evolutionary history of the GPx

There is large diversity among glutathione peroxidase (GPx) enzymes regarding their function, structure, presence of the highly reactive selenocysteine (SeCys) residue, substrate usage, and reducing agent preference. Moreover, most vertebrate GPxs are very distinct from non-animal GPxs, and it is still unclear if they came from a common GPx ancestor. In this study, we aimed to unveil how GPx evolved throughout different phyla. Based on our phylogenetic trees and sequence analyses, we propose that all GPx encoding genes share a monomeric common ancestor and that the SeCys amino acid was incorporated early in the evolution of the metazoan kingdom. In addition, classical GPx and the cysteine-exclusive GPx07 have been present since non-bilaterian animals, but they seem to have been lost throughout evolution in different phyla. Therefore, the birth-and-death of GPx family members (like in other oxidoreductase families) seems to be an ongoing process, occurring independently across different kingdoms and phyla

Pesquisar-Agir, Pesquisar-Intervir, Pesquisar-Interferir / Search-Act, Search-Intervene, Search-Interfere

Este artigo discute modos de pesquisar a partir da máxima “transformar para conhecer”, tal como propõem os socioanalistas. Aborda-se as derivações da pesquisa-intervenção considerando produções que tratam de sua gênese teórica e social na França e suas atualizações no Brasil, tratando de estratégias de produção de conhecimento forjadas no bojo das discussões relativas aos modos de fazer ciência no campo social. A partir daí, são tematizadas três séries/modulações de fazer pesquisa: pesquisar-agir; pesquisar-intervir; pesquisar-interferir

Molecular evolution and diversification of the GRF transcription factor family

Growth Regulating Factors (GRFs) comprise a transcription factor family with important functions in plant growth and development. They are characterized by the presence of QLQ and WRC domains, responsible for interaction with proteins and DNA, respectively. The QLQ domain is named due to the similarity to a protein interaction domain found in the SWI2/SNF2 chromatin remodeling complex. Despite the occurrence of the QLQ domain in both families, the divergence between them had not been further explored. Here, we show evidence for GRF origin and determined its diversification in angiosperm species. Phylogenetic analysis revealed 11 well-supported groups of GRFs in flowering plants. These groups were supported by gene structure, synteny, and protein domain composition. Synteny and phylogenetic analyses allowed us to propose different sets of probable orthologs in the groups. Besides, our results, together with functional data previously published, allowed us to suggest candidate genes for engineering agronomic traits. In addition, we propose that the QLQ domain of GRF genes evolved from the eukaryotic SNF2 QLQ domain, most likely by a duplication event in the common ancestor of the Charophytes and land plants. Altogether, our results are important for advancing the origin and evolution of the GRF family in Streptophyta

Effective recommendations towards healthy routines to preserve mental health during the COVID-19 pandemic

Objective: To assess the adherence to a set of evidence-based recommendations to support mental health during the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic and its association with depressive and anxiety symptoms. Methods: A team of health workers and researchers prepared the recommendations, formatted into three volumes (1: COVID-19 prevention; 2: Healthy habits; 3: Biological clock and sleep). Participants were randomized to receive only Volume 1 (control), Volumes 1 and 2, Volumes 1 and 3, or all volumes. We used a convenience sample of Portuguese-speaking participants over age 18 years. An online survey consisting of sociodemographic and behavioral questionnaires and mental health instruments (Patient Health Questionnaire-9 [PHQ-9] and Generalized Anxiety Disorder-7 [GAD-7]) was administered. At 14 and 28 days later, participants were invited to complete follow-up surveys, which also included questions regarding adherence to the recommendations. A total of 409 participants completed the study – mostly young adult women holding university degrees. Results: The set of recommendations contained in Volumes 2 and 3 was effective in protecting mental health, as suggested by significant associations of adherence with PHQ-9 and GAD-7 scores (reflecting anxiety and depression symptoms, respectively). Conclusion: The recommendations developed in this study could be useful to prevent negative mental health effects in the context of the pandemic and beyond

Identificação e caracterização de uma nova heme peroxidase exclusiva de plantas

Peroxidases são enzimas amplamente distribuídas nos organismos, sendo de fundamental importância para o seu desenvolvimento. Atuam reduzindo o peróxido de hidrogênio à água, minimizando, assim, o dano celular em condições de estresse e modulando as respostas celulares que utilizam o peróxido de hidrogênio como molécula sinalizadora. Através de análises em bancos de depósito de genomas, uma provável nova heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related ou APx-R) foi identificada. APx-R é uma proteína exclusiva de plantas e está presente desde organismos basais, como algas, até angiospermas. Diferentemente de outras peroxidases, geralmente codificadas por pequenas famílias gênicas originadas a partir de eventos de duplicação, APx-R se apresenta como um gene cópia-única em todos os genomas de plantas já sequenciados e disponibilizados. Apesar de haver grande similaridade de estrutura proteica entre APx e APx-R, APx-R possui um grande número de substituições conservadas em domínios críticos, sugerindo que esta proteína provavelmente se originou de algum membro da família das ascorbato peroxidases, mas acumulou mutações suficientes de forma que não pode mais ser considerado um membro desta família. Para verificar a localização subcelular de APx-R, protoplastos de arroz foram transfectados com uma construção de fusão traducional APx-R::YFP, sob o controle do promotor 35S. A visualização da florescência foi feita através de microscopia confocal e revelou que APx-R é uma proteína de dupla-localização, a qual pode localizar-se tanto nas mitocôndrias quanto nos cloroplastos. Análises de BiFC mostraram que APx-R pode interagir com as APx presentes nos mesmos compartimentos subcelulares, indicando que estas proteínas podem estar atuando de forma sinérgica no metabolismo de detoxificação do peróxido de hidrogênio. Para caracterizar APx-R funcionalmente, mutantes de arroz superexpressando RNA de interferência objetivando silenciar o gene OsAPx-R foram obtidos através de transformação via Agrobacterium tumefaciens. As plantas RNAi-OsAPx-R apresentaram alterações no metabolismo do peróxido de hidrogênio quando comparadas às plantas não-transformadas, mostrando diferenças nas atividades de SoD. Cat e APx, suportando a provável participação de APx-R na defesa contra o estresse. Assim, estes resultados mostraram que OsAPx-R codifica uma proteína funcional, a qual está relacionada com o sistema antioxidante e é requerida na resposta a estresses, provavelmente atuando na proteção dos cloroplastos e mitocôndrias, ambas organelas com intensa formação de espécies reativas de oxigênio.Peroxidases are widely distributed in all organisms, being of fundamental importance for their development. These enzymes act reducing hydrogen peroxide into water, minimizing cellular damage in stressful conditions and modulating cell responses through hydrogen peroxide signaling. From analysis in public genomic databases, a putative new heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related or APx-R) was identified. APx-R is exclusive of plants and present from basal to vascular organisms. Unlike other peroxidases, usually encoded by large genic families originated from duplication events, APx-R is present as a single-copy gene in all available plant genomes. Despite the high structure similarity between APx and APx-R proteins, APx-R presents a great number of conserved substitutions in critical domains, suggesting that this protein probably emerged from the family of ascorbate peroxidases, but accumulated enough mutations so it cannot be grouped in this family anymore. To access subcellular localization, rice protoplasts were transfected with a translational fusion of yellow fluorescent protein (YFP) to APx-R protein under the control of the 35S promoter. Fluorescence visualization was performed by confocal microscopy and revealed that APx-R is a dual-target protein targeted to chloroplasts and mitochondrias. BiFc analysis showed that APx-R can interact with APx proteins which are present in the same subcellular compartments, indicating that these proteins may be acting synergistically in hydrogen peroxide scavenging metabolism. To further characterize APx-R in antioxidant metabolism, rice mutants expressing interference RNA for APx-R gene were obtained through Agrobacterium tumefaciens transformation. RNAi-silenced plants presented a disturbed hydrogen peroxide metabolism in comparison to non-transformed plants, with differences in SoD, Cat and APx activity, supporting the participation of APx-R in stress defense. Altogether, these results showed that OsAPx-R encodes a functional protein, which is related to the antioxidant system and required in stress response, probably acting in chloroplast and mitochondria protection, both organelles with intense reactive oxygen species formation

Caracterização de um novo membro da superfamília de peroxidases não animais : ascorbato peroxidase-relacionada

Peroxidases atuam catalisando a redução do peróxido de hidrogênio à água a fim de minimizar o dano celular e modular, direta ou indiretamente, respostas celulares dependentes da sinalização operada por esta espécie reativa de oxigênio. Análises prévias, feitas em bancos de dados de sequências genômicas, permitiram a identificação de uma nova heme peroxidase não-animal (ascorbato peroxidase-relacionada ou APx-R), a qual foi descrita pela primeira vez em 2011 em um estudo publicado pelo nosso grupo de pesquisa. O trabalho detalhado nos próximos capítulos desta tese teve como objetivo caracterizar a participação de APx-R no metabolismo antioxidante vegetal através de abordagens filogenéticas e funcionais. Os resultados apresentados nos capítulos dois e três mostram que APx-R é uma peroxidase de classe I, filogeneticamente relacionada à ascorbato peroxidase, citocromo-c peroxidase e catalase peroxidase. Em Arabidopsis thaliana, APx-R codifica uma proteína cloroplastídica que atua regulando os processos de germinação e maturação da semente. A superexpressão de APx-R in planta afetou drasticamente a viabilidade das sementes, sugerindo que os níveis de expressão deste gene devem ser rigorosamente controlados para permitir o desenvolvimento da planta. Além disso, as análises filogenéticas aqui apresentadas levaram à identificação de uma nova família de peroxidases (intitulada ascorbato peroxidase-like ou APx-L), adicionando um novo componente ao complexo sistema antioxidante vegetal.Peroxidases act reducing hydrogen peroxide into water, minimizing cell injury and modulating cell responses through hydrogen peroxide signaling. From analysis in public genome databases, we identified a non-animal heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related or APx-R) present from basal to vascular plants, which was initially described in a study published by our group in 2011. The work described hereafter aimed to characterize APx-R participation in the antioxidant metabolism through phylogenetic and functional approaches. The results presented on chapters two and three showed that APx-R is a class I peroxidase, phylogenetically related to ascorbate peroxidase, cytochrome-c peroxidase and catalase peroxidase. In Arabidopsis thaliana, APx-R gene encodes a chloroplast protein which acts regulating germination and seed maturation processes. The overexpression of APx-R in planta impaired seed viability, showing that APx-R expression level must be tightly controlled in order to enable plants to develop properly. In addition, the phylogenetic analysis here presented allowed the identification of a new peroxidase family, called ascorbate peroxidase-like (APx-L), which adds a new component into plant antioxidant metabolism

Caracterização de um novo membro da superfamília de peroxidases não animais : ascorbato peroxidase-relacionada

Peroxidases atuam catalisando a redução do peróxido de hidrogênio à água a fim de minimizar o dano celular e modular, direta ou indiretamente, respostas celulares dependentes da sinalização operada por esta espécie reativa de oxigênio. Análises prévias, feitas em bancos de dados de sequências genômicas, permitiram a identificação de uma nova heme peroxidase não-animal (ascorbato peroxidase-relacionada ou APx-R), a qual foi descrita pela primeira vez em 2011 em um estudo publicado pelo nosso grupo de pesquisa. O trabalho detalhado nos próximos capítulos desta tese teve como objetivo caracterizar a participação de APx-R no metabolismo antioxidante vegetal através de abordagens filogenéticas e funcionais. Os resultados apresentados nos capítulos dois e três mostram que APx-R é uma peroxidase de classe I, filogeneticamente relacionada à ascorbato peroxidase, citocromo-c peroxidase e catalase peroxidase. Em Arabidopsis thaliana, APx-R codifica uma proteína cloroplastídica que atua regulando os processos de germinação e maturação da semente. A superexpressão de APx-R in planta afetou drasticamente a viabilidade das sementes, sugerindo que os níveis de expressão deste gene devem ser rigorosamente controlados para permitir o desenvolvimento da planta. Além disso, as análises filogenéticas aqui apresentadas levaram à identificação de uma nova família de peroxidases (intitulada ascorbato peroxidase-like ou APx-L), adicionando um novo componente ao complexo sistema antioxidante vegetal.Peroxidases act reducing hydrogen peroxide into water, minimizing cell injury and modulating cell responses through hydrogen peroxide signaling. From analysis in public genome databases, we identified a non-animal heme-peroxidase (ascorbate peroxidase-related or APx-R) present from basal to vascular plants, which was initially described in a study published by our group in 2011. The work described hereafter aimed to characterize APx-R participation in the antioxidant metabolism through phylogenetic and functional approaches. The results presented on chapters two and three showed that APx-R is a class I peroxidase, phylogenetically related to ascorbate peroxidase, cytochrome-c peroxidase and catalase peroxidase. In Arabidopsis thaliana, APx-R gene encodes a chloroplast protein which acts regulating germination and seed maturation processes. The overexpression of APx-R in planta impaired seed viability, showing that APx-R expression level must be tightly controlled in order to enable plants to develop properly. In addition, the phylogenetic analysis here presented allowed the identification of a new peroxidase family, called ascorbate peroxidase-like (APx-L), which adds a new component into plant antioxidant metabolism