Identification and characterization of Tc1/mariner-like DNA transposons in genomes of the pathogenic fungi of the Paracoccidioides species complex

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>Paracoccidioides brasiliensis </it>(Eukaryota, Fungi, Ascomycota) is a thermodimorphic fungus, the etiological agent of paracoccidioidomycosis, the most important systemic mycoses in Latin America. Three isolates corresponding to distinct phylogenetic lineages of the <it>Paracoccidioides </it>species complex had their genomes sequenced. In this study the identification and characterization of class II transposable elements in the genomes of these fungi was carried out.</p> <p>Results</p> <p>A genomic survey for DNA transposons in the sequence assemblies of <it>Paracoccidioides</it>, a genus recently proposed to encompass species <it>P. brasiliensis </it>(harboring phylogenetic lineages S1, PS2, PS3) and <it>P. lutzii </it>(<it>Pb01-like </it>isolates), has been completed. Eight new <it>Tc1/mariner </it>families, referred to as Trem (<b>Tr</b>ansposable <b>e</b>lement <b>m</b>ariner), labeled A through H were identified. Elements from each family have 65-80% sequence similarity with other <it>Tc1/mariner </it>elements. They are flanked by 2-bp TA target site duplications and different termini. Encoded DDD-transposases, some of which have complete ORFs, indicated that they could be functionally active. The distribution of Trem elements varied between the genomic sequences characterized as belonging to <it>P. brasiliensis </it>(S1 and PS2) and <it>P. lutzii</it>. TremC and H elements would have been present in a hypothetical ancestor common to <it>P. brasiliensis </it>and <it>P. lutzii</it>, while TremA, B and F elements were either acquired by <it>P. brasiliensis </it>or lost by <it>P. lutzii </it>after speciation. Although TremD and TremE share about 70% similarity, they are specific to <it>P. brasiliensis </it>and <it>P. lutzii</it>, respectively. This suggests that these elements could either have been present in a hypothetical common ancestor and have evolved divergently after the split between <it>P. brasiliensis </it>and <it>P. Lutzii</it>, or have been independently acquired by horizontal transfer.</p> <p>Conclusions</p> <p>New families of <it>Tc1/mariner </it>DNA transposons in the genomic assemblies of the <it>Paracoccidioides </it>species complex are described. Families were distinguished based on significant BLAST identities between transposases and/or TIRs. The expansion of Trem in a putative ancestor common to the species <it>P. brasiliensis </it>and <it>P. lutzii </it>would have given origin to TremC and TremH, while other elements could have been acquired or lost after speciation had occurred. The results may contribute to our understanding of the organization and architecture of genomes in the genus <it>Paracoccidioides</it>.</p

PRIMEIRA ESCOLA SOLAR DO BRASIL, O PROJETO PROMOÇÃO DA GERAÇÃO RENOVÁVEL DE ELETRICIDADE NA AMÉRICA DO SUL E SEUS IMPACTOS

O objetivo deste estudo é analisar o impacto da implementação da primeira escola solar no Brasil, desenvolvida no âmbito do projeto Promoção da geração renovável de eletricidade na América do Sul (REGSA). Para alcançar este objetivo, a técnica de pesquisa empregada envolveu entrevistas em profundidade com questionários semiestruturados que foram aplicados em 8 pessoas as quais tiveram alguma relação com o projeto, ou pertencem à comunidade local. Entre os entrevistados, estão membros do governo, da comunidade, membros do REGSA na Unisul e empresas locais. Teve especificamente como objetivo analisar o impacto alcançado em três níveis: a) transferência de tecnologia; b) desenvolvimento sustentável; e c) participação na tripla hélice. Os resultados mostraram que em todas as três esferas de análise, referentes aos objetivos específicos, o projeto REGSA teve um impacto positivo. O objetivo deste estudo é analisar o impacto da implementação da primeira escola solar no Brasil, desenvolvida no âmbito do projeto Promoção da geração renovável de eletricidade na América do Sul (REGSA). Para alcançar este objetivo, a técnica de pesquisa empregada envolveu entrevistas em profundidade com questionários semiestruturados que foram aplicados em 8 pessoas as quais tiveram alguma relação com o projeto, ou pertencem à comunidade local. Entre os entrevistados, estão membros do governo, da comunidade, membros do REGSA na Unisul e empresas locais. Teve especificamente como objetivo analisar o impacto alcançado em três níveis: a) transferência de tecnologia; b) desenvolvimento sustentável; e c) participação na tripla hélice. Os resultados mostraram que em todas as três esferas de análise, referentes aos objetivos específicos, o projeto REGSA teve um impacto positivo